BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211C05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 31,341,423 - 31,494,340
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1810054G18Rik, Psenen, U2af1l4, Tmem149, Wbp7, Zbtb32, Upk1a, Cox6b1, Etv2, 3100004P22Rik, 2310022K01Rik, 4930479M11Rik, 2200002J24Rik
Upstream gene4930432E11Rik, 1700067C01Rik, Zfp84, LOC100043794, Zfp30, EG625349, 6330581L23Rik, BC027344, Zfp420, Zfp27, Zfp74, LOC625437, LOC100043796, Zfp568, Zfp14, LOC100043798, Zfp82, Zfp566, Zfp260, Zfp382, Zfp146, EG330503, Cox7a1, Capns1, Tbcb, Polr2i, Ovol3, Wdr62, EG668354, 1700020L13Rik, Clip3, Alkbh6, AI428936, 0610010E21Rik, Lrfn3, Tyrobp, Hcst, AY078069, Aplp1, Kirrel2, Nphs1, LOC100034728, Prodh2, Gm1082, Snx26, BC053749, Hspb6
Downstream geneEG233075, Atp4a, Tmem147, Gapdhs, Sbsn, Dmkn, Krtdap, Ffar2, Ffar3, Ffar1, Cd22, Mag, Hamp2, Usf2-ps1, Hamp1, Usf2, LOC100043823, Lsr, Tmem162, Fxyd5, Fxyd7, Fxyd1, Lgi4, Fxyd3, Hpn, Scn1b, Gramd1a, LOC672598, LOC100043323, LOC100043827, Apbh, Abpe, LOC100043326, EG384585, LOC100043328, LOC100043331, LOC626181, LOC100043334, LOC100043834, LOC546947, LOC677233, LOC100043337, LOC546949, LOC100043836
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211C05.bB6Ng01-211C05.g
ACCGA029297GA029298
length1,1201,089
definitionB6Ng01-211C05.b B6Ng01-211C05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,493,210 - 31,494,340)(31,341,423 - 31,342,503)
sequence
gaattcctaaccctcctgcctccatctcccaaaagctgaggttacagcca
ttcctggtgagaaacaagacactttctaactgtatttaggcagctgctgc
ctatgaatatggtcattttttaacataaataatcatatggacaatttcaa
aaaattaacagaaataagttacttttatctaagtatgagaatgcatttga
attccatagttttccccctgaagtccttgcagtctgggatgtggtcccga
tgtcactttacatgaattggtgtgtcccttgagctcctgaaaagaaccta
ttttgggatgccttggaccggaatccacagtcacaccaaaacctcaatac
atataaccactgcctgagcctatgtccacagccactgcccgagcctgagt
tcacatacctattaactgagcctaagtccacaatgcagtcattgcctgag
cctgaatctacacaactatcatctaaacctgaatctgtgcagctcctaaa
tgcctaaacctgagcccacatggtcactgcctgatgttgtagctagatag
ccaatgtccaaacaaacacaatttcttccaacactcccaacctcctacac
ccaaccactgaaagacaatgcctgctacagacagcttgaatttacgatga
cgttatggccttgttcatcgcaactgtacaatggccagacatactgaaga
tcagtttcaccagcttctcagactatgcagccttcagacggtactcaaat
tctgcatctttgggacaagtgtcttgattgatcaaattattctttttatc
atgtgtatgagcaacactaaggccgtctctaggtggtgaacacataggcc
tctacctacaggctggatgtgaagtgagctgaagtatcagatatgtctgg
tagcttatatggactgtagcccatggtgtggacacagagtgctgtacaat
gccacttcagctgatgggaaacttctggccacagttcagggaaagccttc
ttgatggcaagtgtcagatgcagcccctacagtgggcagccactgcatgt
cctcactgagctaagcacacctgacttgttgaggaagtggtcagaatgaa
taattattctgtcctataaa
gaattccatctctatctgtcagcccaggggcagagggtggtcaagatgct
ctctttacgcagttgtctagggcaggtgtcatgtctacttttatcttgag
agccccaagaatcaaagtcatgtatctgtcccaggaatccatgtctaccc
tttcaggccagatgattttcaaacctgttaccctccgcccagcccgtaag
gtccacatgtgctcaccaaggccccatctggtagccacatctgtttgcac
ttaagatccctgttccctaggaagccatatctatgtggcctagggacctc
tgtccataatcctaagagcaaatagctatctgtcctacccgattctctat
tcattgaggggggcccaggcattaaagctatctaccactcatgggggagt
tgttgacttatccacccactcttcaatctggcctcctgattgaactcatc
ctacctctccatcctcgggcagaggaggcagcggtgagccgggtgagcgc
tcgcgctctcgcactgtggggctgttgcgcatccaggcgcggcagatggg
gtacagtggtgtgttctcactgaactgggccaagtccacactccggtcaa
atagcttgatcacatacgtatctggggtggtaaggtaggcgataagtgtg
tagttcctggctccacacccaccctctcagtcccctgcctactcactgga
tctctgaggacccccctcagcgagcccatcgtccatctccctcctcttct
tcctccgctggtgggggaagcgggcagatggcctgtgtggttaaggtgag
tgttcaggcccgggagctggggactgggaacctttttagtgagctggggt
cccagccacctttacctttttgcttgtggcagcaatggaacaatccctgc
agggagagatcatggtgtcagaggctttaataaacagctgctcaacgctg
ccccccaaggtggaagtgacgtagttcagaacaaaagcatttgcctagca
tggggcaaaagccctgggtttctatccctagctcctaaaaacaaccaaaa
tatacaatccctgggattattggtactcccttgggccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_31493210_31494340
seq2: B6Ng01-211C05.b_46_1165 (reverse)

seq1  TTTATAGGGACAGAATAATATATTCAATTCTGACCACTGTCCTCAAACAA  50
      |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||
seq2  TTTATA-GGACAGAATAAT-TATTC-ATTCTGACCACT-TCCTC-AACAA  45

seq1  GTCA-GTGTGCCTTAGGCTCAGTGA-GACATGCAGT-GCTGCCCACTGTA  97
      |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  GTCAGGTGTG-CTTA-GCTCAGTGAGGACATGCAGTGGCTGCCCACTGTA  93

seq1  GGGGCTGCATCCTGAACACCTGCCATTCAAGAAGGCTTTTCCCTTGAACT  147
      |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||
seq2  GGGGCTGCAT-CTG-ACACTTGCCA-TCAAGAAGGCTTT--CCCTGAACT  138

seq1  GT-GCCAGAAGTTTCCCATCAGCCTGAAGTGGCATTGTACAGCACCTCTG  196
      || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTGGCCAGAAGTTTCCCATCAG-CTGAAGTGGCATTGTACAGCA-CTCTG  186

seq1  TGTCCACACCATGGGCTACAGTCCATATAAGCTACCAGACATATCCTGAT  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGTCCACACCATGGGCTACAGTCCATATAAGCTACCAGACATAT-CTGAT  235

seq1  ACTTCAGCTCACTTCACATCCAGCCTGTAGGTAGAGGCCTATGTGTTCAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGCTCACTTCACATCCAGCCTGTAGGTAGAGGCCTATGTGTTCAC  285

seq1  CACCTAGAGACGGCCTTAGTGTTGCTCATACACATGATAAAAAGAATAAT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTAGAGACGGCCTTAGTGTTGCTCATACACATGATAAAAAGAATAAT  335

seq1  TTGATCAATCAAGACACTTGTCCCAAAGATGCAGAATTTGAGTACCGTCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCAATCAAGACACTTGTCCCAAAGATGCAGAATTTGAGTACCGTCT  385

seq1  GAAGGCTGCATAGTCTGAGAAGCTGGTGAAACTGATCTTCAGTATGTCTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGCTGCATAGTCTGAGAAGCTGGTGAAACTGATCTTCAGTATGTCTG  435

seq1  GCCATTGTACAGTTGCGATGAACAAGGCCATAACGTCATCGTAAATTCAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATTGTACAGTTGCGATGAACAAGGCCATAACGTCATCGTAAATTCAA  485

seq1  GCTGTCTGTAGCAGGCATTGTCTTTCAGTGGTTGGGTGTAGGAGGTTGGG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTGTAGCAGGCATTGTCTTTCAGTGGTTGGGTGTAGGAGGTTGGG  535

seq1  AGTGTTGGAAGAAATTGTGTTTGTTTGGACATTGGCTATCTAGCTACAAC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTGGAAGAAATTGTGTTTGTTTGGACATTGGCTATCTAGCTACAAC  585

seq1  ATCAGGCAGTGACCATGTGGGCTCAGGTTTAGGCATTTAGGAGCTGCACA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGGCAGTGACCATGTGGGCTCAGGTTTAGGCATTTAGGAGCTGCACA  635

seq1  GATTCAGGTTTAGATGATAGTTGTGTAGATTCAGGCTCAGGCAATGACTG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAGGTTTAGATGATAGTTGTGTAGATTCAGGCTCAGGCAATGACTG  685

seq1  CATTGTGGACTTAGGCTCAGTTAATAGGTATGTGAACTCAGGCTCGGGCA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGGACTTAGGCTCAGTTAATAGGTATGTGAACTCAGGCTCGGGCA  735

seq1  GTGGCTGTGGACATAGGCTCAGGCAGTGGTTATATGTATTGAGGTTTTGG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTGTGGACATAGGCTCAGGCAGTGGTTATATGTATTGAGGTTTTGG  785

seq1  TGTGACTGTGGATTCCGGTCCAAGGCATCCCAAAATAGGTTCTTTTCAGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGACTGTGGATTCCGGTCCAAGGCATCCCAAAATAGGTTCTTTTCAGG  835

seq1  AGCTCAAGGGACACACCAATTCATGTAAAGTGACATCGGGACCACATCCC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCAAGGGACACACCAATTCATGTAAAGTGACATCGGGACCACATCCC  885

seq1  AGACTGCAAGGACTTCAGGGGGAAAACTATGGAATTCAAATGCATTCTCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGCAAGGACTTCAGGGGGAAAACTATGGAATTCAAATGCATTCTCA  935

seq1  TACTTAGATAAAAGTAACTTATTTCTGTTAATTTTTTGAAATTGTCCATA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAGATAAAAGTAACTTATTTCTGTTAATTTTTTGAAATTGTCCATA  985

seq1  TGATTATTTATGTTAAAAAATGACCATATTCATAGGCAGCAGCTGCCTAA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTATTTATGTTAAAAAATGACCATATTCATAGGCAGCAGCTGCCTAA  1035

seq1  ATACAGTTAGAAAGTGTCTTGTTTCTCACCAGGAATGGCTGTAACCTCAG  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGTTAGAAAGTGTCTTGTTTCTCACCAGGAATGGCTGTAACCTCAG  1085

seq1  CTTTTGGGAGATGGAGGCAGGAGGGTTAGGAATTC  1131
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGGAGATGGAGGCAGGAGGGTTAGGAATTC  1120

seq1: chr7_31341423_31342503
seq2: B6Ng01-211C05.g_68_1156

seq1  GAATTCCATCTCTATCTGTCAGCCCAGGGGCAGAGGGTGGTCAAGATGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCTCTATCTGTCAGCCCAGGGGCAGAGGGTGGTCAAGATGCT  50

seq1  CTCTTTACGCAGTTGTCTAGGGCAGGTGTCATGTCTACTTTTATCTTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTACGCAGTTGTCTAGGGCAGGTGTCATGTCTACTTTTATCTTGAG  100

seq1  AGCCCCAAGAATCAAAGTCATGTATCTGTCCCAGGAATCCATGTCTACCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAAGAATCAAAGTCATGTATCTGTCCCAGGAATCCATGTCTACCC  150

seq1  TTTCAGGCCAGATGATTTTCAAACCTGTTACCCTCCGCCCAGCCCGTAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGGCCAGATGATTTTCAAACCTGTTACCCTCCGCCCAGCCCGTAAG  200

seq1  GTCCACATGTGCTCACCAAGGCCCCATCTGGTAGCCACATCTGTTTGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACATGTGCTCACCAAGGCCCCATCTGGTAGCCACATCTGTTTGCAC  250

seq1  TTAAGATCCCTGTTCCCTAGGAAGCCATATCTATGTGGCCTAGGGACCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGATCCCTGTTCCCTAGGAAGCCATATCTATGTGGCCTAGGGACCTC  300

seq1  TGTCCATAATCCTAAGAGCAAATAGCTATCTGTCCTACCCGATTCTCTAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCATAATCCTAAGAGCAAATAGCTATCTGTCCTACCCGATTCTCTAT  350

seq1  TCATTGAGGGGGGCCCAGGCATTAAAGCTATCTACCACTCATGGGGGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGAGGGGGGCCCAGGCATTAAAGCTATCTACCACTCATGGGGGAGT  400

seq1  TGTTGACTTATCCACCCACTCTTCAATCTGGCCTCCTGATTGAACTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGACTTATCCACCCACTCTTCAATCTGGCCTCCTGATTGAACTCATC  450

seq1  CTACCTCTCCATCCTCGGGCAGAGGAGGCAGCGGTGAGCCGGGTGAGCGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTCTCCATCCTCGGGCAGAGGAGGCAGCGGTGAGCCGGGTGAGCGC  500

seq1  TCGCGCTCTCGCACTGTGGGGCTGTTGCGCATCCAGGCGCGGCAGATGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCGCTCTCGCACTGTGGGGCTGTTGCGCATCCAGGCGCGGCAGATGGG  550

seq1  GTACAGTGGTGTGTTCTCACTGAACTGGGCCAAGTCCACACTCCGGTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGTGGTGTGTTCTCACTGAACTGGGCCAAGTCCACACTCCGGTCAA  600

seq1  ATAGCTTGATCACATACGTATCTGGGGTGGTAAGGTAGGCGATAAGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTGATCACATACGTATCTGGGGTGGTAAGGTAGGCGATAAGTGTG  650

seq1  TAGTTCCTGGCTCCACACCCACCCTCTCAGTCCCCTGCCTACTCACTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTCCTGGCTCCACACCCACCCTCTCAGTCCCCTGCCTACTCACTGGA  700

seq1  TCTCTGAGGACCCCCCTCAGCGAGCCCATCGTCCATCTCCCTCCTCTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAGGACCCCCCTCAGCGAGCCCATCGTCCATCTCCCTCCTCTTCT  750

seq1  TCCTCCGCTGGTGGGGGAAGCGGGCAGATGGCCTGTGTGGTTAAGGTGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCGCTGGTGGGGGAAGCGGGCAGATGGCCTGTGTGGTTAAGGTGAG  800

seq1  TG-TCAGGCCC-GGAGCTGGGGACTGGGAACC-TTTTAGTGAGCTGGGGT  847
      || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGGCCCGGGAGCTGGGGACTGGGAACCTTTTTAGTGAGCTGGGGT  850

seq1  CCCAGCCACC-TTACC-TTTTGCCTGTGGCAGCAATGGAACAATCCCTGC  895
      |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCCACCTTTACCTTTTTGCTTGTGGCAGCAATGGAACAATCCCTGC  900

seq1  AGGGAGAGA-CATGGTGTCAGGAGGCTTTAATAAACAGCTGCTCAACGCT  944
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAGATCATGGTGTCA-GAGGCTTTAATAAACAGCTGCTCAACGCT  949

seq1  GCCCCCCAAGGTGGAAGTGACGTAGTTCAGGAACAGAGCATTTGCCTAGC  994
      |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||
seq2  GCCCCCCAAGGTGGAAGTGACGTAGTTCAGAACAAAAGCATTTGCCTAGC  999

seq1  AT-GGGCAAAAGCCCTGGGGTTCTATCGCTAGCT-CTAAAAACAAACAAA  1042
      || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||
seq2  ATGGGGCAAAAGCCCTGGGTTTCTATCCCTAGCTCCTAAAAACAACCAAA  1049

seq1  AATTAACATCCTGGGGATTATTGGTACT-CCTTGGGCCTT  1081
      |  ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |
seq2  ATATACAATCCCTGGGATTATTGGTACTCCCTTGGGCCCT  1089