BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203I22
Chromosome7 (Build37)
Map Location 143,617,885 - 143,779,300
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneClrn3, Ptpre, Mki67, LOC668764
Downstream geneLOC546009, EG621677, EG668771, Mgmt, EG621804, Ebf3, 9430038I01Rik, Txnl2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203I22.bB6Ng01-203I22.g
ACCGA023739GA023740
length8721,148
definitionB6Ng01-203I22.b B6Ng01-203I22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(143,778,431 - 143,779,300)(143,617,885 - 143,619,020)
sequence
gaattctctctgctatttatagaaaatctcagagatggccagttgattct
gaggcccatgagttgaggggcatctaacagaggagggtagacacaccagc
cagaaaaggacagtggcagagagagaccttggaaccagtatggcaccatg
taaccagggagctccagcttcctgtgtctcaggtggagtacattccagca
gtgcagatggagttctgaggttacatgtccacctcttgatggggcccact
gggacagcattgttctggggtaggatgtcatttatactcatactggagag
cacacaggatggtgagagaggtgactagagaggaaggccagggctgctga
aactccaggatcgttgaataagattaaacaaagaggggaagtcagagaca
cagaggggcctatctttgagcaagactacttgattcagtcgatgcatatc
tgacatgaacttaaggagggggaggtttgtccatgctctgtaagttgtga
atacttttatcaagcaagagggaaactttatctcatttttatgtcaggca
tctttagaggagacaacacatattctggagtgggagaagagggagagatg
gagggacatggaaacagatgaacatttgtcagggaccaaggttgtctctg
ggaaacaaagacaaaggctagggagtggaagaaaacatctaacacaggaa
aacacacacacacacatgcacacacacacacacacttcacaagcacacac
atgcacacacacacacatgcacacacacacacactcacacacacacacac
ccacaagcacacacatgcacacacacacacaccatgcacacacactcaca
cacttacacacacgcacacaca

gaattcatcatgaattgaaacgcccagcatacagttatagatggcagcta
gccgaggacatcacctccaggtccttcagaatcacagggatggaagcagc
tgctctctgagaacaggatgtccccctggattctccaaagatgatagccc
tgtgtcagatgtccccgtagctaagatctctatcacttcttctccatatc
ctcatctttcaaagacaggttatgcaggccatgttcgagacagagctgta
gtcacactccacccctgtgaaggtgtagtcaatatattcagggtggtttt
gcatcaaagatttgtctgatttatgtccatctcattatttatttttatca
gcatgggcttataggcatttatcaaatactttgattataatttgctacta
tttttttttcatttttagccatccgagttttgcatttggtatctttggca
tatacgggagtgaacttttccattttgtgtgtttgtatgttttatagatg
atagaatatatatgtgtatctatctctatctacatgtctatgcatatgtt
tgtctctctatgtctctaggtgtgttgatatgtgcatctttgatgtattt
gtctctctatgtccctaggtgtgttgatatgtgcatctctgatgtatttg
tctctctatgtctctaggtgtgttgatatgtgcatctctgatgtatttgt
ctctctatgtccctaggtgtgttgatatgtgcatctctgatgtatttgtc
tctctatgtctctaggtgtgttgatatgtgcatctctgatgtatttgtct
ctctatgtctctaggtgtgttgatatgtgcatcttctgatgtatttgtct
ctctatgtctctagggtgtgttgatatgtgcatctctgatgtataaatga
atccataccacagaagaatgctttgttttttgccaaggaacagcagaaac
ggttagagatgcgtagccttgagggaggggagaagctctctgaatttgat
ctcgaagacacacacttctgaagtcattttctatttggattctttagtta
ctcatggcattctggaaatagtgaacctccttgcactactggcttttcat
ggtcattggggaaatctttcttttccgggcaagcctggccggatacct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_143778431_143779300
seq2: B6Ng01-203I22.b_42_913 (reverse)

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGAGTGTGTGTGCAT-GTGTGTGTGT  49
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGTGTGTGCGTGTGTGTAAGTGTGTGAGTGTGTGTGCATGGTGTGTGTGT  50

seq1  GTGTGCATGTGTGTGCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCATGTGTGTGCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGT  100

seq1  GTGCATGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGCTTGTG-AGTGTGTGTGTGTG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTGCATGTGTGTGTGTGTGCATGTGTGTGCTTGTGAAGTGTGTGTGTGTG  150

seq1  TGTGCATGTGTGTGTGTGTGTTTTCCTGTGTTAGATGTTTTCTTCCACTC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATGTGTGTGTGTGTGTTTTCCTGTGTTAGATGTTTTCTTCCACTC  200

seq1  CCTAGCCTTTGTCTTTGTTTCCCAGAGACAACCTTGGTCCCTGACAAATG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCCTTTGTCTTTGTTTCCCAGAGACAACCTTGGTCCCTGACAAATG  250

seq1  TTCATCTGTTTCCATGTCCCTCCATCTCTCCCTCTTCTCCCACTCCAGAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTGTTTCCATGTCCCTCCATCTCTCCCTCTTCTCCCACTCCAGAA  300

seq1  TATGTGTTGTCTCCTCTAAAGATGCCTGACATAAAAATGAGATAAAGTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTTGTCTCCTCTAAAGATGCCTGACATAAAAATGAGATAAAGTTT  350

seq1  CCCTCTTGCTTGATAAAAGTATTCACAACTTACAGAGCATGGACAAACCT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTTGCTTGATAAAAGTATTCACAACTTACAGAGCATGGACAAACCT  400

seq1  CCCCCTCCTTAAGTTCATGTCAGATATGCATCGACTGAATCAAGTAGTCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCCTTAAGTTCATGTCAGATATGCATCGACTGAATCAAGTAGTCT  450

seq1  TGCTCAAAGATAGGCCCCTCTGTGTCTCTGACTTCCCCTCTTTGTTTAAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAAAGATAGGCCCCTCTGTGTCTCTGACTTCCCCTCTTTGTTTAAT  500

seq1  CTTATTCAACGATCCTGGAGTTTCAGCAGCCCTGGCCTTCCTCTCTAGTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTCAACGATCCTGGAGTTTCAGCAGCCCTGGCCTTCCTCTCTAGTC  550

seq1  ACCTCTCTCACCATCCTGTGTGCTCTCCAGTATGAGTATAAATGACATCC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCTCACCATCCTGTGTGCTCTCCAGTATGAGTATAAATGACATCC  600

seq1  TACCCCAGAACAATGCTGTCCCAGTGGGCCCCATCAAGAGGTGGACATGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCAGAACAATGCTGTCCCAGTGGGCCCCATCAAGAGGTGGACATGT  650

seq1  AACCTCAGAACTCCATCTGCACTGCTGGAATGTACTCCACCTGAGACACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCAGAACTCCATCTGCACTGCTGGAATGTACTCCACCTGAGACACA  700

seq1  GGAAGCTGGAGCTCCCTGGTTACATGGTGCCATACTGGTTCCAAGGTCTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTGGAGCTCCCTGGTTACATGGTGCCATACTGGTTCCAAGGTCTC  750

seq1  TCTCTGCCACTGTCCTTTTCTGGCTGGTGTGTCTACCCTCCTCTGTTAGA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGCCACTGTCCTTTTCTGGCTGGTGTGTCTACCCTCCTCTGTTAGA  800

seq1  TGCCCCTCAACTCATGGGCCTCAGAATCAACTGGCCATCTCTGAGATTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCTCAACTCATGGGCCTCAGAATCAACTGGCCATCTCTGAGATTTT  850

seq1  CTATAAATAGCAGAGAGAATTC  870
      ||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAAATAGCAGAGAGAATTC  872


seq1: chr7_143617885_143619020
seq2: B6Ng01-203I22.g_62_1209

seq1  GAATTCATCATGAATTGAAACGCCCAGCATACAGTTATAGATGGCAGCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCATGAATTGAAACGCCCAGCATACAGTTATAGATGGCAGCTA  50

seq1  GCCGAGGACATCACCTCCAGGTCCTTCAGAATCACAGGGATGGAAGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGAGGACATCACCTCCAGGTCCTTCAGAATCACAGGGATGGAAGCAGC  100

seq1  TGCTCTCTGAGAACAGGATGTCCCCCTGGATTCTCCAAAGATGATAGCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTCTGAGAACAGGATGTCCCCCTGGATTCTCCAAAGATGATAGCCC  150

seq1  TGTGTCAGATGTCCCCGTAGCTAAGATCTCTATCACTTCTTCTCCATATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCAGATGTCCCCGTAGCTAAGATCTCTATCACTTCTTCTCCATATC  200

seq1  CTCATCTTTCAAAGACAGGTTATGCAGGCCATGTTCGAGACAGAGCTGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTTTCAAAGACAGGTTATGCAGGCCATGTTCGAGACAGAGCTGTA  250

seq1  GTCACACTCCACCCCTGTGAAGGTGTAGTCAATATATTCAGGGTGGTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACACTCCACCCCTGTGAAGGTGTAGTCAATATATTCAGGGTGGTTTT  300

seq1  GCATCAAAGATTTGTCTGATTTATGTCCATCTCATTATTTATTTTTATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAAAGATTTGTCTGATTTATGTCCATCTCATTATTTATTTTTATCA  350

seq1  GCATGGGCTTATAGGCATTTATCAAATACTTTGATTATAATTTGCTACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGGCTTATAGGCATTTATCAAATACTTTGATTATAATTTGCTACTA  400

seq1  TTTTTTTTTCATTTTTAGCCATCCGAGTTTTGCATTTGGTATCTTTGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTCATTTTTAGCCATCCGAGTTTTGCATTTGGTATCTTTGGCA  450

seq1  TATACGGGAGTGAACTTTTCCATTTTGTGTGTTTGTATGTTTTATAGATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACGGGAGTGAACTTTTCCATTTTGTGTGTTTGTATGTTTTATAGATG  500

seq1  ATAGAATATATATGTGTATCTATCTCTATCTACATGTCTATGCATATGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAATATATATGTGTATCTATCTCTATCTACATGTCTATGCATATGTT  550

seq1  TGTCTCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTTTGATGTATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTTTGATGTATTT  600

seq1  GTCTCTCTATGTCCCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTCTATGTCCCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTG  650

seq1  TCTCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGT  700

seq1  CTCTCTATGTCCCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTATGTCCCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGTC  750

seq1  TCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATTTGTCT  800

seq1  CTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATC-TCTGATGTATTTGTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CTCTATGTCTCTAGGTGTGTTGATATGTGCATCTTCTGATGTATTTGTCT  850

seq1  CTCTATGTCTCTA-GGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATAAATGA  898
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGTCTCTAGGGTGTGTTGATATGTGCATCTCTGATGTATAAATGA  900

seq1  ATCCATA-CACAGAAG-ATGCTT--GTTTTTGCCAAGGAACAGCAGAAAG  944
      ||||||| |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATCCATACCACAGAAGAATGCTTTGTTTTTTGCCAAGGAACAGCAGAAAC  950

seq1  GGTTAGAGATGCGTAGCCTTGAGGGAGGGGAG-AGCTCTCTGAATTTGAT  993
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GGTTAGAGATGCGTAGCCTTGAGGGAGGGGAGAAGCTCTCTGAATTTGAT  1000

seq1  CTCG-AGACACAACAC-TCTGAAGTTCATTGTCTATT--GACTCTTCTTT  1039
      |||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||  || ||||   |
seq2  CTCGAAGACAC-ACACTTCTGAAG-TCATTTTCTATTTGGATTCTTTAGT  1048

seq1  ACCACAGTGCA-TCTGG-AATAGGTGACCTTCCTGCA-TACTGGCCTTTT  1086
        | ||  ||| ||||| |||||   |||| | |||| |||||||  |||
seq2  TACTCATGGCATTCTGGAAATAGTGAACCTCCTTGCACTACTGGC--TTT  1096

seq1  CCATGGTCATT-GGGAAATCT---TCTTCCGTGGCAAGCACTGCCAGGAT  1132
       |||||||||| |||||||||   | ||||| ||||||| ||| | ||||
seq2  TCATGGTCATTGGGGAAATCTTTCTTTTCCG-GGCAAGC-CTGGCCGGAT  1144

seq1  ACCT  1136
      ||||
seq2  ACCT  1148


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |