BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-213G03
Chromosome7 (Build37)
Map Location 35,556,580 - 35,734,284
singlet/doubletdoublet
Overlap geneChst8, Pepd
Upstream geneLOC627079, LOC635803, Abpg, LOC100043864, LOC100043865, Abpb, Abpa, LOC100043866, LOC100043867, LOC100043868, Wtip, Sae2, LOC100043410, Pdcd2l, Gpi1, 4931406P16Rik, EG619734, Lsm14a, LOC668460, LOC668464, Kctd15
Downstream geneCebpg, Cebpa, Slc7a10, Wdr88, Gpatch1, Rhpn2, C230052I12Rik, Ccdc123, Slc7a9, 2410004F06Rik, Nudt19, Rgs9bp, Ankrd27, Pdcd5, Dpy19l3, zfp507
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-213G03.bB6Ng01-213G03.g
ACCGA030928GA030929
length1,2091,110
definitionB6Ng01-213G03.b B6Ng01-213G03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,733,069 - 35,734,284)(35,556,580 - 35,557,725)
sequence
gaattcatgcacataggttctgcatgtctggaagggcgatggcctggtac
caaggaagtgtccccactacctctctcgactctgagggatgggtggctct
cagcttaggccacatgctcattccatagagccttcacggtcagcatccct
atttcaggaaactctgccctaacattgacttcctcaggcactgacaaaga
tgcacggcatctggcttggtcatgggctgctggagccaagtttttgaggg
gccctgggtgcctggagtccagaagacatgtctcaagtcctcttcactgc
aggtctgtcctccctatctctgcctctctagctccctccagcctatggag
cagcccttgtccctacagcagagcccggcaatgagagcctaagccctgct
cccatccactatatgcctaccagagtctatggagagaccctcttctaaat
gtcccctggaacttgtgtcagatacaacagggcctaacacagctccctgg
gctgggccagatccctcattcatcacaaatatcacaaagtaatcagaggc
catagcctcttggaagcccagtggcctgtggctccagcaagatctctctg
acctctgacatgtctaccacctccctcacctctgctcctctactgtcccc
accactctctgacctggtacacactctcctcctcaggaggcctggctctg
gtctgaggctaaggctccacacctatgggacaatacaccagataggtaat
gccatgaagccatattctgaagtgaaagtcacaaaccgactacctggctg
gaccacagctcagagggtctggaatgggtagactactgaggccactgcca
gcccctcctccaggcaggccaagaaaaggcagcctgggaggcccccagga
cagacagagggctaaatctacctatcagtctaggtagaacagagacccaa
tatggaggcatttcagaggggtcaaaagcaaatcccaggaatgtggagct
tcatctgggcagcgagagagactgagacagattggttacacactggaaac
tagacaacagaaagattcatcttgcttaggaaagtcttattattaatcca
gcagtcagcttggagacttctcgccagcaagtaaagtgccagtcctgtgt
tccaagtggcttgagaaccaaggttttctccagctgtaccggatctgagt
gcttgcagc
gaattcaaccccacaggacccacatgagcacacatggcacacggtccctt
tccagaaactaaatgtaataataataataattaataataacaacatctca
gggttatctgtgtaatgtggcagttcttagtgtgcgtttcatggagttct
tccgagaaggtgaggatctgtgccttcaaggattacaaggactttgcttc
ccctccataacaggagcctcctgcgtcatcttcacatgtccctaaaagtg
acaaagaaatcaaaagcaagagtgttgctgctggcatatgaattgaggac
actattgaggacctttgaggcaagccagagggatacgcaacggggcaagc
attgatctctactgggttctgtgatggtctgaatgaaatggctcccatgg
gcctgtagggagtagcactattaggaggtgggcgtggccttgttggagga
agtgtgtcactgatgtgtggactttgaggtctcagatgttcaagccagac
ccagtgtctcactctcttcctgcctgctgacccagatgcagaactctcag
ctccttctccagcaccatgtctgcctgtgtgccaccatgtctgctgccat
gatgataatggactgaacttctgaactgcaagcctgacccagtcaagtgt
ttccttataagagttgccacagtcatggcatctcttcacagcaataaaac
tcttaactaaagcgggctgggatagccgaatgcatctgagttgggttgcc
tgccatgcagtcatcagcatgtgggtctctgcctctgcagcctcacaggc
cctcagaatcccagctataacttagccggcagactgccttaaagatcatg
gaagttaaacactggagacaccacacaaacaaacttcctgaattccactc
tgtgcaaaaaaaatataaataacctaaaaaaaccaaaaaaaaaagaatta
agaaacattaccacacaacccaaccggacctttcttcaagcacttcttca
tgatgaagaagaaaagacctcatggacatgaattgaagatgatgcttaaa
tgcacagtgacagctcatgaaggtgtcatggaaatcagtctcaatccatc
tagcctcata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_35733069_35734284
seq2: B6Ng01-213G03.b_44_1252 (reverse)

seq1  GCTGCAAGCACCTCAGGACTCGGTGACAAGCTGGGGAGAAACCTT-GTCC  49
      |||||||||| |||| ||  |||| || |||||| || ||||||| || |
seq2  GCTGCAAGCA-CTCA-GATCCGGT-AC-AGCTGGAGA-AAACCTTGGTTC  45

seq1  TCAAAGGGCCAC-TGTGACACAGGACT-GCACTTACCTGCCTGCCGAG-A  96
      ||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||  ||  ||| |||| |
seq2  TCAA---GCCACTTGGAACACAGGACTGGCACTTTACTTGCTGGCGAGAA  92

seq1  GTCTCC-AGCTGACTGCTGGA-TAATAAT-AGACTTTTCCTAAGCAAGAT  143
      |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  GTCTCCAAGCTGACTGCTGGATTAATAATAAGAC-TTTCCTAAGCAAGAT  141

seq1  GAATCTTTCCTGTTGTCCTAGTTTCCAGTGTGTAACCAATCTGTCCTCAG  193
      |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GAATCTTT-CTGTTGT-CTAGTTTCCAGTGTGTAACCAATCTGT-CTCAG  188

seq1  TCTCCTCTCGCTGCCCAGATGAAGCTCCACATTCCTGGGATTTTGCTTTT  243
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCT-CTCTCGCTGCCCAGATGAAGCTCCACATTCCTGGGA-TTTGCTTTT  236

seq1  GACCCCTCTGAAATGCCTCCATATTGGGTCTCTGTTCTACCTAGACTGAT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCTCTGAAATGCCTCCATATTGGGTCTCTGTTCTACCTAGACTGAT  286

seq1  AGGTAGATTTAGCCCTCTGTCTGTCCTGGGGGCCTCCCAGGCTGCCTTTT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGATTTAGCCCTCTGTCTGTCCTGGGGGCCTCCCAGGCTGCCTTTT  336

seq1  CTTGGCCTGCCTGGAGGAGGGGCTGGCAGTGGCCTCAGTAGTCTACCCAT  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCCTGCCTGGAGGAGGGGCTGGCAGTGGCCTCAGTAGTCTACCCAT  386

seq1  TCCAGACCCTCTGAGCTGTGGTCCAGCCAGGTAGTCGGTTTGTGACTTTC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGACCCTCTGAGCTGTGGTCCAGCCAGGTAGTCGGTTTGTGACTTTC  436

seq1  ACTTCAGAATATGGCTTCATGGCATTACCTATCTGGTGTATTGTCCCATA  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCAGAATATGGCTTCATGGCATTACCTATCTGGTGTATTGTCCCATA  486

seq1  GGTGTGGAGCCTTAGCCTCAGACCAGAGCCAGGCCTCCTGAGGAGGAGAG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGGAGCCTTAGCCTCAGACCAGAGCCAGGCCTCCTGAGGAGGAGAG  536

seq1  TGTGTACCAGGTCAGAGAGTGGTGGGGACAGTAGAGGAGCAGAGGTGAGG  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTACCAGGTCAGAGAGTGGTGGGGACAGTAGAGGAGCAGAGGTGAGG  586

seq1  GAGGTGGTAGACATGTCAGAGGTCAGAGAGATCTTGCTGGAGCCACAGGC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGGTAGACATGTCAGAGGTCAGAGAGATCTTGCTGGAGCCACAGGC  636

seq1  CACTGGGCTTCCAAGAGGCTATGGCCTCTGATTACTTTGTGATATTTGTG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGGCTTCCAAGAGGCTATGGCCTCTGATTACTTTGTGATATTTGTG  686

seq1  ATGAATGAGGGATCTGGCCCAGCCCAGGGAGCTGTGTTAGGCCCTGTTGT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGAGGGATCTGGCCCAGCCCAGGGAGCTGTGTTAGGCCCTGTTGT  736

seq1  ATCTGACACAAGTTCCAGGGGACATTTAGAAGAGGGTCTCTCCATAGACT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGACACAAGTTCCAGGGGACATTTAGAAGAGGGTCTCTCCATAGACT  786

seq1  CTGGTAGGCATATAGTGGATGGGAGCAGGGCTTAGGCTCTCATTGCCGGG  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAGGCATATAGTGGATGGGAGCAGGGCTTAGGCTCTCATTGCCGGG  836

seq1  CTCTGCTGTAGGGACAAGGGCTGCTCCATAGGCTGGAGGGAGCTAGAGAG  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTGTAGGGACAAGGGCTGCTCCATAGGCTGGAGGGAGCTAGAGAG  886

seq1  GCAGAGATAGGGAGGACAGACCTGCAGTGAAGAGGACTTGAGACATGTCT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGATAGGGAGGACAGACCTGCAGTGAAGAGGACTTGAGACATGTCT  936

seq1  TCTGGACTCCAGGCACCCAGGGCCCCTCAAAAACTTGGCTCCAGCAGCCC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGACTCCAGGCACCCAGGGCCCCTCAAAAACTTGGCTCCAGCAGCCC  986

seq1  ATGACCAAGCCAGATGCCGTGCATCTTTGTCAGTGCCTGAGGAAGTCAAT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCAAGCCAGATGCCGTGCATCTTTGTCAGTGCCTGAGGAAGTCAAT  1036

seq1  GTTAGGGCAGAGTTTCCTGAAATAGGGATGCTGACCGTGAAGGCTCTATG  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGGCAGAGTTTCCTGAAATAGGGATGCTGACCGTGAAGGCTCTATG  1086

seq1  GAATGAGCATGTGGCCTAAGCTGAGAGCCACCCATCCCTCAGAGTCGAGA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGAGCATGTGGCCTAAGCTGAGAGCCACCCATCCCTCAGAGTCGAGA  1136

seq1  GAGGTAGTGGGGACACTTCCTTGGTACCAGGCCATCGCCCTTCCAGACAT  1193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTAGTGGGGACACTTCCTTGGTACCAGGCCATCGCCCTTCCAGACAT  1186

seq1  GCAGAACCTATGTGCATGAATTC  1216
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACCTATGTGCATGAATTC  1209

seq1: chr7_35556580_35557725
seq2: B6Ng01-213G03.g_66_1175

seq1  GAATTCAACCCCACAGGACCCACATGAGCACACATGGCACACGGTCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCCCACAGGACCCACATGAGCACACATGGCACACGGTCCCTT  50

seq1  TCCAGAAACTAAATGTAATAATAATAATAATTAATAATAACAACATCTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAAACTAAATGTAATAATAATAATAATTAATAATAACAACATCTCA  100

seq1  GGGTTATCTGTGTAATGTGGCAGTTCTTAGTGTGCGTTTCATGGAGTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTATCTGTGTAATGTGGCAGTTCTTAGTGTGCGTTTCATGGAGTTCT  150

seq1  TCCGAGAAGGTGAGGATCTGTGCCTTCAAGGATTACAAGGACTTTGCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGAAGGTGAGGATCTGTGCCTTCAAGGATTACAAGGACTTTGCTTC  200

seq1  CCCTCCATAACAGGAGCCTCCTGCGTCATCTTCACATGTCCCTAAAAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCATAACAGGAGCCTCCTGCGTCATCTTCACATGTCCCTAAAAGTG  250

seq1  ACAAAGAAATCAAAAGCAAGAGTGTTGCTGCTGGCATATGAATTGAGGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAAATCAAAAGCAAGAGTGTTGCTGCTGGCATATGAATTGAGGAC  300

seq1  ACTATTGAGGACCTTTGAGGCAAGCCAGAGGGATACGCAACGGGGCAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTGAGGACCTTTGAGGCAAGCCAGAGGGATACGCAACGGGGCAAGC  350

seq1  ATTGATCTCTACTGGGTTCTGTGATGGTCTGAATGAAATGGCTCCCATGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATCTCTACTGGGTTCTGTGATGGTCTGAATGAAATGGCTCCCATGG  400

seq1  GCCTGTAGGGAGTAGCACTATTAGGAGGTGGGCGTGGCCTTGTTGGAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTAGGGAGTAGCACTATTAGGAGGTGGGCGTGGCCTTGTTGGAGGA  450

seq1  AGTGTGTCACTGATGTGTGGACTTTGAGGTCTCAGATGTTCAAGCCAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGTCACTGATGTGTGGACTTTGAGGTCTCAGATGTTCAAGCCAGAC  500

seq1  CCAGTGTCTCACTCTCTTCCTGCCTGCTGACCCAGATGCAGAACTCTCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGTCTCACTCTCTTCCTGCCTGCTGACCCAGATGCAGAACTCTCAG  550

seq1  CTCCTTCTCCAGCACCATGTCTGCCTGTGTGCCACCATGTCTGCTGCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCTCCAGCACCATGTCTGCCTGTGTGCCACCATGTCTGCTGCCAT  600

seq1  GATGATAATGGACTGAACTTCTGAACTGCAAGCCTGACCCAGTCAAGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATAATGGACTGAACTTCTGAACTGCAAGCCTGACCCAGTCAAGTGT  650

seq1  TTCCTTATAAGAGTTGCCACAGTCATGGCATCTCTTCACAGCAATAAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTATAAGAGTTGCCACAGTCATGGCATCTCTTCACAGCAATAAAAC  700

seq1  TCTTAACTAAAGCGGGCTGGGATAGCCGAATGCATCTGAGTTGGGTTGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAACTAAAGCGGGCTGGGATAGCCGAATGCATCTGAGTTGGGTTGCC  750

seq1  TGCCATGCAGTCATCAGCATGTGGGTCTCTGCCTCTGCAGCCTCACAGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGCAGTCATCAGCATGTGGGTCTCTGCCTCTGCAGCCTCACAGGC  800

seq1  CCTCAGAATCCCAGCTATAACTTAGCCGGCAGACTGCCTTAAAGATCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGAATCCCAGCTATAACTTAGCCGGCAGACTGCCTTAAAGATCATG  850

seq1  GAAGTTAAACACTGGAGACACCACACAAACAAACTTCCTGAATTCCACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTAAACACTGGAGACACCACACAAACAAACTTCCTGAATTCCACTC  900

seq1  TGTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAAAAAAACCAAAAA  950
      || |||        |||||||| | ||| |||| |||||||   | ||||
seq2  TG-TGC--------AAAAAAAATATAAATAACCTAAAAAAA---CCAAAA  938

seq1  AAAAAAGAAATAAAGAAAACAATAACAACAACAAAACCCAAACCCGGACC  1000
      ||||||||| |||   ||||| |    || ||| |||||||  |||||||
seq2  AAAAAAGAATTAA--GAAACATT----ACCACACAACCCAA--CCGGACC  980

seq1  TTTCCTCAAAGCACTTCTTCATGATGAAAGAGAAAAGACCTTTATGACAT  1050
      |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    |||||
seq2  TTTCTTC-AAGCACTTCTTCATGATGAAGAAGAAAAGACCTCATGGACAT  1029

seq1  GTAATAGGAAGAATGATGCCTATAAATGCACAGTGACAGCTCATGAGAAG  1100
      | | |  |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||   | 
seq2  GAATT--GAAG-ATGATGC--TTAAATGCACAGTGACAGCTCATG---AA  1071

seq1  GGTGTCAT-GAGACAAGTCCTCAAAATCCCCAAATCAGAGCCTCATA  1146
      |||||||| || |  ||| |||  |||||    |||  |||||||||
seq2  GGTGTCATGGAAATCAGT-CTC--AATCC----ATC-TAGCCTCATA  1110