BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189F24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,709,026 - 103,853,090
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4
Upstream geneFrda-ps, EG666836, LOC670727, LOC666858
Downstream geneNars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1, LOC622994, LOC100040211, Clns1a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189F24.bB6Ng01-189F24.g
ACCGA013416GA013417
length1,030687
definitionB6Ng01-189F24.b B6Ng01-189F24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,709,026 - 103,710,027)(103,852,407 - 103,853,090)
sequence
gaattcaccgagataatgcatatttcagatgtcatgctattccttgggca
cttgctatagcctaggaatggttttaagtactgagattctgtcaatcatc
aaaacttctcactcttaagaacattaaattttaatggggagacaggttgg
gaaattaaactgtatactgtgtgtcaagatagtaagtgctgtgcgaacaa
gtcccagggtgagggaggagagttgtaattttaaatatggtggccagaga
agggttcatagagacagtgaattgggggttttgtcattgataacaggaga
tgtgaggttgtggaatgaaaaccagtagagggaaggacagctgcagggac
cttagtgtagaatgttaatggcttgtttgaacagcaacaaaggggccagt
gggtagaacagtggagtatgccagagatggcctggagtggaaggtgtgca
ggctggcactagaactactgagaactttgagggaggatgggcagggtcta
accagtgcatgagtaagatcattctggatgctgcattgagaatagactgc
agcaggcacaggttcaagtgttatgctagggcaaaaatccatgcaaggaa
ggatgtggactctgaccaagcaggcaaaccttgtaagtagctggggttgc
ctctgtgagcagcttccctgtcctgttctgctcctcagggatctcgcttt
caccaaagaccccttactcttagtcctaggacccagcaagaattcccagg
tactctaggggcaagagaacctctatttggtcctctaaccacacacctac
tgtggggacagttgctggattccttagccgctgtcccattccgtgctccc
tctctcttctttgatcctgaaaccatcatcccgagccctggctcctccat
cctgctgctgatcctctttgctttctgatcctgctgctttcctcccaccc
ctgtccttgcattctcttctccaggaggcatgtggtacacgcttattttg
ctaaacctccctctttatgcttacatttcc
gaattctctacctccctgtctctcacccttgtcacatggaacaacaggag
aggccgacctaccgcccagtcctcctaagttgttatttcatcttagcggc
tctgatctaggacactcatgtcccagaccactatctcagagtcctcattg
ccttgtgcctcagttctagagaaccaacacatgcaaggcagatcctaata
ttccttgccggttcagcctcagaggagagagcggagagcctggaagagct
gccgttatggtgtggacacaggccagaccagtgcaaggcatcttgataca
gcctatgcactatgactgtggtgctggtacagggcctttggcggccctag
ctgcttcgattggtggcccctggccaaatgggagccatggggagctgtgg
gggaggaggaaatgcttacccacaaagtatgcgagcaggatgacgagcgt
agctgagatgaggatggcgctcagcgctgcacacttccagttgcagtact
tggaaggcttcttgaggttaaaggctggtcgggagaaggtgctgcggggc
aggggccggggtgggggcgagtacacggtgctagacgttagggggtaccc
tgggggatgtggtgcagaagagcggggaggtgcctccggggcttgaagag
gaagtgcctgtggatggagagaggttgggaaggtgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103709026_103710027
seq2: B6Ng01-189F24.b_45_1054

seq1  GAATTCACCGAGATAATGCATATTTCAGATGTCATGCTATTCCTTGGGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCGAGATAATGCATATTTCAGATGTCATGCTATTCCTTGGGCA  50

seq1  CTTGCTATAGCCTAGGAATGGTTTTAAGTACTGAGATTCTGTCAATCATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTATAGCCTAGGAATGGTTTTAAGTACTGAGATTCTGTCAATCATC  100

seq1  AAAACTTCTCACTCTTAAGAACATTAAATTTTAATGGGGAGACAGGTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTCTCACTCTTAAGAACATTAAATTTTAATGGGGAGACAGGTTGG  150

seq1  GAAATTAAACTGTATACTGTGTGTCAAGATAGTAAGTGCTGTGCGAACAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTAAACTGTATACTGTGTGTCAAGATAGTAAGTGCTGTGCGAACAA  200

seq1  GTCCCAGGGTGAGGGAGGAGAGTTGTAATTTTAAATATGGTGGCCAGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGGGTGAGGGAGGAGAGTTGTAATTTTAAATATGGTGGCCAGAGA  250

seq1  AGGGTTCATAGAGACAGTGAATTGGGGGTTTTGTCATTGATAACAGGAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTCATAGAGACAGTGAATTGGGGGTTTTGTCATTGATAACAGGAGA  300

seq1  TGTGAGGTTGTGGAATGAAAACCAGTAGAGGGAAGGACAGCTGCAGGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGGTTGTGGAATGAAAACCAGTAGAGGGAAGGACAGCTGCAGGGAC  350

seq1  CTTAGTGTAGAATGTTAATGGCTTGTTTGAACAGCAACAAAGGGGCCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGTAGAATGTTAATGGCTTGTTTGAACAGCAACAAAGGGGCCAGT  400

seq1  GGGTAGAACAGTGGAGTATGCCAGAGATGGCCTGGAGTGGAAGGTGTGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGAACAGTGGAGTATGCCAGAGATGGCCTGGAGTGGAAGGTGTGCA  450

seq1  GGCTGGCACTAGAACTACTGAGAACTTTGAGGGAGGATGGGCAGGGTCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGCACTAGAACTACTGAGAACTTTGAGGGAGGATGGGCAGGGTCTA  500

seq1  ACCAGTGCATGAGTAAGATCATTCTGGATGCTGCATTGAGAATAGACTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTGCATGAGTAAGATCATTCTGGATGCTGCATTGAGAATAGACTGC  550

seq1  AGCAGGCACAGGTTCAAGTGTTATGCTAGGGCAAAAATCCATGCAAGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCACAGGTTCAAGTGTTATGCTAGGGCAAAAATCCATGCAAGGAA  600

seq1  GGATGTGGACTCTGACCAAGCAGGCAAACCTTGTAAGTAGCTGGGGTTGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGGACTCTGACCAAGCAGGCAAACCTTGTAAGTAGCTGGGGTTGC  650

seq1  CTCTGTGAGCAGCTTCCCTGTCCTGTTCTGCTCCTCAGGGATCTCGC-TT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTCTGTGAGCAGCTTCCCTGTCCTGTTCTGCTCCTCAGGGATCTCGCTTT  700

seq1  CACCAAAGACCCCTTACTCTTAGTCCTAGGA-CCAGCAAGAATTCCCAGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CACCAAAGACCCCTTACTCTTAGTCCTAGGACCCAGCAAGAATTCCCAGG  750

seq1  TACTCTA-GGGCAAGAGAACCTCTATTTGGTCCTCTAACCACACACCTAC  797
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTAGGGGCAAGAGAACCTCTATTTGGTCCTCTAACCACACACCTAC  800

seq1  TGT-GGGACAGTTGCTGGATTCCTTAGCCGCTGTCCCATTCCGTGCTCCC  846
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGACAGTTGCTGGATTCCTTAGCCGCTGTCCCATTCCGTGCTCCC  850

seq1  TCTCTCTTCTTTGATCCTG-AACCATCATCCCGAG-CCTGGCT-CTCCAT  893
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||
seq2  TCTCTCTTCTTTGATCCTGAAACCATCATCCCGAGCCCTGGCTCCTCCAT  900

seq1  CCTGCTGCTGATCCTC-TTGCTTTCTGATCCTGCTGCTTTCCTCCCACCC  942
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTGCTGATCCTCTTTGCTTTCTGATCCTGCTGCTTTCCTCCCACCC  950

seq1  CTGGCCTTGCATTCTCTTCCCCAGGAGGCATGTGGTACACGCTTATTTTG  992
      ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTTGCATTCTCTTCTCCAGGAGGCATGTGGTACACGCTTATTTTG  1000

seq1  CTAAAACTCC  1002
      ||||| ||||
seq2  CTAAACCTCC  1010

seq1: chr7_103852407_103853090
seq2: B6Ng01-189F24.g_68_754 (reverse)

seq1  GACACCTTCCC-ACCTCTCTCCATCCACAGGCACTTCCTCTTCAAG-CCC  48
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GACACCTTCCCAACCTCTCTCCATCCACAGGCACTTCCTCTTCAAGCCCC  50

seq1  GGAGGCACCTCCCCGCTCTTCTGCACCACAT-CCCCAGGGTACCCCCTAA  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCACCTCCCCGCTCTTCTGCACCACATCCCCCAGGGTACCCCCTAA  100

seq1  CGTCTAGCACCGTGTACTCGCCCCCACCCCGGCCCCTGCCCCGCAGCACC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTAGCACCGTGTACTCGCCCCCACCCCGGCCCCTGCCCCGCAGCACC  150

seq1  TTCTCCCGACCAGCCTTTAACCTCAAGAAGCCTTCCAAGTACTGCAACTG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCCGACCAGCCTTTAACCTCAAGAAGCCTTCCAAGTACTGCAACTG  200

seq1  GAAGTGTGCAGCGCTGAGCGCCATCCTCATCTCAGCTACGCTCGTCATCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGTGCAGCGCTGAGCGCCATCCTCATCTCAGCTACGCTCGTCATCC  250

seq1  TGCTCGCATACTTTGTGGGTAAGCATTTCCTCCTCCCCCACAGCTCCCCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCGCATACTTTGTGGGTAAGCATTTCCTCCTCCCCCACAGCTCCCCA  300

seq1  TGGCTCCCATTTGGCCAGGGGCCACCAATCGAAGCAGCTAGGGCCGCCAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCCATTTGGCCAGGGGCCACCAATCGAAGCAGCTAGGGCCGCCAA  350

seq1  AGGCCCTGTACCAGCACCACAGTCATAGTGCATAGGCTGTATCAAGATGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCTGTACCAGCACCACAGTCATAGTGCATAGGCTGTATCAAGATGC  400

seq1  CTTGCACTGGTCTGGCCTGTGTCCACACCATAACGGCAGCTCTTCCAGGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCACTGGTCTGGCCTGTGTCCACACCATAACGGCAGCTCTTCCAGGC  450

seq1  TCTCCGCTCTCTCCTCTGAGGCTGAACCGGCAAGGAATATTAGGATCTGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCGCTCTCTCCTCTGAGGCTGAACCGGCAAGGAATATTAGGATCTGC  500

seq1  CTTGCATGTGTTGGTTCTCTAGAACTGAGGCACAAGGCAATGAGGACTCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATGTGTTGGTTCTCTAGAACTGAGGCACAAGGCAATGAGGACTCT  550

seq1  GAGATAGTGGTCTGGGACATGAGTGTCCTAGATCAGAGCCGCTAAGATGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAGTGGTCTGGGACATGAGTGTCCTAGATCAGAGCCGCTAAGATGA  600

seq1  AATAACAACTTAGGAGGACTGGGCGGTAGGTCGGCCTCTCCTGTTGTTCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACAACTTAGGAGGACTGGGCGGTAGGTCGGCCTCTCCTGTTGTTCC  650

seq1  ATGTGACAAGGGTGAGAGACAGGGAGGTAGAGAATTC  684
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACAAGGGTGAGAGACAGGGAGGTAGAGAATTC  687