BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205A03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 118,481,839 - 118,565,148
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC384658
Upstream geneSbf2, LOC668246, Adm, B430319F04Rik, Ampd3, Rnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658
Downstream geneGalntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3, Mical2, Micalcl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205A03.bB6Ng01-205A03.g
ACCGA024802GA024803
length893764
definitionB6Ng01-205A03.b B6Ng01-205A03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,481,839 - 118,482,735)(118,564,387 - 118,565,148)
sequence
gaattctagtgtgagctcattggtttccagcctgttttcttctgcacctg
gggtccaggaaagcctcaaaggacctttcaaacatggctattgacatgac
ttcccatcaccatggactgaagatttcgtggtgacctacaagaacctctg
ttgcttgctcatcactgactcatgagctggagtcacaatagcctggccct
ctttgagggctgtactccagtgtacacctgttcctgggacagtcttctct
gtcacacctgcctgtcttgatccttcctgcatggcagctttctgcccaga
tgctgtctctctagaatatccttcccagacaagcatgctttaaagagccc
ctttcatctctgtaactcgacttttccctcctaaaacttactatgactgg
tattaaaaatacatccgtttatttaccacttatgtttcagactaaatggt
aatctgtaggaggaaagggatgtcagcacattgttttgtaccactggatc
cttggatttaaacagtgtttaagacatagcaggatctctccctctctctc
tctctctctctctctctctctctctctctctctctctttcacacacacac
acacacacacacacacacacacacacacacacacacactccacacacaaa
gcaaataaatgaatgagtgttgaagctctgttagtgatagctggttgcta
tttggcccatcactatccactggaaaggtatccgacccccccccccaaaa
tggctgcaggcagatgctctaaggaccattctcagatgtggcatgaagtc
acatagtttagatctccagctgaatgtgtgagatatagtcaaggagtggg
atattctgctgcctctgttcatggggtaatttaaatcatgaag
gaattcaaagattggctgagtagatgtgaaccttcctgctgcacactcac
caaaactttttataattcaaaggcaagaaaaagactaaggaagacatcac
tggggctggagagacatctcagaggctaaaagcatctactgctcttgcag
aagacccaagttcgttctcagagcccacatggcagctcacaaccatctgt
aactccagttctaggggctctgatgccctctcttggcctccatggaaacc
atctccccaccccccgacacacacacaagttcacatacatgtatgaagag
agagcattcatacacatacaacaatactgcatcttcactgctgtgctgta
gagagatggcaacatcatctctacagcagatggtcatgtgatttagatga
tacctgggcctctggactgtaacaggagaacctggagttagtctgtatgt
gggaatttaagaaaagaagggacgtggatcacgtagcataacaaagtgag
aggaactctgaagtggtcccatgaccagcagagagaggagttttggacaa
catggcacagctcaaagagagcagatggaaggacagctggggaggaaaaa
caacaccataaaatctgacggccttgagcctgaccctagcagcaaaaagc
cctgtgcctgtgctggtcaggatgagaactgtcgctcatagactcaggca
actcaggtgtttgaacacttgacccccagatggtggcactattgggggag
gttttgggttggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_118481839_118482735
seq2: B6Ng01-205A03.b_44_936

seq1  GAATTCTAGTGTGAGCTCATTGGTTTCCAGCCTGTTTTCTTCTGCACCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGTGTGAGCTCATTGGTTTCCAGCCTGTTTTCTTCTGCACCTG  50

seq1  GGGTCCAGGAAAGCCTCAAAGGACCTTTCAAACATGGCTATTGACATGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCAGGAAAGCCTCAAAGGACCTTTCAAACATGGCTATTGACATGAC  100

seq1  TTCCCATCACCATGGACTGAAGATTTCGTGGTGACCTACAAGAACCTCTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATCACCATGGACTGAAGATTTCGTGGTGACCTACAAGAACCTCTG  150

seq1  TTGCTTGCTCATCACTGACTCATGAGCTGGAGTCACAATAGCCTGGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGCTCATCACTGACTCATGAGCTGGAGTCACAATAGCCTGGCCCT  200

seq1  CTTTGAGGGCTGTACTCCAGTGTACACCTGTTCCTGGGACAGTCTTCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAGGGCTGTACTCCAGTGTACACCTGTTCCTGGGACAGTCTTCTCT  250

seq1  GTCACACCTGCCTGTCTTGATCCTTCCTGCATGGCAGCTTTCTGCCCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACACCTGCCTGTCTTGATCCTTCCTGCATGGCAGCTTTCTGCCCAGA  300

seq1  TGCTGTCTCTCTAGAATATCCTTCCCAGACAAGCATGCTTTAAAGAGCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCTCTCTAGAATATCCTTCCCAGACAAGCATGCTTTAAAGAGCCC  350

seq1  CTTTCATCTCTGTAACTCGACTTTTCCCTCCTAAAACTTACTATGACTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATCTCTGTAACTCGACTTTTCCCTCCTAAAACTTACTATGACTGG  400

seq1  TATTAAAAATACATCCGTTTATTTACCACTTATGTTTCAGACTAAATGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAAAATACATCCGTTTATTTACCACTTATGTTTCAGACTAAATGGT  450

seq1  AATCTGTAGGAGGAAAGGGATGTCAGCACATTGTTTTGTACCACTGGATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTGTAGGAGGAAAGGGATGTCAGCACATTGTTTTGTACCACTGGATC  500

seq1  CTTGGATTTAAACAGTGTTTAAGACATAGCAGGATCTCTCCCTCTCTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGATTTAAACAGTGTTTAAGACATAGCAGGATCTCTCCCTCTCTCTC  550

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACACACACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACACACACAC  600

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCACACACAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCACACACAAA  650

seq1  GCAAATAAATGAATGAGTGTTGAAGCTCTGTTAGTGATAGCTGGTTGCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATAAATGAATGAGTGTTGAAGCTCTGTTAGTGATAGCTGGTTGCTA  700

seq1  TTTGGCCCATCACTATCCACTGGAAAGGTATCCAACCCCCCCCCCCAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TTTGGCCCATCACTATCCACTGGAAAGGTATCCGACCCCCCCCCCCAAAA  750

seq1  TGGCTGCAGGCAGAGGCTCTAAGGACCATTCTCAGATGTGGCATGGAAGT  800
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGGCTGCAGGCAGATGCTCTAAGGACCATTCTCAGATGTGGCAT-GAAGT  799

seq1  CACATAGTTTAGATCTCCAGGCTGAATGTGTGAGATAGAGTCAAGGAGTG  850
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CACATAGTTTAGATCTCCA-GCTGAATGTGTGAGATATAGTCAAGGAGTG  848

seq1  GGATATTCTGCCTGCCTCTGTTCATGGGGTTAGTTTTAAACATGAAG  897
      |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||
seq2  GGATATTCTG-CTGCCTCTGTTCATGGGG-TAATTTAAATCATGAAG  893

seq1: chr7_118564387_118565148
seq2: B6Ng01-205A03.g_67_830 (reverse)

seq1  CACCA--CCCAAACCTCCCCCAATAGTGCCACCATCTGGGGGTCAAGTGT  48
      |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAACCCAAAACCTCCCCCAATAGTGCCACCATCTGGGGGTCAAGTGT  50

seq1  TCAAACACCTGAGTTGCCTGAGTCTATGAGCGACAGTTCTCATCCTGACC  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACACCTGAGTTGCCTGAGTCTATGAGCGACAGTTCTCATCCTGACC  100

seq1  AGCACAGGCACAGGGCTTTTTGCTGCTAGGGTCAGGCTCAAGGCCGTCAG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGCACAGGGCTTTTTGCTGCTAGGGTCAGGCTCAAGGCCGTCAG  150

seq1  ATTTTATGGTGTTGTTTTTCCTCCCCAGCTGTCCTTCCATCTGCTCTCTT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTATGGTGTTGTTTTTCCTCCCCAGCTGTCCTTCCATCTGCTCTCTT  200

seq1  TGAGCTGTGCCATGTTGTCCAAAACTCCTCTCTCTGCTGGTCATGGGACC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTGTGCCATGTTGTCCAAAACTCCTCTCTCTGCTGGTCATGGGACC  250

seq1  ACTTCAGAGTTCCTCTCACTTTGTTATGCTACGTGATCCACGTCCCTTCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGAGTTCCTCTCACTTTGTTATGCTACGTGATCCACGTCCCTTCT  300

seq1  TTTCTTAAATTCCCACATACAGACTAACTCCAGGTTCTCCTGTTACAGTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTAAATTCCCACATACAGACTAACTCCAGGTTCTCCTGTTACAGTC  350

seq1  CAGAGGCCCAGGTATCATCTAAATCACATGACCATCTGCTGTAGAGATGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGCCCAGGTATCATCTAAATCACATGACCATCTGCTGTAGAGATGA  400

seq1  TGTTGCCATCTCTCTACAGCACAGCAGTGAAGATGCAGTATTGTTGTATG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCATCTCTCTACAGCACAGCAGTGAAGATGCAGTATTGTTGTATG  450

seq1  TGTATGAATGCTCTCTCTTCATACATGTATGTGAACTTGTGTGTGTGTCG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGAATGCTCTCTCTTCATACATGTATGTGAACTTGTGTGTGTGTCG  500

seq1  GGGGGTGGGGAGATGGTTTCCATGGAGGCCAAGAGAGGGCATCAGAGCCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTGGGGAGATGGTTTCCATGGAGGCCAAGAGAGGGCATCAGAGCCC  550

seq1  CTAGAACTGGAGTTACAGATGGTTGTGAGCTGCCATGTGGGCTCTGAGAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACTGGAGTTACAGATGGTTGTGAGCTGCCATGTGGGCTCTGAGAA  600

seq1  CGAACTTGGGTCTTCTGCAAGAGCAGTAGATGCTTTTAGCCTCTGAGATG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACTTGGGTCTTCTGCAAGAGCAGTAGATGCTTTTAGCCTCTGAGATG  650

seq1  TCTCTCCAGCCCCAGTGATGTCTTCCTTAGTCTTTTTCTTGCCTTTGAAT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCAGCCCCAGTGATGTCTTCCTTAGTCTTTTTCTTGCCTTTGAAT  700

seq1  TATAAAAAGTTTTGGTGAGTGTGCAGCAGGAAGGTTCACATCTACTCAGC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAAAGTTTTGGTGAGTGTGCAGCAGGAAGGTTCACATCTACTCAGC  750

seq1  CAATCTTTGAATTC  762
      ||||||||||||||
seq2  CAATCTTTGAATTC  764