BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-187M06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 75,835,331 - 75,987,886
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArrdc4
Upstream geneTtc23, Dmn, LOC665319, LOC100041771, Igf1r, C330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639
Downstream geneLOC384741, EG665410
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-187M06.bB6Ng01-187M06.g
ACCGA012254GA012255
length1,137998
definitionB6Ng01-187M06.b B6Ng01-187M06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,986,736 - 75,987,886)(75,835,331 - 75,836,108)
sequence
gaattctactaaaatggtaggaaagaaagaacagttaaaaagtggaaacc
tggggccataactcaatgagtaaggtgattgccaaacacacataatggcc
caagtccagtcctcagaaccaatgttaaaagtccgggcatgatggagtgt
gcttgtaatcccagcactgtagaggtagaaacaggagggttcctggggat
atcttgataccttgccagctgagctaatcaaagtagcaagctccaggcaa
atggaagaccctgttgagaaatacaagattcatggcatcctgagtgacaa
cccccagagttgacccctgtgcatcctcacaaaagtgtgcacataccccc
ctcccaaacaaaagtgtatacgaatgcacacatgcaaaagaaaataaaca
catggacatggacgcagatggaggttctaagatttatataatttgagggt
ggccttctaagggagcgaatgcatatactattagtacactccatactgtt
tacgagatggatccttgcatagcagagtggcctgatcaatctagctgttc
tatctcccatgtggctttatacagccccattttagggtggctcccagagc
tgctgatggcagtgaggagtgggatttacacttaaacaaattcttgtgct
acttagatgctggtccacaatgaccacagggatactttgagaaccgctga
cttacataattgatgcaggggagtctttaaggcaaagcacactagatact
tttccacattaaaataagtaataaacttatttactaactaacattttcca
aaaaatacaggccaggtcaaggacccctcacaggaccagagaggacctgg
gaagtgaaaggactctgggatccaagctctcttgacccataccagagggc
accttccttactgcagccagcccctaagaggtaaatttataaagaagaga
ttttaccaattttttgccaactatacacctttttctagtaatccctgaag
cagagattataaatttgaattcccactagactcataagatcttctctcaa
aataatttcttcacctagcaatttactgataactgtttcatgctcccaga
gaaggttagcagttcatgaattgattcctaggaagct

gaattcttcctctgcagtttcagggagctgctgggaccttgcagtgagtg
gtaggggagcctctaggtgaagacccccaagagaggaaaaggttgtgaga
ggctattgcatgaagatatgaaagtaaagcctgtgttacagtggaagtca
gaagacattggaaatgagatagacaccaaggagacctgcaggcatgggat
ggaaccagaccaaaagagagacgtgtggtgtaagcatcaaagctgagggt
gcagaaccatttggtccctttggaagtaaagatactagacatgaagctat
aggacttggtgtttgtctgctggtctttgggccagtatcttctaactgta
tcccagttccttcctttgaatgagaagtgtcataggttcagtgaggatat
tcgaatgattaatctccagttggtgacagagtttggagaggcttaagtgg
tacctaagtacctagtagcacctacaggaagaagtccctgggcgtgggct
ctggcaattcatagacataccctattaattgttttccattttgtctttgt
gcttgcacttaacgatgtgatcctggtttccaggacaacggttggtcatt
tgctgctgtgtcttcttgcggtgatggattctcactcccaggaacggcaa
gccaaaataaactctttactccttaagttgctttcggtcatggcatctca
tgacagcagtataaaggcaaccgctctggaaagtgttatacatttgagac
ttggaggcttgttctgatgggctcagaggaagaagagagtacaggccaca
gagctcttaatccttcacccacacttagctcaacagctcaagatgtgaga
aagataaaatcaagtctcacatatatggatatatatgcatatacatatct
cttgtggtttgtgtatatgtatatatatatgtatgtgtagtatatacata
aatgtatatacattcatatgtatgtatgtgtgtatgtatggatgtagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_75986736_75987886
seq2: B6Ng01-187M06.b_44_1180 (reverse)

seq1  AGCTTCCTAGGAATC-ATTCATGAACCTTGCTTACTTTCTTCTGGGAGCA  49
      ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||| ||||||||| 
seq2  AGCTTCCTAGGAATCAATTCATGAAC--TGCTAACCTTC-TCTGGGAGC-  46

seq1  ATGAAAACAGTTAACAGTTAAAATGCTAGGTGAAGAAAATTTATTTTGAG  99
      ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||
seq2  ATG-AAACAGTTATCAG-TAAATTGCTAGGTGAAGAAA--TTATTTTGAG  92

seq1  AGAAGATCTTATGAGTCTAGGTGGGATTCAAATTTATAATCCTCTTGCTT  149
      ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||
seq2  AGAAGATCTTATGAGTCTAGTGGGAATTCAAATTTATAAT-CTC-TGCTT  140

seq1  CAGGGATTTACTAGAAAAAGGTGTATTAGTTGGCAAAAAATTGGTAAAAT  199
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGA-TTACTAGAAAAAGGTGTA-TAGTTGGCAAAAAATTGGTAAAAT  188

seq1  CTCTTCTTTTATAAATTTTACCTCCTTAGGGGCTGGCCTGCAGTAAGGAA  249
      |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTCTTC-TTTATAAA-TTTACCT-CTTAGGGGCTGG-CTGCAGTAAGGAA  234

seq1  GGTGCCCTCTGGTATGGGTCAAGAGAGCTTGGATCCCAGAGTCC-TTCAC  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGTGCCCTCTGGTATGGGTCAAGAGAGCTTGGATCCCAGAGTCCTTTCAC  284

seq1  TTCCCAGGTCCTCTCTGGTCCTGTGAGGGGTCCTTGACCTGGCCTGTATT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGGTCCTCTCTGGTCCTGTGAGGGGTCCTTGACCTGGCCTGTATT  334

seq1  TTTTGGAAAATGTTAGTTAGTAAATAAGTTTATTACTTATTTTAATGTGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGAAAATGTTAGTTAGTAAATAAGTTTATTACTTATTTTAATGTGG  384

seq1  AAAAGTATCTAGTGTGCTTTGCCTTAAAGACTCCCCTGCATCAATTATGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTATCTAGTGTGCTTTGCCTTAAAGACTCCCCTGCATCAATTATGT  434

seq1  AAGTCAGCGGTTCTCAAAGTATCCCTGTGGTCATTGTGGACCAGCATCTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGCGGTTCTCAAAGTATCCCTGTGGTCATTGTGGACCAGCATCTA  484

seq1  AGTAGCACAAGAATTTGTTTAAGTGTAAATCCCACTCCTCACTGCCATCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCACAAGAATTTGTTTAAGTGTAAATCCCACTCCTCACTGCCATCA  534

seq1  GCAGCTCTGGGAGCCACCCTAAAATGGGGCTGTATAAAGCCACATGGGAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCTCTGGGAGCCACCCTAAAATGGGGCTGTATAAAGCCACATGGGAG  584

seq1  ATAGAACAGCTAGATTGATCAGGCCACTCTGCTATGCAAGGATCCATCTC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACAGCTAGATTGATCAGGCCACTCTGCTATGCAAGGATCCATCTC  634

seq1  GTAAACAGTATGGAGTGTACTAATAGTATATGCATTCGCTCCCTTAGAAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACAGTATGGAGTGTACTAATAGTATATGCATTCGCTCCCTTAGAAG  684

seq1  GCCACCCTCAAATTATATAAATCTTAGAACCTCCATCTGCGTCCATGTCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCCTCAAATTATATAAATCTTAGAACCTCCATCTGCGTCCATGTCC  734

seq1  ATGTGTTTATTTTCTTTTGCATGTGTGCATTCGTATACACTTTTGTTTGG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTATTTTCTTTTGCATGTGTGCATTCGTATACACTTTTGTTTGG  784

seq1  GAGGGGGGTATGTGCACACTTTTGTGAGGATGCACAGGGGTCAACTCTGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGGGTATGTGCACACTTTTGTGAGGATGCACAGGGGTCAACTCTGG  834

seq1  GGGTTGTCACTCAGGATGCCATGAATCTTGTATTTCTCAACAGGGTCTTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTCACTCAGGATGCCATGAATCTTGTATTTCTCAACAGGGTCTTC  884

seq1  CATTTGCCTGGAGCTTGCTACTTTGATTAGCTCAGCTGGCAAGGTATCAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCCTGGAGCTTGCTACTTTGATTAGCTCAGCTGGCAAGGTATCAA  934

seq1  GATATCCCCAGGAACCCTCCTGTTTCTACCTCTACAGTGCTGGGATTACA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATCCCCAGGAACCCTCCTGTTTCTACCTCTACAGTGCTGGGATTACA  984

seq1  AGCACACTCCATCATGCCCGGACTTTTAACATTGGTTCTGAGGACTGGAC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACACTCCATCATGCCCGGACTTTTAACATTGGTTCTGAGGACTGGAC  1034

seq1  TTGGGCCATTATGTGTGTTTGGCAATCACCTTACTCATTGAGTTATGGCC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCCATTATGTGTGTTTGGCAATCACCTTACTCATTGAGTTATGGCC  1084

seq1  CCAGGTTTCCACTTTTTAACTGTTCTTTCTTTCCTACCATTTTAGTAGAA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTTCCACTTTTTAACTGTTCTTTCTTTCCTACCATTTTAGTAGAA  1134

seq1  TTC  1151
      |||
seq2  TTC  1137


seq1: chr7_75835331_75836108
seq2: B6Ng01-187M06.g_286_1062

seq1  CGTGTGGTGTAAGCATCAAAGCTGAGGGTGCAGAACCATTTGGTCCCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGTGGTGTAAGCATCAAAGCTGAGGGTGCAGAACCATTTGGTCCCTTT  50

seq1  GGAAGTAAAGATACTAGACATGAAGCTATAGGACTTGGTGTTTGTCTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTAAAGATACTAGACATGAAGCTATAGGACTTGGTGTTTGTCTGCT  100

seq1  GGTCTTTGGGCCAGTATCTTCTAACTGTATCCCAGTTCCTTCCTTTGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTTTGGGCCAGTATCTTCTAACTGTATCCCAGTTCCTTCCTTTGAAT  150

seq1  GAGAAGTGTCATAGGTTCAGTGAGGATATTCGAATGATTAATCTCCAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTGTCATAGGTTCAGTGAGGATATTCGAATGATTAATCTCCAGTT  200

seq1  GGTGACAGAGTTTGGAGAGGCTTAAGTGGTACCTAAGTACCTAGTAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACAGAGTTTGGAGAGGCTTAAGTGGTACCTAAGTACCTAGTAGCAC  250

seq1  CTACAGGAAGAAGTCCCTGGGCGTGGGCTCTGGCAATTCATAGACATACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGAAGAAGTCCCTGGGCGTGGGCTCTGGCAATTCATAGACATACC  300

seq1  CTATTAATTGTTTTCCATTTTGTCTTTGTGCTTGCACTTAACGATGTGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAATTGTTTTCCATTTTGTCTTTGTGCTTGCACTTAACGATGTGAT  350

seq1  CCTGGTTTCCAGGACAACGGTTGGTCATTTGCTGCTGTGTCTTCTTGCGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTTCCAGGACAACGGTTGGTCATTTGCTGCTGTGTCTTCTTGCGG  400

seq1  TGATGGATTCTCACTCCCAGGAACGGCAAGCCAAAATAAACTCTTTACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGATTCTCACTCCCAGGAACGGCAAGCCAAAATAAACTCTTTACTC  450

seq1  CTTAAGTTGCTTTCGGTCATGGCATCTCATGACAGCAGTATAAAGGCAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGTTGCTTTCGGTCATGGCATCTCATGACAGCAGTATAAAGGCAAC  500

seq1  CGCTCTGGAAAGTGTTATACATTTGAGACTTGGAGGCTTGTTCTGATGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTCTGGAAAGTGTTATACATTTGAGACTTGGAGGCTTGTTCTGATGGG  550

seq1  CTCAGAGGAAGAAGAGAGTACAGGCCACAGAGCTCTTAATCCTTCACCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGAAGAAGAGAGTACAGGCCACAGAGCTCTTAATCCTTCACCCA  600

seq1  CACTTAGCTCAACAGCTCAAGATGTGAGAAAGATAAAATCAAGTCTCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGCTCAACAGCTCAAGATGTGAGAAAGATAAAATCAAGTCTCACA  650

seq1  TATATGGATATATATGCATATACATATCTCTTGTGGTTTTGTGTATATGT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATATGGATATATATGCATATACATATCTCTTGTGG-TTTGTGTATATGT  699

seq1  ATATATAATATGTATGTGTA-TATATACATAAATGTATATACATTCATAT  749
      |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAT-ATATGTATGTGTAGTATATACATAAATGTATATACATTCATAT  748

seq1  GTATGTATGTGTGTATGTATGTATGTATG  778
      ||||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  GTATGTATGTGTGTATGTATGGATGTAGG  777


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |