BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-208C01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 65,437,166 - 65,581,953
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGabrg3, Gabra5, Gabrb3, EG668807, LOC434189
Downstream geneAtp10a, LOC621446, LOC668811, LOC668813, LOC668815, EG668818, Ube3a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-208C01.bB6Ng01-208C01.g
ACCGA027090GA027091
length856979
definitionB6Ng01-208C01.b B6Ng01-208C01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,437,166 - 65,437,906)(65,580,986 - 65,581,953)
sequence
gaattccataattacttaggaagtttatagataacaactttgaatttcca
tttgctactatactttttctatttttctgttaatatgttggaatcatgac
catggtaattgacaattaagtttacaaaattaaatgttttgttttgtttt
attaatctttgtgggtcaaaaacctctgctgtgaaatttgtacatctgcc
atatactttgtacataagaatatatatgtatgaataggaagctatatatc
tatgtggcctgaggagaacctttggtgttgtgtcctggtagctacccacc
tagttttttgaggcagaattttccaaagtagggtctctcttatgagttta
tctagatgtccactgcatagcagggatctgctgatctctgcctccccaag
cacacttcactgtcccaagccttgagaagtatactctgcaattttatgag
gtcccatttgccaattgttgatcttagagcttaagccattggtgttctgt
tcaggaaaatttcccttttatccgtgtgttcgaggctcttccccacttgc
tcttgcattagtttcagtgtatctggttttacatggaggatcttgatgaa
cttgaacttgagatttgtactgggagatgagaatggatcgatttgcattc
ttctacatgttgactgacagcaccatttgttgaaaatggtgggttttttt
tccccaggagaaggttttagctcctttgtcaaagatcaagtgaccatagg
tgtgtgggttcatttctgggtcttcagttatattccattgatctacctgt
gtgtctctgtaccaataccatgcagtttatatcactattgctctgtgata
cagctt
gaattcactggagcaggtataatcaccgatattgtctcacatgaagacaa
cctctggactttgtgtaagtttaatttgttcctttgccactatagtgggg
gtattgaatgtcctccaaaactgatgtgttaatgttttcccactaaggtg
gtactgttgggaggtggtagatcagaggtatggcctagtacaagatcctc
atatcattgagaatgtatatacagggggtttggggacactggtttcttct
tttactctttcccttttagtaaaaaaaaaatcatgtattgctggagtttg
tgtattgcttgacttcatgtttcagcaagtgtgctgtgctcctgtgcact
ggaaacaatgattcatcctttttctggactgtaacctggaaaccagtaag
ccaaaataattcttttctttttataaatggattacctcgggtgttctaat
ggcaggcagtttaacgcattaaactgttctgctctgtttcttcttccttg
cagatcccttggggaatgcttcctcaatatgaacacccttcataaagttg
tatgcgcaggggtattgctccaaaaagtaaagtttatcttacagtcacca
tattcagttgaagaggaaagttagggtcagtggttgatggctcagtggta
gtagcgcctgggcttgattttggtccctggtgcctggaggctttaggaga
tctgactgaccccctcttctggtctctataggcacacacattcatatgca
tcactcatgcctacatatacacatttcataccgataacatttaaaacata
tcgctttaaagggaaagttgtccataaagaatctttatcatgcaactacc
atgaatctggggcttccctctcctatttatctgagtttttccacagttca
atcaccccacagtaccccttggccttgctagaaattctagtcccccctcc
tggattccagatttatcacatctcatcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_65437166_65437906
seq2: B6Ng01-208C01.b_45_785

seq1  GAATTCCATAATTACTTAGGAAGTTTATAGATAACAACTTTGAATTTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATAATTACTTAGGAAGTTTATAGATAACAACTTTGAATTTCCA  50

seq1  TTTGCTACTATACTTTTTCTATTTTTCTGTTAATATGTTGGAATCATGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTACTATACTTTTTCTATTTTTCTGTTAATATGTTGGAATCATGAC  100

seq1  CATGGTAATTGACAATTAAGTTTACAAAATTAAATGTTTTGTTTTGTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTAATTGACAATTAAGTTTACAAAATTAAATGTTTTGTTTTGTTTT  150

seq1  ATTAATCTTTGTGGGTCAAAAACCTCTGCTGTGAAATTTGTACATCTGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATCTTTGTGGGTCAAAAACCTCTGCTGTGAAATTTGTACATCTGCC  200

seq1  ATATACTTTGTACATAAGAATATATATGTATGAATAGGAAGCTATATATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACTTTGTACATAAGAATATATATGTATGAATAGGAAGCTATATATC  250

seq1  TATGTGGCCTGAGGAGAACCTTTGGTGTTGTGTCCTGGTAGCTACCCACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGCCTGAGGAGAACCTTTGGTGTTGTGTCCTGGTAGCTACCCACC  300

seq1  TAGTTTTTTGAGGCAGAATTTTCCAAAGTAGGGTCTCTCTTATGAGTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTTTGAGGCAGAATTTTCCAAAGTAGGGTCTCTCTTATGAGTTTA  350

seq1  TCTAGATGTCCACTGCATAGCAGGGATCTGCTGATCTCTGCCTCCCCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGATGTCCACTGCATAGCAGGGATCTGCTGATCTCTGCCTCCCCAAG  400

seq1  CACACTTCACTGTCCCAAGCCTTGAGAAGTATACTCTGCAATTTTATGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTTCACTGTCCCAAGCCTTGAGAAGTATACTCTGCAATTTTATGAG  450

seq1  GTCCCATTTGCCAATTGTTGATCTTAGAGCTTAAGCCATTGGTGTTCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCATTTGCCAATTGTTGATCTTAGAGCTTAAGCCATTGGTGTTCTGT  500

seq1  TCAGGAAAATTTCCCTTTTATCCGTGTGTTCGAGGCTCTTCCCCACTTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAAAATTTCCCTTTTATCCGTGTGTTCGAGGCTCTTCCCCACTTGC  550

seq1  TCTTGCATTAGTTTCAGTGTATCTGGTTTTACATGGAGGATCTTGATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCATTAGTTTCAGTGTATCTGGTTTTACATGGAGGATCTTGATGAA  600

seq1  CTTGAACTTGAGATTTGTACTGGGAGATGAGAATGGATCGATTTGCATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACTTGAGATTTGTACTGGGAGATGAGAATGGATCGATTTGCATTC  650

seq1  TTCTACATGTTGACTGACAGCACCATTTGTTGAAAATGGTGGGTTTTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACATGTTGACTGACAGCACCATTTGTTGAAAATGGTGGGTTTTTTT  700

seq1  TCCCCAGGAGAAGGTTTTAGCTCCTTTGTCAAAGATCAAGT  741
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAGGAGAAGGTTTTAGCTCCTTTGTCAAAGATCAAGT  741

seq1: chr7_65580986_65581953
seq2: B6Ng01-208C01.g_66_1044 (reverse)

seq1  ATGATGAGATGTGATAAATCTGGAATCCAGGA-GAGGGACTA-AATATCC  48
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || 
seq2  ATGATGAGATGTGATAAATCTGGAATCCAGGAGGGGGGACTAGAATTTCT  50

seq1  TGCAAGGCCAA-GGGTACTGTGGGCTGA-TGGACTGTGGTAAAAC-CAGA  95
       |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||| ||||
seq2  AGCAAGGCCAAGGGGTACTGTGGGGTGATTGAACTGTGGAAAAACTCAGA  100

seq1  TAAATAGGAGA-GGAAGCCCCAG-CTCATGGTAGTTGCATGATTAAGATT  143
      ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAAATAGGAGAGGGAAGCCCCAGATTCATGGTAGTTGCATGATAAAGATT  150

seq1  CTTTGTGGAC-ACTTTCCCTTT-AAGGGATATGTTTT-AATGTTATCGGT  190
      |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  CTTTATGGACAACTTTCCCTTTAAAGCGATATGTTTTAAATGTTATCGGT  200

seq1  ATG-AATGTGTATATGTAGGCATGAGTGATGCATATGAATGTGTGTGCCT  239
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATGTGTATATGTAGGCATGAGTGATGCATATGAATGTGTGTGCCT  250

seq1  ATAGAGACCAGAAGAGGGGGTCAGTCAGATCTCCTAAAGCCTCCAGGCAC  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGACCAGAAGAGGGGGTCAGTCAGATCTCCTAAAGCCTCCAGGCAC  300

seq1  CAGGGACCAAAATCAAGCCCAGGCGCTACTACCACTGAGCCATCAACCAC  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGACCAAAATCAAGCCCAGGCGCTACTACCACTGAGCCATCAACCAC  350

seq1  TGACCCTAACTTTCCTCTTCAACTGAATATGGTGACTGTAAGATAAACTT  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCTAACTTTCCTCTTCAACTGAATATGGTGACTGTAAGATAAACTT  400

seq1  TACTTTTTGGAGCAATACCCCTGCGCATACAACTTTATGAAGGGTGTTCA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTTTGGAGCAATACCCCTGCGCATACAACTTTATGAAGGGTGTTCA  450

seq1  TATTGAGGAAGCATTCCCCAAGGGATCTGCAAGGAAGAAGAAACAGAGCA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGGAAGCATTCCCCAAGGGATCTGCAAGGAAGAAGAAACAGAGCA  500

seq1  GAACAGTTTAATGCGTTAAACTGCCTGCCATTAGAACACCCGAGGTAATC  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTTTAATGCGTTAAACTGCCTGCCATTAGAACACCCGAGGTAATC  550

seq1  CATTTATAAAAAGAAAAGAATTATTTTGGCTTACTGGTTTCCAGGTTACA  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTATAAAAAGAAAAGAATTATTTTGGCTTACTGGTTTCCAGGTTACA  600

seq1  GTCCAGAAAAAGGATGAATCATTGTTTCCAGTGCACAGGAGCACAGCACA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGAAAAAGGATGAATCATTGTTTCCAGTGCACAGGAGCACAGCACA  650

seq1  CTTGCTGAAACATGAAGTCAAGCAATACACAAACTCCAGCAATACATGAT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGAAACATGAAGTCAAGCAATACACAAACTCCAGCAATACATGAT  700

seq1  TTTTTTTTTACTAAAAGGGAAAGAGTAAAAGAAGAAACCAGTGTCCCCAA  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTACTAAAAGGGAAAGAGTAAAAGAAGAAACCAGTGTCCCCAA  750

seq1  ACCCCCTGTATATACATTCTCAATGATATGAGGATCTTGTACTAGGCCAT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCTGTATATACATTCTCAATGATATGAGGATCTTGTACTAGGCCAT  800

seq1  ACCTCTGATCTACCACCTCCCAACAGTACCACCTTAGTGGGAAAACATTA  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGATCTACCACCTCCCAACAGTACCACCTTAGTGGGAAAACATTA  850

seq1  ACACATCAGTTTTGGAGGACATTCAATACCCCCACTATAGTGGCAAAGGA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATCAGTTTTGGAGGACATTCAATACCCCCACTATAGTGGCAAAGGA  900

seq1  ACAAATTAAACTTACACAAAGTCCAGAGGTTGTCTTCATGTGAGACAATA  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATTAAACTTACACAAAGTCCAGAGGTTGTCTTCATGTGAGACAATA  950

seq1  TCGGTGATTATACCTGCTCCAGTGAATTC  968
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGTGATTATACCTGCTCCAGTGAATTC  979