BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-201K03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 37,100,796 - 37,297,113
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGpatch1, Rhpn2, C230052I12Rik, Ccdc123, Slc7a9, 2410004F06Rik, Nudt19, Rgs9bp, Ankrd27, Pdcd5, Dpy19l3, zfp507, LOC100043872, EG668988, LOC668507
Downstream geneTshz3, LOC100043874, Zfp536
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-201K03.bB6Ng01-201K03.g
ACCGA022353GA022354
length4701,040
definitionB6Ng01-201K03.b B6Ng01-201K03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,296,638 - 37,297,113)(37,100,796 - 37,101,840)
sequence
ttgggattattacccagttgagaatgaaaacatggattgccagggatgga
ttttacattgaccccgagtttataaaaacttctggtggcattcactcttg
gtgtatgtgtagtacattgctgcttgctgcatgctttcttccaattaggt
ggcatcatttaaccttccccatagcccagagtctgggtccaacaagtctc
atttgatttgaaaggaaatggaggctcagagagtctaaaaatcttggcgg
gatcaaatggctgaggagtaggtgtgtggtcatgcgaaccagatgggacc
acatcaggggtccttgctttgtgtttatgttgtacccatgaggaagtttc
tgggactagtagacttgatgcacaatttgaagctcaacagagcccgagat
ctgtgcactgttttcaaaagttatgcaaatcatttgaatcaattaaatgg
tagtggtggtggtggtggta
gaattcaattaggctggattgtattgattagatcagttttgctttggctc
tggctagtctgctttctacaggtaggtcctagatcttggaattgtgggac
cttccagcttctttccatttattttatcatgacaaaatatttgttggtgg
ggacagctcttaaaccacggagcccacctagggatgtagatccacttaca
tctctattgttagagcaaaagcatttgaaggaaattcggtagatgctact
atacccagagtaatgttctgctctaaccagcctctcaattgaatgcagag
accccataacgcagagagaactatatccactggatactgttttctgatta
taagtctcatcccagcaggccatagggccggggagacatcctagaatcca
tccaaactaacagaaacgtgggggtttaagatcaatgtgagcccatatgg
aagttgcactgtgtttcctagatgttgagccctgggtcctggaggcacag
ccagcaatggatagataagggtctgtctccagggtagcccactgagggag
ttgggcaagcaagacccaaagtacaacctatctttagccactagagttat
acccaagattctgtgtgatctatcactgcagtttcttagccctcatgggt
ggctttctaggggatggggcagtgtgactttaggctgcttcatctgttgt
gagccttgagaaatgagcagtgtataaacgcctgtcttgctggactgtga
tggggcagaagagatacagtccctaacacactcccttactaagcgttgat
caccagaactcttaggaggtggccagacaggcaggggtctcatggatggg
catagattgcagatgatgggaaaggcctttggggcagatggtggttagca
gatttgtaacttcagatgcttgttctatcagaggactgcagaactgccct
gggggagggacttggggccatgcccagatgggtgtgccttactgaggatc
tacttagagctgttgtataaacaggagtgctgcttgtgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_37296638_37297113
seq2: B6Ng01-201K03.b_43_518 (reverse)

seq1  TACCACCACCACCACCACTACCATTTAATTGATTCAAATGATTTGCATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACCACCACCACCACTACCATTTAATTGATTCAAATGATTTGCATAA  50

seq1  CTTTTGAAAACAGTGCACAGATCTCGGGCTCTGTTGAGCTTCAAATTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGAAAACAGTGCACAGATCTCGGGCTCTGTTGAGCTTCAAATTGTG  100

seq1  CATCAAGTCTACTAGTCCCAGAAACTTCCTCATGGGTACAACATAAACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAGTCTACTAGTCCCAGAAACTTCCTCATGGGTACAACATAAACAC  150

seq1  AAAGCAAGGACCCCTGATGTGGTCCCATCTGGTTCGCATGACCACACACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAGGACCCCTGATGTGGTCCCATCTGGTTCGCATGACCACACACC  200

seq1  TACTCCTCAGCCATTTGATCCCGCCAAGATTTTTAGACTCTCTGAGCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCTCAGCCATTTGATCCCGCCAAGATTTTTAGACTCTCTGAGCCTC  250

seq1  CATTTCCTTTCAAATCAAATGAGACTTGTTGGACCCAGACTCTGGGCTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCCTTTCAAATCAAATGAGACTTGTTGGACCCAGACTCTGGGCTAT  300

seq1  GGGGAAGGTTAAATGATGCCACCTAATTGGAAGAAAGCATGCAGCAAGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGGTTAAATGATGCCACCTAATTGGAAGAAAGCATGCAGCAAGCA  350

seq1  GCAATGTACTACACATACACCAAGAGTGAATGCCACCAGAAGTTTTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGTACTACACATACACCAAGAGTGAATGCCACCAGAAGTTTTTATA  400

seq1  AACTCGGGGTCAATGTAAAATCCATCCCTGGCAATCCATGTTTTCATTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCGGGGTCAATGTAAAATCCATCCCTGGCAATCCATGTTTTCATTCT  450

seq1  CAACTGGGTAATAATCCCAAGAATTC  476
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGGGTAATAATCCCAAGAATTC  476

seq1: chr7_37100796_37101840
seq2: B6Ng01-201K03.g_64_1103

seq1  GAATTCAATTAGGCTGGATTGTATTGATTAGATCAGTTTTGCTTTGGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTAGGCTGGATTGTATTGATTAGATCAGTTTTGCTTTGGCTC  50

seq1  TGGCTAGTCTGCTTTCTACAGGTAGGTCCTAGATCTTGGAATTGTGGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAGTCTGCTTTCTACAGGTAGGTCCTAGATCTTGGAATTGTGGGAC  100

seq1  CTTCCAGCTTCTTTCCATTTATTTTATCATGACAAAATATTTGTTGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAGCTTCTTTCCATTTATTTTATCATGACAAAATATTTGTTGGTGG  150

seq1  GGACAGCTCTTAAACCACGGAGCCCACCTAGGGATGTAGATCCACTTACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGCTCTTAAACCACGGAGCCCACCTAGGGATGTAGATCCACTTACA  200

seq1  TCTCTATTGTTAGAGCAAAAGCATTTGAAGGAAATTCGGTAGATGCTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATTGTTAGAGCAAAAGCATTTGAAGGAAATTCGGTAGATGCTACT  250

seq1  ATACCCAGAGTAATGTTCTGCTCTAACCAGCCTCTCAATTGAATGCAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCAGAGTAATGTTCTGCTCTAACCAGCCTCTCAATTGAATGCAGAG  300

seq1  ACCCCATAACGCAGAGAGAACTATATCCACTGGATACTGTTTTCTGATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCATAACGCAGAGAGAACTATATCCACTGGATACTGTTTTCTGATTA  350

seq1  TAAGTCTCATCCCAGCAGGCCATAGGGCCGGGGAGACATCCTAGAATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCTCATCCCAGCAGGCCATAGGGCCGGGGAGACATCCTAGAATCCA  400

seq1  TCCAAACTAACAGAAACGTGGGGGTTTAAGATCAATGTGAGCCCATATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAACTAACAGAAACGTGGGGGTTTAAGATCAATGTGAGCCCATATGG  450

seq1  AAGTTGCACTGTGTTTCCTAGATGTTGAGCCCTGGGTCCTGGAGGCACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGCACTGTGTTTCCTAGATGTTGAGCCCTGGGTCCTGGAGGCACAG  500

seq1  CCAGCAATGGATAGATAAGGGTCTGTCTCCAGGGTAGCCCACTGAGGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAATGGATAGATAAGGGTCTGTCTCCAGGGTAGCCCACTGAGGGAG  550

seq1  TTGGGCAAGCAAGACCCAAAGTACAACCTATCTTTAGCCACTAGAGTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCAAGCAAGACCCAAAGTACAACCTATCTTTAGCCACTAGAGTTAT  600

seq1  ACCCAAGATTCTGTGTGATCTATCACTGCAGTTTCTTAGCCCTCATGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAGATTCTGTGTGATCTATCACTGCAGTTTCTTAGCCCTCATGGGT  650

seq1  GGCTTTCTAGGGGATGGGGCAGTGTGACTTTAGGCTGCTTCATCTGTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTCTAGGGGATGGGGCAGTGTGACTTTAGGCTGCTTCATCTGTTGT  700

seq1  GAGCCTTGAGAAATGAGCAGTGTATAAACGCCTGTCTTGCTGGACTGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTTGAGAAATGAGCAGTGTATAAACGCCTGTCTTGCTGGACTGTGA  750

seq1  TGGGGCAGAAGAGATACAGTCCCTAACACACTCCCTTACTAAGCGTTGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCAGAAGAGATACAGTCCCTAACACACTCCCTTACTAAGCGTTGAT  800

seq1  CACCAGAACTCTTAGGAGGTGGCCAGACAGGCAGGGGTCTCATGGATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGAACTCTTAGGAGGTGGCCAGACAGGCAGGGGTCTCATGGATGGG  850

seq1  CATAGATTGCAGATGATGGG-AAGGCCTTTGGGGCAGATGGTGGTTAGCA  899
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGATTGCAGATGATGGGAAAGGCCTTTGGGGCAGATGGTGGTTAGCA  900

seq1  GATTTGTAACTTCAGATGCTTGTTCTATCAGGAGGACTGCAGAACTGCCC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GATTTGTAACTTCAGATGCTTGTTCTATCA-GAGGACTGCAGAACTGCCC  949

seq1  TGGGGGAGGGACTTGGGGCCAATGCCCAAGATGGGGTGTGCCTTACTGAG  999
      |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  TGGGGGAGGGACTTGGGGCC-ATGCCC-AGAT-GGGTGTGCCTTACTGAG  996

seq1  GATCTAACTTAGAGCTGGTTTGTAT-AACAGGAGTGCTGCTTGTGTT  1045
      ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GATCT-ACTTAGAGCTG--TTGTATAAACAGGAGTGCTGCTTGTGTT  1040