BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185O09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 25,595,074 - 25,714,050
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG545936, LOC100043712, Lypd4, Dmrtc2, Rps19, Cd79a, Arhgef1, EG232974
Upstream geneEG622222, LOC546943, V1rd12, V1rd13, V1rd17, LOC100043121, V1rd16, LOC384575, V1rd20, V1rd18, V1rd15, EG622446, Zfp180, Zfp112, Zfp235, Zfp114, Zfp111, Zfp109, Zfp108, Zfp93, LOC100043690, Zfp61, LOC100043691, Zfp94, 1700008P20Rik, Lypd5, Kcnn4, 1500002O20Rik, Irgc1, Plaur, Cadm4, Zfp428, Irgq, 2310033E01Rik, Xrcc1, Zfp575, Ethe1, LOC100043138, EG232970, Lypd3, LOC100043706, Tex101, Gm1096, BC049730, EG210155, Cd177, Ceacam10
Downstream geneRabac1, Atp1a3, Grik5, Zfp574, Pou2f2, Dedd2, Zfp526, Gsk3a, 9130221H12Rik, Erf, Cic, Pafah1b3, EG623131, Tmem145, Megf8, Cnfn, Lipe, BC024561, LOC434148, Ceacam1, Ceacam2, LOC100043722, EG632778, 2310004L02Rik, B3gnt8, Bckdha, Exosc5, A830041P22Rik, BC028440, Tgfb1, Ccdc97, Hnrpul1, Axl, LOC667950, Cyp2s1, LOC100043732, EG623475, Cyp2b10
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185O09.bB6Ng01-185O09.g
ACCGA010886GA010887
length674687
definitionB6Ng01-185O09.b B6Ng01-185O09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(25,713,377 - 25,714,050)(25,595,074 - 25,595,758)
sequence
gaattccagtggaccccagtacttgtgagtggaaactgggagggggtggc
gatgaggaacctgaggaacctgagcccggctactgcctcacccccccttg
cccctccccagtaccccatcttctctcccacagttactactacaacaagc
gcattctccacaagaccaaagggaagaggttcacctacaagttcaacttc
agcaaagttgtacttgttaattacccactgctggatgtggctgctgctgc
cacaggctcccctctcttgctgacccctgggccctttgctggggcacctg
ggccagatgctccacccctgacccctgaggtgagtctggatactgcaatc
ttagtgctggaagaggggtgttttgtgtcctctccagagggggctaagca
gtaccgcctccctacctccctctccagaccctgcagaacctgttctctgc
cccacgcctaggagagccaggggctcggacacccctattcaccccagaga
cggataaactacgtctggacagccccttcccattcctgggttctggtaag
gggctgggggctgggggaggggatcagcacacgtggagtgtgtactccag
gagataagatagagatgtgtctacagagtacgtgtgggtacatgtgttta
aagcccagggaggggatgcggcaa
gaattcactacatagaccaggctggcctcaaactcacagagagctgcttg
ccttggcctcccatgttctggaatgcaccaccatgctcactaaggccaat
tacgtctctgtgaatggttctctgtgatctctgggtgttgagttgttaat
tctatgaaacatgtaaggactgtcgtacctggatggcacccacctccctt
gtgttgtgtccccacattggggtttgagttttatcaaagtagtgtgggga
gtggattgtaaggatactggataatggtggaaggaacccgaacaagctga
gtttatcaatatgggccagtgagtggagattcaagctttaatatggttaa
agttttaaaaaaccaaaataccaatttttaaaagtgtccaaattttgact
agctagctgaagcacttgtctgaaaaagagctggagatgcctggtatccc
ttgatttgatgttgaggggattttaaggctggggggaattgcagtgctaa
agtgggtccactttataagcctccacagtggaaatgccggaagtcactag
tttctgtgagatctaagatggcgagcagcaccagctcagatgaagagctt
ctgctgctctttcccctctgcagacctcggggtgagaggttgccgcccaa
tcggacgctttgcacgagatgaaagtgattggacccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_25713377_25714050
seq2: B6Ng01-185O09.b_43_716 (reverse)

seq1  TTGCCGCATCCCCTCCCTGGCTTTTAAACACATGTACCCACACGTACTCT  50
      ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCGCATCCCCTCCCTGGGCTTTAAACACATGTACCCACACGTACTCT  50

seq1  GTAGACACATCTCTATCTTATCTCCTGGAGTACACACTCCACGTGTGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACACATCTCTATCTTATCTCCTGGAGTACACACTCCACGTGTGCTG  100

seq1  ATCCCCTCCCCCAGCCCCCAGCCCCTTACCAGAACCCAGGAATGGGAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCTCCCCCAGCCCCCAGCCCCTTACCAGAACCCAGGAATGGGAAGG  150

seq1  GGCTGTCCAGACGTAGTTTATCCGTCTCTGGGGTGAATAGGGGTGTCCGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCCAGACGTAGTTTATCCGTCTCTGGGGTGAATAGGGGTGTCCGA  200

seq1  GCCCCTGGCTCTCCTAGGCGTGGGGCAGAGAACAGGTTCTGCAGGGTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTGGCTCTCCTAGGCGTGGGGCAGAGAACAGGTTCTGCAGGGTCTG  250

seq1  GAGAGGGAGGTAGGGAGGCGGTACTGCTTAGCCCCCTCTGGAGAGGACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGGAGGTAGGGAGGCGGTACTGCTTAGCCCCCTCTGGAGAGGACAC  300

seq1  AAAACACCCCTCTTCCAGCACTAAGATTGCAGTATCCAGACTCACCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACCCCTCTTCCAGCACTAAGATTGCAGTATCCAGACTCACCTCAG  350

seq1  GGGTCAGGGGTGGAGCATCTGGCCCAGGTGCCCCAGCAAAGGGCCCAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCAGGGGTGGAGCATCTGGCCCAGGTGCCCCAGCAAAGGGCCCAGGG  400

seq1  GTCAGCAAGAGAGGGGAGCCTGTGGCAGCAGCAGCCACATCCAGCAGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCAAGAGAGGGGAGCCTGTGGCAGCAGCAGCCACATCCAGCAGTGG  450

seq1  GTAATTAACAAGTACAACTTTGCTGAAGTTGAACTTGTAGGTGAACCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATTAACAAGTACAACTTTGCTGAAGTTGAACTTGTAGGTGAACCTCT  500

seq1  TCCCTTTGGTCTTGTGGAGAATGCGCTTGTTGTAGTAGTAACTGTGGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTGGTCTTGTGGAGAATGCGCTTGTTGTAGTAGTAACTGTGGGAG  550

seq1  AGAAGATGGGGTACTGGGGAGGGGCAAGGGGGGGTGAGGCAGTAGCCGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGATGGGGTACTGGGGAGGGGCAAGGGGGGGTGAGGCAGTAGCCGGG  600

seq1  CTCAGGTTCCTCAGGTTCCTCATCGCCACCCCCTCCCAGTTTCCACTCAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGTTCCTCAGGTTCCTCATCGCCACCCCCTCCCAGTTTCCACTCAC  650

seq1  AAGTACTGGGGTCCACTGGAATTC  674
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACTGGGGTCCACTGGAATTC  674

seq1: chr7_25595074_25595758
seq2: B6Ng01-185O09.g_69_755

seq1  GAATTCACTACATAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAGAGCTGCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTACATAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCACAGAGAGCTGCTTG  50

seq1  CCTTGGCCTCCCATGTTCTGGAATGCACCACCATGCTCACTAAGGCCAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCCTCCCATGTTCTGGAATGCACCACCATGCTCACTAAGGCCAAT  100

seq1  TACGTCTCTGTGAATGGTTCTCTGTGATCTCTGGGTGTTGAGTTGTTAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTCTCTGTGAATGGTTCTCTGTGATCTCTGGGTGTTGAGTTGTTAAT  150

seq1  TCTATGAAACATGTAAGGACTGTCGTACCTGGATGGCACCCACCTCCCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGAAACATGTAAGGACTGTCGTACCTGGATGGCACCCACCTCCCTT  200

seq1  GTGTTGTGTCCCCACATTGGGGTTTGAGTTTTATCAAAGTAGTGTGGGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGTGTCCCCACATTGGGGTTTGAGTTTTATCAAAGTAGTGTGGGGA  250

seq1  GTGGATTGTAAGGATACTGGATAATGGTGGAAGGAACCCGAACAAGCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGATTGTAAGGATACTGGATAATGGTGGAAGGAACCCGAACAAGCTGA  300

seq1  GTTTATCAATATGGGCCAGTGAGTGGAGATTCAAGCTTTAATATGGTTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCAATATGGGCCAGTGAGTGGAGATTCAAGCTTTAATATGGTTAA  350

seq1  AGTTTTAAAAAACCAAAATACCAATTTTTAAAAGTGTCCAAATTTTGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTAAAAAACCAAAATACCAATTTTTAAAAGTGTCCAAATTTTGACT  400

seq1  AGCTAGCTGAAGCACTTGTCTGAAAAAGAGCTGGAGATGCCTGGTATCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGCTGAAGCACTTGTCTGAAAAAGAGCTGGAGATGCCTGGTATCCC  450

seq1  TTGATTTGATGTTGAGGGGATTTTAAGGCTGGGGGGAATTGCAGTGCTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTTGATGTTGAGGGGATTTTAAGGCTGGGGGGAATTGCAGTGCTAA  500

seq1  AGTGGGTCCACTTTATAAGCCTCCACAGTGGAAATGCCGGAAGTCACTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTCCACTTTATAAGCCTCCACAGTGGAAATGCCGGAAGTCACTAG  550

seq1  -TTCTGTGAGATCTAAGATGGCGAGCAGCACCAGCTCAGATGAAGAGC-T  598
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTCTGTGAGATCTAAGATGGCGAGCAGCACCAGCTCAGATGAAGAGCTT  600

seq1  CTGCTGCTCTTTCCCCTCTGCAGACCTCGGGGTGAGAGGTTGCCGCCCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGCTCTTTCCCCTCTGCAGACCTCGGGGTGAGAGGTTGCCGCCCAA  650

seq1  TCGGACGCATTGCACGAGATGAGAGTGACTGGACCCC  685
      |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  TCGGACGCTTTGCACGAGATGAAAGTGATTGGACCCC  687