BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185K20
Chromosome7 (Build37)
Map Location 115,050,201 - 115,240,622
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr473, LOC669301, Olfr474, Olfr476, Olfr477, LOC626732, Olfr478, Olfr479, Olfr480, Olfr481, LOC100043059, Olfr482
Upstream geneOlfr708, Olfr709-ps1, Olfr710, LOC384651, Olfr6, Olfr711, GA_x5J8B7W6B6J-1784824-1783474, Olfr2, Olfr713, Olfr714, Olfr17, Olfr715, Olfr716, Nlrp14, LOC100042278, 1700012H05Rik, Syt9, Olfml1, Ppfibp2, 5330417H12Rik, Cyb5r2, Ovch2, LOC100042310, Olfr467, Olfr468-ps1, Olfr469, GA_x5J8B7W6B6J-2580381-2580079, Olfr470, Olfr471, LOC626661, Olfr472
Downstream geneOlfr483, Olfr484, Olfr485, Olfr486, Olfr487, Olfr1538-ps1, Olfr488, LOC546990, Olfr489-ps1, Olfr490, LOC626881, Olfr491, Olfr492, Olfr493, Olfr494, Olfr495, Olfr496-ps1, Olfr497, Olfr498, Olfr499-ps1, Olfr500-ps1, Olfr501-ps1, Olfr502, LOC269980, Olfr503, Olfr504, Olfr505-ps1, Olfr506, Olfr507, Olfr508, Olfr509, Olfr510, Olfr511-ps1, Olfr512, Olfr513, Olfr514, Olfr515-ps1, Olfr516, Olfr517, Olfr518, Olfr519, Nlrp10, Eif3s5, BC049265, Tub, Ric3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185K20.bB6Ng01-185K20.g
ACCGA010724GA010725
length1,191923
definitionB6Ng01-185K20.b B6Ng01-185K20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(115,239,447 - 115,240,622)(115,050,201 - 115,051,036)
sequence
gaattcattccatcatattctagttagaaaacactgtgactctagataag
gagctactgtgtctaaactaatagtaactaatagtgtgttaaatatttat
atttggcatgatgataaagttgatatttaaaataactttagagaatattg
gtctatttgaaagaattttaaatatccaatgagtttataacaataagctc
tacttgtaaattttgtgaaaactttattcagttttacaaactatgagatc
aacatcaccagcaatgcacctttctatgtacatggggaagctgaaatatt
atccttttgtctttccctgatctgaacagcattgccaccactcacttaca
atgtgcttactaagagcaacagacagagttcaatcagctggtgtttatat
ctaatactcttttaaaatttgttactttcacttagcatatatgagtgctg
cctgctgtacatacatgcaccatgtgaatgtctagtttcggtgaggacca
gaacagggtactgagtcccaagaactgtaaaaacaaattgctgtgaaaaa
caatgtggatattaagaatcaaacacaggccctctgcaagtacagttagt
gagcatatcttgagaacaatctctgaatttcacatcatgttactttatat
atacatgtggtgtgtgtgtgtgtgtgcatgtgcatgatgtgtctgggtat
atatgtatatatacacacacatgtgactgtgagtgcaattttgtatatat
gtttatgtgtttgttcaaggccagcctggtctacatattgaaagccagga
ttacaccatgccttgaaaagaaaaaaacagtaacaacaacaaaaaataac
taactgatatttcatggaaataaaattataaattaaaaatgaatacattt
ttttaaattctattctgggcatttcataagcattccataaattaagcaat
aatttcagaacttcattataataattctataatttacttttttattcttg
ctaataataaaataaaatgactactttgaaaggaatcacaaattttgtat
tcactcatttgtttattttgtctgaagaagaatgatgcagcctaaaatgc
ataggttctgaagtgttcaaagaacaacattcagggagttaactttcatc
tctccaacctggtgagttgccaagaagtaaacctctggatg
gaattcaatgtttttttccttagagtaatgggataaaagacaccaggaga
tagctatatttatcaattacaacaaggcagaaaaacataattgtctatac
catgaaagtgcataggattaactttaaaaaaaaagactttaattttaata
aacaaacaaacaatctttgtttaaaactctttctagagcaaggaaatcaa
aatctttaatggtagagctaactaaaaactatttgtgaccagaatttatg
ctaaaaatattattgaataaagtcagttgtataattaatgaactatatga
ctattaaaatataagaggaaaatatgatacaatgctatgaagtggaaatt
tctgttttttttttttttgagactcagttgtgttatgggatggttttatg
gaacctgtcttatgagaggctgttttactgaggcagaaacatgggaggat
gttttggtaagaatagatacaagtggtggttttatggaagcttcctggaa
aagggcatgtgatattttgctagagcagatgattgaggggacacatgatg
tttgcaaagggtacgaacataacccaacaggcagtggacaacactgttgt
actgattcaccttgacactttatgctggtcttcactgatgatgctatggc
actggtttgcctttctttctttgctgatcattgtttgtctcagactttgt
agaaagaaatgcaccaaagaacttcacatgatattctggctgcttcttgc
cacttctgtatggacttgggtcagtcagcagagccttgtggtttcttctg
gatcaaactgctattgcagattcgtaaatgttgtttgtgagtggattgag
ctactgctgctgattcctgtgaactgaactttctgatattctgacaatga
agatgggttatcaccccaaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_115239447_115240622
seq2: B6Ng01-185K20.b_41_1231 (reverse)

seq1  CATCCAGAGTTTTACTCCT--GCAACTCACAAGGTGGGAGAGAAGAA--G  46
      ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||| |||   
seq2  CATCCAGAGGTTTACTTCTTGGCAACTCACCAGGTTGGAGAGATGAAAGT  50

seq1  TAACT-CCTGGATGTTG-TCTTTTGACAC-TCAG-ACCTATGC-TTTTA-  90
      ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||| |||||||| ||||| 
seq2  TAACTCCCTGAATGTTGTTCTTTGAACACTTCAGAACCTATGCATTTTAG  100

seq1  GCTGCATCATTC-TCTTCAGAC-AAATAAACAAATGAGTGAATACAAAAT  138
      |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCATCATTCTTCTTCAGACAAAATAAACAAATGAGTGAATACAAAAT  150

seq1  TTGTGATTCCTTTCAAAGTAGTCATTT--ATTTATTA-TAGCAAAGGAAT  185
      |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  ||||
seq2  TTGTGATTCCTTTCAAAGTAGTCATTTTATTTTATTATTAGCAA--GAAT  198

seq1  AAAAAGTAAAATTATAGAATTA-TATAATGAAG-TCTGAAATTATTGCTA  233
      |||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  AAAAAAGTAAATTATAGAATTATTATAATGAAGTTCTGAAATTATTGCTT  248

seq1  AATTTATGGAATGCTTATGAAATGCCCAGAATAGAATTTAAAAAAATGTA  283
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATGGAATGCTTATGAAATGCCCAGAATAGAATTTAAAAAAATGTA  298

seq1  TTCATTTTTAATTTATAATTTTATTTCCATGAAATATCAGTTAGTTATTT  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTTTAATTTATAATTTTATTTCCATGAAATATCAGTTAGTTATTT  348

seq1  TTTGTTGTTGTTACTGTTTTTTTCTTTTCAAGGCATGGTGTAATCCTGGC  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGTTGTTACTGTTTTTTTCTTTTCAAGGCATGGTGTAATCCTGGC  398

seq1  TTTCAATATGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACAAACACATAAACATATATA  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAATATGTAGACCAGGCTGGCCTTGAACAAACACATAAACATATATA  448

seq1  CAAAATTGCACTCACAGTCACATGTGTGTGTATATATACATATATACCCA  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTGCACTCACAGTCACATGTGTGTGTATATATACATATATACCCA  498

seq1  GACACATCATGCACATGCACACACACACACACACCACATGTATATATAAA  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACATCATGCACATGCACACACACACACACACCACATGTATATATAAA  548

seq1  GTAACATGATGTGAAATTCAGAGATTGTTCTCAAGATATGCTCACTAACT  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACATGATGTGAAATTCAGAGATTGTTCTCAAGATATGCTCACTAACT  598

seq1  GTACTTGCAGAGGGCCTGTGTTTGATTCTTAATATCCACATTGTTTTTCA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTGCAGAGGGCCTGTGTTTGATTCTTAATATCCACATTGTTTTTCA  648

seq1  CAGCAATTTGTTTTTACAGTTCTTGGGACTCAGTACCCTGTTCTGGTCCT  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAATTTGTTTTTACAGTTCTTGGGACTCAGTACCCTGTTCTGGTCCT  698

seq1  CACCGAAACTAGACATTCACATGGTGCATGTATGTACAGCAGGCAGCACT  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGAAACTAGACATTCACATGGTGCATGTATGTACAGCAGGCAGCACT  748

seq1  CATATATGCTAAGTGAAAGTAACAAATTTTAAAAGAGTATTAGATATAAA  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATGCTAAGTGAAAGTAACAAATTTTAAAAGAGTATTAGATATAAA  798

seq1  CACCAGCTGATTGAACTCTGTCTGTTGCTCTTAGTAAGCACATTGTAAGT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGCTGATTGAACTCTGTCTGTTGCTCTTAGTAAGCACATTGTAAGT  848

seq1  GAGTGGTGGCAATGCTGTTCAGATCAGGGAAAGACAAAAGGATAATATTT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGTGGCAATGCTGTTCAGATCAGGGAAAGACAAAAGGATAATATTT  898

seq1  CAGCTTCCCCATGTACATAGAAAGGTGCATTGCTGGTGATGTTGATCTCA  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCCCCATGTACATAGAAAGGTGCATTGCTGGTGATGTTGATCTCA  948

seq1  TAGTTTGTAAAACTGAATAAAGTTTTCACAAAATTTACAAGTAGAGCTTA  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTGTAAAACTGAATAAAGTTTTCACAAAATTTACAAGTAGAGCTTA  998

seq1  TTGTTATAAACTCATTGGATATTTAAAATTCTTTCAAATAGACCAATATT  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATAAACTCATTGGATATTTAAAATTCTTTCAAATAGACCAATATT  1048

seq1  CTCTAAAGTTATTTTAAATATCAACTTTATCATCATGCCAAATATAAATA  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAAAGTTATTTTAAATATCAACTTTATCATCATGCCAAATATAAATA  1098

seq1  TTTAACACACTATTAGTTACTATTAGTTTAGACACAGTAGCTCCTTATCT  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACACACTATTAGTTACTATTAGTTTAGACACAGTAGCTCCTTATCT  1148

seq1  AGAGTCACAGTGTTTTCTAACTAGAATATGATGGAATGAATTC  1176
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCACAGTGTTTTCTAACTAGAATATGATGGAATGAATTC  1191

seq1: chr7_115050201_115051036
seq2: B6Ng01-185K20.g_69_904

seq1  GAATTCAATGTTTTTTTCCTTAGAGTAATGGGATAAAAGACACCAGGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGTTTTTTTCCTTAGAGTAATGGGATAAAAGACACCAGGAGA  50

seq1  TAGCTATATTTATCAATTACAACAAGGCAGAAAAACATAATTGTCTATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTATATTTATCAATTACAACAAGGCAGAAAAACATAATTGTCTATAC  100

seq1  CATGAAAGTGCATAGGATTAACTTTAAAAAAAAAGACTTTAATTTTAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAAGTGCATAGGATTAACTTTAAAAAAAAAGACTTTAATTTTAATA  150

seq1  AACAAACAAACAATCTTTGTTTAAAACTCTTTCTAGAGCAAGGAAATCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACAAACAATCTTTGTTTAAAACTCTTTCTAGAGCAAGGAAATCAA  200

seq1  AATCTTTAATGGTAGAGCTAACTAAAAACTATTTGTGACCAGAATTTATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTAATGGTAGAGCTAACTAAAAACTATTTGTGACCAGAATTTATG  250

seq1  CTAAAAATATTATTGAATAAAGTCAGTTGTATAATTAATGAACTATATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAATATTATTGAATAAAGTCAGTTGTATAATTAATGAACTATATGA  300

seq1  CTATTAAAATATAAGAGGAAAATATGATACAATGCTATGAAGTGGAAATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAAAATATAAGAGGAAAATATGATACAATGCTATGAAGTGGAAATT  350

seq1  TCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGACTCAGTTGTGTTATGGGATGGTTTTATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTTTTTTTTTTTTGAGACTCAGTTGTGTTATGGGATGGTTTTATG  400

seq1  GAACCTGTCTTATGAGAGGCTGTTTTACTGAGGCAGAAACATGGGAGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGTCTTATGAGAGGCTGTTTTACTGAGGCAGAAACATGGGAGGAT  450

seq1  GTTTTGGTAAGAATAGATACAAGTGGTGGTTTTATGGAAGCTTCCTGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGGTAAGAATAGATACAAGTGGTGGTTTTATGGAAGCTTCCTGGAA  500

seq1  AAGGGCATGTGATATTTTGCTAGAGCAGATGATTGAGGGGACACATGATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCATGTGATATTTTGCTAGAGCAGATGATTGAGGGGACACATGATG  550

seq1  TTTGCAAAGGGTACGAACATAACCCAACAGGCAGTGGACAACACTGTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAAAGGGTACGAACATAACCCAACAGGCAGTGGACAACACTGTTGT  600

seq1  ACTGATTCACCTTGACACTTTATGCTGGTCTTCACTGATGATGCTATGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATTCACCTTGACACTTTATGCTGGTCTTCACTGATGATGCTATGGC  650

seq1  ACTGGTTTGCCTTTCTTTCTTTGCTGATCATTGTTTGTCTCAGACTTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGTTTGCCTTTCTTTCTTTGCTGATCATTGTTTGTCTCAGACTTTGT  700

seq1  AGAAAGAAATGCACCAAAGAACTTCACATGATATTCTGGCTGCTTCTTGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAAATGCACCAAAGAACTTCACATGATATTCTGGCTGCTTCTTGC  750

seq1  CACTTCTGTATGGACTTGGGTCAGTCAGCAGAGCCTTGTGGTTTCTTCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTGTATGGACTTGGGTCAGTCAGCAGAGCCTTGTGGTTTCTTCTG  800

seq1  GATCAAACTGCTATTGCAGATTCGTAAATGTTGTTT  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAACTGCTATTGCAGATTCGTAAATGTTGTTT  836