BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-181P13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 139,245,693 - 139,369,009
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCpxm2
Upstream geneDmbt1, 4933402N03Rik, 5430419D17Rik, LOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik, Pstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3, LOC677073, LOC100043679, Gpr26
Downstream gene4631426J05Rik, LOC100043682, LOC100043683, Oat, Nkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1, Ctbp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-181P13.bB6Ng01-181P13.g
ACCGA007990GA007991
length7781,084
definitionB6Ng01-181P13.b B6Ng01-181P13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(139,368,232 - 139,369,009)(139,245,693 - 139,246,774)
sequence
gaattctttcccacaaatactcctttcttttaaaagtaaacagaatcaag
gacttccaggagggcaaaaaccataatgtttaataattcttaaactttag
gttttttttttttttttttttgaaaatcccaattatcgtagggaatgggc
acttcacaaaaataagtaaaagctgaaatagttgattctttttttcacca
ggcaagccctctctcctactccctagaaaaagaaatcttccatccaaagc
atgttatttttctcatatgaagaaacattgcttcttatcctaacaagtgc
atttacaagtgaatttaactgttacaagatggtttattatccactgaaat
tttagaaatcgtggaaattaaggcaaagaaaattactagtatctctgtta
ttccccccacctccaaaatcacaagtagatatttcctcctacttagcttt
tctctgactagtatttttggatacaactccaatcatactggttgtttgtg
tgtttgttttttgtttttctaaattcaaactcacaaacttttaaaacatt
agatcatagggagttttcaaaatcaccataagccctttataaaataactt
tttattgtttttatttatacaattgattttgagttgtctatatggggttt
ggagagatgggtcagcattcaagagagcatatagctcttgtagagaacct
aagttcagttcccagaacccatgttggccatttcacaaccaactgtaact
caagctccaggaggtgggaggggtagtg
gaattccctatgcctttctgtcaggagaaagtcctactcagacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacattcagcctat
tagttccattcttttagaaaatgctgactaatagaaaggggacatatggc
agagaggcctggggttaactctggactagaatctatgattattaatattg
acaacttgacaggatctacaatcctcctaagagacacacccctgaatatg
tctgtgatgggttagctagactgttaattaagatgagaaaacccaactgt
ggataccaccatgtgttaggctgaacaacaagaaaaaaggcaactgagta
tcagtatccatctctctctacttccagactatgtacacgcacacacacat
gcacagacacatatgcatacaccttacacgcatgcacgtatgcacacatg
cacacacatgcatgtgcattacacatgcacacacatgcacacacacatat
gcatacacctgtacatgcatgcacacatgcacacacatgcatgtgcatta
cacatgcacacacacacacgcacacacatgtgcacacagccacacatgca
tgtgcatgccttaaattgctcttgtcagatgttttgtcacagcaacagga
aacgtaactagtgcatcatccgtagtccttgggaacatgatgttagactg
gcagatagatctaagacgtacttccagccactgtgtgccaggaagcccca
ttgacggtgccctcctccttctgaaaatcttccgtgtggcacactcgcct
cctggcatctgtcatgaggcggtgagtggaggcgtaggaatacgccagcc
agcggaacacatgatcatcaggtgttggggtgtgctcctgggtcttccac
agggaaccgcaccatgtcataggggtatgccacgaccagctcaccccccc
ttgtagggtgcctcccagcacaaacgggatcttctccatccaaggcggat
gacggctctggtctctgtggccactgggagtaatacaaattacaaacaga
aagaagtgcttcgcctcttagcctttccaaaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_139368232_139369009
seq2: B6Ng01-181P13.b_48_825 (reverse)

seq1  CACTACCCCTCCCACCTCCTGGAGCTTGAGTTACAGTTGGTTGTGAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTACCCCTCCCACCTCCTGGAGCTTGAGTTACAGTTGGTTGTGAAATG  50

seq1  GCCAACATGGGTTCTGGGAACTGAACTTAGGTTCTCTACAAGAGCTATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACATGGGTTCTGGGAACTGAACTTAGGTTCTCTACAAGAGCTATAT  100

seq1  GCTCTCTTGAATGCTGACCCATCTCTCCAAACCCCATATAGACAACTCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCTTGAATGCTGACCCATCTCTCCAAACCCCATATAGACAACTCAA  150

seq1  AATCAATTGTATAAATAAAAACAATAAAAAGTTATTTTATAAAGGGCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATTGTATAAATAAAAACAATAAAAAGTTATTTTATAAAGGGCTTA  200

seq1  TGGTGATTTTGAAAACTCCCTATGATCTAATGTTTTAAAAGTTTGTGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGATTTTGAAAACTCCCTATGATCTAATGTTTTAAAAGTTTGTGAGT  250

seq1  TTGAATTTAGAAAAACAAAAAACAAACACACAAACAACCAGTATGATTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATTTAGAAAAACAAAAAACAAACACACAAACAACCAGTATGATTGG  300

seq1  AGTTGTATCCAAAAATACTAGTCAGAGAAAAGCTAAGTAGGAGGAAATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTATCCAAAAATACTAGTCAGAGAAAAGCTAAGTAGGAGGAAATAT  350

seq1  CTACTTGTGATTTTGGAGGTGGGGGGAATAACAGAGATACTAGTAATTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTGTGATTTTGGAGGTGGGGGGAATAACAGAGATACTAGTAATTTT  400

seq1  CTTTGCCTTAATTTCCACGATTTCTAAAATTTCAGTGGATAATAAACCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCCTTAATTTCCACGATTTCTAAAATTTCAGTGGATAATAAACCAT  450

seq1  CTTGTAACAGTTAAATTCACTTGTAAATGCACTTGTTAGGATAAGAAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAACAGTTAAATTCACTTGTAAATGCACTTGTTAGGATAAGAAGCA  500

seq1  ATGTTTCTTCATATGAGAAAAATAACATGCTTTGGATGGAAGATTTCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCTTCATATGAGAAAAATAACATGCTTTGGATGGAAGATTTCTTT  550

seq1  TTCTAGGGAGTAGGAGAGAGGGCTTGCCTGGTGAAAAAAAGAATCAACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAGGGAGTAGGAGAGAGGGCTTGCCTGGTGAAAAAAAGAATCAACTA  600

seq1  TTTCAGCTTTTACTTATTTTTGTGAAGTGCCCATTCCCTACGATAATTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGCTTTTACTTATTTTTGTGAAGTGCCCATTCCCTACGATAATTGG  650

seq1  GATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTAAAGTTTAAGAATTATTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTAAAGTTTAAGAATTATTAAA  700

seq1  CATTATGGTTTTTGCCCTCCTGGAAGTCCTTGATTCTGTTTACTTTTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATGGTTTTTGCCCTCCTGGAAGTCCTTGATTCTGTTTACTTTTAAA  750

seq1  AGAAAGGAGTATTTGTGGGAAAGAATTC  778
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGAGTATTTGTGGGAAAGAATTC  778

seq1: chr7_139245693_139246774
seq2: B6Ng01-181P13.g_66_1149

seq1  GAATTCCCTATGCCTTTCTGTCAGGAGAAAGTCCTACTCAGACACACACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTATGCCTTTCTGTCAGGAGAAAGTCCTACTCAGACACACACA  50

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTCAGCCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTCAGCCTAT  100

seq1  TAGTTCCATTCTTTTAGAAAATGCTGACTAATAGAAAGGGGACATATGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCCATTCTTTTAGAAAATGCTGACTAATAGAAAGGGGACATATGGC  150

seq1  AGAGAGGCCTGGGGTTAACTCTGGACTAGAATCTATGATTATTAATATTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGGCCTGGGGTTAACTCTGGACTAGAATCTATGATTATTAATATTG  200

seq1  ACAACTTGACAGGATCTACAATCCTCCTAAGAGACACACCCCTGAATATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTGACAGGATCTACAATCCTCCTAAGAGACACACCCCTGAATATG  250

seq1  TCTGTGATGGGTTAGCTAGACTGTTAATTAAGATGAGAAAACCCAACTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGATGGGTTAGCTAGACTGTTAATTAAGATGAGAAAACCCAACTGT  300

seq1  GGATACCACCATGTGTTAGGCTGAACAACAAGAAAAAAGGCAACTGAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATACCACCATGTGTTAGGCTGAACAACAAGAAAAAAGGCAACTGAGTA  350

seq1  TCAGTATCCATCTCTCTCTACTTCCAGACTATGTACACGCACACACACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTATCCATCTCTCTCTACTTCCAGACTATGTACACGCACACACACAT  400

seq1  GCACAGACACATATGCATACACCTTACACGCATGCACGTATGCACACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGACACATATGCATACACCTTACACGCATGCACGTATGCACACATG  450

seq1  CACACACATGCATGTGCATTACACATGCACACACATGCACACACACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACATGCATGTGCATTACACATGCACACACATGCACACACACATAT  500

seq1  GCATACACCTGTACATGCATGCACACATGCACACACATGCATGTGCATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACACCTGTACATGCATGCACACATGCACACACATGCATGTGCATTA  550

seq1  CACATGCACACACACACACGCACACACATGTGCACACAGCCACACATGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCACACACACACACGCACACACATGTGCACACAGCCACACATGCA  600

seq1  TGTGCATGCCTTAAATTGCTCTTGTCAGATGTTTTGTCACAGCAACAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATGCCTTAAATTGCTCTTGTCAGATGTTTTGTCACAGCAACAGGA  650

seq1  AACGTAACTAGTGCATCATCCGTAGTCCTTGGGAACATGATGTTAGACTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTAACTAGTGCATCATCCGTAGTCCTTGGGAACATGATGTTAGACTG  700

seq1  GCAGATAGATCTAAGACGTACTTCCAGCCACTGTGTGCCAGGAAGCCCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGATAGATCTAAGACGTACTTCCAGCCACTGTGTGCCAGGAAGCCCCA  750

seq1  TTGACGGTGCCCTCCTCCTTCTGAAAATCTTCCGTGTGGCACACTCGCCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACGGTGCCCTCCTCCTTCTGAAAATCTTCCGTGTGGCACACTCGCCT  800

seq1  CCTGGCATCTGTCATGAGGCGGTGAGTGGAGGCGTAGGAATACGCCAGCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCATCTGTCATGAGGCGGTGAGTGGAGGCGTAGGAATACGCCAGCC  850

seq1  AGCGGAACACATGATCATCAGGTGTTGGGGTGTGCTCCTGGGTCTTCCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGAACACATGATCATCAGGTGTTGGGGTGTGCTCCTGGGTCTTCCAC  900

seq1  AGGG-ACCGCACCATGTCATAGGGGTATGCCACGACCAGCTCACCCCCC-  948
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGGGAACCGCACCATGTCATAGGGGTATGCCACGACCAGCTCACCCCCCC  950

seq1  -TGTAGGTTGCCTCCCAGCACAAACGGGATCTTCTCCATCC-AGGC-GAT  995
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||
seq2  TTGTAGGGTGCCTCCCAGCACAAACGGGATCTTCTCCATCCAAGGCGGAT  1000

seq1  GACGGCTCTGGTCTCTGTGGCCACCTGGGAGT-ATACAAATTTAACAAAC  1044
      ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||
seq2  GACGGCTCTGGTCTCTGTGGCCA-CTGGGAGTAATACAAATT--ACAAAC  1047

seq1  AGAAAGAAGTTGCTTCGCTTCCTTAG-CTTTCAAAAAAA  1082
      ||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||
seq2  AGAAAGAAG-TGCTTCGCCT-CTTAGCCTTTCCAAAAAA  1084