BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214B15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 56,791,480 - 56,952,627
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDbx1
Upstream geneMrgprb2, Mrgprb9-ps, Mrgprb3, EG639116, Zdhhc13, Csrp3, E2f8, LOC100040465, 9130015G15Rik, 5330421F07Rik
Downstream geneHtatip2, Prmt3, Slc6a5, Nell1, 4933405O20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214B15.bB6Ng01-214B15.g
ACCGA031443GA031444
length9061,118
definitionB6Ng01-214B15.b B6Ng01-214B15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,791,480 - 56,792,384)(56,951,502 - 56,952,627)
sequence
gaattcccatgctgatgaggagaggtccagcccctaacatccagtctctg
tcccctcactgcagggaaagaaggctagggagtgggcagtacagatgggc
aaaggaacttatactctcactggtttggtgtgaagagaccattttttctc
cttggacctcggtttcagcttgtttctaagtgaacaagcaggggtcagaa
atctatgtgtgggtgggcatccgtactgtcattgctgcagaggcagaccc
aggcggatccctagggctcacagccagaccagtgtagcctagagagcaag
caccagggctatgagcgtccctgtctcaaacaaaacaaaatggcaagcag
cacttgagaaatgatactcaagggtgtcttgtagcctacacatgtgtgct
cacgcttgttcacacacacctgtgcccttagcatgtgtgctcaagtatct
acacatacacacatacctttttaaaattgaagctaataagcacagggcag
ttggttcccctaatgtggttccagcaacatgtatctcctttctgtcccat
gagccattgctgtctgtgagctcaggtctgtctctagggagtgtagccaa
ggtttaagattgagaactgccagctgaggcagctgtggcagctgtgacag
ctgtggctcccatcccttgctactgtgtgatactcttgttagaaatagct
ttctgtctttgttttttagtcaggctctcctgctcttttatcctaatgct
acattctgaatgctggagtgacctgtgtgactcacaccttgctttatgca
gtactggggatctaacctaggactttccctcatgctaggagacctttcta
cccacggagccacatcccttcttctttttgtttttttgaggaggtggggg
ggatta
gaattcatagagatctgcctgcctctgcccttcgagtgctgggattaagg
gcatgtgccatctccctctgacaagagtttgtacatctaaaatagaacca
gctgtagaattaggggagacgggtacaaaatgaagatatgaaatctcttg
tttaaaaaaatgactaagaattcgaaaatgtagacatagaacacagcact
tcctttctcaggagggggccctgtataactgcccaggtcactcacccatg
aagccagtcctgccaagaaagcctacatatcaccatccctaagagaggcc
acacccgcgccgacagcacctccatttcttctgacttttcgctcacaact
atccacagctgactctttcttctctgtgatttgaacttcagaagagtcca
ctccgcacctcagaaggactgagctgtgcacacacaatgccatttcttct
ggacggttctccaaactttcatctattctagtcctggcaagcttggctgc
accgttcatcggccttttcctgccctcaagccaagtcattatccttttta
tatactgcactttgtgcccctgtgaacctgttgaaaaatagtgaaaagag
agttgaaaagtaccactggctcctaaaaatagtgctgactaggaggcaga
aagggggaactccggttttattcagtgctaaagataacaccaccagaatg
atagactcctccgaattgtttgttcccactggccattgtcccctgggcac
tgaatgagcctcttagcagctcttgaggcctgtcacaggtaggcacccaa
tggagataattcccagcctatgcttcactgctccttaacagaccctcgcc
ctgctttgaaaggcctcggactctgctgaataaaatcctcgcctccatca
acttagtctcccactgaattttccggggatgtgagcagcttcccagcagc
agcagaggatgtttctgaattgagctctgtctgatcagagcccagttggg
ctaggctcttcccagcaagagggggagacgggccatcatcccacgaggga
gcctgtgctctcctctgctctgctgctgcctatattggtatcaagtggca
gaaaattctttctttaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_56791480_56792384
seq2: B6Ng01-214B15.b_45_950

seq1  GAATTCCCATGCTGATGAGGAGAGGTCCAGCCCCTAACATCCAGTCTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCATGCTGATGAGGAGAGGTCCAGCCCCTAACATCCAGTCTCTG  50

seq1  TCCCCTCACTGCAGGGAAAGAAGGCTAGGGAGTGGGCAGTACAGATGGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCACTGCAGGGAAAGAAGGCTAGGGAGTGGGCAGTACAGATGGGC  100

seq1  AAAGGAACTTATACTCTCACTGGTTTGGTGTGAAGAGACCATTTTTTCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAACTTATACTCTCACTGGTTTGGTGTGAAGAGACCATTTTTTCTC  150

seq1  CTTGGACCTCGGTTTCAGCTTGTTTCTAAGTGAACAAGCAGGGGTCAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGACCTCGGTTTCAGCTTGTTTCTAAGTGAACAAGCAGGGGTCAGAA  200

seq1  ATCTATGTGTGGGTGGGCATCCGTACTGTCATTGCTGCAGAGGCAGACCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGTGTGGGTGGGCATCCGTACTGTCATTGCTGCAGAGGCAGACCC  250

seq1  AGGCGGATCCCTAGGGCTCACAGCCAGACCAGTGTAGCCTAGAGAGCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCGGATCCCTAGGGCTCACAGCCAGACCAGTGTAGCCTAGAGAGCAAG  300

seq1  CACCAGGGCTATGAGCGTCCCTGTCTCAAACAAAACAAAATGGCAAGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGGCTATGAGCGTCCCTGTCTCAAACAAAACAAAATGGCAAGCAG  350

seq1  CACTTGAGAAATGATACTCAAGGGTGTCTTGTAGCCTACACATGTGTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGAGAAATGATACTCAAGGGTGTCTTGTAGCCTACACATGTGTGCT  400

seq1  CACGCTTGTTCACACACACCTGTGCCCTTAGCATGTGTGCTCAAGTATCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCTTGTTCACACACACCTGTGCCCTTAGCATGTGTGCTCAAGTATCT  450

seq1  ACACATACACACATACCTTTTTAAAATTGAAGCTAATAAGCACAGGGCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACACACATACCTTTTTAAAATTGAAGCTAATAAGCACAGGGCAG  500

seq1  TTGGTTCCCCTAATGTGGTTCCAGCAACATGTATCTCCTTTCTGTCCCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTCCCCTAATGTGGTTCCAGCAACATGTATCTCCTTTCTGTCCCAT  550

seq1  GAGCCATTGCTGTCTGTGAGCTCAGGTCTGTCTCTAGGGAGTGTAGCCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCATTGCTGTCTGTGAGCTCAGGTCTGTCTCTAGGGAGTGTAGCCAA  600

seq1  GGTTTAAGATTGAGAACTGCCAGCTGAGGCAGCTGTGGCAGCTGTGACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAAGATTGAGAACTGCCAGCTGAGGCAGCTGTGGCAGCTGTGACAG  650

seq1  CTGTGGCTCCCATCCCTTGCTACTGTGTGATACTCTTGTTAGAAATAGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCTCCCATCCCTTGCTACTGTGTGATACTCTTGTTAGAAATAGCT  700

seq1  TTCTGTCTTTGTTTTTTAGTCAGGCTCTCCTGCTCTTTTATCCTAATGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTTTGTTTTTTAGTCAGGCTCTCCTGCTCTTTTATCCTAATGCT  750

seq1  ACATTCTGAATGCTGGAGTGACCTGTGTGACTCACACCTTGCTTTATGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTGAATGCTGGAGTGACCTGTGTGACTCACACCTTGCTTTATGCA  800

seq1  GTACTGGGGATCTAACCTAGGACTTTCCCTCATGCTAGGAGACCTTTCTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGGGGATCTAACCTAGGACTTTCCCTCATGCTAGGAGACCTTTCTA  850

seq1  CCCACGGAGCCACATCCCTTCTTCTTTTTGTTTTTTTGAGGAGGT-GGGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CCCACGGAGCCACATCCCTTCTTCTTTTTGTTTTTTTGAGGAGGTGGGGG  900

seq1  GGATTA  905
      ||||||
seq2  GGATTA  906

seq1: chr7_56951502_56952627
seq2: B6Ng01-214B15.g_62_1179 (reverse)

seq1  TCTATAAGAAAAGGAATTTTCTG-CACTTGATACCCATATAAGCAGGCAG  49
      |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||
seq2  TCTA-AAGAAA--GAATTTTCTGCCACTTGATACCAATATAGGCA-GCAG  46

seq1  CAGAGCAGAGGAGAGCACAGGCTCCCTCGTGGGATGGATGCCCGTTCTCC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   ||
seq2  CAGAGCAGAGGAGAGCACAGGCTCCCTCGTGGGATGATGGCCCGTCTCCC  96

seq1  CCTCTTGCTTGGGAAGGAGGCCTAGCCC-ACTGGGCTCTGATTCAGAACA  148
      |||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||| |||| |||
seq2  CCTCTTGC-TGGGAAG--AGCCTAGCCCAACTGGGCTCTGA-TCAG-ACA  141

seq1  GGAGCTCAATTCAGAAACATCCTCTGCTGCTGCTGGGAAGCTGCTCACAT  198
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GAGCTCAATTCAGAAACATCCTCTGCTGCTGCTGGGAAGCTGCTCACAT  190

seq1  CCCCGGAAAATTCAGTGGGAGACTAAGTTGATGGAGGCGAGGATTTTATT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGGAAAATTCAGTGGGAGACTAAGTTGATGGAGGCGAGGATTTTATT  240

seq1  CAGCAGAGTCCGAGGCCTTTCAAAGCAGGGCGAGGGTCTGTTAAGGAGCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAGTCCGAGGCCTTTCAAAGCAGGGCGAGGGTCTGTTAAGGAGCA  290

seq1  GTGAAGCATAGGCTGGGAATTATCTCCATTGGGTGCCTACCTGTGACAGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGCATAGGCTGGGAATTATCTCCATTGGGTGCCTACCTGTGACAGG  340

seq1  CCTCAAGAGCTGCTAAGAGGCTCATTCAGTGCCCAGGGGACAATGGCCAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAGAGCTGCTAAGAGGCTCATTCAGTGCCCAGGGGACAATGGCCAG  390

seq1  TGGGAACAAACAATTCGGAGGAGTCTATCATTCTGGTGGTGTTATCTTTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAACAAACAATTCGGAGGAGTCTATCATTCTGGTGGTGTTATCTTTA  440

seq1  GCACTGAATAAAACCGGAGTTCCCCCTTTCTGCCTCCTAGTCAGCACTAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAATAAAACCGGAGTTCCCCCTTTCTGCCTCCTAGTCAGCACTAT  490

seq1  TTTTAGGAGCCAGTGGTACTTTTCAACTCTCTTTTCACTATTTTTCAACA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGAGCCAGTGGTACTTTTCAACTCTCTTTTCACTATTTTTCAACA  540

seq1  GGTTCACAGGGGCACAAAGTGCAGTATATAAAAAGGATAATGACTTGGCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCACAGGGGCACAAAGTGCAGTATATAAAAAGGATAATGACTTGGCT  590

seq1  TGAGGGCAGGAAAAGGCCGATGAACGGTGCAGCCAAGCTTGCCAGGACTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGCAGGAAAAGGCCGATGAACGGTGCAGCCAAGCTTGCCAGGACTA  640

seq1  GAATAGATGAAAGTTTGGAGAACCGTCCAGAAGAAATGGCATTGTGTGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGATGAAAGTTTGGAGAACCGTCCAGAAGAAATGGCATTGTGTGTG  690

seq1  CACAGCTCAGTCCTTCTGAGGTGCGGAGTGGACTCTTCTGAAGTTCAAAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTCAGTCCTTCTGAGGTGCGGAGTGGACTCTTCTGAAGTTCAAAT  740

seq1  CACAGAGAAGAAAGAGTCAGCTGTGGATAGTTGTGAGCGAAAAGTCAGAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAGAAGAAAGAGTCAGCTGTGGATAGTTGTGAGCGAAAAGTCAGAA  790

seq1  GAAATGGAGGTGCTGTCGGCGCGGGTGTGGCCTCTCTTAGGGATGGTGAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGGAGGTGCTGTCGGCGCGGGTGTGGCCTCTCTTAGGGATGGTGAT  840

seq1  ATGTAGGCTTTCTTGGCAGGACTGGCTTCATGGGTGAGTGACCTGGGCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGGCTTTCTTGGCAGGACTGGCTTCATGGGTGAGTGACCTGGGCAG  890

seq1  TTATACAGGGCCCCCTCCTGAGAAAGGAAGTGCTGTGTTCTATGTCTACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACAGGGCCCCCTCCTGAGAAAGGAAGTGCTGTGTTCTATGTCTACA  940

seq1  TTTTCGAATTCTTAGTCATTTTTTTAAACAAGAGATTTCATATCTTCATT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCGAATTCTTAGTCATTTTTTTAAACAAGAGATTTCATATCTTCATT  990

seq1  TTGTACCCGTCTCCCCTAATTCTACAGCTGGTTCTATTTTAGATGTACAA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTACCCGTCTCCCCTAATTCTACAGCTGGTTCTATTTTAGATGTACAA  1040

seq1  ACTCTTGTCAGAGGGAGATGGCACATGCCCTTAATCCCAGCACTCGAAGG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGTCAGAGGGAGATGGCACATGCCCTTAATCCCAGCACTCGAAGG  1090

seq1  GCAGAGGCAGGCAGATCTCTATGAATTC  1126
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGCAGGCAGATCTCTATGAATTC  1118