BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-188J24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 70,963,391 - 71,115,796
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf13, E030018B13Rik
Upstream geneEG622251, Chrna7, Otud7a, LOC545971, LOC100041386, LOC665083
Downstream geneTrpm1, BB128963, Mtmr15, LOC100041582, Mphosph10, Mcee, Apba2, 5730507A09Rik, Ndnl2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-188J24.bB6Ng01-188J24.g
ACCGA012879GA012880
length8321,045
definitionB6Ng01-188J24.b B6Ng01-188J24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,114,971 - 71,115,796)(70,963,391 - 70,964,423)
sequence
gaattcttaaagacaagttacaaaaaagcaggataacaactgtagtaaga
acttttgacaaaagctatttgctgtgaataaactcaattatttaaattcc
ttctccttagcagccagaacaaaacaaacaaagagtgtggtttaaaaaga
atggtaaacaaaaaacaatacaacaacaaaaaaaacctcttgctgtccat
tctgtcactgtaagtggaagccccaaggagggtgggggtacaggggtgtg
aaggggcctgtatctgaatttctgaattcaaacagttgaggtctaggcac
tcaggatacgcacatgctatggactgaatagctcttctgcaggactcaag
acagcatcctgtcactaagaagattcacatttctgtggtaaaataagcaa
atatctgttcagtctttacacaatgtctaacccagtcagggtttgccatc
aaatgaatttgctaccgacttagacagaatgtcttggttttcaggaatac
ttagattttagaattgtgtgttagaggttacagacctgtaatagaagctg
ttaattaacctctggggagggagaaatgttttcctagttcagatatctaa
taccatgtggacttaaagatattgcataaacaatataaacaggctcacaa
caggggtttcacaaaaaagggcattgtttcaaccaattctaatgaatgct
gctaaatgggcatctggcctgtctaccagacatagggtcagacaagagag
ggccattttaggagggatgacctctgccctttcgggaccctcgacttaaa
ggccagagcacaagagggtcagagtatgcttt
gaattccaagtcagagatccattggatatttctgcagaaccaagagtgtg
aagatgccaggccctgtgcagaccagtacacctggcctcgaccttagtgg
agtgaatcgattgcatctctgtgtggcaatcttggagtaagactgttgct
gcctgaagctagaaacagtagggtttggacttaaccttccctacacaagc
tacactgattcaatgtttccggttgtcatggcagaccttctaccctcgga
gtaagtccaaggcctcaacttgtacccaatgcctggtaatcccagctggg
aagagctgtgcccactggtcccgtcgtatctagtcaaggacattagtcat
ggctttcctgtccctctcttctgtaccaccagttttccatttctccaaga
ctgccctcaacacattatgtttaagttgaccctccatcttcctcttcccc
tgggacagaggagcaaggatcagatgttccccacactgaagtgcctctac
acaccttgtcttgctctgagaacactctgacaggaatgtggggggcagag
atgaggggcaaacagagaggtggctggtcagctgtgagcctgaaccctgg
agagcaagtggagaccctgggttgaagaagctactccaagctctgggaag
tgagatggtcagaggcctcaggacaggggaagggtggcaggaagtggccc
tggatcagcaagggctgagagaattcagtgtaacacttgttaggaagatg
cttgaggccttagcaaggcagagagaggcagaaagctaggacttctaact
ctgcctttgtggttttccctcccagaccagacatctcagtatcagcgtga
acttgttttgagctgagctctgctcccaagtctccttcacagatcatgaa
agacatactggaataggagcagacagcttcccaaagcaacttaactgaac
tttcagaaaaatgcttccaagaatcttcaatagaactcagaacaagcaag
gctggaagagaatggctcagcaggtaagagcactgaactgctctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_71114971_71115796
seq2: B6Ng01-188J24.b_47_878 (reverse)

seq1  AAAGCCTACTCTGACCCTC-TGTGCTCTGGCCTTT-AGTC-AGGGTCCCG  47
      ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  AAAGCATACTCTGACCCTCTTGTGCTCTGGCCTTTAAGTCGAGGGTCCCG  50

seq1  -AAGGGCAGAGGTCATCCCTCCT-AAATGGCCCTCTCTTGTCTGACCCTA  95
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGCAGAGGTCATCCCTCCTAAAATGGCCCTCTCTTGTCTGACCCTA  100

seq1  TGTCTGGTAGACAGGCCAGATGCCCATTTAGCAGCATTCATTAGAATTGG  145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGTAGACAGGCCAGATGCCCATTTAGCAGCATTCATTAGAATTGG  150

seq1  TTGAAACAATGCCC-TTTTTGTGAAACCCCTGTTGTGAGCCTGTTTATAT  194
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACAATGCCCTTTTTTGTGAAACCCCTGTTGTGAGCCTGTTTATAT  200

seq1  TGTTTATGCAATATCTTTAAGTCCACATGGTATTAGATATCTGAACTAGG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATGCAATATCTTTAAGTCCACATGGTATTAGATATCTGAACTAGG  250

seq1  AAAACATTTCTCCCTCCCCAGAGGTTAATTAACAGCTTCTATTACAGGTC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATTTCTCCCTCCCCAGAGGTTAATTAACAGCTTCTATTACAGGTC  300

seq1  TGTAACCTCTAACACACAATTCTAAAATCTAAGTATTCCTGAAAACCAAG  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACCTCTAACACACAATTCTAAAATCTAAGTATTCCTGAAAACCAAG  350

seq1  ACATTCTGTCTAAGTCGGTAGCAAATTCATTTGATGGCAAACCCTGACTG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTGTCTAAGTCGGTAGCAAATTCATTTGATGGCAAACCCTGACTG  400

seq1  GGTTAGACATTGTGTAAAGACTGAACAGATATTTGCTTATTTTACCACAG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGACATTGTGTAAAGACTGAACAGATATTTGCTTATTTTACCACAG  450

seq1  AAATGTGAATCTTCTTAGTGACAGGATGCTGTCTTGAGTCCTGCAGAAGA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGAATCTTCTTAGTGACAGGATGCTGTCTTGAGTCCTGCAGAAGA  500

seq1  GCTATTCAGTCCATAGCATGTGCGTATCCTGAGTGCCTAGACCTCAACTG  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCAGTCCATAGCATGTGCGTATCCTGAGTGCCTAGACCTCAACTG  550

seq1  TTTGAATTCAGAAATTCAGATACAGGCCCCTTCACACCCCTGTACCCCCA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATTCAGAAATTCAGATACAGGCCCCTTCACACCCCTGTACCCCCA  600

seq1  CCCTCCTTGGGGCTTCCACTTACAGTGACAGAATGGACAGCAAGAGGTTT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCTTGGGGCTTCCACTTACAGTGACAGAATGGACAGCAAGAGGTTT  650

seq1  TTTTTGTTGTTGTATTGTTTTTTGTTTACCATTCTTTTTAAACCACACTC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTGTTGTATTGTTTTTTGTTTACCATTCTTTTTAAACCACACTC  700

seq1  TTTGTTTGTTTTGTTCTGGCTGCTAAGGAGAAGGAATTTAAATAATTGAG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGTTTTGTTCTGGCTGCTAAGGAGAAGGAATTTAAATAATTGAG  750

seq1  TTTATTCACAGCAAATAGCTTTTGTCAAAAGTTCTTACTACAGTTGTTAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTCACAGCAAATAGCTTTTGTCAAAAGTTCTTACTACAGTTGTTAT  800

seq1  CCTGCTTTTTTGTAACTTGTCTTTAAGAATTC  826
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTTTTTTGTAACTTGTCTTTAAGAATTC  832

seq1: chr7_70963391_70964423
seq2: B6Ng01-188J24.g_64_1108

seq1  GAATTCCAAGTCAGAGATCCATTGGATATTTCTGCAGAACCAAGAGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGTCAGAGATCCATTGGATATTTCTGCAGAACCAAGAGTGTG  50

seq1  AAGATGCCAGGCCCTGTGCAGACCAGTACACCTGGCCTCGACCTTAGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCCAGGCCCTGTGCAGACCAGTACACCTGGCCTCGACCTTAGTGG  100

seq1  AGTGAATCGATTGCATCTCTGTGTGGCAATCTTGGAGTAAGACTGTTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATCGATTGCATCTCTGTGTGGCAATCTTGGAGTAAGACTGTTGCT  150

seq1  GCCTGAAGCTAGAAACAGTAGGGTTTGGACTTAACCTTCCCTACACAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGAAGCTAGAAACAGTAGGGTTTGGACTTAACCTTCCCTACACAAGC  200

seq1  TACACTGATTCAATGTTTCCGGTTGTCATGGCAGACCTTCTACCCTCGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTGATTCAATGTTTCCGGTTGTCATGGCAGACCTTCTACCCTCGGA  250

seq1  GTAAGTCCAAGGCCTCAACTTGTACCCAATGCCTGGTAATCCCAGCTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGTCCAAGGCCTCAACTTGTACCCAATGCCTGGTAATCCCAGCTGGG  300

seq1  AAGAGCTGTGCCCACTGGTCCCGTCGTATCTAGTCAAGGACATTAGTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTGTGCCCACTGGTCCCGTCGTATCTAGTCAAGGACATTAGTCAT  350

seq1  GGCTTTCCTGTCCCTCTCTTCTGTACCACCAGTTTTCCATTTCTCCAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTCCTGTCCCTCTCTTCTGTACCACCAGTTTTCCATTTCTCCAAGA  400

seq1  CTGCCCTCAACACATTATGTTTAAGTTGACCCTCCATCTTCCTCTTCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTCAACACATTATGTTTAAGTTGACCCTCCATCTTCCTCTTCCCC  450

seq1  TGGGACAGAGGAGCAAGGATCAGATGTTCCCCACACTGAAGTGCCTCTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACAGAGGAGCAAGGATCAGATGTTCCCCACACTGAAGTGCCTCTAC  500

seq1  ACACCTTGTCTTGCTCTGAGAACACTCTGACAGGAATGTGGGGGGCAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTTGTCTTGCTCTGAGAACACTCTGACAGGAATGTGGGGGGCAGAG  550

seq1  ATGAGGGGCAAACAGAGAGGTGGCTGGTCAGCTGTGAGCCTGAACCCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGGGCAAACAGAGAGGTGGCTGGTCAGCTGTGAGCCTGAACCCTGG  600

seq1  AGAGCAAGTGGAGACCCTGGGTTGAAGAAGCTACTCCAAGCTCTGGGAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAGTGGAGACCCTGGGTTGAAGAAGCTACTCCAAGCTCTGGGAAG  650

seq1  TGAGATGGTCAGAGGCCTCAGGACAGGGGAAGGGTGGCAGGAAGTGGCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGGTCAGAGGCCTCAGGACAGGGGAAGGGTGGCAGGAAGTGGCCC  700

seq1  TGGATCAGCAAGGGCTGAGAGAATTCAGTGTAACACTTGTTAGGAAGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATCAGCAAGGGCTGAGAGAATTCAGTGTAACACTTGTTAGGAAGATG  750

seq1  CTTGAGGCCTTAGCAAGGCAGAGAGAGGCAGAAAGCTAGGACTTCTAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGGCCTTAGCAAGGCAGAGAGAGGCAGAAAGCTAGGACTTCTAACT  800

seq1  CTGCCTTTGTGGTTTTCCCTCCCAGACCAGACATCTCAGTATCAGCGTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTTGTGGTTTTCCCTCCCAGACCAGACATCTCAGTATCAGCGTGA  850

seq1  ACTTGTTTTGAGCTGAGCTCTGCTCCCAAGTCTCC-TCACAGATCATGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACTTGTTTTGAGCTGAGCTCTGCTCCCAAGTCTCCTTCACAGATCATGAA  900

seq1  AGACATACTGG-ATAGGAGCAGACAGCT--CCAAAGCAACTTAACTGAAC  946
      ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
seq2  AGACATACTGGAATAGGAGCAGACAGCTTCCCAAAGCAACTTAACTGAAC  950

seq1  -TTCAGAAAAATGCT--CCAGAATCTTCATAAGAACTCAGAAC-AGC-AG  991
       ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||| ||
seq2  TTTCAGAAAAATGCTTCCAAGAATCTTCAATAGAACTCAGAACAAGCAAG  1000

seq1  GCTGG-AGAG-ATGGCTCAGCAGGTAAGAGCACTG-ACTGCTCTT  1033
      ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCTGGAAGAGAATGGCTCAGCAGGTAAGAGCACTGAACTGCTCTT  1045