BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-181O18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 151,391,178 - 151,443,146
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneKcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498
Downstream geneShank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a, LOC669079, LOC677315, Fgf3, Fgf4, Fgf15, Oraov1, Ccnd1, 1810010D01Rik, LOC100040049, Tpcn2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181O18.bB6Ng01-181O18.g
ACCGA007954GA007955
length9601,041
definitionB6Ng01-181O18.b B6Ng01-181O18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,391,178 - 151,392,125)(151,442,102 - 151,443,146)
sequence
gaattccaatatgctctagtgccttaactataaagctggcacccaaaaca
gtctcttgcttccctctctcatcagcctttggcagccaccaactctcctg
ctggctccgggcagttcatgtcatggaattcatcagaagatagtctttca
caagtgactattttaatttagcaaaaggcttatcattctttttttgtggc
taattcctttgcatttgcatatacatggcacattttatcagtctctggat
gggcacttaagttgttcccaccctttggctgtttgtgactcatttttggc
tgtgaacattcaggtataggttttggttagtctattctgttctctcaggt
ttatatgtaagggtagaaatgttgggttgtgtgatggctatgtttaagca
catgtgcaagtgcatgtgtgcacatgtgtgtgtgtgttatgtttgcatat
gtgtgttggtgtatgcatgcacatgaggaagccagaggaggacatatggt
gtcctgctttctcactctaccttattcctttgagatggggtccctccatg
aacctggagcttgactggtggcctgaaagccccagtgagccccctgtccc
tgccccacacagggctgggttacaggtatgcatgtagctccagccggttt
tttatgcagctctgtggttttggattcaggtcctcatgtttgtgcagcaa
gcacccttacctactgagctatctcatcagcactgattaacatctgaggg
cctgccaggctgtggttggctgtgactggcattggtgagtagcttttgct
ctgtggctctgtgaaaagtcacaacacacccccgtgctggaaaaagttct
ttcgaactgtaggcacaatgctactttgctgaagcaaaagtacatatatt
attgtgggccaggtaccttaggttgggattgtagcctcctcttttctctc
tctctctctt
gaattctttggtcaggggtaatgctgcatggaattgtgagcaggcctggc
tccagggctctgccttgagttcctgccctgatttccctcaatgatggact
gtgtctgtcgtggaagtttaaaatcatccctccccacctcagctgatgtt
ggtaacagttttattgcagcgacagaatgcaactagaacatggatacaaa
aagggggcactgagcagcaagatgctggactacagacagaagatagtaaa
ggggctctcatcctctgtctatgcctgtcactcccatgctgtcaccatct
gaattataacagccctgtcctcatacataacctgagggcatctattcaca
gggagggcaggggtgactgggtacatttgacggatggcatcaccgaaacc
aaatcacacacctaccccatgtcactcaggttgttcagatcagcacccca
gacagtgccttccttcgctctgtaggttgggtcagggacctacatcctgg
gctgtcctcagggctccaagatggggcattacctagtttctctgactcat
cctcctgacttatggtttgaggcagaggccatgaggaagggggaccctca
tgagctaataagtggcttactaaggataaaaagagagacctcaactagca
gctttcccaggcttaccacttgatagcctgtgccatgtgtgggtaaggca
gaagtcgccagcagtaggaagggtgtgcaccagacacagttcttgatctt
agacttctggctccacaagtggaatgactttgtcctctaaacatcaccga
gtctacatggggtagttctgaccatggcttccctgctcatcatagattgc
tgaactaaccaaaggccccatcacacaaggagcaaatcactgcagtccag
gcactggagtgagaacttgtggacaggaacactagccaggctggggacga
tcttagccaagctgtgcacactgctcacacttcacaccaggggtgggttg
aagagcccaggtatactggccttctatgacagatgagtccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_151391178_151392125
seq2: B6Ng01-181O18.b_47_1005

seq1  GAATTCCAATATGCTCTAGTGCCTTAACTATAAAGCTGGCACCCAAAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAATATGCTCTAGTGCCTTAACTATAAAGCTGGCACCCAAAACA  50

seq1  GTCTCTTGCTTCCCTCTCTCATCAGCCTTTGGCAGCCACCAACTCTCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTGCTTCCCTCTCTCATCAGCCTTTGGCAGCCACCAACTCTCCTG  100

seq1  CTGGCTCCGGGCAGTTCATGTCATGGAATTCATCAGAAGATAGTCTTTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCCGGGCAGTTCATGTCATGGAATTCATCAGAAGATAGTCTTTCA  150

seq1  CAAGTGACTATTTTAATTTAGCAAAAGGCTTATCATTCTTTTTTTGTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGACTATTTTAATTTAGCAAAAGGCTTATCATTCTTTTTTTGTGGC  200

seq1  TAATTCCTTTGCATTTGCATATACATGGCACATTTTATCAGTCTCTGGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTCCTTTGCATTTGCATATACATGGCACATTTTATCAGTCTCTGGAT  250

seq1  GGGCACTTAAGTTGTTCCCACCCTTTGGCTGTTTGTGACTCATTTTTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCACTTAAGTTGTTCCCACCCTTTGGCTGTTTGTGACTCATTTTTGGC  300

seq1  TGTGAACATTCAGGTATAGGTTTTGGTTAGTCTATTCTGTTCTCTCAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAACATTCAGGTATAGGTTTTGGTTAGTCTATTCTGTTCTCTCAGGT  350

seq1  TTATATGTAAGGGTAGAAATGTTGGGTTGTGTGATGGCTATGTTTAAGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTAAGGGTAGAAATGTTGGGTTGTGTGATGGCTATGTTTAAGCA  400

seq1  CATGTGCAAGTGCATGTGTGCACATGTGTGTGTGTGTTATGTTTGCATAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCAAGTGCATGTGTGCACATGTGTGTGTGTGTTATGTTTGCATAT  450

seq1  GTGTGTTGGTGTATGCATGCACATGAGGAAGCCAGAGGAGGACATATGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTGGTGTATGCATGCACATGAGGAAGCCAGAGGAGGACATATGGT  500

seq1  GTCCTGCTTTCTCACTCTACCTTATTCCTTTGAGATGGGGTCCCTCCATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCTTTCTCACTCTACCTTATTCCTTTGAGATGGGGTCCCTCCATG  550

seq1  AACCTGGAGCTTGACTGGTGGCCTGAAAGCCCCAGTGAGCCCCCTGTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGAGCTTGACTGGTGGCCTGAAAGCCCCAGTGAGCCCCCTGTCCC  600

seq1  TGCCCCACACAGGGCTGGGTTACAGGTATGCATGTAGCTCCAGCCGGTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCACACAGGGCTGGGTTACAGGTATGCATGTAGCTCCAGCCGGTTT  650

seq1  TTTATGCAGCTCTGTGGTTTTGGATTCAGGTCCTCATGTTTGTGCAGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCAGCTCTGTGGTTTTGGATTCAGGTCCTCATGTTTGTGCAGCAA  700

seq1  GCACCCTTACCTACTGAGCTATCTCATCAGCACTGATTAACATCTGAGGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCTTACCTACTGAGCTATCTCATCAGCACTGATTAACATCTGAGGG  750

seq1  CCTGCCAGGCTGTGGTTGGCTGTGACTGGCATTGGTGAGTAGC-TTTGCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CCTGCCAGGCTGTGGTTGGCTGTGACTGGCATTGGTGAGTAGCTTTTGCT  800

seq1  CTGTGGCTCTGTG-AAAGTCAC-ACACACCCCCGTGCTGGAAAAAGTTC-  846
      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTGTGGCTCTGTGAAAAGTCACAACACACCCCCGTGCTGGAAAAAGTTCT  850

seq1  TTCGAACTGTAGGCACAATGCTACTTTGCTGAAGC-AAAGTACA-ATATT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  TTCGAACTGTAGGCACAATGCTACTTTGCTGAAGCAAAAGTACATATATT  900

seq1  A-TGTGGG-CAGGTACC-TAGGTTGG--ATGTAGCCTCTCTC-TCTCTCT  938
      | |||||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||| | |||||
seq2  ATTGTGGGCCAGGTACCTTAGGTTGGGATTGTAGCCTC-CTCTTTTCTCT  949

seq1  CTCTCTCTCT  948
      ||||||||||
seq2  CTCTCTCTCT  959

seq1: chr7_151442102_151443146
seq2: B6Ng01-181O18.g_66_1106 (reverse)

seq1  GGGACCTCATCCTGTCATAGAAGGCCAGTATACCTGGGCTCCTTCACCCA  50
      |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||
seq2  GGGA-CTCAT-CTGTCATAGAAGGCCAGTATACCTGGGCTCTTCAACCCA  48

seq1  CCCCTGGTGTGAAGTGTGAGGCAGGTGTGCACAGCTTGGCT-AGATCGTC  99
      ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCCCTGGTGTGAAGTGTGA-GCA-GTGTGCACAGCTTGGCTAAGATCGTC  96

seq1  CCCAGCCTGGCTAGTGTTCCTTGTCCACAAGTTCTCACTCCAGTGCCCTG  149
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCCAGCCTGGCTAGTGTTCC-TGTCCACAAGTTCTCACTCCAGTG-CCTG  144

seq1  GACTGCAGTGATTTGCTCCTTGTGTGATGGGGCCTTTGGTTAGTTCAGCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCAGTGATTTGCTCCTTGTGTGATGGGGCCTTTGGTTAGTTCAGCA  194

seq1  ATCTATGATGAGCAGGGAAGCCATGGTCAGAACTA-CCCATGTAGACTCG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATCTATGATGAGCAGGGAAGCCATGGTCAGAACTACCCCATGTAGACTCG  244

seq1  GTGATGTTTAGAGGACAAAGTCATTCCACTTGTGGAGCCAGAAGTCTAAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGTTTAGAGGACAAAGTCATTCCACTTGTGGAGCCAGAAGTCTAAG  294

seq1  ATCAAGAACTGTGTCTGGTGCACACCCTTCCTACTGCTGGCGACTTCTGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGAACTGTGTCTGGTGCACACCCTTCCTACTGCTGGCGACTTCTGC  344

seq1  CTTACCCACACATGGCACAGGCTATCAAGTGGTAAGCCTGGGAAAGCTGC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCCACACATGGCACAGGCTATCAAGTGGTAAGCCTGGGAAAGCTGC  394

seq1  TAGTTGAGGTCTCTCTTTTTATCCTTAGTAAGCCACTTATTAGCTCATGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGAGGTCTCTCTTTTTATCCTTAGTAAGCCACTTATTAGCTCATGA  444

seq1  GGGTCCCCCTTCCTCATGGCCTCTGCCTCAAACCATAAGTCAGGAGGATG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCCCCTTCCTCATGGCCTCTGCCTCAAACCATAAGTCAGGAGGATG  494

seq1  AGTCAGAGAAACTAGGTAATGCCCCATCTTGGAGCCCTGAGGACAGCCCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGAGAAACTAGGTAATGCCCCATCTTGGAGCCCTGAGGACAGCCCA  544

seq1  GGATGTAGGTCCCTGACCCAACCTACAGAGCGAAGGAAGGCACTGTCTGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTAGGTCCCTGACCCAACCTACAGAGCGAAGGAAGGCACTGTCTGG  594

seq1  GGTGCTGATCTGAACAACCTGAGTGACATGGGGTAGGTGTGTGATTTGGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGATCTGAACAACCTGAGTGACATGGGGTAGGTGTGTGATTTGGT  644

seq1  TTCGGTGATGCCATCCGTCAAATGTACCCAGTCACCCCTGCCCTCCCTGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGTGATGCCATCCGTCAAATGTACCCAGTCACCCCTGCCCTCCCTGT  694

seq1  GAATAGATGCCCTCAGGTTATGTATGAGGACAGGGCTGTTATAATTCAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGATGCCCTCAGGTTATGTATGAGGACAGGGCTGTTATAATTCAGA  744

seq1  TGGTGACAGCATGGGAGTGACAGGCATAGACAGAGGATGAGAGCCCCTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGACAGCATGGGAGTGACAGGCATAGACAGAGGATGAGAGCCCCTTT  794

seq1  ACTATCTTCTGTCTGTAGTCCAGCATCTTGCTGCTCAGTGCCCCCTTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCTTCTGTCTGTAGTCCAGCATCTTGCTGCTCAGTGCCCCCTTTTT  844

seq1  GTATCCATGTTCTAGTTGCATTCTGTCGCTGCAATAAAACTGTTACCAAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCATGTTCTAGTTGCATTCTGTCGCTGCAATAAAACTGTTACCAAC  894

seq1  ATCAGCTGAGGTGGGGAGGGATGATTTTAAACTTCCACGACAGACACAGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCTGAGGTGGGGAGGGATGATTTTAAACTTCCACGACAGACACAGT  944

seq1  CCATCATTGAGGGAAATCAGGGCAGGAACTCAAGGCAGAGCCCTGGAGCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATTGAGGGAAATCAGGGCAGGAACTCAAGGCAGAGCCCTGGAGCC  994

seq1  AGGCCTGCTCACAATTCCATGCAGCATTACCCCTGACCAAAGAATTC  1045
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGCTCACAATTCCATGCAGCATTACCCCTGACCAAAGAATTC  1041