BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-201E06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 86,933,232 - 87,048,979
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG665900, Mesp1, Mesp2, Anpep, Ap3s2
Upstream geneMrps11, Det1, Isg20l1, Isg20, Acan, Hapln3, Mfge8, Abhd2, Rlbp1, BC025462, Polg, AI854517, Rhcg, 5730590G19Rik, Plin, Pex11a, EG626359
Downstream gene2610034B18Rik, Zfp710, Idh2, Sema4b, Cib1, D330012F22Rik, LOC100042374, LOC100042379, Ttll13, Ngrn, Vps33b, Prc1, Rccd1, Unc45a, Hddc3, Man2a2, Fes, Furin, LOC384647, Blm, Crtc3, Iqgap1, LOC100042402, Zscan2, Wdr73, Nmb
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-201E06.bB6Ng01-201E06.g
ACCGA022089GA022090
length1,0361,065
definitionB6Ng01-201E06.b B6Ng01-201E06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,933,232 - 86,934,267)(87,047,915 - 87,048,979)
sequence
gaattcttattttatgagcatgcctggtaccagcagaggtcagaagaggg
tgttagactcttgttacaggctgtgactgaggctacagatagttgtgagc
caccacgtggatactgggaatcaaaccaaggttctctggaagagcagcaa
gtgctcttaatggtggaaccatctctctggcttgactggtaaaccaccag
cttggctgctgctccttaaagcactggcttatcagcatccacagagtact
gctgtcttggtctggaccggccccactgctgcccacactgctggctggga
taccctagagcttatgctgcgtgccccattggtgcacatgctggcatgac
tctgggactgttgactgtggttgtccccggccccagaattctcacaggag
gaatctcttgattctttgtgtttctgcttcctgatctgcacctgtcaggc
agcagcaggcaccaccctcctcacaggggctctgcagctacagggacttg
acgccacatagttccaacccatggacactcggcctggccattggcagctg
ctttgtagctgctggtccttcacccaggttctgaccagctcagatggaga
aagcagctcccttcctggaagaatggcagcaaggttgagagtgggctgtc
cggggcccaggtgcccatgtgactgtgctaattggaagacccaacttcct
ggcctgagccttgacctcttcagatcctgcaaaggacgcaaaggagttga
ggtgctgtctagcagacaggttctgcagtcagtcctaacgcagacactgg
gcatctgctggagcctgcgaacctcatctttccttataactttcccatcg
ttacaatgtcctggcattgggatgcctcttaaattggctgagtactaggg
tggtaggctcccccaccaaggtttggagtgccttcctgggtgcaggacta
ctattgtcctcctgggggactggcacttggggtttcctccaggtgctgat
tgagccaggaaagggggatggggctgggatcagtgg
gaattcttttgtatgtagacattttgttaatttctttgcagtgttcttac
tttttatgtttcttgtacccgcactctgttgtccaggatctctagtgttg
tgcgggctaggcatggggtaaatggcatcaggtctgggtcgctggtttcc
aaagcacctcagctgttgccgtgaagcgcagcgtttgctgtgggtcttct
gtaaacatcctgtatcaggtgagggcttcttccttgttcttcctaatggc
tagggattgctggtcatgaaaggatgtcaggatttgtcagaagtccttcc
tctgcctcttgggtgcctttttgcctcatccttctaatgccattttaaac
atctgtgaggatgtctgctcagccagtaaacgattccatttattgggcat
ggcttttagaaggaagtaagtggccataaaaatgctgcccttcctttctc
gtgcatcttatcttcttgtcagttccataaagcaccttgctgctgcagca
gatttttttgctgttcatacaactgtttatttttagctgtgggttggcac
tgagaaatgactgctcatatctatttgttgttgaagttgatggtagaagg
agtcagaatcctgtcttagtcacccttagacttactgaaggtgtttccca
gagagcgactccactttccttgcatgtcagcctggctatctgcactctca
caaagtatttgccatctcaggtgtgccttgatagtcagctgttttgttta
acttacgtaggcaaaagacctatctgaaaacagcaagcttatcactggat
tcatgcttcttaacggaagactctttcccttaacttgaggccagcagcgc
ctggcggtggatcttgctggtcccggcagctgcttaattaagctgccccc
ttaaatgctcattgaagcttagagcagcaaggcccacccagacaacattt
gactgaattctaatactttcaaaattttccagtctggtgtttctttgtta
cttgaagaaaggtctcatgtagcctagctggcctgggagcttccttactg
tggtagctgagctaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_86933232_86934267
seq2: B6Ng01-201E06.b_46_1081

seq1  GAATTCTTATTTTATGAGCATGCCTGGTACCAGCAGAGGTCAGAAGAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATTTTATGAGCATGCCTGGTACCAGCAGAGGTCAGAAGAGGG  50

seq1  TGTTAGACTCTTGTTACAGGCTGTGACTGAGGCTACAGATAGTTGTGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGACTCTTGTTACAGGCTGTGACTGAGGCTACAGATAGTTGTGAGC  100

seq1  CACCACGTGGATACTGGGAATCAAACCAAGGTTCTCTGGAAGAGCAGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACGTGGATACTGGGAATCAAACCAAGGTTCTCTGGAAGAGCAGCAA  150

seq1  GTGCTCTTAATGGTGGAACCATCTCTCTGGCTTGACTGGTAAACCACCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTTAATGGTGGAACCATCTCTCTGGCTTGACTGGTAAACCACCAG  200

seq1  CTTGGCTGCTGCTCCTTAAAGCACTGGCTTATCAGCATCCACAGAGTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTGCTGCTCCTTAAAGCACTGGCTTATCAGCATCCACAGAGTACT  250

seq1  GCTGTCTTGGTCTGGACCGGCCCCACTGCTGCCCACACTGCTGGCTGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTTGGTCTGGACCGGCCCCACTGCTGCCCACACTGCTGGCTGGGA  300

seq1  TACCCTAGAGCTTATGCTGCGTGCCCCATTGGTGCACATGCTGGCATGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCTAGAGCTTATGCTGCGTGCCCCATTGGTGCACATGCTGGCATGAC  350

seq1  TCTGGGACTGTTGACTGTGGTTGTCCCCGGCCCCAGAATTCTCACAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGACTGTTGACTGTGGTTGTCCCCGGCCCCAGAATTCTCACAGGAG  400

seq1  GAATCTCTTGATTCTTTGTGTTTCTGCTTCCTGATCTGCACCTGTCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCTTGATTCTTTGTGTTTCTGCTTCCTGATCTGCACCTGTCAGGC  450

seq1  AGCAGCAGGCACCACCCTCCTCACAGGGGCTCTGCAGCTACAGGGACTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCAGGCACCACCCTCCTCACAGGGGCTCTGCAGCTACAGGGACTTG  500

seq1  ACGCCACATAGTTCCAACCCATGGACACTCGGCCTGGCCATTGGCAGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCACATAGTTCCAACCCATGGACACTCGGCCTGGCCATTGGCAGCTG  550

seq1  CTTTGTAGCTGCTGGTCCTTCACCCAGGTTCTGACCAGCTCAGATGGAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAGCTGCTGGTCCTTCACCCAGGTTCTGACCAGCTCAGATGGAGA  600

seq1  AAGCAGCTCCCTTCCTGGAAGAATGGCAGCAAGGTTGAGAGTGGGCTGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGCTCCCTTCCTGGAAGAATGGCAGCAAGGTTGAGAGTGGGCTGTC  650

seq1  CGGGGCCCAGGTGCCCATGTGACTGTGCTAATTGGAAGACCCAACTTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGCCCAGGTGCCCATGTGACTGTGCTAATTGGAAGACCCAACTTCCT  700

seq1  GGCCTGAGCCTTGACCTCTTCAGATCCTGCAAAGGACGCAAAGGAGTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGAGCCTTGACCTCTTCAGATCCTGCAAAGGACGCAAAGGAGTTGA  750

seq1  GGTGCTGTCTAGCAGACAGGTTCTGCAGTCAGTCCTAACGCAGACACTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGTCTAGCAGACAGGTTCTGCAGTCAGTCCTAACGCAGACACTGG  800

seq1  GCATCTGCTGGAGCCTGCGAACCTCATCTTTCCTTATAAC-TTCCCATCG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCATCTGCTGGAGCCTGCGAACCTCATCTTTCCTTATAACTTTCCCATCG  850

seq1  TTACAATGTCCTGGCATTGGGATGCCTCTTAGATTGGCTGAGTACTAGGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTACAATGTCCTGGCATTGGGATGCCTCTTAAATTGGCTGAGTACTAGGG  900

seq1  TGGTAGGCTCCCCCACCAAGGTTTGGAGTGCCTTCCTGGGTGCAGGACTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGGCTCCCCCACCAAGGTTTGGAGTGCCTTCCTGGGTGCAGGACTA  950

seq1  CTATTGTCCTCCT-GGGGACTGGCACTTGGGGTTTCCTCCAGGTGCTGAT  998
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGTCCTCCTGGGGGACTGGCACTTGGGGTTTCCTCCAGGTGCTGAT  1000

seq1  TGGGCCAGGAAGGGGGGGATGGGGCCTGGGATCAGTGG  1036
      || ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGAGCCAGGAA-AGGGGGATGGGG-CTGGGATCAGTGG  1036

seq1: chr7_87047915_87048979
seq2: B6Ng01-201E06.g_67_1131 (reverse)

seq1  TTAGCCTCAGCTA-CACAGTAAGGAAGCT-CCAGGCCAGCCTAGGCTACA  48
      |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||
seq2  TTAG-CTCAGCTACCACAGTAAGGAAGCTCCCAGGCCAG-CTAGGCTACA  48

seq1  TGAGACCTTTTCTCAAAGTAACAAAAGAAACACCAAGACTGGAAAATTTT  98
      ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGAGACC-TTTCTTCAAGTAAC-AAAGAAACACC-AGACTGGAAAATTTT  95

seq1  GAAAGTATTAGAAATTCAGTCAAATG-TGTCTGGGTGGGCC-TGCTGCTC  146
      ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAAGTATTAG-AATTCAGTCAAATGTTGTCTGGGTGGGCCTTGCTGCTC  144

seq1  TAAGCTTC-ATGAGCA-TTAAGGGGGCAGCTTAATTAAGCAGCTGCCGGG  194
      |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTTCAATGAGCATTTAAGGGGGCAGCTTAATTAAGCAGCTGCCGGG  194

seq1  ACCAGCAAGATCCACCGCCAGGCGCTGCTGGCCTCAAGTTAAGGGAAAGA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCAAGATCCACCGCCAGGCGCTGCTGGCCTCAAGTTAAGGGAAAGA  244

seq1  GTCTTCCGTTAAGAAGCATGAATCCAGTGATAAGCTTGCTGTTTTCAGAT  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCCGTTAAGAAGCATGAATCCAGTGATAAGCTTGCTGTTTTCAGAT  294

seq1  AGGTCTTTTGCCTACGTAAGTTAAACAAAACAGCTGACTATCAAGGCACA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTTGCCTACGTAAGTTAAACAAAACAGCTGACTATCAAGGCACA  344

seq1  CCTGAGATGGCAAATACTTTGTGAGAGTGCAGATAGCCAGGCTGACATGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGATGGCAAATACTTTGTGAGAGTGCAGATAGCCAGGCTGACATGC  394

seq1  AAGGAAAGTGGAGTCGCTCTCTGGGAAACACCTTCAGTAAGTCTAAGGGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAAGTGGAGTCGCTCTCTGGGAAACACCTTCAGTAAGTCTAAGGGT  444

seq1  GACTAAGACAGGATTCTGACTCCTTCTACCATCAACTTCAACAACAAATA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAGACAGGATTCTGACTCCTTCTACCATCAACTTCAACAACAAATA  494

seq1  GATATGAGCAGTCATTTCTCAGTGCCAACCCACAGCTAAAAATAAACAGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAGCAGTCATTTCTCAGTGCCAACCCACAGCTAAAAATAAACAGT  544

seq1  TGTATGAACAGCAAAAAAATCTGCTGCAGCAGCAAGGTGCTTTATGGAAC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGAACAGCAAAAAAATCTGCTGCAGCAGCAAGGTGCTTTATGGAAC  594

seq1  TGACAAGAAGATAAGATGCACGAGAAAGGAAGGGCAGCATTTTTATGGCC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGAAGATAAGATGCACGAGAAAGGAAGGGCAGCATTTTTATGGCC  644

seq1  ACTTACTTCCTTCTAAAAGCCATGCCCAATAAATGGAATCGTTTACTGGC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACTTCCTTCTAAAAGCCATGCCCAATAAATGGAATCGTTTACTGGC  694

seq1  TGAGCAGACATCCTCACAGATGTTTAAAATGGCATTAGAAGGATGAGGCA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGACATCCTCACAGATGTTTAAAATGGCATTAGAAGGATGAGGCA  744

seq1  AAAAGGCACCCAAGAGGCAGAGGAAGGACTTCTGACAAATCCTGACATCC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGCACCCAAGAGGCAGAGGAAGGACTTCTGACAAATCCTGACATCC  794

seq1  TTTCATGACCAGCAATCCCTAGCCATTAGGAAGAACAAGGAAGAAGCCCT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGACCAGCAATCCCTAGCCATTAGGAAGAACAAGGAAGAAGCCCT  844

seq1  CACCTGATACAGGATGTTTACAGAAGACCCACAGCAAACGCTGCGCTTCA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGATACAGGATGTTTACAGAAGACCCACAGCAAACGCTGCGCTTCA  894

seq1  CGGCAACAGCTGAGGTGCTTTGGAAACCAGCGACCCAGACCTGATGCCAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCAACAGCTGAGGTGCTTTGGAAACCAGCGACCCAGACCTGATGCCAT  944

seq1  TTACCCCATGCCTAGCCCGCACAACACTAGAGATCCTGGACAACAGAGTG  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCCATGCCTAGCCCGCACAACACTAGAGATCCTGGACAACAGAGTG  994

seq1  CGGGTACAAGAAACATAAAAAGTAAGAACACTGCAAAGAAATTAACAAAA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGTACAAGAAACATAAAAAGTAAGAACACTGCAAAGAAATTAACAAAA  1044

seq1  TGTCTACATACAAAAGAATTC  1065
      |||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTACATACAAAAGAATTC  1065