BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-200G08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 88,663,274 - 88,788,564
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFsd2, Whdc1, Homer2
Upstream geneBlm, Crtc3, Iqgap1, LOC100042402, Zscan2, Wdr73, Nmb, Sec11a, Zfp592, Alpk3, Slc28a1, EG623286, LOC100043130, Pde8a, EG636544, Rps17, Cpeb1, LOC623355, Ap3b2, BC048679
Downstream gene2610204K14Rik, 3110040N11Rik, Btbd1, Tm6sf1, LOC100043161, Hdgfrp3, Bnc1, Sh3gl3, Adamtsl3, 1700129I04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-200G08.bB6Ng01-200G08.g
ACCGA021472GA021473
length588717
definitionB6Ng01-200G08.b B6Ng01-200G08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(88,787,972 - 88,788,564)(88,663,274 - 88,663,806)
sequence
attacaaattgagaccaatacagcaaagcactttcgttgcgcacactaac
ctactgaatgccctaactctgccacatagctgctacagagtgcggctgtt
tacctgggtgaccacatggctgctgtccagcaaaggatcatgctaggtat
ccccagctggggaaagaacaccgtttacaggctgtagtatagctctcaac
tgcgtgccaaatgcagtatttcagattcagcacagcaaaaataaagtaaa
ataaataaaagtgtgaagtatgatttctaatgactatgaatcactttcac
accatgataaagtcaaagactcttaagtggagtcatgttccatattccaa
aagtatgtgtgggccactccctaattacatgatcctcatccatccattaa
gagattatcctctcctgaaactgtaacaggcgttcccttggtaatttagc
cattcatttgtgtgtgtgcatgtctgtgtctctgtgtgtgtgtggttatg
agagagagatagagagagagagagagagagagagacctagaccctaaacc
ataggttgcagtcatcttgacaagccagcaagtgattt
gaattcaattaaaaataaaatgggttgggaggggaggctacagagatggc
tcagtagctaagagcactgactgctcttccaaaggaccctggttcaatcc
ccagcatccacatggcagctcacaactgtctgtaactctagttcctagag
atccatcacctgcacacagacacacatgcagaaaaaacaccaatgcacat
aaaataaggaaaaaaaaaagggctggagagatggctcagctgtcaagagc
actgactattcttccacaggtcctgagttcaattcccagcaatcacttgg
tggctcataacctctgtaatgggatctgatgccctcttctggtatgtcta
aagacagccacagtgtactcatgttcataaaataaataattatttaaaaa
aaaagaaatggaaaaaaaaaaccccagaccagagaccttaacagagacat
cacctggaaagacatgtttacgataaataaacacatgaagagatggtcac
atcatccattagagaaatgcaaactgaacaacaacaggaggtggctgcac
actcactggaatgcccaacctggagcacaactccaaatgtttggtgagca
tttgaatcaacaggacatctcattcactgctggtaagaatgcaacattat
ccaagtcagaaaatattcacctggccccaacaattgtcttctcttagtat
tgacccaaattttgtcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_88787972_88788564
seq2: B6Ng01-200G08.b_47_640 (reverse)

seq1  AAATCACTCGCTGGCTTGTCAAGATGACTGCAACCTATGGTTTAGGGTCT  50
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCACTTGCTGGCTTGTCAAGATGACTGCAACCTATGGTTTAGGGTCT  50

seq1  CGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATAACCACACA  100
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTCTCATAACCACACA  100

seq1  CACACAGAGACACAGACATGCACACACACAAATGAATGGCTAAATTACCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGAGACACAGACATGCACACACACAAATGAATGGCTAAATTACCA  150

seq1  AGGGAACGCCTGTTACAGTTTCAGGAGAGGATAATCTCTTAATGGATGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAACGCCTGTTACAGTTTCAGGAGAGGATAATCTCTTAATGGATGGA  200

seq1  TGAGGATCATGTAATTAGGGAGTGGCCCACACATACTTTTGGAATATGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGATCATGTAATTAGGGAGTGGCCCACACATACTTTTGGAATATGGA  250

seq1  ACATGACTCCACTTAAGAGTCTTTGACTTTATCATGGTGTGAAAGTGATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGACTCCACTTAAGAGTCTTTGACTTTATCATGGTGTGAAAGTGATT  300

seq1  CATAGTCATTAGAAATCATACTTCACACTTTTATTTATTTTACTTTATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCATTAGAAATCATACTTCACACTTTTATTTATTTTACTTTATTT  350

seq1  TTGCTGTGCTGAATCTGAAATACTGCATTTGGCACGCAGTTGAGAGCTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTGCTGAATCTGAAATACTGCATTTGGCACGCAGTTGAGAGCTAT  400

seq1  ACTACAGCCTGTAAACGGTGTTCTTTCCCCAGCTGGGGATACCTAGCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAGCCTGTAAACGGTGTTCTTTCCCCAGCTGGGGATACCTAGCATG  450

seq1  ATCCTTTGCTGGACAGCAGCCATGTGGTCACCCAGGTAAACAGCCGCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTGCTGGACAGCAGCCATGTGGTCACCCAGGTAAACAGCCGCACT  500

seq1  CTGTAGCAGCTATGTGGCAGAGTTAGGGCATTCAGTAGGTTAGTGTGCGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGCAGCTATGTGGCAGAGTTAGGGCATTCAGTAGGTTAGTGTGCGC  550

seq1  AACG-CAGTGCTTTGCTGTATTGGTCTCAATTTGTAATGAATTC  593
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGAAAGTGCTTTGCTGTATTGGTCTCAATTTGTAATGAATTC  594

seq1: chr7_88663274_88663806
seq2: B6Ng01-200G08.g_70_602

seq1  GAATTCAATTAAAAATAAAATGGGTTGGGAGGGGAGGCTACAGAGATGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTAAAAATAAAATGGGTTGGGAGGGGAGGCTACAGAGATGGC  50

seq1  TCAGTAGCTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGACCCTGGTTCAATCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGCTAAGAGCACTGACTGCTCTTCCAAAGGACCCTGGTTCAATCC  100

seq1  CCAGCATCCACATGGCAGCTCACAACTGTCTGTAACTCTAGTTCCTAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCATCCACATGGCAGCTCACAACTGTCTGTAACTCTAGTTCCTAGAG  150

seq1  ATCCATCACCTGCACACAGACACACATGCAGAAAAAACACCAATGCACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATCACCTGCACACAGACACACATGCAGAAAAAACACCAATGCACAT  200

seq1  AAAATAAGGAAAAAAAAAAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCTGTCAAGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAGGAAAAAAAAAAGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCTGTCAAGAGC  250

seq1  ACTGACTATTCTTCCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAATCACTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGACTATTCTTCCACAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAATCACTTGG  300

seq1  TGGCTCATAACCTCTGTAATGGGATCTGATGCCCTCTTCTGGTATGTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCATAACCTCTGTAATGGGATCTGATGCCCTCTTCTGGTATGTCTA  350

seq1  AAGACAGCCACAGTGTACTCATGTTCATAAAATAAATAATTATTTAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACAGCCACAGTGTACTCATGTTCATAAAATAAATAATTATTTAAAAA  400

seq1  AAAAGAAATGGAAAAAAAAAACCCCAGACCAGAGACCTTAACAGAGACAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAATGGAAAAAAAAAACCCCAGACCAGAGACCTTAACAGAGACAT  450

seq1  CACCTGGAAAGACATGTTTACGATAAATAAACACATGAAGAGATGGTCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGGAAAGACATGTTTACGATAAATAAACACATGAAGAGATGGTCAC  500

seq1  ATCATCCATCAGAGAAATGCAAACTGAACAACA  533
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCCATTAGAGAAATGCAAACTGAACAACA  533