BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-187L10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 85,207,352 - 85,227,116
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneA330068G13Rik, Ntrk3, Mrpl46, Mrps11, Det1, Isg20l1, Isg20, Acan
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-187L10.bB6Ng01-187L10.g
ACCGA012214GA012215
length6361,139
definitionB6Ng01-187L10.b B6Ng01-187L10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,207,352 - 85,207,987)(85,225,958 - 85,227,116)
sequence
gaattcttccttttcacatacaaatggcaaaatactatgtgctccccact
gaagcttgcatattttaactaagtgaaatttacaagctcccatgtggtgg
caggatgtgagtgcactatgaatggagacatacctgatgaacacatatac
cacaggttaaagttagagttagggttatgatcggggttaggggttagggg
ctaggggctagggttcagggagtttccattgcctggttatcacaaaacaa
tgaagatatcagttattgtatgtgcctgtatatgcagtattgctgcaata
ggtaaattctaaaggcatagtggccttttaaatcaaaaggctgtccaatg
ataattctccatgaaattcagatcatatcaaacttacttgagacctcttc
ttccagtcttgactccaagattgtcctataccaaagctaaaactctacat
ataggacttctttattgccagcctatagtgaaatggggattttagcagca
acagagggcatgcctgtcactatttcttaagcaaggaaaggcaccttata
tctgctcagtctgttgacgagaactcaatcacatgatgtcatcctgacca
caagtatgtttaggaatatattcttgtatagccttc
gaattctttcccaggaagcattcatccattttcctccctggaattgaagg
aaggctggagcagttactggctggctcgggagatggacatggactagatg
gagtgagaataacttgggcaaccaaacacagatggaaccagactaaggct
gaaggcagagtcatactatggagaccaggtaagtcagtgaagtatgtctg
ctgttggacccgagccagacaaagttcaaagacacagtaaggcaggaagt
atggtaacggtgagtcacagcaacccagacttctcatgagtctggggcca
caggttcttgattacctgttgctgactttagggatccaaggtcagattgg
acagtgatttgagggacacttcttagttcctggcgatactgatgagggtg
tttttacttataacaaagcccggtgaagatattctccatcttttagacca
ctctgtggaccattgtgctagctgaccagatgacaaagtctttggctcat
tatactttagatgattgtttacctagctgcctagcattaaatgatgggag
aaaaatcgaaagaaacaagaaactagaactagcccctaacccattttact
caagtctatgaagcatggcattttgattctgtgactgaggcctagttatc
caccttaaatttaaagggcaacaacaggttgtcttataataataacaaaa
caatgctgttttcctgacagttgagagaaaagtaggaggaagaccacaaa
gcatcccagggacaaagtgaagatatatatttagaattcaaaggccaggc
tatgttgactttactctgtgacatcacatcgagtttgccaatgtcaagga
tgctaatgtttgcttcagtttcactgagttactgccctgcattcctccaa
gtaacttgcacatgggaagttttcaatgctcatgaaatctcttcaggtac
agggaaatttgaggtatatggagatcaggaatttgttgagattacatacc
ctggtagcagagatggacttgggctctgtcctaaactcatatatctatat
ctagtttttaaatcttattgactatgcaaacaagtctcaatagtattctg
tctgactccacatctgtctcttgctggaaattcagttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_85207352_85207987
seq2: B6Ng01-187L10.b_46_681

seq1  GAATTCTTCCTTTTCACATACAAATGGCAAAATACTATGTGCTCCCCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTTTTCACATACAAATGGCAAAATACTATGTGCTCCCCACT  50

seq1  GAAGCTTGCATATTTTAACTAAGTGAAATTTACAAGCTCCCATGTGGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTTGCATATTTTAACTAAGTGAAATTTACAAGCTCCCATGTGGTGG  100

seq1  CAGGATGTGAGTGCACTATGAATGGAGACATACCTGATGAACACATATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATGTGAGTGCACTATGAATGGAGACATACCTGATGAACACATATAC  150

seq1  CACAGGTTAAAGTTAGAGTTAGGGTTATGATCGGGGTTAGGGGTTAGGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTTAAAGTTAGAGTTAGGGTTATGATCGGGGTTAGGGGTTAGGGG  200

seq1  CTAGGGGCTAGGGTTCAGGGAGTTTCCATTGCCTGGTTATCACAAAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGGCTAGGGTTCAGGGAGTTTCCATTGCCTGGTTATCACAAAACAA  250

seq1  TGAAGATATCAGTTATTGTATGTGCCTGTATATGCAGTATTGCTGCAATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATATCAGTTATTGTATGTGCCTGTATATGCAGTATTGCTGCAATA  300

seq1  GGTAAATTCTAAAGGCATAGTGGCCTTTTAAATCAAAAGGCTGTCCAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAATTCTAAAGGCATAGTGGCCTTTTAAATCAAAAGGCTGTCCAATG  350

seq1  ATAATTCTCCATGAAATTCAGATCATATCAAACTTACTTGAGACCTCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTCTCCATGAAATTCAGATCATATCAAACTTACTTGAGACCTCTTC  400

seq1  TTCCAGTCTTGACTCCAAGATTGTCCTATACCAAAGCTAAAACTCTACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTCTTGACTCCAAGATTGTCCTATACCAAAGCTAAAACTCTACAT  450

seq1  ATAGGACTTCTTTATTGCCAGCCTATAGTGAAATGGGGATTTTAGCAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACTTCTTTATTGCCAGCCTATAGTGAAATGGGGATTTTAGCAGCA  500

seq1  ACAGAGGGCATGCCTGTCACTATTTCTTAAGCAAGGAAAGGCACCTTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGGGCATGCCTGTCACTATTTCTTAAGCAAGGAAAGGCACCTTATA  550

seq1  TCTGCTCAGTCTGTTGACGAGAACTCAATCACATGATGTCATCCTGACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCAGTCTGTTGACGAGAACTCAATCACATGATGTCATCCTGACCA  600

seq1  CAAGTATGTTTAGGAATATATTCTTGTAGAGCCTTC  636
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAAGTATGTTTAGGAATATATTCTTGTATAGCCTTC  636

seq1: chr7_85225958_85227116
seq2: B6Ng01-187L10.g_64_1202 (reverse)

seq1  ATAACTGAATTTCTCAGGGAAAAGAGACAGGATGGTTGGGAGTTCAGGAC  50
      ||||||||||||| |||    |||||||| ||||    |||| ||||   
seq2  ATAACTGAATTTC-CAG---CAAGAGACA-GATG---TGGAG-TCAG--A  39

seq1  CAGATACCTATGAAGACTTTGTTTCCAATAAGTCAAT-AGATTTAAAAAC  99
      ||||   ||||  |||| |||||| ||   ||||||| ||||||||||||
seq2  CAGAATACTATTGAGAC-TTGTTTGCA--TAGTCAATAAGATTTAAAAAC  86

seq1  TAGATAAATAGATAAATAATGAGTTTTAGGACAGAGCCCAAGTCCATCTC  149
      |||||  |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAT--ATAGATA---TATGAG-TTTAGGACAGAGCCCAAGTCCATCTC  130

seq1  TGCTTACCA-GGTATGTAATCTTCAACAAATTCCTTGATCTCCTTATACC  198
      ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  TGC-TACCAGGGTATGTAATC-TCAACAAATTCC-TGATCTCCATATACC  177

seq1  TC-AATTTCCCTGTACCTGAAGAGATTTCATGAGCATTGAAAACTTCCCA  247
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTTCCCTGTACCTGAAGAGATTTCATGAGCATTGAAAACTTCCCA  227

seq1  TGTGCAAGTTACTTGGAGGAATGCAGGGCAGTAACTCAGTGAAACTGAAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAAGTTACTTGGAGGAATGCAGGGCAGTAACTCAGTGAAACTGAAG  277

seq1  CAAACATTAGCATCCTTGACATTGGCAAACTCGATGTGATGTCACAGAGT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATTAGCATCCTTGACATTGGCAAACTCGATGTGATGTCACAGAGT  327

seq1  AAAGTCAACATAGCCTGGCCTTTGAATTCTAAATATATATCTTCACTTTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCAACATAGCCTGGCCTTTGAATTCTAAATATATATCTTCACTTTG  377

seq1  TCCCTGGGATGCTTTGTGGTCTTCCTCCTACTTTTCTCTCAACTGTCAGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGGATGCTTTGTGGTCTTCCTCCTACTTTTCTCTCAACTGTCAGG  427

seq1  AAAACAGCATTGTTTTGTTATTATTATAAGACAACCTGTTGTTGCCCTTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGCATTGTTTTGTTATTATTATAAGACAACCTGTTGTTGCCCTTT  477

seq1  AAATTTAAGGTGGATAACTAGGCCTCAGTCACAGAATCAAAATGCCATGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTAAGGTGGATAACTAGGCCTCAGTCACAGAATCAAAATGCCATGC  527

seq1  TTCATAGACTTGAGTAAAATGGGTTAGGGGCTAGTTCTAGTTTCTTGTTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAGACTTGAGTAAAATGGGTTAGGGGCTAGTTCTAGTTTCTTGTTT  577

seq1  CTTTCGATTTTTCTCCCATCATTTAATGCTAGGCAGCTAGGTAAACAATC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCGATTTTTCTCCCATCATTTAATGCTAGGCAGCTAGGTAAACAATC  627

seq1  ATCTAAAGTATAATGAGCCAAAGACTTTGTCATCTGGTCAGCTAGCACAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAAGTATAATGAGCCAAAGACTTTGTCATCTGGTCAGCTAGCACAA  677

seq1  TGGTCCACAGAGTGGTCTAAAAGATGGAGAATATCTTCACCGGGCTTTGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCCACAGAGTGGTCTAAAAGATGGAGAATATCTTCACCGGGCTTTGT  727

seq1  TATAAGTAAAAACACCCTCATCAGTATCGCCAGGAACTAAGAAGTGTCCC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTAAAAACACCCTCATCAGTATCGCCAGGAACTAAGAAGTGTCCC  777

seq1  TCAAATCACTGTCCAATCTGACCTTGGATCCCTAAAGTCAGCAACAGGTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCACTGTCCAATCTGACCTTGGATCCCTAAAGTCAGCAACAGGTA  827

seq1  ATCAAGAACCTGTGGCCCCAGACTCATGAGAAGTCTGGGTTGCTGTGACT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGAACCTGTGGCCCCAGACTCATGAGAAGTCTGGGTTGCTGTGACT  877

seq1  CACCGTTACCATACTTCCTGCCTTACTGTGTCTTTGAACTTTGTCTGGCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCGTTACCATACTTCCTGCCTTACTGTGTCTTTGAACTTTGTCTGGCT  927

seq1  CGGGTCCAACAGCAGACATACTTCACTGACTTACCTGGTCTCCATAGTAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTCCAACAGCAGACATACTTCACTGACTTACCTGGTCTCCATAGTAT  977

seq1  GACTCTGCCTTCAGCCTTAGTCTGGTTCCATCTGTGTTTGGTTGCCCAAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCTGCCTTCAGCCTTAGTCTGGTTCCATCTGTGTTTGGTTGCCCAAG  1027

seq1  TTATTCTCACTCCATCTAGTCCATGTCCATCTCCCGAGCCAGCCAGTAAC  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCTCACTCCATCTAGTCCATGTCCATCTCCCGAGCCAGCCAGTAAC  1077

seq1  TGCTCCAGCCTTCCTTCAATTCCAGGGAGGAAAATGGATGAATGCTTCCT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCAGCCTTCCTTCAATTCCAGGGAGGAAAATGGATGAATGCTTCCT  1127

seq1  GGGAAAGAATTC  1159
      ||||||||||||
seq2  GGGAAAGAATTC  1139