BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-214K19
Chromosome7 (Build37)
Map Location 84,623,971 - 84,752,776
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG244071
Downstream geneA330068G13Rik, Ntrk3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-214K19.bB6Ng01-214K19.g
ACCGA031863GA031864
length887516
definitionB6Ng01-214K19.b B6Ng01-214K19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,623,971 - 84,624,850)(84,752,256 - 84,752,776)
sequence
gaattcaattcccagaacctatatggtaggaagtgaaaactacctaccat
tgaggtcctctaacctccacatgtgtaccatggcatgttcatccctatct
aacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
tccaaaaaaacaacaacaacaataacaacaaaaaaccatgggcatgtgcg
cacatgcacacacacatacacatgtaaaagactggatacatgcactctgc
cacacacacatacacatgaacatatacatacatataccagaaaaatacat
atttttaaaaataacactttggggacatggtaaaacatggtatctataat
acatggtatctataatacatggtatctataataatcttagtattcagaag
gctgaggcaagaggatctgcataacactaaggcaagtctgagctttggag
taagttcaaaacaagacagaaatagatagataaataaattaattcatttt
tagtttttctgtcatgtgggtagtatccatatgttccatgggactttgct
ttcattacaactcacaatcatgattgacagcaaagtcactctgccaggct
gtgttgactcaaatagagagaatgcaaactctagtggtccttatacctca
agggaaatgtatagccctcaaacttcttcacgctgcatatttaattagtc
ctaatcaattccatgatgtacagtgatagtttttaatttcatgggtcttc
aggtaaatggcagcaactttttttttaggtattgttaagggcaatctcaa
ggggaaagatttaaaggcattttaaaattattctacctttatgtatgtgt
atttgtttttgtgtctgtatatatatatacatatata
atgcaatcacacctaaggcttgcagaagaaagaggaggtggtaagatgcc
agagacagaaaacagggaagggctgttaaatgtcatcttctagggaagac
actgtctttacacatgagaagtcacagaagctatggattccttctttgtg
tctgtgtattcacaggtccagcaaaagtcagttatggatggatgaaggtg
gagctcagactttctcaccaccaactgctgaaatatttactaatgataga
ttcagggagaaaaatgaatcaataccttatgtttgtttcccattggagat
cccagtggattattcaagccagtgatcagagaaatggccccagttaaatg
caaataaaactcaaggtcctgaattaggaaaaggattggtgtggatgtgg
gacttgagattttatagggataagagggtgggaaatgagttggggagtta
cactaaacttctattaaatacaagtataacattgcccaacaccaaacttc
ataaaaatcaatgaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_84623971_84624850
seq2: B6Ng01-214K19.b_36_922

seq1  GAATTCAATTCCCAGAACCTATATGGTAGGAAGTGAAAACTACCTACCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTCCCAGAACCTATATGGTAGGAAGTGAAAACTACCTACCAT  50

seq1  TGAGGTCCTCTAACCTCCACATGTGTACCATGGCATGTTCATCCCTATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTCCTCTAACCTCCACATGTGTACCATGGCATGTTCATCCCTATCT  100

seq1  AACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA  150

seq1  TCCAAAAAAACAACAACAACAATAACAACAAAAAACCATGGGCATGTGCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAAAAACAACAACAACAATAACAACAAAAAACCATGGGCATGTGCG  200

seq1  CACATGCACACACACATACACATGTAAAAGACTGGATACATGCACTCTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGCACACACACATACACATGTAAAAGACTGGATACATGCACTCTGC  250

seq1  CACACACACATACACATGAACATATACATACATATACCAGAAAAATACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACATACACATGAACATATACATACATATACCAGAAAAATACAT  300

seq1  ATTTTTAAAAATAACACTTTGGGGACATGGTAAAACATGGTATCTATAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAAAAATAACACTTTGGGGACATGGTAAAACATGGTATCTATAAT  350

seq1  ACATGGTATCTATAATACATGGTATCTATAATAATCTTAGTATTCAGAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGTATCTATAATACATGGTATCTATAATAATCTTAGTATTCAGAAG  400

seq1  GCTGAGGCAAGAGGATCTGCATAACACTAAGGCAAGTCTGAGCTTTGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGGCAAGAGGATCTGCATAACACTAAGGCAAGTCTGAGCTTTGGAG  450

seq1  TAAGTTCAAAACAAGACAGAAATAGATAGATAAATAAATTAATTCATTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTCAAAACAAGACAGAAATAGATAGATAAATAAATTAATTCATTTT  500

seq1  TAGTTTTTCTGTCATGTGGGTAGTATCCATATGTTCCATGGGACTTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTTCTGTCATGTGGGTAGTATCCATATGTTCCATGGGACTTTGCT  550

seq1  TTCATTACAACTCACAATCATGATTGACAGCAAAGTCACTCTGCCAGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTACAACTCACAATCATGATTGACAGCAAAGTCACTCTGCCAGGCT  600

seq1  GTGTTGACTCAAATAGAGAGAATGCAAACTCTAGTGGTCCTTATACCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGACTCAAATAGAGAGAATGCAAACTCTAGTGGTCCTTATACCTCA  650

seq1  AGGGAAATGTATAGCCCTC-AACTTCTTCACGCTGCATATTTAATTAGTC  699
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAATGTATAGCCCTCAAACTTCTTCACGCTGCATATTTAATTAGTC  700

seq1  CTAATCAATTCCATGATGTACAGTGATAGTTTT--AATTCATGGGTCTTC  747
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||
seq2  CTAATCAATTCCATGATGTACAGTGATAGTTTTTAATTTCATGGGTCTTC  750

seq1  AGGTAAATGGCAGCAAC-TTTTTTTTAGGTATTG-TAAGGGCAATCTCAA  795
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGGTAAATGGCAGCAACTTTTTTTTTAGGTATTGTTAAGGGCAATCTCAA  800

seq1  GGGGAAAGATTTAAAGGCA-TTTAAAATTATTCTACCTTTATGTATGTGT  844
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAGATTTAAAGGCATTTTAAAATTATTCTACCTTTATGTATGTGT  850

seq1  ATTTG-TTTTGTGTCTGTATATATATATACATATATA  880
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTTTGTGTCTGTATATATATATACATATATA  887

seq1: chr7_84752256_84752776
seq2: B6Ng01-214K19.g_68_589 (reverse)

seq1  TTTCATTGATTTTTATGAAGTTTGATATTGGACAATGTTATACATGTATT  50
      |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||
seq2  TTTCATTGATTTTTATGAAGTTTGGTGTTGGGCAATGTTATACTTGTATT  50

seq1  TAATAG-AGTTTAGTGTCACTCCCCAACTCATTTCCCACCCTCTTATCCC  99
      |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGAAGTTTAGTGTAACTCCCCAACTCATTTCCCACCCTCTTATCCC  100

seq1  TATAAAATCTCAAGTCCCACATCCACACCAATCCTTTTCCTAATTCAGGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAAATCTCAAGTCCCACATCCACACCAATCCTTTTCCTAATTCAGGA  150

seq1  CCTTGAGTTTTATTTGCATTTAACTGGGGCCATTTCTCTGATCACTGGCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGTTTTATTTGCATTTAACTGGGGCCATTTCTCTGATCACTGGCT  200

seq1  TGAATAATCCACTGGGATCTCCAATGGGAAACAAACATAAGGTATTGATT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAATCCACTGGGATCTCCAATGGGAAACAAACATAAGGTATTGATT  250

seq1  CATTTTTCTCCCTGAATCTATCATTAGTAAATATTTCAGCAGTTGGTGGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTTCTCCCTGAATCTATCATTAGTAAATATTTCAGCAGTTGGTGGT  300

seq1  GAGAAAGTCTGAGCTCCACCTTCATCCATCCATAACTGACTTTTGCTGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGTCTGAGCTCCACCTTCATCCATCCATAACTGACTTTTGCTGGA  350

seq1  CCTGTGAATACACAGACACAAAGAAGGAATCCATAGCTTCTGTGACTTCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGAATACACAGACACAAAGAAGGAATCCATAGCTTCTGTGACTTCT  400

seq1  CATGTGTAAAGACAGTGTCTTCCCTAGAAGATGACATTTAACAGCCCTTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTAAAGACAGTGTCTTCCCTAGAAGATGACATTTAACAGCCCTTC  450

seq1  CCTGTTTTCTGTCTCTGGCATCTTACCACCTCCTCTTTCTTCTGCAAGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTTTTCTGTCTCTGGCATCTTACCACCTCCTCTTTCTTCTGCAAGCC  500

seq1  TTAGGTGTGATTGCATGAATTC  521
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTGTGATTGCATGAATTC  522