BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-211P01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 119,398,660 - 119,547,735
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMical2, Micalcl
Upstream geneLOC384658, Galntl4, LOC668399, LOC100042678, Usp47, Dkk3
Downstream geneParva, LOC627808, Tead1, 4632411J06Rik, LOC434227, Arntl, A630005I04Rik, Btbd10, Pth
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-211P01.bB6Ng01-211P01.g
ACCGA029865GA029866
length1,154910
definitionB6Ng01-211P01.b B6Ng01-211P01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,546,562 - 119,547,735)(119,398,660 - 119,399,568)
sequence
gaattcttatcatggatctttttagacacattggaaagatttcacttgcc
atagtgaaatcaacactcagtgtctgggcaagatggtgcccacccccagc
acttgggaggtagaagcaagagaattgtgggttcaaagccagcctgagcc
acatgtgatttttgtctgaaaaaaaacaaaacaaaaacaaaaaccaaaaa
accaaccaaccaaccaaccaatcaaccaaaacaaactagagcttaacaca
aacaaacttgttaattgtcatttatagtgacctagttttccccaagagtg
ctctcaaaactacaaagcaaattacgtcagtctctactgagatccagtga
ccctcagcatcaaattcaagtgaccaagcctggtgtaccctagtctttgc
ttacctgggcgtgactggcatacagcgtccagctgtttgttttctgaatg
taaaaatagcaacaacaacaaaaatgtgtacaatctgtttgaagccattc
tggttttgtgtatattttcctcttgagggactgccatgcccctaactgct
tgcagattggtgtgtggttttaccaggtccactcttgttcgccatctggc
tcagaagtcattctttagatgtgactattttttcgcctccttagaatctg
tgctaatctactgttcactgcaatcttgttaacacgctggatatgcttac
tggtgcttgctggcattcgagtggttatggcggaaccctcaatgcgctgc
gtggggcaccttcctcagagtgcctgtggtttcaggcctgccttctgtac
tctgggttttgtctatacatggcaggcaagtgctttagcaattgtgctcc
aggtcaacccacgtcctctgacttctcatgagctccaggctcagttcaca
gctgtctcgatcggcctcaggccccagagtttagagtataactgtcccca
cagctccttgcatactttaggatgatccacagatgtttgctgtagggttt
caggactaagtcctatgctgaagatttttttttaaatcccagtagatgtg
attttttattacattattatttattatgggtgcatccactgtggaggtca
gagaaccatgagagtcagttctcttccttcatcatgggtctgggacaaac
tcat
gaattcattcattgataaatgtatggttaaatgtatggataaatgtatgg
ttaggtgaataaacgaatgattgaatgaatgggtggatgagcaccaagca
aagttctcttccttccaacaggaacataaaggcagtgaacaggtctagac
caagttgcccacctgctatctaggatccagcatatacttcagaagaaaca
cattgggctttggaggaaagaaagttgtatgaaaagctgtttcctaggaa
gtagcagggcagggctgggcagggcagggcagagcagggcagggcagtgc
agggcagtgcagggaagcagttaacatttgagccataatatgccagacct
gtttttagggcttaagacaaacgtcaatagcatttgcatagccacagcaa
aagcaggttagagtctgttctgacggctgttctgcttgttcagcccacag
gatgagatgccctactgctgggcgcatgtcacaggaacctccctatgggg
tgctggctctgtccattggcttgcatggaggatttcacactgatacccta
gatcttgccctcctaatacactgactgacatgctagtaagctttaagcca
ctcaagagtcccttctgactctgcagatggccccatctgctataaaggct
ggatgctgtgcatgggccccactgaaggatgagagggaatgtgtggccag
ctgcatggccacctgggcagacatttaatggaaggaacagacaggtactt
gccccttccccctggcctcagcatacgattcaggaaggtgctatttatat
cactagtttcaccaacgatggtgtcagcagcaaatccatggacttcacac
atctgaaatcacgctgaaatggagagtgtgcaacccaaatttaggaaatt
tagagacaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_119546562_119547735
seq2: B6Ng01-211P01.b_46_1199 (reverse)

seq1  ATGAGTTTTGTCCCCAGGACCCACATGATGGAAGGAGAGAACTGACTCCC  50
      ||||| ||||||||   ||||  ||||||| | | ||||||||||||  |
seq2  ATGAG-TTTGTCCC--AGACC--CATGATGAAGGAAGAGAACTGACT--C  43

seq1  TCATGGTGTCCTCTGACCCTCACAAGTGTGTGCACACAATAATAAATAAA  100
      |||||  || ||||||||  ||| ||||  ||||| | ||||||||||| 
seq2  TCATG--GTTCTCTGACCTCCAC-AGTGGATGCAC-CCATAATAAATAA-  88

seq1  TAAATGTAATAAAAAATTCAACATCTACTTGGGATTTAAAAAAAAAATCT  150
        |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||| 
seq2  -TAATGTAATAAAAAAT--CACATCTAC-TGGGATTT-AAAAAAAAATC-  132

seq1  TTCAGCAATAGGACTTAGTCCTGAAACCCTACAGCAAACATCTGTGGATC  200
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGC-ATAGGACTTAGTCCTGAAACCCTACAGCAAACATCTGTGGATC  181

seq1  ATCCTTAAAGTATGCAAGGAGCTGTGGGGACAGTTATACTCTAAACTCTG  250
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCC-TAAAGTATGCAAGGAGCTGTGGGGACAGTTATACTCTAAACTCTG  230

seq1  GGGCCTGAGGCCGATCGAGACAGCTGTGAACTGAGCCTGGAGCTCATGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTGAGGCCGATCGAGACAGCTGTGAACTGAGCCTGGAGCTCATGAG  280

seq1  AAGTCAGAGGACGTGGGTTGACCTGGAGCACAATTGCTAAAGCACTTGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGAGGACGTGGGTTGACCTGGAGCACAATTGCTAAAGCACTTGCC  330

seq1  TGCCATGTATAGACAAAACCCAGAGTACAGAAGGCAGGCCTGAAACCACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGTATAGACAAAACCCAGAGTACAGAAGGCAGGCCTGAAACCACA  380

seq1  GGCACTCTGAGGAAGGTGCCCCACGCAGCGCATTGAGGGTTCCGCCATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACTCTGAGGAAGGTGCCCCACGCAGCGCATTGAGGGTTCCGCCATAA  430

seq1  CCACTCGAATGCCAGCAAGCACCAGTAAGCATATCCAGCGTGTTAACAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCGAATGCCAGCAAGCACCAGTAAGCATATCCAGCGTGTTAACAAG  480

seq1  ATTGCAGTGAACAGTAGATTAGCACAGATTCTAAGGAGGCGAAAAAATAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGTGAACAGTAGATTAGCACAGATTCTAAGGAGGCGAAAAAATAG  530

seq1  TCACATCTAAAGAATGACTTCTGAGCCAGATGGCGAACAAGAGTGGACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCTAAAGAATGACTTCTGAGCCAGATGGCGAACAAGAGTGGACCT  580

seq1  GGTAAAACCACACACCAATCTGCAAGCAGTTAGGGGCATGGCAGTCCCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAACCACACACCAATCTGCAAGCAGTTAGGGGCATGGCAGTCCCTC  630

seq1  AAGAGGAAAATATACACAAAACCAGAATGGCTTCAAACAGATTGTACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGAAAATATACACAAAACCAGAATGGCTTCAAACAGATTGTACACA  680

seq1  TTTTTGTTGTTGTTGCTATTTTTACATTCAGAAAACAAACAGCTGGACGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTGTTGTTGCTATTTTTACATTCAGAAAACAAACAGCTGGACGC  730

seq1  TGTATGCCAGTCACGCCCAGGTAAGCAAAGACTAGGGTACACCAGGCTTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGCCAGTCACGCCCAGGTAAGCAAAGACTAGGGTACACCAGGCTTG  780

seq1  GTCACTTGAATTTGATGCTGAGGGTCACTGGATCTCAGTAGAGACTGACG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTGAATTTGATGCTGAGGGTCACTGGATCTCAGTAGAGACTGACG  830

seq1  TAATTTGCTTTGTAGTTTTGAGAGCACTCTTGGGGAAAACTAGGTCACTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTGCTTTGTAGTTTTGAGAGCACTCTTGGGGAAAACTAGGTCACTA  880

seq1  TAAATGACAATTAACAAGTTTGTTTGTGTTAAGCTCTAGTTTGTTTTGGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGACAATTAACAAGTTTGTTTGTGTTAAGCTCTAGTTTGTTTTGGT  930

seq1  TGATTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTTTTTGGTTTTTGTTTTTGTTTTGTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTTTTTGGTTTTTGTTTTTGTTTTGTT  980

seq1  TTTTTTCAGACAAAAATCACATGTGGCTCAGGCTGGCTTTGAACCCACAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCAGACAAAAATCACATGTGGCTCAGGCTGGCTTTGAACCCACAA  1030

seq1  TTCTCTTGCTTCTACCTCCCAAGTGCTGGGGGTGGGCACCATCTTGCCCA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTGCTTCTACCTCCCAAGTGCTGGGGGTGGGCACCATCTTGCCCA  1080

seq1  GACACTGAGTGTTGATTTCACTATGGCAAGTGAAATCTTTCCAATGTGTC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTGAGTGTTGATTTCACTATGGCAAGTGAAATCTTTCCAATGTGTC  1130

seq1  TAAAAAGATCCATGATAAGAATTC  1174
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGATCCATGATAAGAATTC  1154

seq1: chr7_119398660_119399568
seq2: B6Ng01-211P01.g_65_974

seq1  GAATTCATTCATTGATAAATGTATGGTTAAATGTATGGATAAATGTATGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCATTGATAAATGTATGGTTAAATGTATGGATAAATGTATGG  50

seq1  TTAGGTGAATAAACGAATGATTGAATGAATGGGTGGATGAGCACCAAGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTGAATAAACGAATGATTGAATGAATGGGTGGATGAGCACCAAGCA  100

seq1  AAGTTCTCTTCCTTCCAACAGGAACATAAAGGCAGTGAACAGGTCTAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCTCTTCCTTCCAACAGGAACATAAAGGCAGTGAACAGGTCTAGAC  150

seq1  CAAGTTGCCCACCTGCTATCTAGGATCCAGCATATACTTCAGAAGAAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGCCCACCTGCTATCTAGGATCCAGCATATACTTCAGAAGAAACA  200

seq1  CATTGGGCTTTGGAGGAAAGAAAGTTGTATGAAAAGCTGTTTCCTAGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGGGCTTTGGAGGAAAGAAAGTTGTATGAAAAGCTGTTTCCTAGGAA  250

seq1  GTAGCAGGGCAGGGCTGGGCAGGGCAGGGCAGAGCAGGGCAGGGCAGTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGGGCAGGGCTGGGCAGGGCAGGGCAGAGCAGGGCAGGGCAGTGC  300

seq1  AGGGCAGTGCAGGGAAGCAGTTAACATTTGAGCCATAATATGCCAGACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGTGCAGGGAAGCAGTTAACATTTGAGCCATAATATGCCAGACCT  350

seq1  GTTTTTAGGGCTTAAGACAAACGTCAATAGCATTTGCATAGCCACAGCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAGGGCTTAAGACAAACGTCAATAGCATTTGCATAGCCACAGCAA  400

seq1  AAGCAGGTTAGAGTCTGTTCTGACGGCTGTTCTGCTTGTTCAGCCCACAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGGTTAGAGTCTGTTCTGACGGCTGTTCTGCTTGTTCAGCCCACAG  450

seq1  GATGAGATGCCCTACTGCTGGGCGCATGTCACAGGAACCTCCCTATGGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGATGCCCTACTGCTGGGCGCATGTCACAGGAACCTCCCTATGGGG  500

seq1  TGCTGGCTCTGTCCATTGGCTTGCATGGAGGATTTCACACTGATACCCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGCTCTGTCCATTGGCTTGCATGGAGGATTTCACACTGATACCCTA  550

seq1  GATCTTGCCCTCCTAATACACTGACTGACATGCTAGTAAGCTTTAAGCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTGCCCTCCTAATACACTGACTGACATGCTAGTAAGCTTTAAGCCA  600

seq1  CTCAAGAGTCCCTTCTGACTCTGCAGATGGCCCCATCTGCTATAAAGGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAGTCCCTTCTGACTCTGCAGATGGCCCCATCTGCTATAAAGGCT  650

seq1  GGATGCTGTGCATGGGCCCCACTGAAGGATGAGAGGGAATGTGTGGCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGTGCATGGGCCCCACTGAAGGATGAGAGGGAATGTGTGGCCAG  700

seq1  CTGCATGGCCACCTGGGCAGACATTTAATGGAAGGAACAGACAGGTAC-T  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTGCATGGCCACCTGGGCAGACATTTAATGGAAGGAACAGACAGGTACTT  750

seq1  GCCCCTTCCCCCTGGCCTCAGCATACGATCCAGGAAGGTGCTATTTATAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTTCCCCCTGGCCTCAGCATACGATTCAGGAAGGTGCTATTTATAT  800

seq1  CACTAGTTACACCAACGATGGTGTCAGCAGCAAAGCCATGGAC-TCACAC  848
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
seq2  CACTAGTTTCACCAACGATGGTGTCAGCAGCAAATCCATGGACTTCACAC  850

seq1  ATCAGAAAATCACGCTGAAATGGAGAGTGTGCAACCCAAATTTAAGAAAT  898
      ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATCTG-AAATCACGCTGAAATGGAGAGTGTGCAACCCAAATTTAGGAAAT  899

seq1  TTAGAGACAGA  909
      |||||||||||
seq2  TTAGAGACAGA  910