BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211E09
Chromosome7 (Build37)
Map Location 114,261,089 - 114,442,766
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr715, Olfr716, Nlrp14, LOC100042278, 1700012H05Rik
Upstream geneEG668117, Gvin1, LOC672660, LOC100042097, LOC668128, LOC634394, EG209380, EG668139, Gm1966, LOC100042141, Olfr693, Olfr694, Olfr695, Olfr696-ps1, Olfr697, Olfr698, Olfr699, Olfr700, Olfr701, Olfr702, Olfr703, Olfr704, Olfr705, Olfr706, Olfr707, Olfr708, Olfr709-ps1, Olfr710, LOC384651, Olfr6, Olfr711, GA_x5J8B7W6B6J-1784824-1783474, Olfr2, Olfr713, Olfr714, Olfr17
Downstream geneSyt9, Olfml1, Ppfibp2, 5330417H12Rik, Cyb5r2, Ovch2, LOC100042310, Olfr467, Olfr468-ps1, Olfr469, GA_x5J8B7W6B6J-2580381-2580079, Olfr470, Olfr471, LOC626661, Olfr472, Olfr473, LOC669301, Olfr474, Olfr476, Olfr477, LOC626732, Olfr478, Olfr479, Olfr480, Olfr481, LOC100043059, Olfr482, Olfr483, Olfr484, Olfr485, Olfr486, Olfr487, Olfr1538-ps1, Olfr488, LOC546990, Olfr489-ps1, Olfr490
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211E09.bB6Ng01-211E09.g
ACCGA029387GA029388
length1,047907
definitionB6Ng01-211E09.b B6Ng01-211E09.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(114,261,089 - 114,262,143)(114,441,873 - 114,442,766)
sequence
gaattcaattactatatgaacaaaatcagaagtcagatggctttctgaaa
cccaaaccacatcatcttctgatgcgattttgagcaatatttatacaaga
tatgaaagaaagacagataacatgtggtttggcaaatttagcctgtgatt
ttaattacaacagcaagtgtcccagggtgttgctgtaaaggacagaaagg
taatatgctaaggactctcaaagcacgagggaatcccaggtttacacaac
ctttaggaactcacctttaaatatttcctcaaaggaaaataattagaagc
atgacctaagagacttggagcttgtactcagtgaagtaaagcagaggggc
ataattagtataaagataaaactcctaagatcagtatgggctttgagaaa
cttttcccagaagccagtgctgtcctttaagtctctccctcatgctaggt
cttaggctccttcatggacgacacttccaacagtgtttctgctccatgcc
tacattgaggtcagagaggggaagctgctaataggtctagttggcataat
tctgtagggttggctggagattggggtagaagaaatatgctgtgttattg
gccctcctactcgctcatagtttttcttattaggctcctaagcaaaaatt
ctattcccattcttctccaaaattccagtctgtaaactggaatccaaact
ttccccttcagggatgaagctcatggcctagggaccacaaagacacagag
gccatgtcatccagtattgctctccctttggtgtggaaggcagctctgcc
tggctctgtccttgttcagctatcagcctccagcttttcattgcttcctt
agtttctatacatcccactatctccctttatgggtgacatactgaataca
gcaagagttgcaaagacactaagaatattggtttgaggagctcatcagaa
catgcttgggggctcaagttccttccgcccactgcagaccagggtccctg
gacaggagtctcctgacacccgcaaggacccacacagatctgcacgg
gaattcatatacagtggaaaagcatggagtttatgttagatgaagtaaga
cagacagaaaaaaatattgcattctcatatggggaaactaaaaaatgcaa
aatagaaaacccacaaaagttgttagcagaggtgggggaggggctttgga
agacgtaggtcaaagggtataaatcttacttgctgtttctcctggccacg
agctcatggtccatctttccttaattgtgcaggataaatctagttagctt
acagcaggagcagtagggtgaactgtagagagaagactgcatcctgcaat
tagctaaaagagattttagatgttcttacacacaaaaaggtaaaaatatg
agataacagaagtgttagcctacctaaatcatttcactgtagaaaaaagc
ctaatatatatctattcattcatatattcattatatatatatatgaatga
ataggaaactgtataattcacatgtatatcctgaatttacgcattctggt
attcatctggttagctttacaatatcatactacttgtgaacttgatcgat
tttagagcatttaagaagctcctctatattcaagagattctgattagata
tttagaagtgtttgattaagtttgaaatcaacattaaatgtttaggaaaa
atttaacctatggtgaataaatcttatttattagttgtgtatatgttgta
taaaaatattcagtagggatgttattaatatttaaataaattatagattt
caagggttaataaattggaagataataatgtttactcttcaggaatagca
atttttttgacataaattaatcttcactgacatgacctacacagttttta
gaatgagataactgggtgaatggggaatgaagagaaagaagacagacact
gattctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_114261089_114262143
seq2: B6Ng01-211E09.b_44_1090

seq1  GAATTCAATTACTATATGAACAAAATCAGAAGTCAGATGGCTTTCTGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTACTATATGAACAAAATCAGAAGTCAGATGGCTTTCTGAAA  50

seq1  CCCAAACCACATCATCTTCTGATGCGATTTTGAGCAATATTTATACAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAACCACATCATCTTCTGATGCGATTTTGAGCAATATTTATACAAGA  100

seq1  TATGAAAGAAAGACAGATAACATGTGGTTTGGCAAATTTAGCCTGTGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAAGAAAGACAGATAACATGTGGTTTGGCAAATTTAGCCTGTGATT  150

seq1  TTAATTACAACAGCAAGTGTCCCAGGGTGTTGCTGTAAAGGACAGAAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTACAACAGCAAGTGTCCCAGGGTGTTGCTGTAAAGGACAGAAAGG  200

seq1  TAATATGCTAAGGACTCTCAAAGCACGAGGGAATCCCAGGTTTACACAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGCTAAGGACTCTCAAAGCACGAGGGAATCCCAGGTTTACACAAC  250

seq1  CTTTAGGAACTCACCTTTAAATATTTCCTCAAAGGAAAATAATTAGAAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGGAACTCACCTTTAAATATTTCCTCAAAGGAAAATAATTAGAAGC  300

seq1  ATGACCTAAGAGACTTGGAGCTTGTACTCAGTGAAGTAAAGCAGAGGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTAAGAGACTTGGAGCTTGTACTCAGTGAAGTAAAGCAGAGGGGC  350

seq1  ATAATTAGTATAAAGATAAAACTCCTAAGATCAGTATGGGCTTTGAGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTAGTATAAAGATAAAACTCCTAAGATCAGTATGGGCTTTGAGAAA  400

seq1  CTTTTCCCAGAAGCCAGTGCTGTCCTTTAAGTCTCTCCCTCATGCTAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCCAGAAGCCAGTGCTGTCCTTTAAGTCTCTCCCTCATGCTAGGT  450

seq1  CTTAGGCTCCTTCATGGACGACACTTCCAACAGTGTTTCTGCTCCATGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGCTCCTTCATGGACGACACTTCCAACAGTGTTTCTGCTCCATGCC  500

seq1  TACATTGAGGTCAGAGAGGGGAAGCTGCTAATAGGTCTAGTTGGCATAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTGAGGTCAGAGAGGGGAAGCTGCTAATAGGTCTAGTTGGCATAAT  550

seq1  TCTGTAGGGTTGGCTGGAGATTGGGGTAGAAGAAATATGCTGTGTTATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAGGGTTGGCTGGAGATTGGGGTAGAAGAAATATGCTGTGTTATTG  600

seq1  GCCCTCCTACTCGCTCATAGTTTTTCTTATTAGGCTCCTAAGCAAAAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCTACTCGCTCATAGTTTTTCTTATTAGGCTCCTAAGCAAAAATT  650

seq1  CTATTCCCATTCTTCTCCAAAATTCCAGTCTGTAAACTGGAATCCAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTCCCATTCTTCTCCAAAATTCCAGTCTGTAAACTGGAATCCAAACT  700

seq1  TTCCCCTTCAGGGATGAAGCTCATGGCCTAGGGACCACAAAGACACAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTTCAGGGATGAAGCTCATGGCCTAGGGACCACAAAGACACAGAG  750

seq1  GCCATGTCATCCAGTATTGCTCTCCCTTTGGTGTGGAAGGCAGCTCTGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGTCATCCAGTATTGCTCTCCCTTTGGTGTGGAAGGCAGCTCTGCC  800

seq1  TGGCTCTGTCCTTGTTCAGCTATCAGCCTCCAGCTTTTCATTGCTTCCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCTGTCCTTGTTCAGCTATCAGCCTCCAGCTTTTCATTGCTTCCTT  850

seq1  AGGTTTCTATACATCCCACTATCTCCCTTTATGGGTGACATACTGAATAC  900
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  A-GTTTCTATACATCCCACTATCTCCCTTTATGGGTGACATACTGAATAC  899

seq1  AGCAAGAGTTGCAAAGACACTAAGAATATTGGTTTGAGGAGCTCATCAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGCAAGAGTTGCAAAGACACTAAGAATATTGGTTTGAGGAGCTCATC-AG  948

seq1  AACATGCTTGGGGGCTCAAGTTCCTTCCGGCCCACTGCAGAACCAGGGTC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  AACATGCTTGGGGGCTCAAGTTCCTTCC-GCCCACTGCAG-ACCAGGGTC  996

seq1  CCTGGACAAGGGAGTCTCCTGACACCCGCAAGGACCCACACAGGATCTGC  1050
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  CCTGGACA--GGAGTCTCCTGACACCCGCAAGGACCCACACA-GATCTG-  1042

seq1  CACGG  1055
      |||||
seq2  CACGG  1047

seq1: chr7_114441873_114442766
seq2: B6Ng01-211E09.g_69_967 (reverse)

seq1  GTGTCTGTCTTCTTTCTCTTCATTCCCCA-TCACCCAGTTATCTCATTCT  49
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTGTCTTCTTTCTCTTCATTCCCCATTCACCCAGTTATCTCATTCT  50

seq1  TAAAACTGTGTAGGTCATGTCAGTG-AGATTAATTTATGTCAAAAAAATT  98
       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTGTGTAGGTCATGTCAGTGAAGATTAATTTATGTCAAAAAAATT  100

seq1  GCTATTCCTGAAGAGT-AACATTATTATCTTCCAATTTATTAACCCTTGA  147
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTCCTGAAGAGTAAACATTATTATCTTCCAATTTATTAACCCTTGA  150

seq1  AATCTATAATTTATTTAAATATTAATAACAT-CCTACTGAATATTTTTAT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AATCTATAATTTATTTAAATATTAATAACATCCCTACTGAATATTTTTAT  200

seq1  ACAACATATACACAACTAATAAATAAGATTTATTCACCATAGGTTAAA-T  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACAACATATACACAACTAATAAATAAGATTTATTCACCATAGGTTAAATT  250

seq1  TTTCCTAAACATTTAATGTTGATTTCAAACTTAATCAAACACTTCTAAAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTAAACATTTAATGTTGATTTCAAACTTAATCAAACACTTCTAAAT  300

seq1  ATCTAATCAGAATCTCTTGAATATAGAGGAGCTTCTTAAATGCTCTAAAA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATCAGAATCTCTTGAATATAGAGGAGCTTCTTAAATGCTCTAAAA  350

seq1  TCGATCAAGTTCACAAGTAGTATGATATTGTAAAGCTAACCAGATGAATA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATCAAGTTCACAAGTAGTATGATATTGTAAAGCTAACCAGATGAATA  400

seq1  CCAGAATGCGTAAATTCAGGATATACATGTGAATTATACAGTTTCCTATT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAATGCGTAAATTCAGGATATACATGTGAATTATACAGTTTCCTATT  450

seq1  CATTCATATATATATATAATGAATATATGAATGAATAGATATATATTAGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATATATATATATAATGAATATATGAATGAATAGATATATATTAGG  500

seq1  CTTTTTTCTACAGTGAAATGATTTAGGTAGGCTAACACTTCTGTTATCTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTCTACAGTGAAATGATTTAGGTAGGCTAACACTTCTGTTATCTC  550

seq1  ATATTTTTACCTTTTTGTGTGTAAGAACATCTAAAATCTCTTTTAGCTAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTTACCTTTTTGTGTGTAAGAACATCTAAAATCTCTTTTAGCTAA  600

seq1  TTGCAGGATGCAGTCTTCTCTCTACAGTTCACCCTACTGCTCCTGCTGTA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGATGCAGTCTTCTCTCTACAGTTCACCCTACTGCTCCTGCTGTA  650

seq1  AGCTAACTAGATTTATCCTGCACAATTAAGGAAAGATGGACCATGAGCTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAACTAGATTTATCCTGCACAATTAAGGAAAGATGGACCATGAGCTC  700

seq1  GTGGCCAGGAGAAACAGCAAGTAAGATTTATACCCTTTGACCTACGTCTT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCAGGAGAAACAGCAAGTAAGATTTATACCCTTTGACCTACGTCTT  750

seq1  CCAAAGCCCCTCCCCCACCTCTGCTAACAACTTTTGTGGGTTTTCTATTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCCCCTCCCCCACCTCTGCTAACAACTTTTGTGGGTTTTCTATTT  800

seq1  TGCATTTTTTAGTTTCCCCATATGAGAATGCAATATTTTTTTCTGTCTGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTTTTTAGTTTCCCCATATGAGAATGCAATATTTTTTTCTGTCTGT  850

seq1  CTTACTTCATCTAACATAAACTCCATGCTTTTCCACTGTATATGAATTC  894
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTTCATCTAACATAAACTCCATGCTTTTCCACTGTATATGAATTC  899