BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-207K17
Chromosome7 (Build37)
Map Location 91,110,511 - 91,307,139
singlet/doubletdoublet
Overlap gene9930013L23Rik, 2210412D01Rik
Upstream geneLOC619909, A530021J07Rik, EG666160, Tmc3, Stard5, Il16, Phgdh-ps1, LOC666170, 1700026D08Rik, Mesdc1, Mesdc2
Downstream geneArnt2, LOC100039239, Fah, Zfand6, 2610206C17Rik, EG620480, Olfr291, LOC666276, Olfr290, ENSMUSG00000070600, F830104D24Rik, LOC620641, EG620672
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-207K17.bB6Ng01-207K17.g
ACCGA026755GA026756
length856410
definitionB6Ng01-207K17.b B6Ng01-207K17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,110,511 - 91,111,358)(91,306,724 - 91,307,139)
sequence
gaattccaaaatcgaatgttatatagccttccttagagatctggatgctg
aggcccagaaagaacaagagactgggtcagggtcaaggcctcaagcaaaa
tgagcagctggggagaagtgggttagatcaaggctgttggagtagaacat
gatgcttgttgcctatctgccaccacccagctatatggggctttggacac
actaggtctcccatcttagcttccaccctagtccacgctttatgttagac
tcacttggtgatagcttatagcactgacgtaccaggcaccatcctaaggc
aaaatgactcattctctaacaaatgactgtacataaatttcgtagtactc
tgggatgaaacatcccccacaggttcttgtgtttgaacacttggtctaca
ggtagtgaacctgcttttggaggttgtgaaatctttaggagaggaagaca
aaaatggaggatgtaggtcattggaggtggggtttgagtattatatagcc
tggctccacctcctgtcttctctgttttctaaaacatctttttattttaa
tgttttatgtgtatgagcatttggttcttatgtatgcctgtatagaccat
gtgtgcctggtattcacagaggtcagaagaaaaacataggaccccctgaa
actggagttatgggtggttgtgacccacccatgtggaagctgggactcaa
actccggacttctctgcaaaagcaaatactttaaaccacagagccatctc
tccagctccctcctactgttttcttgatccacccagatgggtacaagctc
ttggtgttcacagccacaggtgactccagccaccatacctttccctccta
ctatgg
tatttccaggctggattgctaagctgatttactctcagaggtagtctctg
aggactacctgatgaactgaaagatgctggacattctgtttttcaatcag
ggagaacttttatagccttaggagaaacttgccgtttctatgacaaccaa
tcagtggtaattaggggaaatcttgacatggtcatagaaaacctcaaaga
aaggagatgtaagtcagatccttggtagctattgggtttggtgtggaagc
tgagaaaactcacttcagagacaaaagattaaaaatggaagctttatttt
ttttgagtgctcaggaaggtggccagtttgggatctgaatcacgtcctca
aagggagttgtacaaccttttgaaaggatgggaacataaagcggggtggg
gggtggggta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_91110511_91111358
seq2: B6Ng01-207K17.b_46_901

seq1  GAATTCCAAAATCGAATGTTATATAGCCTTCCTTAGAGATCTGGATGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAATCGAATGTTATATAGCCTTCCTTAGAGATCTGGATGCTG  50

seq1  AGGCCCAGAAAGAACAAGAGACTGGGTCAGGGTCAAGGCCTCAAGCAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCAGAAAGAACAAGAGACTGGGTCAGGGTCAAGGCCTCAAGCAAAA  100

seq1  TGAGCAGCTGGGGAGAAGTGGGTTAGATCAAGGCTGTTGGAGTAGAACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGCTGGGGAGAAGTGGGTTAGATCAAGGCTGTTGGAGTAGAACAT  150

seq1  GATGCTTGTTGCCTATCTGCCACCACCCAGCTATATGGGGCTTTGGACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTTGTTGCCTATCTGCCACCACCCAGCTATATGGGGCTTTGGACAC  200

seq1  ACTAGGTCTCCCATCTTAGCTTCCACCCTAGTCCACGCTTTATGTTAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGGTCTCCCATCTTAGCTTCCACCCTAGTCCACGCTTTATGTTAGAC  250

seq1  TCACTTGGTGATAGCTTATAGCACTGACGTACCAGGCACCATCCTAAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTGGTGATAGCTTATAGCACTGACGTACCAGGCACCATCCTAAGGC  300

seq1  AAAATGACTCATTCTCTAACAAATGACTGTACATAAATTTCGTAGTACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGACTCATTCTCTAACAAATGACTGTACATAAATTTCGTAGTACTC  350

seq1  TGGGATGAAACATCCCCCACAGGTTCTTGTGTTTGAACACTTGGTCTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGAAACATCCCCCACAGGTTCTTGTGTTTGAACACTTGGTCTACA  400

seq1  GGTAGTGAACCTGCTTTTGGAGGTTGTGAAATCTTTAGGAGAGGAAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGTGAACCTGCTTTTGGAGGTTGTGAAATCTTTAGGAGAGGAAGACA  450

seq1  AAAATGGAGGATGTAGGTCATTGGAGGTGGGGTTTGAGTATTATATAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGAGGATGTAGGTCATTGGAGGTGGGGTTTGAGTATTATATAGCC  500

seq1  TGGCTCCACCTCCTGTCTTCTCTGTTTTCTAAAACATCTTTTTATTTTAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCACCTCCTGTCTTCTCTGTTTTCTAAAACATCTTTTTATTTTAA  550

seq1  TGTTTTATGTGTATGAGCATTTGGTTCTTATGTATGCCTGTATAGACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTATGTGTATGAGCATTTGGTTCTTATGTATGCCTGTATAGACCAT  600

seq1  GTGTGCCTGGTATTCACAGAGGTCAGAAG-AAAACATAGGACCCCCTGAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCCTGGTATTCACAGAGGTCAGAAGAAAAACATAGGACCCCCTGAA  650

seq1  ACTGGAGTTATGGGTGGTTGTGACCCA-CCATGTGGAAGCTGGGACTCAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGAGTTATGGGTGGTTGTGACCCACCCATGTGGAAGCTGGGACTCAA  700

seq1  ACT-CGGAC-TCTCTGCAAAAGCAAATACTTTTAACCACAGAGCCATCTC  746
      ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACTCCGGACTTCTCTGCAAAAGCAAATACTTTAAACCACAGAGCCATCTC  750

seq1  TCCAGC-CCCTCCTACTG-TTTCTTGATCCACCCAGATGGGTACAAGCTC  794
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTCCCTCCTACTGTTTTCTTGATCCACCCAGATGGGTACAAGCTC  800

seq1  TTGGTG-TCACAGCCACAGGTGACTCCAGCCACCATACC-TTCCCTCCTA  842
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTGGTGTTCACAGCCACAGGTGACTCCAGCCACCATACCTTTCCCTCCTA  850

seq1  CTATGG  848
      ||||||
seq2  CTATGG  856

seq1: chr7_91306724_91307139
seq2: B6Ng01-207K17.g_68_483 (reverse)

seq1  TACCCCACCCCCCACCCCGCTTTATGTTCCCATCCTTTCAAAAGGTTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCCACCCCCCACCCCGCTTTATGTTCCCATCCTTTCAAAAGGTTGTA  50

seq1  CAACTCCCTTTGAGGACGTGATTCAGATCCCAAACTGGCCACCTTCCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCCTTTGAGGACGTGATTCAGATCCCAAACTGGCCACCTTCCTGA  100

seq1  GCACTCAAAAAAAATAAAGCTTCCATTTTTAATCTTTTGTCTCTGAAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCAAAAAAAATAAAGCTTCCATTTTTAATCTTTTGTCTCTGAAGTG  150

seq1  AGTTTTCTCAGCTTCCACACCAAACCCAATAGCTACCAAGGATCTGACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTCTCAGCTTCCACACCAAACCCAATAGCTACCAAGGATCTGACTT  200

seq1  ACATCTCCTTTCTTTGAGGTTTTCTATGACCATGTCAAGATTTCCCCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTCCTTTCTTTGAGGTTTTCTATGACCATGTCAAGATTTCCCCTAA  250

seq1  TTACCACTGATTGGTTGTCATAGAAACGGCAAGTTTCTCCTAAGGCTATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCACTGATTGGTTGTCATAGAAACGGCAAGTTTCTCCTAAGGCTATA  300

seq1  AAAGTTCTCCCTGATTGAAAAACAGAATGTCCAGCATCTTTCAGTTCATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTCTCCCTGATTGAAAAACAGAATGTCCAGCATCTTTCAGTTCATC  350

seq1  AGGTAGTCCTCAGAGACTACCTCTGAGAGTAAATCAGCTTAGCAATCCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGTCCTCAGAGACTACCTCTGAGAGTAAATCAGCTTAGCAATCCAG  400

seq1  CCTGGAAATAGAATTC  416
      ||||||||||||||||
seq2  CCTGGAAATAGAATTC  416