BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189N04
Chromosome7 (Build37)
Map Location 132,380,386 - 132,518,393
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4933440M02Rik
Upstream geneEG628779, EG545999, LOC670828
Downstream geneLOC100043014, Jmjd5, Nsmce1, EG244214, Il4ra, Il21r, Gtf3c1, D430042O09Rik, Gsg1l, Xpo6, Sbk1, LOC100043495, Lat, 2210013K02Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189N04.bB6Ng01-189N04.g
ACCGA013741GA013742
length1,1561,062
definitionB6Ng01-189N04.b B6Ng01-189N04.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(132,380,386 - 132,381,547)(132,517,331 - 132,518,393)
sequence
gaattcagctgacctagtctgagagctgaatgcatcaaaatgctagaaga
aaacaagcaaacctgcctgatttggactcatgtgggagtttcctctgagg
ttaaccttctatcttggaaggagactcataaacacaagaagtaaacaagt
caaaagagcttcaggaagtcccttgaaactggtaggattcactaggccct
tccctccccaagagtggatataagcagtaggaagtgctggaagtcactca
cagatcagtcaacctgcccagaagactctctaacatgctgagttgcctaa
aagagagtcagaccagctgagtcaccaagagggtacaaagattagccaag
ctgcctagaataagcagagagcagccaagtgatctggtcaaagctcagac
gaatagagctatctgcagagaagactcttcaactgtttgagctgcctgtg
agctgtgtagtgagctccaggtttctcgctttggtaagctgtcactcacg
ctgggtgggctttggtgatacagctgtcttaaagtcctctctgtccctcc
atgaagcccttaccaatacacctgtaagtaatgccaataaacccattgtt
tcaccaagttggacttaggtgatatccttcctttggtctgtctttggttc
tctgtctgagagaagagacatttgttctcatctccccaggaattgtgtca
aaaatcaggatgaaggctacagtttcttcaaagacatcaaaaaacattgg
agaaattttgtttttactccgttttttaaatggtgtctgctgaatctctc
tgtaagtattgttcatatgactgtgaacccagaaaatgtataacacatat
tgctggtctccttatatttgaattttgtgaaactttagcaatgctgtcaa
ctttggaaaaaggtatcctaagttacctttgttgagttgacgttacagaa
tgaacatccatgcttgttctaacaaacttaaactttaaacatatttttcc
atttgtacatgggtaactcattgtattaaatatgtaaagtctgattatgt
tggttctgttacgaggccattaaacaatctctaatggggaaaattgaccc
aaaggtaatgattaacattcatccaaccttaatgttggtatgttacaaag
agttag
gaattcactccctcttggttggggaaggcagtgcagagtggctctagctg
gggtgatgtgattgagtgacctaagcttttcacatcatggttaactagaa
agcagagcacacaggctggaactctggggtggatataaccttcaaaggcc
tacccctaacaacctatgtctaccagtcagggactacttcctaaaggccc
cacagccttcaaaacgttaccgcaagcagaggatagaacattgaatcccc
agtcctccctcatcactgacctccttggggtacagcctggagatctcacc
tgagaactcagctcaggctagcttttggaggagccagcctgaggcactgt
cctctcccttcctacatgcattgagcttctggctcaggaggagtcagtgg
gggagctgttaggaccttccatccagagcaacaggtccttcaacaaagga
caaagacaaagtgccatcctggctgcgggatgaggccaagggtgaattta
ggaagggaggccatgtttagatacccagctccctggccctgtaggttttt
cgtttttttttttcaccccaggttcatgaggtctactggctggccacctt
tcccactttcccattttatgtctatacagagtcttggggtcttcttagtc
tgctggccagagagaactggcaaacagctcttcctccagctcagttaata
attcaggagccagcacctacagccacccattactctaagcccattgacac
cctcaatgctggggcaatggacaggaaaggaaaaaaaatcacctgtctac
ttaaacaaatagacctcccctcacgtgcttgcctggtccctctgctgggg
tgggagggaccctgagcacctgtggcatcacactgcactctaggcctggg
aagtgcagcttgcttcttagatttggccaattatccctccctccatcttt
ctgttcaaggatgctgaagacccagaacgagtgttgaagaaggtgagaga
tgagttcttctcaagctgcaagcacccatgccttaggcaggaagaaaaga
ggggttctatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_132380386_132381547
seq2: B6Ng01-189N04.b_44_1199

seq1  GAATTCAGCTGACCTAGTCTGAGAGCTGAATGCATCAAAATGCTAGAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTGACCTAGTCTGAGAGCTGAATGCATCAAAATGCTAGAAGA  50

seq1  AAACAAGCAAACCTGCCTGATTTGGACTCATGTGGGAGTTTCCTCTGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGCAAACCTGCCTGATTTGGACTCATGTGGGAGTTTCCTCTGAGG  100

seq1  TTAACCTTCTATCTTGGAAGGAGACTCATAAACACAAGAAGTAAACAAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCTTCTATCTTGGAAGGAGACTCATAAACACAAGAAGTAAACAAGT  150

seq1  CAAAAGAGCTTCAGGAAGTCCCTTGAAACTGGTAGGATTCACTAGGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGAGCTTCAGGAAGTCCCTTGAAACTGGTAGGATTCACTAGGCCCT  200

seq1  TCCCTCCCCAAGAGTGGATATAAGCAGTAGGAAGTGCTGGAAGTCACTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCCCAAGAGTGGATATAAGCAGTAGGAAGTGCTGGAAGTCACTCA  250

seq1  CAGATCAGTCAACCTGCCCAGAAGACTCTCTAACATGCTGAGTTGCCTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATCAGTCAACCTGCCCAGAAGACTCTCTAACATGCTGAGTTGCCTAA  300

seq1  AAGAGAGTCAGACCAGCTGAGTCACCAAGAGGGTACAAAGATTAGCCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGTCAGACCAGCTGAGTCACCAAGAGGGTACAAAGATTAGCCAAG  350

seq1  CTGCCTAGAATAAGCAGAGAGCAGCCAAGTGATCTGGTCAAAGCTCAGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTAGAATAAGCAGAGAGCAGCCAAGTGATCTGGTCAAAGCTCAGAC  400

seq1  GAATAGAGCTATCTGCAGAGAAGACTCTTCAACTGTTTGAGCTGCCTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGAGCTATCTGCAGAGAAGACTCTTCAACTGTTTGAGCTGCCTGTG  450

seq1  AGCTGTGTAGTGAGCTCCAGGTTTCTCGCTTTGGTAAGCTGTCACTCACG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTGTAGTGAGCTCCAGGTTTCTCGCTTTGGTAAGCTGTCACTCACG  500

seq1  CTGGGTGGGCTTTGGTGATACAGCTGTCTTAAAGTCCTCTCTGTCCCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGGGCTTTGGTGATACAGCTGTCTTAAAGTCCTCTCTGTCCCTCC  550

seq1  ATGAAGCCCTTACCAATACACCTGTAAGTAATGCCAATAAACCCATTGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCCCTTACCAATACACCTGTAAGTAATGCCAATAAACCCATTGTT  600

seq1  TCACCAAGTTGGACTTAGGTGATATCCTTCCTTTGGTCTGTCTTTGGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAGTTGGACTTAGGTGATATCCTTCCTTTGGTCTGTCTTTGGTTC  650

seq1  TCTGTCTGAGAGAAGAGACATTTGTTCTCATCTCCCCAGGAATTGTGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCTGAGAGAAGAGACATTTGTTCTCATCTCCCCAGGAATTGTGTCA  700

seq1  AAAATCAGGATGAAGGCTACAGTTTCTTCAAAGACATCAAAAAACATTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCAGGATGAAGGCTACAGTTTCTTCAAAGACATCAAAAAACATTGG  750

seq1  AGAAATTTTGTTTTTACTCCGTTTTTTAAATGGTGTCTGCTGAATCTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATTTTGTTTTTACTCCGTTTTTTAAATGGTGTCTGCTGAATCTCTC  800

seq1  TGTAAGTATTGTTCATATGACTGTGAACCCAGAAAATGTATAACACATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTATTGTTCATATGACTGTGAACCCAGAAAATGTATAACACATAT  850

seq1  TGCTGGTCTCCTTATATTTGAATTTTGTGAAACTTTAGCAATGCTGTCAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGTCTCCTTATATTTGAATTTTGTGAAACTTTAGCAATGCTGTCAA  900

seq1  CTTTGGAAAAAGGTATCCTAAGTTACC-TTGTTGAGTTGACGTTTACAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| 
seq2  CTTTGGAAAAAGGTATCCTAAGTTACCTTTGTTGAGTTGACG-TTACAG-  948

seq1  AATGAACATCCATGC-TGTTCT-ACAAACTTTAAACTTTAAACATATTTT  997
      ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACATCCATGCTTGTTCTAACAAAC-TTAAACTTTAAACATATTTT  997

seq1  TCCATTTGTACAT-GGTAACTCATTGTATTAAATATGTAAAGTCTTGATT  1046
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCCATTTGTACATGGGTAACTCATTGTATTAAATATGTAAAGTC-TGATT  1046

seq1  ATGTGGGTTCTGTTACAGAGGCCAATAAAACATTCTCTAGTGGGGAAAAA  1096
      |||| ||||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||| ||||
seq2  ATGTTGGTTCTGTTAC-GAGGCC-ATTAAACAATCTCTAATGGGG-AAAA  1093

seq1  ATGACACAAAAAGTTAATGAATTAGACA-TCATCAAACTTTAAATGTT-G  1144
       |||| |  |||| ||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||| |
seq2  TTGACCC--AAAGGTAATG-ATTA-ACATTCATCCAACCTT-AATGTTGG  1138

seq1  TATGTTACAAAGAGTTAG  1162
      ||||||||||||||||||
seq2  TATGTTACAAAGAGTTAG  1156

seq1: chr7_132517331_132518393
seq2: B6Ng01-189N04.g_66_1127 (reverse)

seq1  ACATAGAACCCCTCTCTCCTTCCTGCCTAAGGCATGGGTGCTTGCAGCTT  50
      ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGAACCCCTCTTTTCTTCCTGCCTAAGGCATGGGTGCTTGCAGCTT  50

seq1  GAGGAAGAACTCATCTCTCACC-TCTCCAACACTCGTTCTGTGTCTTCAG  99
      || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  GA-GAAGAACTCATCTCTCACCTTCTTCAACACTCGTTCTGGGTCTTCAG  99

seq1  CATCCCTGAACAG-AAGATGGAGGGAGGGATAAATGGCCAAATCTAAAGA  148
      ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  CATCCTTGAACAGAAAGATGGAGGGAGGGATAATTGGCCAAATCT-AAGA  148

seq1  AGCAAGCTGCACCTTCCAAGGCCTAGAGTGCAGTGTGATGCCACAGGTGC  198
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGCAAGCTGCA-CTTCCCAGGCCTAGAGTGCAGTGTGATGCCACAGGTG-  196

seq1  CTCAGGGTCCCTCCCACCCCAGCAGAGGGACCAGGCAAGCACGTGAGGGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGTCCCTCCCACCCCAGCAGAGGGACCAGGCAAGCACGTGAGGGG  246

seq1  AGGTCTATTTG-TTAAGTAGACAGGTGATTTTTTTTCCTTTCCTGTCCAT  297
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTATTTGTTTAAGTAGACAGGTGATTTTTTTTCCTTTCCTGTCCAT  296

seq1  TGCCCCAGCATTGAGGGTGTCAATGGGCTTAGAGTAATGGGTGGCTGTAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCAGCATTGAGGGTGTCAATGGGCTTAGAGTAATGGGTGGCTGTAG  346

seq1  GTGCTGGCTCCTGAATTATTAACTGAGCTGGAGGAAGAGCTGTTTGCCAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGCTCCTGAATTATTAACTGAGCTGGAGGAAGAGCTGTTTGCCAG  396

seq1  TTCTCTCTGGCCAGCAGACTAAGAAGACCCCAAGACTCTGTATAGACATA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCTGGCCAGCAGACTAAGAAGACCCCAAGACTCTGTATAGACATA  446

seq1  AAATGGGAAAGTGGGAAAGGTGGCCAGCCAGTAGACCTCATGAACCTGGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGGAAAGTGGGAAAGGTGGCCAGCCAGTAGACCTCATGAACCTGGG  496

seq1  GTGAAAAAAAAAAACGAAAAACCTACAGGGCCAGGGAGCTGGGTATCTAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAAAAAAAAACGAAAAACCTACAGGGCCAGGGAGCTGGGTATCTAA  546

seq1  ACATGGCCTCCCTTCCTAAATTCACCCTTGGCCTCATCCCGCAGCCAGGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGCCTCCCTTCCTAAATTCACCCTTGGCCTCATCCCGCAGCCAGGA  596

seq1  TGGCACTTTGTCTTTGTCCTTTGTTGAAGGACCTGTTGCTCTGGATGGAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACTTTGTCTTTGTCCTTTGTTGAAGGACCTGTTGCTCTGGATGGAA  646

seq1  GGTCCTAACAGCTCCCCCACTGACTCCTCCTGAGCCAGAAGCTCAATGCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTAACAGCTCCCCCACTGACTCCTCCTGAGCCAGAAGCTCAATGCA  696

seq1  TGTAGGAAGGGAGAGGACAGTGCCTCAGGCTGGCTCCTCCAAAAGCTAGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGAAGGGAGAGGACAGTGCCTCAGGCTGGCTCCTCCAAAAGCTAGC  746

seq1  CTGAGCTGAGTTCTCAGGTGAGATCTCCAGGCTGTACCCCAAGGAGGTCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTGAGTTCTCAGGTGAGATCTCCAGGCTGTACCCCAAGGAGGTCA  796

seq1  GTGATGAGGGAGGACTGGGGATTCAATGTTCTATCCTCTGCTTGCGGTAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGAGGGAGGACTGGGGATTCAATGTTCTATCCTCTGCTTGCGGTAA  846

seq1  CGTTTTGAAGGCTGTGGGGCCTTTAGGAAGTAGTCCCTGACTGGTAGACA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTTGAAGGCTGTGGGGCCTTTAGGAAGTAGTCCCTGACTGGTAGACA  896

seq1  TAGGTTGTTAGGGGTAGGCCTTTGAAGGTTATATCCACCCCAGAGTTCCA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTGTTAGGGGTAGGCCTTTGAAGGTTATATCCACCCCAGAGTTCCA  946

seq1  GCCTGTGTGCTCTGCTTTCTAGTTAACCATGATGTGAAAAGCTTAGGTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGTGCTCTGCTTTCTAGTTAACCATGATGTGAAAAGCTTAGGTCA  996

seq1  CTCAATCACATCACCCCAGCTAGAGCCACTCTGCACTGCCTTCCCCAACC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATCACATCACCCCAGCTAGAGCCACTCTGCACTGCCTTCCCCAACC  1046

seq1  AAGAGGGAGTGAATTC  1063
      ||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGAGTGAATTC  1062