BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186D13
Chromosome7 (Build37)
Map Location 26,155,697 - 26,269,462
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLipe, BC024561, LOC434148, Ceacam1
Upstream geneKcnn4, 1500002O20Rik, Irgc1, Plaur, Cadm4, Zfp428, Irgq, 2310033E01Rik, Xrcc1, Zfp575, Ethe1, LOC100043138, EG232970, Lypd3, LOC100043706, Tex101, Gm1096, BC049730, EG210155, Cd177, Ceacam10, EG545936, LOC100043712, Lypd4, Dmrtc2, Rps19, Cd79a, Arhgef1, EG232974, Rabac1, Atp1a3, Grik5, Zfp574, Pou2f2, Dedd2, Zfp526, Gsk3a, 9130221H12Rik, Erf, Cic, Pafah1b3, EG623131, Tmem145, Megf8, Cnfn
Downstream geneCeacam2, LOC100043722, EG632778, 2310004L02Rik, B3gnt8, Bckdha, Exosc5, A830041P22Rik, BC028440, Tgfb1, Ccdc97, Hnrpul1, Axl, LOC667950, Cyp2s1, LOC100043732, EG623475, Cyp2b10, LOC232993, EG667957, BC026762, Cyp2b13, EG668047, LOC623532, Cyp2b9, LOC667968, Cyp2a4, Nlrp9c, LOC100043195, Nlrp4a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186D13.bB6Ng01-186D13.g
ACCGA011125GA011126
length1,1681,055
definitionB6Ng01-186D13.b B6Ng01-186D13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,268,289 - 26,269,462)(26,155,697 - 26,156,732)
sequence
gaattccttcttaccctagttgctttgctcgtggtgtttatcacagcaat
agaaagcaaactaagtcacctagtttccaacagtcccaatatctacagac
atctcccacaagcctgctctaaaattgtcttcttctcatgtctctgagga
tattactttgcctcctggccatcactcaccagaagagaccaggtgattat
aggggagtcacctagacagatgacaaagctgtcccagaaaggtcaagagg
acatgaacagaccccagacacagctcagcccacacaggcaggtagcatct
ctccctgagactattcataggatgatgaggtccacattctctcttaggtc
acacaagtcccatcctcctgcacatctaggacacaaatcttctaagataa
ctgttcctgggcttccattcctggatcagaacctaactggtgacaccagt
gacaatggttccatcccctccccagtcatcactccactggcccctttcca
gacctcacagacaatctctgtcactttcctgctgggagtaaatcccactt
cccagagcattgagattgctcaatgggcagactgggctcagcagggtttc
tgtatcacaagagggaataaaccacagggtttaggaaggacaggggctcc
ctctgatgctggcagggccagggccaggacatggcagaggttagccctgg
ggtaacctggtctcgaaaatcaagtgatcctgattaacattcctactcaa
agtgtgttctagaggactgggccatgaagacagaaagggcagaaaggact
ggaaggccacactgagagcagaagaggttagggactcagcccgtgtgtct
ctgggtgctgctgctgcctgtctgaaagttcagcttcaaggaaggacaag
aggcctgggcaccagagcagcaaaggcacgggaagcagtgcgggagctga
agcgcttctccacagagagaggacagagcaggcagaagagaccatgctgt
tcaacctcatggtgcaatagggtatgtcttaagcagggagtcctgctcac
tagtgtccacttgagaaactcttcctggtgtgcgccccagcgcatacatc
acacatggactctctaggagccctttagtgttcccacttcaccatgcagc
aggttggcagcagtgact
gaattcctcagggattaagggactgggtcttgggtacttgattcaccaaa
gtttcccctcaacaggcctgacagggttgtaggtgactcagtaaggaagc
ggcattagagttgggtggggttcctaccatgggtgtcacccccaaaatat
aggaggcaccagaaaatcggggtgtcaactctagaagaggttgtgtcacc
atgccacagtgtgtgggtatgaggggacaacaaatggatcacctgccagc
ctgtgatctggacggcctatgaccacagctttctccacatatccaacact
ctgtctcctggcaccacccaaatggctgactggctgtggccccagactta
tggtagtgagcatcattttgcttgcgcgtgtctgtcttttggggtgatgc
cgacatgcatgggtggcattgcccacttcagctctgagtccccatccact
tatctttgcatctttattcccccccacccccgcttttgttttgtttttga
gacaggctctcacgtatccaaggctggtctctgactcactgtgtaactga
ggatgaatttgaacattttgccttcatctccaagtactgagatcatacaa
acagaactacagaacctggcgctggggatccaacccagggccttgtctat
gcaaggcaagcactcggcccagccgcagcatatccaactagcttccttcc
tcccatcttattattattaatttttatttttgaagctgggttttactctg
tatgtagttaggctggcctcaaactttagggtgatcctcctgcctcagcc
acctgagttctttggattgcaaacatgagctgtcatacccctcactttcc
ttttcctcatctttgcaagcccatttttgacatgtgtgtgtttggtgtcc
tcatctcttggtctccctccttcccagacccccgtgcctgggtatcctta
atcctgaggtcttctgtcctcacatccactgttactcctccccatctcct
gcccctatccaagccttgcctcctcttagaaaatggtctcttcccccata
ccact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_26268289_26269462
seq2: B6Ng01-186D13.b_45_1212 (reverse)

seq1  AGTCACTGCTTCCCACCCTGCTGCATGTGTGAAGTGG--ACACTTAAGGG  48
      ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||
seq2  AGTCACTGC-TGCCAACCTGCTGCATG-GTGAAGTGGGAACACTAAAGGG  48

seq1  CTCCTTAGAGAGTCCATTGTGTTGGATGGTATTGCGCTGGGGCGCACA-C  97
      |||| ||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||| |
seq2  CTCC-TAGAGAGTCCA-TGTGT--GAT-GTA-TGCGCTGGGGCGCACACC  92

seq1  AGGAAGGAGTTTTCCTCAAGTGGACACTAGTGAGCAGGACTCCCTGCTTA  147
      ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAA-GAGTTT--CTCAAGTGGACACTAGTGAGCAGGACTCCCTGCTTA  139

seq1  AGGACATTACCCTATTGCACCATGAGGTTGAACAGCATGGTCTCTTCTGC  197
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GACA-TACCCTATTGCACCATGAGGTTGAACAGCATGGTCTCTTCTGC  187

seq1  CTGCTCTGTCCTCTCTCTGTGGAGAAGCGCTTCAGCTCCCGCACTGCTT-  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTGCTCTGTCCTCTCTCTGTGGAGAAGCGCTTCAGCTCCCGCACTGCTTC  237

seq1  CCGTGCC-TTGCTGCTCTGGTG-CCAGGCCTCTTGTCCTTCCTTGAAGCT  294
      ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGCCTTTGCTGCTCTGGTGCCCAGGCCTCTTGTCCTTCCTTGAAGCT  287

seq1  GAACTTTCAGACAGGCAGCAGCAGCACCCAGAGACACACGGGCTGAGTCC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTTTCAGACAGGCAGCAGCAGCACCCAGAGACACACGGGCTGAGTCC  337

seq1  CTAACCTCTTCTGCTCTCAGTGTGGCCTTCCAGTCCTTTCTGCCC-TTCT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTAACCTCTTCTGCTCTCAGTGTGGCCTTCCAGTCCTTTCTGCCCTTTCT  387

seq1  GTCTTCATGGCCCAGTCCTCTAGAACACACTTTGAGTAGGAATGTTAATC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCATGGCCCAGTCCTCTAGAACACACTTTGAGTAGGAATGTTAATC  437

seq1  AGGATCACTTGATTTTCGAGACCAGGTTACCCCAGGGCTAACCTCTGCCA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCACTTGATTTTCGAGACCAGGTTACCCCAGGGCTAACCTCTGCCA  487

seq1  TGTCCTGGCCCTGGCCCTGCCAGCATCAGAGGGAGCCCCTGTCCTTCCTA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTGGCCCTGGCCCTGCCAGCATCAGAGGGAGCCCCTGTCCTTCCTA  537

seq1  AACCCTGTGGTTTATTCCCTCTTGTGATACAGAAACCCTGCTGAGCCCAG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTGTGGTTTATTCCCTCTTGTGATACAGAAACCCTGCTGAGCCCAG  587

seq1  TCTGCCCATTGAGCAATCTCAATGCTCTGGGAAGTGGGATTTACTCCCAG  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCATTGAGCAATCTCAATGCTCTGGGAAGTGGGATTTACTCCCAG  637

seq1  CAGGAAAGTGACAGAGATTGTCTGTGAGGTCTGGAAAGGGGCCAGTGGAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAAGTGACAGAGATTGTCTGTGAGGTCTGGAAAGGGGCCAGTGGAG  687

seq1  TGATGACTGGGGAGGGGATGGAACCATTGTCACTGGTGTCACCAGTTAGG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGACTGGGGAGGGGATGGAACCATTGTCACTGGTGTCACCAGTTAGG  737

seq1  TTCTGATCCAGGAATGGAAGCCCAGGAACAGTTATCTTAGAAGATTTGTG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGATCCAGGAATGGAAGCCCAGGAACAGTTATCTTAGAAGATTTGTG  787

seq1  TCCTAGATGTGCAGGAGGATGGGACTTGTGTGACCTAAGAGAGAATGTGG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGATGTGCAGGAGGATGGGACTTGTGTGACCTAAGAGAGAATGTGG  837

seq1  ACCTCATCATCCTATGAATAGTCTCAGGGAGAGATGCTACCTGCCTGTGT  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCATCATCCTATGAATAGTCTCAGGGAGAGATGCTACCTGCCTGTGT  887

seq1  GGGCTGAGCTGTGTCTGGGGTCTGTTCATGTCCTCTTGACCTTTCTGGGA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGAGCTGTGTCTGGGGTCTGTTCATGTCCTCTTGACCTTTCTGGGA  937

seq1  CAGCTTTGTCATCTGTCTAGGTGACTCCCCTATAATCACCTGGTCTCTTC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTGTCATCTGTCTAGGTGACTCCCCTATAATCACCTGGTCTCTTC  987

seq1  TGGTGAGTGATGGCCAGGAGGCAAAGTAATATCCTCAGAGACATGAGAAG  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGAGTGATGGCCAGGAGGCAAAGTAATATCCTCAGAGACATGAGAAG  1037

seq1  AAGACAATTTTAGAGCAGGCTTGTGGGAGATGTCTGTAGATATTGGGACT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAATTTTAGAGCAGGCTTGTGGGAGATGTCTGTAGATATTGGGACT  1087

seq1  GTTGGAAACTAGGTGACTTAGTTTGCTTTCTATTGCTGTGATAAACACCA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAAACTAGGTGACTTAGTTTGCTTTCTATTGCTGTGATAAACACCA  1137

seq1  CGAGCAAAGCAACTAGGGTAAGAAGGAATTC  1174
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCAAAGCAACTAGGGTAAGAAGGAATTC  1168

seq1: chr7_26155697_26156732
seq2: B6Ng01-186D13.g_65_1119

seq1  GAATTCCTCAGGGATTAAGGGACTGGGTCTTGGGTACTTGATTCACCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAGGGATTAAGGGACTGGGTCTTGGGTACTTGATTCACCAAA  50

seq1  GTTTCCCCTCAACAGGCCTGACAGGGTTGTAGGTGACTCAGTAAGGAAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCCCTCAACAGGCCTGACAGGGTTGTAGGTGACTCAGTAAGGAAGC  100

seq1  GGCATTAGAGTTGGGTGGGGTTCCTACCATGGGTGTCACCCCCAAAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATTAGAGTTGGGTGGGGTTCCTACCATGGGTGTCACCCCCAAAATAT  150

seq1  AGGAGGCACCAGAAAATCGGGGTGTCAACTCTAGAAGAGGTTGTGTCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGCACCAGAAAATCGGGGTGTCAACTCTAGAAGAGGTTGTGTCACC  200

seq1  ATGCCACAGTGTGTGGGTATGAGGGGACAACAAATGGATCACCTGCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCACAGTGTGTGGGTATGAGGGGACAACAAATGGATCACCTGCCAGC  250

seq1  CTGTGATCTGGACGGCCTATGACCACAGCTTTCTCCACATATCCAACACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATCTGGACGGCCTATGACCACAGCTTTCTCCACATATCCAACACT  300

seq1  CTGTCTCCTGGCACCACCCAAATGGCTGACTGGCTGTGGCCCCAGACTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCCTGGCACCACCCAAATGGCTGACTGGCTGTGGCCCCAGACTTA  350

seq1  TGGTAGTGAGCATCATTTTGCTTGCGCGTGTCTGTCTTTTGGGGTGATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGTGAGCATCATTTTGCTTGCGCGTGTCTGTCTTTTGGGGTGATGC  400

seq1  CGACATGCATGGGTGGCATTGCCCACTTCAGCTCTGAGTCCCCATCCACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACATGCATGGGTGGCATTGCCCACTTCAGCTCTGAGTCCCCATCCACT  450

seq1  TATCTTTGCATCTTTATTCCCCCCCACCCCCGCTTTTGTTTTGTTTTTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTGCATCTTTATTCCCCCCCACCCCCGCTTTTGTTTTGTTTTTGA  500

seq1  GACAGGCTCTCACGTATCCAAGGCTGGTCTCTGACTCACTGTGTAACTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGCTCTCACGTATCCAAGGCTGGTCTCTGACTCACTGTGTAACTGA  550

seq1  GGATGAATTTGAACATTTTGCCTTCATCTCCAAGTACTGAGATCATACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGAATTTGAACATTTTGCCTTCATCTCCAAGTACTGAGATCATACAA  600

seq1  ACAGAACTACAGAACCTGGCGCTGGGGATCCAACCCAGGGCCTTGTCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAACTACAGAACCTGGCGCTGGGGATCCAACCCAGGGCCTTGTCTAT  650

seq1  GCAAGGCAAGCACTCGGCCCAGCCGCAGCATATCCAACTAGCTTCCTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGCAAGCACTCGGCCCAGCCGCAGCATATCCAACTAGCTTCCTTCC  700

seq1  TCCCATCTTATTATTATTAATTTTTA-TTTTGAAGCTGGGTTTTACTCTG  749
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATCTTATTATTATTAATTTTTATTTTTGAAGCTGGGTTTTACTCTG  750

seq1  TATGTAGTTAGGCTGGCCTCAAAC-TTAGGGTGATCCTCCTGCCTCAGCC  798
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGTTAGGCTGGCCTCAAACTTTAGGGTGATCCTCCTGCCTCAGCC  800

seq1  ACCTGAGTTC-TTGGATTGCAAACATGAGCTGTCATACCCCTCACTT--C  845
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |
seq2  ACCTGAGTTCTTTGGATTGCAAACATGAGCTGTCATACCCCTCACTTTCC  850

seq1  CTTTCCTCATCTTTGCAAGCCCA-TTTTGACATGTGTGTGTTT-GTGTCC  893
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTTTCCTCATCTTTGCAAGCCCATTTTTGACATGTGTGTGTTTGGTGTCC  900

seq1  TCATCTCTTGGTCTCCCTCC-TCCCAGA-CCCCGTGCCTGGGTATCCTT-  940
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  TCATCTCTTGGTCTCCCTCCTTCCCAGACCCCCGTGCCTGGGTATCCTTA  950

seq1  ATCCTGAGGTC-TCTGT-CTCACAT-CACTGTTTCT-CTCCCCATCT-CT  985
      ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||||| ||
seq2  ATCCTGAGGTCTTCTGTCCTCACATCCACTGTTACTCCTCCCCATCTCCT  1000

seq1  GCCCTTATCCAAGCC-TGC--TCTCTTAAGATATGGCCCCTT-CCCCATA  1031
      |||| |||||||||| |||   ||||||  | |||| | ||| |||||||
seq2  GCCCCTATCCAAGCCTTGCCTCCTCTTAGAAAATGGTCTCTTCCCCCATA  1050

seq1  CCACT  1036
      |||||
seq2  CCACT  1055