BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-209K10
Chromosome7 (Build37)
Map Location 38,588,654 - 38,730,242
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG627844
Upstream geneLOC100043874, Zfp536, LOC100043453
Downstream geneC80913, Ccne1, 1600014C10Rik, Plekhf1, Pop4, LOC668519, LOC100043464, 1700010N08Rik, EG627975, EG625594, EG627983, EG434171, LOC100043467
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-209K10.bB6Ng01-209K10.g
ACCGA028213GA028214
length613328
definitionB6Ng01-209K10.b B6Ng01-209K10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(38,729,630 - 38,730,242)(38,588,654 - 38,588,981)
sequence
gaattccagcatcctttacatgtcttcgcatttcggaagatgcttgtctc
ttcggaatgttcggtcattagtgggtctggcggtttttgcttgatagcca
agcaagctgtcctgggtaaagaccttgtgtaagtaaagcttaagccttgt
ggtgctgtgggtgagacttgggggaagcggaataaggagctttgcttgcc
tctgcttctacccttgttttgaagtaagatttgttggtgtgaatctgggc
ttttcttctacctggaaggctacaactggctgagccttgacctgggctgt
gggaagtagtgtctgcagtcagacagtgaagcaacacaatgcaccagcat
actccctaaactgttcttttacccctcttattgctggaaatgggattccc
gtccttttcacctccaccacctctcagtgtcatgtaggtaagagggcttg
agagtgaagcctacacaagtgtgtagtgggcaaggcgtcagctccatcca
ggcttccgacctgggcactggtttctgtggagggcttctctggtcggctt
ctgtgctgctaagctgtcacagtgtcagcctgtcagtctccagtctgtag
ggtgggggttgtt

catagaattgtgaaaaaatcaaatatttctcagttttaaaaagacgaagc
caaaaagtacattacaagttaacatgaaggaaaaaaaaaacaggatatca
gttgagttaagacaatgtgtacaagcaagtgtatagctatgagtgcttgt
cttttaaaactgttaactaagaaagagggctagagagatgttaagagtgc
ttgggttccgttcatagcatccacctgacagctcactactgttggtaact
ccagtcccaagggatctgatgccctcctctggcctccatcaacaccagga
acatgtatggagaaaggggggaggggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_38729630_38730242
seq2: B6Ng01-209K10.b_45_657 (reverse)

seq1  AACAACCCCCACCCTACAGACTGGAGACTGACAGGCTGACACTGTGACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACCCCCACCCTACAGACTGGAGACTGACAGGCTGACACTGTGACAG  50

seq1  CTTAGCAGCACAGAAGCCGACCAGAGAAGCCCTCCACAGAAACCAGTGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCAGCACAGAAGCCGACCAGAGAAGCCCTCCACAGAAACCAGTGCC  100

seq1  CAGGTCGGAAGCCTGGATGGAGCTGACGCCTTGCCCACTACACACTTGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCGGAAGCCTGGATGGAGCTGACGCCTTGCCCACTACACACTTGTG  150

seq1  TAGGCTTCACTCTCAAGCCCTCTTACCTACATGACACTGAGAGGTGGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTTCACTCTCAAGCCCTCTTACCTACATGACACTGAGAGGTGGTGG  200

seq1  AGGTGAAAAGGACGGGAATCCCATTTCCAGCAATAAGAGGGGTAAAAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGAAAAGGACGGGAATCCCATTTCCAGCAATAAGAGGGGTAAAAGAA  250

seq1  CAGTTTAGGGAGTATGCTGGTGCATTGTGTTGCTTCACTGTCTGACTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTAGGGAGTATGCTGGTGCATTGTGTTGCTTCACTGTCTGACTGCA  300

seq1  GACACTACTTCCCACAGCCCAGGTCAAGGCTCAGCCAGTTGTAGCCTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTACTTCCCACAGCCCAGGTCAAGGCTCAGCCAGTTGTAGCCTTCC  350

seq1  AGGTAGAAGAAAAGCCCAGATTCACACCAACAAATCTTACTTCAAAACAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGAAGAAAAGCCCAGATTCACACCAACAAATCTTACTTCAAAACAA  400

seq1  GGGTAGAAGCAGAGGCAAGCAAAGCTCCTTATTCCGCTTCCCCCAAGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGAAGCAGAGGCAAGCAAAGCTCCTTATTCCGCTTCCCCCAAGTCT  450

seq1  CACCCACAGCACCACAAGGCTTAAGCTTTACTTACACAAGGTCTTTACCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACAGCACCACAAGGCTTAAGCTTTACTTACACAAGGTCTTTACCC  500

seq1  AGGACAGCTTGCTTGGCTATCAAGCAAAAACCGCCAGACCCACTAATGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGCTTGCTTGGCTATCAAGCAAAAACCGCCAGACCCACTAATGAC  550

seq1  CGAACATTCCGAAGAGACAAGCATCTTCCGAAATGCGAAGACATGTAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACATTCCGAAGAGACAAGCATCTTCCGAAATGCGAAGACATGTAAAG  600

seq1  GATGCTGGAATTC  613
      |||||||||||||
seq2  GATGCTGGAATTC  613


seq1: chr7_38588654_38588981
seq2: B6Ng01-209K10.g_69_396

seq1  CATAGAATTGTGAAAAAATCAAATATTTCTCAGTTTTAAAAAGACGAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAATTGTGAAAAAATCAAATATTTCTCAGTTTTAAAAAGACGAAGC  50

seq1  CAAAAAGTACATTACAAGTTAACATGAAGGAAAAAAAAAACAGGATATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGTACATTACAAGTTAACATGAAGGAAAAAAAAAACAGGATATCA  100

seq1  GTTGAGTTAAGACAATGTGTACAAGCAAGTGTATAGCTATGAGTGCTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGTTAAGACAATGTGTACAAGCAAGTGTATAGCTATGAGTGCTTGT  150

seq1  CTTTTAAAACTGTTAACTAAGAAAGAGGGCTAGAGAGATGTTAAGAGTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAACTGTTAACTAAGAAAGAGGGCTAGAGAGATGTTAAGAGTGC  200

seq1  TTGGGTTCCGTTCATAGCATCCACCTGACAGCTCACTACTGTTGGTAACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTCCGTTCATAGCATCCACCTGACAGCTCACTACTGTTGGTAACT  250

seq1  CCAGTCCCAAGGGATCTGATGCCCTCCTCTGGCCTCCATCAACACCAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCCCAAGGGATCTGATGCCCTCCTCTGGCCTCCATCAACACCAGGA  300

seq1  ACATGTATGGAGAAAGGGGGGAGGGGGA  328
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTATGGAGAAAGGGGGGAGGGGGA  328


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |