BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186C03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 143,476,260 - 143,594,372
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFoxi2, Clrn3, Ptpre, Mki67, LOC668764
Downstream geneLOC546009, EG621677, EG668771, Mgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186C03.bB6Ng01-186C03.g
ACCGA011057GA011058
length1,12166
definitionB6Ng01-186C03.b B6Ng01-186C03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(143,476,260 - 143,477,392)(143,594,307 - 143,594,372)
sequence
gaattcacagcacacagttattatcttttggcccatgttgctccctcatt
tctagtacccttttctttttgttagagcttttattgctatgccaaaaata
ccatgcccccaaagcaagttgggtgtgaaagggtgtgttgggcttacact
tacgtccacggcactgtgcatcgttgaaggacaggaaccaaatcaaggca
tggttctgggggcagccaggagctgatgcaggagccatgaacccagaacc
actcacccaggaatgcacctcccacaatgggctgatccctccccaattga
tcagtaattgagaaaaaaccttacagctgtacctcatgtggcatttcctc
aattgtgtgtccttcctctctgatgactctagcttgtgtcaagttgacac
acaaaaccagccagtataccccactacaaagtgggattaacattccagcc
ccatcttatctgcattgatgatatttgcctagttctgtcttactttatac
tcatatttttagtacgttctttttatccatgtactttagataggaatcta
tgacaattgggttggtatgtgtcatgtatgtactttatggtctttaacat
aatgaactaagtatttttttaatgacaataatgtgcctcaagtgatcata
gcacacggctgaactgtccaaggtcagccaatggattgaccatttctaaa
tatgtgttcaaaaacaaggttgatgtctatcatacactactacaaagaca
agcatacacaccctaccatacataccctacatacacaccctaccaccacc
gccaccaaacaaccaaccaaacaaacaaataaaaccactacaaacaaata
cgacccaacctagcaataagaacaaaatacttccacactcatttcatgtc
cccagtgcccaggtgcccaggaaagcaatgcctacttgaccaacaaggga
taagaggcaatttctggtcttttgacatcagtcattgttccttgtgagta
cactcatgctagcaagggaatttgagtgagaacattgggttaccacaggc
tgatgtatgaatgatagtcagagtcaattctcatacattgatttatcatc
ttagatccacatagtgagtgg
agcactgagcctgcatttctcaaggagtgccaagtttgcctggatagcgg
ggtgggggggtggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_143476260_143477392
seq2: B6Ng01-186C03.b_47_1167

seq1  GAATTCACAGCACACAGTTATTATCTTTTGGCCCATGTTGCTCCCTCATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGCACACAGTTATTATCTTTTGGCCCATGTTGCTCCCTCATT  50

seq1  TCTAGTACCCTTTTCTTTTTGTTAGAGCTTTTATTGCTATGCCAAAAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTACCCTTTTCTTTTTGTTAGAGCTTTTATTGCTATGCCAAAAATA  100

seq1  CCATGCCCCCAAAGCAAGTTGGGTGTGAAAGGGTGTGTTGGGCTTACACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCCCCCAAAGCAAGTTGGGTGTGAAAGGGTGTGTTGGGCTTACACT  150

seq1  TACGTCCACGGCACTGTGCATCGTTGAAGGACAGGAACCAAATCAAGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTCCACGGCACTGTGCATCGTTGAAGGACAGGAACCAAATCAAGGCA  200

seq1  TGGTTCTGGGGGCAGCCAGGAGCTGATGCAGGAGCCATGAACCCAGAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCTGGGGGCAGCCAGGAGCTGATGCAGGAGCCATGAACCCAGAACC  250

seq1  ACTCACCCAGGAATGCACCTCCCACAATGGGCTGATCCCTCCCCAATTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACCCAGGAATGCACCTCCCACAATGGGCTGATCCCTCCCCAATTGA  300

seq1  TCAGTAATTGAGAAAAAACCTTACAGCTGTACCTCATGTGGCATTTCCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAATTGAGAAAAAACCTTACAGCTGTACCTCATGTGGCATTTCCTC  350

seq1  AATTGTGTGTCCTTCCTCTCTGATGACTCTAGCTTGTGTCAAGTTGACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGTGTGTCCTTCCTCTCTGATGACTCTAGCTTGTGTCAAGTTGACAC  400

seq1  ACAAAACCAGCCAGTATACCCCACTACAAAGTGGGATTAACATTCCAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACCAGCCAGTATACCCCACTACAAAGTGGGATTAACATTCCAGCC  450

seq1  CCATCTTATCTGCATTGATGATATTTGCCTAGTTCTGTCTTACTTTATAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTTATCTGCATTGATGATATTTGCCTAGTTCTGTCTTACTTTATAC  500

seq1  TCATATTTTTAGTACGTTCTTTTTATCCATGTACTTTAGATAGGAATCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATTTTTAGTACGTTCTTTTTATCCATGTACTTTAGATAGGAATCTA  550

seq1  TGACAATTGGGTTGGTATGTGTCATGTATGTACTTTATGGTCTTTAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATTGGGTTGGTATGTGTCATGTATGTACTTTATGGTCTTTAACAT  600

seq1  AATGAACTAAGTATTTTTTTAATGACAATAATGTGCCTCAAGTGATCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACTAAGTATTTTTTTAATGACAATAATGTGCCTCAAGTGATCATA  650

seq1  GCACACGGCTGAACTGTCCAAGGTCAGCCAATGGATTGACCATTTCTAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACGGCTGAACTGTCCAAGGTCAGCCAATGGATTGACCATTTCTAAA  700

seq1  TATGTGTTCAAAAACAAGGTTGATGTCTATCATACACTACTACAAAGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTTCAAAAACAAGGTTGATGTCTATCATACACTACTACAAAGACA  750

seq1  AGCATACACACCCTACCATACATACCCTACATACACACCCTACCACCACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATACACACCCTACCATACATACCCTACATACACACCCTACCACCACC  800

seq1  GCCACCAAACAACCAACCAAACAAACAAATAAAACCACTACAAACAAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCAAACAACCAACCAAACAAACAAATAAAACCACTACAAACAAATA  850

seq1  CGACCCAACCTAGCAATAAGAACAAAATACTTCCACACTCATTTCATGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACCCAACCTAGCAATAAGAACAAAATACTTCCACACTCATTTCATGTC  900

seq1  CCCAGTGCCCAGGTGCCCAGGAAAGCAATGCCTACTTGACCAACAAGGGG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCCAGTGCCCAGGTGCCCAGGAAAGCAATGCCTACTTGACCAACAA-GGG  949

seq1  ATAAGAGGCAATTTCTGGTCTTTTGACATCAGTCATTTGTTCCTTGTGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATAAGAGGCAATTTCTGGTCTTTTGACATCAGTCA-TTGTTCCTTGTGAG  998

seq1  TACACTCATGCTAGCAAGGGAATTTGAGTGGAGAACATTTGGTTACCACA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TACACTCATGCTAGCAAGGGAATTTGAGT-GAGAACATTGGGTTACCACA  1047

seq1  GGCTGATGTATGAATGATAGTTCAGAGTTCCATTCTTCATACAATGATTT  1100
      |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||| ||| ||
seq2  GGCTGATGTATGAATGATAG-TCAGAG-TCAATTC-TCATACATTGA-TT  1093

seq1  TATCATCTTTAAGATCCCAACATAGTGGAGTGG  1133
      |||||||||  ||||||  ||||||| ||||||
seq2  TATCATCTT--AGATCC--ACATAGT-GAGTGG  1121

seq1: chr7_143594307_143594372
seq2: B6Ng01-186C03.g_70_135 (reverse)

seq1  CCCCCACCCCCCCACCCCGCTATCCAGGCAAACTTGGCACTCCTTGAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCCCCCCACCCCGCTATCCAGGCAAACTTGGCACTCCTTGAGAA  50

seq1  ATGCAGGCTCAGTGCT  66
      ||||||||||||||||
seq2  ATGCAGGCTCAGTGCT  66