BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-182P22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 37,384,075 - 37,542,077
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTshz3
Upstream geneAnkrd27, Pdcd5, Dpy19l3, zfp507, LOC100043872, EG668988, LOC668507
Downstream geneLOC100043874, Zfp536
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-182P22.bB6Ng01-182P22.g
ACCGA008737GA008738
length1,1151,087
definitionB6Ng01-182P22.b B6Ng01-182P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,540,975 - 37,542,077)(37,384,075 - 37,385,146)
sequence
gaattctctcatcttggaagagaagcagggtggactttcatggatgtttg
cacttcccctgagcagagtcatgattctgtgtcccccacaattgcagttg
gcacatgggagcctgtagaggtaaagcagagtgcatttgtaacttgtggt
cttcagtaaggcagctcgactgtctacacacttgacagtctgaactctcg
agagaagcacaacggataactgagcaatggctccgggaattgggggggtc
cagtccttgaaatgggcactttcaaactggccttatgtgtacaactcagt
tctcactgggactcactgactcttccccctaacatctaaagagttgtgtc
tattaaaaaaaaaaaagaggaatggatggcttgagtcaagcaggaattaa
gatttacatggaaaataaggcaatcgatgtatgcaagattatttatctat
tcacacattcactagcccattcctccatctgcactcatttattcactcat
tcacctataatccatctatctactcattatctgttgatcctatttatcta
cccattggtccatccatccatctatccatctatccatccatccacccaac
atacaatggacacaattaaatattgcaaatgcttggattagagataagaa
cctacaaatggtgacaaaaaaatgaatgagtcagaatcacagccttcatt
tctttacaccatcaagatggcctttgttacaccgagtacagggccattaa
ggagtctgtgatcagcaaaaatgtcttagcttgacattcagagcctcata
taatcaagctccctgttacctttttagggtttttcttttttcctagggct
ggcatacagagccgtgtgcatactagacaggtgctctaccatttgagcca
acctactcagcccctcattgggggatttctaggcagatgctttagcttgt
aagcagcaatatctttcagtgttttctctttctacctgccccagttcaca
aacttcatgctacacctctcataatgtcgtctggccctagacttaccgct
ggtttctcctgttacatggaatgttgaatcttttcagtgtctctctactg
tctacctgccctcaa
gaattctatatccattcagctctgcctggcgcctctctgaagatttattg
gcataacagactctgcttatttcttaccatctctgaaagtgcacatattc
tcagagaggagggaccacatcttcctatctgtgcttttcatgtctgctcc
caggagcatctgtctgtatgtctcttcactgtaacaaaatacccaacaga
acagttcaaggaagacaggcttcattttgactctgtttaaggggactcga
ggactcagtctgtgaacctggttcaggtttctaagcggaatgtcaggaca
aaaagagcataggggagaaaaccattgttcacatcatggtggccaggaag
tagagggtgaagtggacagaaagtggctatggataatatacacccaatga
cccatccctaacgatctacttcctctagcaactccccacttgtcaatgat
ttcagaacctcccaaaatagcactagcagctagagatcaaacatttaaag
catgaacaatgatggacatttgatcaggctggagagatggctcgattggt
ggttaaggacacttgctgatcttccagagggcccaagtttggtctctagc
acccacactgggtggcccaaggccctgtaactccaactccatagatcctg
tgccctcttctggcctatgtgagccactgcacttacctgcacatacccac
acacagacatacatgcatgcacagaagtcaataaataaatgtagtccatg
ggaggaatgggctctatgagaatctctcagacaagtgaaccaaagtacaa
atatttggaagcatcacacacagttctggtggggagaccatggatgactt
attatcattggtggcatgggtgacagtatagtccccagcagtggtttaga
atgtgggcagactgaatagcctaagggcttgatttaatagtaacaaaaga
gaaaaaggtcttgccagaatataaagttgaagctttcgaggacagtgctt
ccatccccaccacacctctttgaaagccagcttcaactaagaacacccaa
tggtcttggcctgacaccctctaaaggatgtattggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_37540975_37542077
seq2: B6Ng01-182P22.b_44_1158 (reverse)

seq1  TTGAAGGCAGGTAGACAGGTAGGAGGACA-TGAAAAGA-TCAACATTCCA  48
      |||| |||||||||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||
seq2  TTGAGGGCAGGTAGACA-GTAGAGAGACACTGAAAAGATTCAACATTCCA  49

seq1  TGTAAACAGGAAGAAACAGC-GTAAGTC-AAGGCCAGACGACATTATGAG  96
      ||| |||||||  || |||| ||||||| | |||||||||||||||||||
seq2  TGT-AACAGGAGAAACCAGCGGTAAGTCTAGGGCCAGACGACATTATGAG  98

seq1  A-GTGTAGCATG-AGTTTGTGGACTGGGGCA-GTAG-AAGAG-AAACACT  141
      | |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||
seq2  AGGTGTAGCATGAAGTTTGTGAACTGGGGCAGGTAGAAAGAGAAAACACT  148

seq1  GAAAGATATTGCTGCTTAC-AGCT-AAGCATCTGCCTAG-AATCCCCCAA  188
      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAAGATATTGCTGCTTACAAGCTAAAGCATCTGCCTAGAAATCCCCCAA  198

seq1  TGAGGGGCTGAGTAGG-TGGCTC-AATGGTAGAGCACCTGTCTAGTATGC  236
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGGCTGAGTAGGTTGGCTCAAATGGTAGAGCACCTGTCTAGTATGC  248

seq1  ACACGGCTCTGTATGCCAGCCCTAGGAAAAAAGAAAAACCCTAAAAAGGT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGGCTCTGTATGCCAGCCCTAGGAAAAAAGAAAAACCCTAAAAAGGT  298

seq1  AACAGGGAGCTTGATTATATGAGGCTCTGAATGTCAAGCTAAGACATTTT  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGAGCTTGATTATATGAGGCTCTGAATGTCAAGCTAAGACATTTT  348

seq1  TGCTGATCACAGACTCCTTAATGGCCCTGTACTCGGTGTAACAAAGGCCA  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATCACAGACTCCTTAATGGCCCTGTACTCGGTGTAACAAAGGCCA  398

seq1  TCTTGATGGTGTAAAGAAATGAAGGCTGTGATTCTGACTCATTCATTTTT  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATGGTGTAAAGAAATGAAGGCTGTGATTCTGACTCATTCATTTTT  448

seq1  TTGTCACCATTTGTAGGTTCTTATCTCTAATCCAAGCATTTGCAATATTT  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCACCATTTGTAGGTTCTTATCTCTAATCCAAGCATTTGCAATATTT  498

seq1  AATTGTGTCCATTGTATGTTGGGTGGATGGATGGATAGATGGATAGATGG  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGTCCATTGTATGTTGGGTGGATGGATGGATAGATGGATAGATGG  548

seq1  ATGGATGGACCAATGGGTAGATAAATAGGATCAACAGATAATGAGTAGAT  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGATGGACCAATGGGTAGATAAATAGGATCAACAGATAATGAGTAGAT  598

seq1  AGATGGATTATAGGTGAATGAGTGAATAAATGAGTGCAGATGGAGGAATG  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGATTATAGGTGAATGAGTGAATAAATGAGTGCAGATGGAGGAATG  648

seq1  GGCTAGTGAATGTGTGAATAGATAAATAATCTTGCATACATCGATTGCCT  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGTGAATGTGTGAATAGATAAATAATCTTGCATACATCGATTGCCT  698

seq1  TATTTTCCATGTAAATCTTAATTCCTGCTTGACTCAAGCCATCCATTCCT  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCCATGTAAATCTTAATTCCTGCTTGACTCAAGCCATCCATTCCT  748

seq1  CTTTTTTTTTTTTAATAGACACAACTCTTTAGATGTTAGGGGGAAGAGTC  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTTTTTTTAATAGACACAACTCTTTAGATGTTAGGGGGAAGAGTC  798

seq1  AGTGAGTCCCAGTGAGAACTGAGTTGTACACATAAGGCCAGTTTGAAAGT  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTCCCAGTGAGAACTGAGTTGTACACATAAGGCCAGTTTGAAAGT  848

seq1  GCCCATTTCAAGGACTGGACCCCCCCAATTCCCGGAGCCATTGCTCAGTT  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATTTCAAGGACTGGACCCCCCCAATTCCCGGAGCCATTGCTCAGTT  898

seq1  ATCCGTTGTGCTTCTCTCGAGAGTTCAGACTGTCAAGTGTGTAGACAGTC  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCGTTGTGCTTCTCTCGAGAGTTCAGACTGTCAAGTGTGTAGACAGTC  948

seq1  GAGCTGCCTTACTGAAGACCACAAGTTACAAATGCACTCTGCTTTACCTC  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCCTTACTGAAGACCACAAGTTACAAATGCACTCTGCTTTACCTC  998

seq1  TACAGGCTCCCATGTGCCAACTGCAATTGTGGGGGACACAGAATCATGAC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGCTCCCATGTGCCAACTGCAATTGTGGGGGACACAGAATCATGAC  1048

seq1  TCTGCTCAGGGGAAGTGCAAACATCCATGAAAGTCCACCCTGCTTCTCTT  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCAGGGGAAGTGCAAACATCCATGAAAGTCCACCCTGCTTCTCTT  1098

seq1  CCAAGATGAGAGAATTC  1103
      |||||||||||||||||
seq2  CCAAGATGAGAGAATTC  1115

seq1: chr7_37384075_37385146
seq2: B6Ng01-182P22.g_68_1154

seq1  GAATTCTATATCCATTCAGCTCTGCCTGGCGCCTCTCTGAAGATTTATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATATCCATTCAGCTCTGCCTGGCGCCTCTCTGAAGATTTATTG  50

seq1  GCATAACAGACTCTGCTTATTTCTTACCATCTCTGAAAGTGCACATATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAACAGACTCTGCTTATTTCTTACCATCTCTGAAAGTGCACATATTC  100

seq1  TCAGAGAGGAGGGACCACATCTTCCTATCTGTGCTTTTCATGTCTGCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGGAGGGACCACATCTTCCTATCTGTGCTTTTCATGTCTGCTCC  150

seq1  CAGGAGCATCTGTCTGTATGTCTCTTCACTGTAACAAAATACCCAACAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCATCTGTCTGTATGTCTCTTCACTGTAACAAAATACCCAACAGA  200

seq1  ACAGTTCAAGGAAGACAGGCTTCATTTTGACTCTGTTTAAGGGGACTCGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCAAGGAAGACAGGCTTCATTTTGACTCTGTTTAAGGGGACTCGA  250

seq1  GGACTCAGTCTGTGAACCTGGTTCAGGTTTCTAAGCGGAATGTCAGGACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCAGTCTGTGAACCTGGTTCAGGTTTCTAAGCGGAATGTCAGGACA  300

seq1  AAAAGAGCATAGGGGAGAAAACCATTGTTCACATCATGGTGGCCAGGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGCATAGGGGAGAAAACCATTGTTCACATCATGGTGGCCAGGAAG  350

seq1  TAGAGGGTGAAGTGGACAGAAAGTGGCTATGGATAATATACACCCAATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGGTGAAGTGGACAGAAAGTGGCTATGGATAATATACACCCAATGA  400

seq1  CCCATCCCTAACGATCTACTTCCTCTAGCAACTCCCCACTTGTCAATGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCCCTAACGATCTACTTCCTCTAGCAACTCCCCACTTGTCAATGAT  450

seq1  TTCAGAACCTCCCAAAATAGCACTAGCAGCTAGAGATCAAACATTTAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAACCTCCCAAAATAGCACTAGCAGCTAGAGATCAAACATTTAAAG  500

seq1  CATGAACAATGATGGACATTTGATCAGGCTGGAGAGATGGCTCGATTGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAACAATGATGGACATTTGATCAGGCTGGAGAGATGGCTCGATTGGT  550

seq1  GGTTAAGGACACTTGCTGATCTTCCAGAGGGCCCAAGTTTGGTCTCTAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAGGACACTTGCTGATCTTCCAGAGGGCCCAAGTTTGGTCTCTAGC  600

seq1  ACCCACACTGGGTGGCCCAAGGCCCTGTAACTCCAACTCCATAGATCCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACACTGGGTGGCCCAAGGCCCTGTAACTCCAACTCCATAGATCCTG  650

seq1  TGCCCTCTTCTGGCCTATGTGAGCCACTGCACTTACCTGCACATACCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTTCTGGCCTATGTGAGCCACTGCACTTACCTGCACATACCCAC  700

seq1  ACACAGACATACATGCATGCACAGAAGTCAATAAATAAATGTAGTCCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGACATACATGCATGCACAGAAGTCAATAAATAAATGTAGTCCATG  750

seq1  GGAGGAATGGGCTCTATGAGAATCTCTCAGACAAGTGAACCAAAGTACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAATGGGCTCTATGAGAATCTCTCAGACAAGTGAACCAAAGTACAA  800

seq1  ATATTTGGAAGCATCACACACAGTTCTGGTGGGGAGACCATGGATGACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTGGAAGCATCACACACAGTTCTGGTGGGGAGACCATGGATGACTT  850

seq1  A-TATCA-TGGTGGCATGGGTGACAGTATAGTCCCCAGCAGTGG-TTAGA  897
      | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATTATCATTGGTGGCATGGGTGACAGTATAGTCCCCAGCAGTGGTTTAGA  900

seq1  ATGTGGGCAGACTG-AGAGGCCAAGGGCTGGA-TTAATAG-AACAAAAGA  944
      |||||||||||||| | || | ||||||| || ||||||| |||||||||
seq2  ATGTGGGCAGACTGAATAGCCTAAGGGCTTGATTTAATAGTAACAAAAGA  950

seq1  GAAAAGGGTCTTGCCCAGAAAATAAAG-TGAAGC-TTCGA-GACAGTGCT  991
      ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||
seq2  GAAAAAGGTCTTG-CCAGAATATAAAGTTGAAGCTTTCGAGGACAGTGCT  999

seq1  TCCATCCCCAC----ACTCCTTGAAAGCCAGCTTCCACCAAAGACACCCA  1037
      |||||||||||     ||| ||||||||||||||| || ||  |||||||
seq2  TCCATCCCCACCACACCTCTTTGAAAGCCAGCTTCAACTAAGAACACCCA  1049

seq1  --TGTCTT-GCCTGACACCCCTCTAAA-GATTTATTGGC  1072
         ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||
seq2  ATGGTCTTGGCCTGACA-CCCTCTAAAGGATGTATTGGC  1087