BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-216H12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 140,289,834 - 140,513,836
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCtbp2
Upstream geneCpxm2, 4631426J05Rik, LOC100043682, LOC100043683, Oat, Nkx1-2, 2310007H09Rik, A930008G19Rik, 2010208K18Rik, C430003P19Rik, Zranb1
Downstream geneLOC668747, 4930404H21Rik, LOC100043237, 2700050L05Rik, Mmp21, Uros, Bccip, Dhx32, LOC100043695, Fank1, Adam12, A130023I24Rik, 4933400E14Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-216H12.bB6Ng01-216H12.g
ACCGA033150GA033151
length974854
definitionB6Ng01-216H12.b B6Ng01-216H12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(140,512,864 - 140,513,836)(140,289,834 - 140,290,687)
sequence
gaattcactaaaattctctttgcttggcttcccaaaccctgcttaggtgg
ggaatgggcatcagtggggtctctttaagtcagcctaagggagataaatc
agctgagttagtgagtgtgaccttgaggtccatgggaggtaaatgggcac
actttgctcgaagaggtccacctgtggcacgggatgagaaagcagcagcc
ttgatctctgcatctatgtgactgcagtcctcctccaactgtgacaatca
aaaatgtctccagaactgaccaacgtcccgtgggtggcaaaatttctcca
gttcagaaacagatatggtgtggggcctagcctctcaggatccacaggtc
atggtttgagtcagaaattctctccacaggttcatgtctcaaatgtgaag
cactgatctgtaaggctgtagaactctcagaggtagagccttgcttatag
aggtaagcctttggagactaacctaacccttgattccgtcctcactctct
tcctttctagtccaccataatgtaacctttccagcgtacacataccatca
tcatgaactgagccccgacctccccttccccaccatgacggaccgaaacc
ctctgagactgagcctaacagctctcttccttttacgtggggcattttcc
agagcaatgcaaacataaccaactgtctttcccagcactgagactagctt
gaagaatgagagtcatcgtctaacgtcactcactactccaacgctgaatt
tcttttctggatttcaactttttctcagagttgccctaaaaatcatccat
tctgttccttacagagaaccaaatcctctgtctagtccctttgttatgcc
cttcatttgtttactttgtataggcagacatgtggttgttcattctctct
ctctaactcagtaaggttactatggctgccataaacaccttggcctcaaa
gcaagttggggggttgtggggggg
gaattctcaggtccacacagggatgaggatgcagtgtacggagctcaggg
caatctgggcaggagaccaagtgagaggggctgtggcctagcccctaacc
ttccagctcatgaccttcaggcatgtgtgtgtgacacctccccccaggac
tcccacatttctactgctcacgatttgattgcccactgccctctgggagg
gtgatgggatccttttcagcagggctccagcaggccactaccctagagcc
ctgccgggaagggccacacgtgctacccttaaccccgagacccaacaagg
gagtaaagatccatctctctactgtatgagagaaagacaaggaaggaagg
ccacaatcctgttcttgtgggcactctgcccttaacgcctcccacttagg
tctgacctgctccaaagcaaactcccgcagggaattcgctcacttggccc
tgctgcatctcccacatgccagggcctgaggaactagaacccagaagtct
gttacaagatgtcatcccagaacactattaaacccctgccgcactcctca
catagctgagcatccagggacacgtaggagccaagactgaacatgtctct
cctgaatggtaaccggaagctctcctaccagtgtagcccacggcctggga
agagccaggtgacttcaaatggactctgggaaggcagaaagaaggggaag
ccataacattagctaaccatcatcaccagaagagaactgtttatttatta
tagtctcatgttcctgagtattctttttaactttaaaatctaagttttca
ctgggtagtggtgtgccatgcctttaaccctagcactcgggaggcagagg
caga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_140512864_140513836
seq2: B6Ng01-216H12.b_44_1017 (reverse)

seq1  CCCCCCCACA--CCCCCAACTTGCTTTGAGGCCAAGGTGTTTAATGGCAG  48
      ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CCCCCCCACAACCCCCCAACTTGCTTTGAGGCCAAGGTGTTT-ATGGCAG  49

seq1  CCATAGTAACCTTAACTGAGTTAGAGAGAGAGAATGAACAACCACATGTC  98
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGTAACCTT-ACTGAGTTAGAGAGAGAGAATGAACAACCACATGTC  98

seq1  TGCCTATACAAAGTAAACAAATGAA-GGCATAACAAAGGGACTAGACAGA  147
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTATACAAAGTAAACAAATGAAGGGCATAACAAAGGGACTAGACAGA  148

seq1  GGATTTGGTTCTCTGTAAGGAACAGAATGGATGATTTTTAGGGCAACTCT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGGTTCTCTGTAAGGAACAGAATGGATGATTTTTAGGGCAACTCT  198

seq1  GAGAAAAAGTTGAAATCCAGAAAAGAAATTCAGCGTTGGAGTAGTGAGTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAAAGTTGAAATCCAGAAAAGAAATTCAGCGTTGGAGTAGTGAGTG  248

seq1  ACGTTAGACGATGACTCTCATTCTTCAAGCTAGTCTCAGTGCTGGGAAAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTAGACGATGACTCTCATTCTTCAAGCTAGTCTCAGTGCTGGGAAAG  298

seq1  ACAGTTGGTTATGTTTGCATTGCTCTGGAAAATGCCCCACGTAAAAGGAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTGGTTATGTTTGCATTGCTCTGGAAAATGCCCCACGTAAAAGGAA  348

seq1  GAGAGCTGTTAGGCTCAGTCTCAGAGGGTTTCGGTCCGTCATGGTGGGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCTGTTAGGCTCAGTCTCAGAGGGTTTCGGTCCGTCATGGTGGGGA  398

seq1  AGGGGAGGTCGGGGCTCAGTTCATGATGATGGTATGTGTACGCTGGAAAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGTCGGGGCTCAGTTCATGATGATGGTATGTGTACGCTGGAAAG  448

seq1  GTTACATTATGGTGGACTAGAAAGGAAGAGAGTGAGGACGGAATCAAGGG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACATTATGGTGGACTAGAAAGGAAGAGAGTGAGGACGGAATCAAGGG  498

seq1  TTAGGTTAGTCTCCAAAGGCTTACCTCTATAAGCAAGGCTCTACCTCTGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGTTAGTCTCCAAAGGCTTACCTCTATAAGCAAGGCTCTACCTCTGA  548

seq1  GAGTTCTACAGCCTTACAGATCAGTGCTTCACATTTGAGACATGAACCTG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTACAGCCTTACAGATCAGTGCTTCACATTTGAGACATGAACCTG  598

seq1  TGGAGAGAATTTCTGACTCAAACCATGACCTGTGGATCCTGAGAGGCTAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAGAATTTCTGACTCAAACCATGACCTGTGGATCCTGAGAGGCTAG  648

seq1  GCCCCACACCATATCTGTTTCTGAACTGGAGAAATTTTGCCACCCACGGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCACACCATATCTGTTTCTGAACTGGAGAAATTTTGCCACCCACGGG  698

seq1  ACGTTGGTCAGTTCTGGAGACATTTTTGATTGTCACAGTTGGAGGAGGAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTGGTCAGTTCTGGAGACATTTTTGATTGTCACAGTTGGAGGAGGAC  748

seq1  TGCAGTCACATAGATGCAGAGATCAAGGCTGCTGCTTTCTCATCCCGTGC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTCACATAGATGCAGAGATCAAGGCTGCTGCTTTCTCATCCCGTGC  798

seq1  CACAGGTGGACCTCTTCGAGCAAAGTGTGCCCATTTACCTCCCATGGACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTGGACCTCTTCGAGCAAAGTGTGCCCATTTACCTCCCATGGACC  848

seq1  TCAAGGTCACACTCACTAACTCAGCTGATTTATCTCCCTTAGGCTGACTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGTCACACTCACTAACTCAGCTGATTTATCTCCCTTAGGCTGACTT  898

seq1  AAAGAGACCCCACTGATGCCCATTCCCCACCTAAGCAGGGTTTGGGAAGC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGACCCCACTGATGCCCATTCCCCACCTAAGCAGGGTTTGGGAAGC  948

seq1  CAAGCAAAGAGAATTTTAGTGAATTC  973
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAAAGAGAATTTTAGTGAATTC  974

seq1: chr7_140289834_140290687
seq2: B6Ng01-216H12.g_68_921

seq1  GAATTCTCAGGTCCACACAGGGATGAGGATGCAGTGTACGGAGCTCAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAGGTCCACACAGGGATGAGGATGCAGTGTACGGAGCTCAGGG  50

seq1  CAATCTGGGCAGGAGACCAAGTGAGAGGGGCTGTGGCCTAGCCCCTAACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTGGGCAGGAGACCAAGTGAGAGGGGCTGTGGCCTAGCCCCTAACC  100

seq1  TTCCAGCTCATGACCTTCAGGCATGTGTGTGTGACACCTCCCCCCAGGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCTCATGACCTTCAGGCATGTGTGTGTGACACCTCCCCCCAGGAC  150

seq1  TCCCACATTTCTACTGCTCACGATTTGATTGCCCACTGCCCTCTGGGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACATTTCTACTGCTCACGATTTGATTGCCCACTGCCCTCTGGGAGG  200

seq1  GTGATGGGATCCTTTTCAGCAGGGCTCCAGCAGGCCACTACCCTAGAGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGGGATCCTTTTCAGCAGGGCTCCAGCAGGCCACTACCCTAGAGCC  250

seq1  CTGCCGGGAAGGGCCACACGTGCTACCCTTAACCCCGAGACCCAACAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCGGGAAGGGCCACACGTGCTACCCTTAACCCCGAGACCCAACAAGG  300

seq1  GAGTAAAGATCCATCTCTCTACTGTATGAGAGAAAGACAAGGAAGGAAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAAAGATCCATCTCTCTACTGTATGAGAGAAAGACAAGGAAGGAAGG  350

seq1  CCACAATCCTGTTCTTGTGGGCACTCTGCCCTTAACGCCTCCCACTTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAATCCTGTTCTTGTGGGCACTCTGCCCTTAACGCCTCCCACTTAGG  400

seq1  TCTGACCTGCTCCAAAGCAAACTCCCGCAGGGAATTCGCTCACTTGGCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACCTGCTCCAAAGCAAACTCCCGCAGGGAATTCGCTCACTTGGCCC  450

seq1  TGCTGCATCTCCCACATGCCAGGGCCTGAGGAACTAGAACCCAGAAGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCATCTCCCACATGCCAGGGCCTGAGGAACTAGAACCCAGAAGTCT  500

seq1  GTTACAAGATGTCAT-CCAGAACACTATTAAACCCCTGCCGCACTCCTCA  549
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAAGATGTCATCCCAGAACACTATTAAACCCCTGCCGCACTCCTCA  550

seq1  CATAGCTGAGCATCCAGGGACACGTAGGAGCCAAGACTGAACATGTCTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCTGAGCATCCAGGGACACGTAGGAGCCAAGACTGAACATGTCTCT  600

seq1  CCTGAATGGTAACCGGAAGCTCTCCTACCAGTGTAGCCCACGGCCTGGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAATGGTAACCGGAAGCTCTCCTACCAGTGTAGCCCACGGCCTGGGA  650

seq1  AGAGCCAGGTGACTTCAAATGGACTCTGGGAAGGCAGAAAGAAGGGGAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGGTGACTTCAAATGGACTCTGGGAAGGCAGAAAGAAGGGGAAG  700

seq1  CCATAACATTAGCTAACCATCATCACCAGAAGAGAACTGTTTATTTATTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAACATTAGCTAACCATCATCACCAGAAGAGAACTGTTTATTTATTA  750

seq1  TAGTCTCATGTTCCTGAGTATTCTTTTTAACTTTAAAATCTAAGTTTTCA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTCATGTTCCTGAGTATTCTTTTTAACTTTAAAATCTAAGTTTTCA  800

seq1  CTGGGTAGTGGTGGTGCCATGCCTTTAACCCAAGCACTCGGGAGGCAGAG  849
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTAGTGGT-GTGCCATGCCTTTAACCCTAGCACTCGGGAGGCAGAG  849

seq1  GCAGA  854
      |||||
seq2  GCAGA  854