BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-212M15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 55,125,696 - 55,223,735
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMrgpra18-ps, EG435978, Mrgprc2-ps
Upstream geneLdhc, Tsg101, Uevld, C86187, LOC384623, ENSMUSG00000056509, Spty2d1, LOC100040174, Tmem86a, Ptpn5, LOC100041710, Mrgpra6, EG668725, Gm660, Mrgpra1, LOC668846, LOC100040217, LOC668727, Mrgpra2, LOC638950, Mrgprc4-ps, LOC677457, EG668729, Mrgpra3, Mrgprc1-ps, LOC100040314, Mrgprc3-ps, EG435977, EG619792, Mrgprc7-ps
Downstream geneMrgpra4, Mrgprx1, Mrgprb7-ps, Mrgprb12-ps, EG270335, Mrgprb5, Mrgprb4, Mrgprb13, Mrgprb8, Mrgprb1, Mrgprx2, Mrgprb2, Mrgprb9-ps, Mrgprb3, EG639116, Zdhhc13, Csrp3, E2f8, LOC100040465
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-212M15.bB6Ng01-212M15.g
ACCGA030496GA030497
length1,1021,131
definitionB6Ng01-212M15.b B6Ng01-212M15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(55,222,618 - 55,223,735)(55,125,696 - 55,126,780)
sequence
gaattcttgatccatgtggtcatgttactttccttttatttataattgat
tttattaagccatatggacaaaaatatgtatattacattatgatcgccag
aagaagggtcaatgttaaggtgatgaaatatggtctgtgttctcagggac
accactggaagatttgtgagcatggatccaatcatctcatcccacaacag
agaatcacaccactgaatgaaactgcaatcattccaactgcagtccaatc
ctgactctgtcctttctggtcctcatcactatcctggtggaactggcagg
aaacaccattgtcctctggctcttgggattccgcatgcacaggaaagcca
tctcagtttatgtcctcaatctggctctggcagactccgtattcctctgc
tgtcatttcattgactctctgctatgcatcattgacttcatctatgccca
taaattaagcagataccttaggcaatgcagaaatcattccctatatcaca
gggctgagcatcctcagtgctattagcatggaggactacctgtctgtatt
gtggccaatctggtaccactgccatcacccaaggaacatgtcaactatcc
tatgtgccctaatctgggttctatcctttctcatgggcatcctcgattgg
ttcttctcaggattcctgggtgagactcatcattatttgtgaaaaaatgt
tgactttattataactgcatttctgatttttttttttatttatgcttctc
tctgggtccagtctggccctactgctgaggatcctctgtggctccaggag
gaaaccactgtccaggttgtatgctaccatctcactcacagtgatggtct
acctcatctgtggcctacctcttgggctttacttgtttctgttacactcc
tttggggttaatttgcatcatcccttttgtcacctttacaaagttactgc
agtcctgtcctgtgtaaacatctctaccaacccatcatcatttaatcatg
gcatttcttttttttttatagtattttcctcgtttacatttcaatgctat
cccaaagtccccatacccaccccccccaatcctaccacccactgcctttt
tg
gaattcagtaaccaaaatggctcctcctggtaatcctgcaaagccttcct
gggtgaggtggacacctctcctctggcagggaaggcacctagatgtctgg
agcctgaaacaggttctgtccaagaagctgtgttacttcctcctgtctca
gaagctgttagcttctgtagtccacactcttacctgctcagactagtatc
tgagggatccaggacccaagatggctcccttaggtgtgtgccttggtttt
tattgcttatgtttttgtccttgcatcttgccatctggttatctctggta
ttagctggtcttgatgtctctgattgtccttgtccctcctgcaagcctgt
gtgtcatttctcctgggagaccagttatttctagaagaaatttaggtatg
gggagttgtggcacagggtcagccccagggtgcagatgaaaactggaagg
atcctgtcccaggtcgctcctctatttctgtgtcctgcgggttctgggca
tgtccctttgagcagaagtgttggtcttacctgtgctcacaggcttgtct
gcactgtggcacaagatcatctcctggctcctttgtctttacattcaggt
acagaacaatcacagacaagagagtcatgcttctggacttgggctatttc
catggcaacaaaagttccaaagaaacaacaagaaaggttcagaggaagtt
agcatgagaatttgattaatgtcataaaggatgcagacatgatactttct
gattaatgatattactcgagagaggtagaaaatctaagtcagtggagagc
ttttgaagatgttggtggaccactgaggcatgtcaagtcagtcagcggag
agcagagtggacagtgataaagtgcagcagggcattcttcactccaaagc
cacctctgaggtccaggcagaggctctcatcatggctctgctttacttct
tgacatccccaccatgtttcagtgtctcagagtgtcctacattgtcctct
ggagaccattttcagtgtctgtgctgcaccgaagcctgaaggagcccgtg
aagagtaaatgatggagttggcacaactgttaatagcagtcatgacagtg
atccggataaataccagagtaaatactgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_55222618_55223735
seq2: B6Ng01-212M15.b_40_1141 (reverse)

seq1  CAAAAAGGGGCAGTGGGTGGGTAGGGGATTGGGGGGGGTGGGTATGGGGG  50
      ||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAAAAA--GGCAGTGGGT-GGTA--GGATTGGGGGGGGTGGGTATGGGG-  44

seq1  ACCTTTGGGATAGCATTGAAAATGTAAACGAGGAAAATACCTAATTAAAA  100
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |  |||
seq2  -ACTTTGGGATAGCATTG-AAATGTAAACGAGGAAAATAC----TATAAA  88

seq1  AAAAAAAGAAATGCCAATGAATTAAATGATTGATGGGGTTGGTAGAGATG  150
      ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGAAATGCC-ATG-ATTAAATGA-TGAT-GGGTTGGTAGAGATG  134

seq1  TTTACACAGGACAGGACTGCAGTAACTTTGTAAAGGTGACAAAAGGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACACAGGACAGGACTGCAGTAACTTTGTAAAGGTGACAAAAGGGATG  184

seq1  ATGCAAATTAACCCCAAAGGAGTGTAACAGAAACAAGTAAAGCCCAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATTAACCCCAAAGGAGTGTAACAGAAACAAGTAAAGCCCAAGAG  234

seq1  GTAGGCCACAGATGAGGTAGACCATCACTGTGAGTGAGATGGTAGCATAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGCCACAGATGAGGTAGACCATCACTGTGAGTGAGATGGTAGCATAC  284

seq1  AACCTGGACAGTGGTTTCCTCCTGGAGCCACAGAGGATCCTCAGCAGTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGACAGTGGTTTCCTCCTGGAGCCACAGAGGATCCTCAGCAGTAG  334

seq1  GGCCAGACTGGACCCAGAGAGAAGCATAAATAAAAAAAAAAATCAGAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGACTGGACCCAGAGAGAAGCATAAATAAAAAAAAAAATCAGAAAT  384

seq1  GCAGTTATAATAAAGTCAACATTTTTTCACAAATAATGATGAGTCTCACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTTATAATAAAGTCAACATTTTTTCACAAATAATGATGAGTCTCACC  434

seq1  CAGGAATCCTGAGAAGAACCAATCGAGGATGCCCATGAGAAAGGATAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATCCTGAGAAGAACCAATCGAGGATGCCCATGAGAAAGGATAGAA  484

seq1  CCCAGATTAGGGCACATAGGATAGTTGACATGTTCCTTGGGTGATGGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGATTAGGGCACATAGGATAGTTGACATGTTCCTTGGGTGATGGCAG  534

seq1  TGGTACCAGATTGGCCACAATACAGACAGGTAGTCCTCCATGCTAATAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACCAGATTGGCCACAATACAGACAGGTAGTCCTCCATGCTAATAGC  584

seq1  ACTGAGGATGCTCAGCCCTGTGATATAGGGAATGATTTCTGCATTGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGGATGCTCAGCCCTGTGATATAGGGAATGATTTCTGCATTGCCTA  634

seq1  AGGTATCTGCTTAATTTATGGGCATAGATGAAGTCAATGATGCATAGCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATCTGCTTAATTTATGGGCATAGATGAAGTCAATGATGCATAGCAG  684

seq1  AGAGTCAATGAAATGACAGCAGAGGAATACGGAGTCTGCCAGAGCCAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCAATGAAATGACAGCAGAGGAATACGGAGTCTGCCAGAGCCAGAT  734

seq1  TGAGGACATAAACTGAGATGGCTTTCCTGTGCATGCGGAATCCCAAGAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGACATAAACTGAGATGGCTTTCCTGTGCATGCGGAATCCCAAGAGC  784

seq1  CAGAGGACAATGGTGTTTCCTGCCAGTTCCACCAGGATAGTGATGAGGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGACAATGGTGTTTCCTGCCAGTTCCACCAGGATAGTGATGAGGAC  834

seq1  CAGAAAGGACAGAGTCAGGATTGGACTGCAGTTGGAATGATTGCAGTTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGGACAGAGTCAGGATTGGACTGCAGTTGGAATGATTGCAGTTTC  884

seq1  ATTCAGTGGTGTGATTCTCTGTTGTGGGATGAGATGATTGGATCCATGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTGGTGTGATTCTCTGTTGTGGGATGAGATGATTGGATCCATGCT  934

seq1  CACAAATCTTCCAGTGGTGTCCCTGAGAACACAGACCATATTTCATCACC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATCTTCCAGTGGTGTCCCTGAGAACACAGACCATATTTCATCACC  984

seq1  TTAACATTGACCCTTCTTCTGGCGATCATAATGTAATATACATATTTTTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATTGACCCTTCTTCTGGCGATCATAATGTAATATACATATTTTTG  1034

seq1  TCCATATGGCTTAATAAAATCAATTATAAATAAAAGGAAAGTAACATGAC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATATGGCTTAATAAAATCAATTATAAATAAAAGGAAAGTAACATGAC  1084

seq1  CACATGGATCAAGAATTC  1118
      ||||||||||||||||||
seq2  CACATGGATCAAGAATTC  1102

seq1: chr7_55125696_55126780
seq2: B6Ng01-212M15.g_121_1193

seq1  TGGACACCTCTCCTCTGGCAGGGAAGGCACCTAGATGTCTGGAGCCTGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACACCTCTCCTCTGGCAGGGAAGGCACCTAGATGTCTGGAGCCTGAA  50

seq1  ACAGGTTCTGTCCAAGAAGCTGTGTTACTTCCTCCTGTCTCAGAAGCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGTTCTGTCCAAGAAGCTGTGTTACTTCCTCCTGTCTCAGAAGCTGT  100

seq1  TAGCTTCTGTAGTCCACACTCTTACCTGCTCAGACTAGTATCTGAGGGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCTGTAGTCCACACTCTTACCTGCTCAGACTAGTATCTGAGGGAT  150

seq1  CCAGGACCCAAGATGGCTCCCTTAGGTGTGTGCCTTGGTTTTTATTGCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACCCAAGATGGCTCCCTTAGGTGTGTGCCTTGGTTTTTATTGCTT  200

seq1  ATGTTTTTGTCCTTGCATCTTGCCATCTGGTTATCTCTGGTATTAGCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTTTGTCCTTGCATCTTGCCATCTGGTTATCTCTGGTATTAGCTGG  250

seq1  TCTTGATGTCTCTGATTGTCCTTGTCCCTCCTGCAAGCCTGTGTGTCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATGTCTCTGATTGTCCTTGTCCCTCCTGCAAGCCTGTGTGTCATT  300

seq1  TCTCCTGGGAGACCAGTTATTTCTAGAAGAAATTTAGGTATGGGGAGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGGGAGACCAGTTATTTCTAGAAGAAATTTAGGTATGGGGAGTTG  350

seq1  TGGCACAGGGTCAGCCCCAGGGTGCAGATGAAAACTGGAAGGATCCTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACAGGGTCAGCCCCAGGGTGCAGATGAAAACTGGAAGGATCCTGTC  400

seq1  CCAGGTCGCTCCTCTATTTCTGTGTCCTGCGGGTTCTGGGCATGTCCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCGCTCCTCTATTTCTGTGTCCTGCGGGTTCTGGGCATGTCCCTT  450

seq1  TGAGCAGAAGTGTTGGTCTTACCTGTGCTCACAGGCTTGTCTGCACTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCAGAAGTGTTGGTCTTACCTGTGCTCACAGGCTTGTCTGCACTGTG  500

seq1  GCACAAGATCATCTCCTGGCTCCTTTGTCTTTACATTCAGGTACAGAACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAGATCATCTCCTGGCTCCTTTGTCTTTACATTCAGGTACAGAACA  550

seq1  ATCACAGACAAGAGAGTCATGCTTCTGGACTTGGGCTATTTCCATGGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGACAAGAGAGTCATGCTTCTGGACTTGGGCTATTTCCATGGCAA  600

seq1  CAAAAGTTCCAAAGAAACAACAAGAAAGGTTCAGAGGAAGTTAGCATGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGTTCCAAAGAAACAACAAGAAAGGTTCAGAGGAAGTTAGCATGAG  650

seq1  AATTTGATTAATGTCATAAAGGATGCAGACATGATACTTTCTGATTAATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGATTAATGTCATAAAGGATGCAGACATGATACTTTCTGATTAATG  700

seq1  ATATTACTCGAGAGAGGTAGAAAATCTAAGTCAGTGGAGAGCTTTTGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTACTCGAGAGAGGTAGAAAATCTAAGTCAGTGGAGAGCTTTTGAAG  750

seq1  ATGTTGGTGGACCACTGAGGCATGTCAAGTCAGTCAGCGGAGAGCAGAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGGTGGACCACTGAGGCATGTCAAGTCAGTCAGCGGAGAGCAGAGT  800

seq1  GGACAGTGATAAAGTGCAGCAGGGCATTCTTCACTCCAAAGCCACCTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGTGATAAAGTGCAGCAGGGCATTCTTCACTCCAAAGCCACCTCTG  850

seq1  AGGTCCAGGCAGAGGCTCTTCATCATGGCTCTGCTTTACTTCTTGACATC  900
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCAGGCAGAGGCTC-TCATCATGGCTCTGCTTTACTTCTTGACATC  899

seq1  CCCACCATGTTTTCAGGTGTCTCAGGAGTGTCCTACATTGTCCTCTGGAG  950
      ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCATG-TTTCA-GTGTCTCA-GAGTGTCCTACATTGTCCTCTGGAG  946

seq1  AACCATTTTCAGTGTCTGGTGCTGCAACCGAAGCCTGAAGGAGCCCGTGA  1000
       |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  -ACCATTTTCAGTGTCT-GTGCTGC-ACCGAAGCCTGAAGGAGCCCGTGA  993

seq1  AGAAGTAAATGATGGAGTTGGCACAACTGTTAATAGCAGTCATGACAAGT  1050
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AG-AGTAAATGATGGAGTTGGCACAACTGTTAATAGCAGTCATGAC-AGT  1041

seq1  GATTCCAGATAAAATACAAGAGTAAATACATGAAA  1085
      || ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||
seq2  GA-TCCGGAT-AAATACCAGAGTAAATAC-TGAAA  1073