BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-223O14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 68,086,334 - 68,266,382
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC625287, D0Kist2
Upstream geneSnrpn, Snurf, EG664849, LOC100041201, LOC100041211, LOC664896, LOC100041229
Downstream geneLOC100041248, LOC100041259, EG664943, B230209E15Rik, EG620934, LOC100041293
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-223O14.bB6Ng01-223O14.g
ACCGA038523GA038524
length1,111448
definitionB6Ng01-223O14.b B6Ng01-223O14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,265,267 - 68,266,382)(68,086,334 - 68,086,786)
sequence
gaattctcattagaccaggcagtgtgtcatagctctaatgtcttatacag
gattatctatgaattaacaataattggaaggccaatatagaaagacaata
cttcctactgctcctctctatttttctggtctcatatccatataatatcc
ccattcctttcaacagattgatgtagatatttcatcagggacagagtgaa
gaaaattggcagagacataagtgaaagataaaactcactgacttggagga
ttcttattcctgaaagacatttctatgtccaacgatgacaaggccctgat
acacatctctaaataggaacaaaaagaaaaaattgaaaacccggggaata
ttttattcatttaacccatatgttatttagcagaatgccagacttagagt
caacctatccctaactcataatggaaaagcatgtttgtttgccttggtct
aaggcccagtcgtatgttttgaatagaaactagctcaagtattttctaga
taatcagaattcccattattattgctgttttgtattcccttccaggattt
tagaattcctctactcaagttaaaatacctgtttgacaatcagccagaaa
gttatgactgtactgaaatgtcaaaggttccttctaacatgagaggacag
agtttaccatatttggaaaccctagtcagtaatcacctcatgcaaagtta
aagggagtacaaaagttgtctgaccatggaggtgtgttttgggatctttt
aatgttgttagatgatttctcctcaataatccagtgagaaatcatccacc
ttgattagaagcgcttggacccaattaccttgggatgggtcacataggat
agactgcactagacacacccaggattggcctatgcggaagtcatcctttt
gcttaatttattcttatctcatattcagattttagattaaagaagctgtg
aataactaactgaagacatatgtgtttagctgttgtctaaaggaaaatgt
tcaatttctccatatcttcagctgaagtactcttgaatttttctgttgga
gtacaataaatgatatctagtttaaaatcagttaacgatggctttgtctg
acatcagcaaa
caggggtttgtaatgtcataggattaacactaatatcaaccaaccagacc
ccacagagttccaagggacttaacaaccaaccaaggagtacacatggaaa
gaccatggctccagctgcaatgtagcagaggatggccttgtcgggtatca
gtgggaggagaggcccttggtcctataaaggctcaatgtccaagtgtagg
ggaatttgagggcagagaggttggagtgggttggtgggtgacagaacacc
ctcatagaagcagggggagaggggaggaataggtgaatctgtgattttag
tgatgatcattttttttgttagataacaaactgcaatgctctttctttta
gaagtttgtcttatgatcacatatctctttaggtgtctgaaatactatac
tgattttgaggtcctgggctattcaaatactcattaatatatggattg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_68265267_68266382
seq2: B6Ng01-223O14.b_50_1160 (reverse)

seq1  TTTGCTGATTGTCAGACAAAGCCATCCTTTAACTGATTTT-AACTAGATA  49
      |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||
seq2  TTTGCTGA-TGTCAGACAAAGCCAT-CGTTAACTGATTTTAAACTAGATA  48

seq1  TCATTTATTGTTACTCCAACAGAAAATTTCAAGAGTACTTCAAGCTGAAG  99
      |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  TCATTTATTG-TACTCCAACAGAAAAATTCAAGAGTACTTC-AGCTGAAG  96

seq1  ATATGGAGAAATTTGAACATTTTCCTTTAGACAAACAGCTTAAACACATA  149
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  ATATGGAGAAA-TTGAACATTTTCCTTTAGAC-AACAGC-TAAACACATA  143

seq1  TGTCTTCAGTTAGTTATTCACAGCTTC-TTAATCTAAAATCTGAATATGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCAGTTAGTTATTCACAGCTTCTTTAATCTAAAATCTGAATATGA  193

seq1  GATAAGAATAAATTAAGCAAAAGGATGACTTCCGCATAGGCCAATCCTGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGAATAAATTAAGCAAAAGGATGACTTCCGCATAGGCCAATCCTGG  243

seq1  GTGTGTCTAGTGCAGTCTATCCTATGTGACCCATCCCAAGGTAATTGGGT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTCTAGTGCAGTCTATCCTATGTGACCCATCCCAAGGTAATTGGGT  293

seq1  CCAAGCGCTTCTAATCAAGGTGGATGATTTCTCACTGGATTATTGAGGAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGCGCTTCTAATCAAGGTGGATGATTTCTCACTGGATTATTGAGGAG  343

seq1  AAATCATCTAACAACATTAAAAGATCCCAAAACACACCTCCATGGTCAGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCATCTAACAACATTAAAAGATCCCAAAACACACCTCCATGGTCAGA  393

seq1  CAACTTTTGTACTCCCTTTAACTTTGCATGAGGTGATTACTGACTAGGGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTTTGTACTCCCTTTAACTTTGCATGAGGTGATTACTGACTAGGGT  443

seq1  TTCCAAATATGGTAAACTCTGTCCTCTCATGTTAGAAGGAACCTTTGACA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAATATGGTAAACTCTGTCCTCTCATGTTAGAAGGAACCTTTGACA  493

seq1  TTTCAGTACAGTCATAACTTTCTGGCTGATTGTCAAACAGGTATTTTAAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTACAGTCATAACTTTCTGGCTGATTGTCAAACAGGTATTTTAAC  543

seq1  TTGAGTAGAGGAATTCTAAAATCCTGGAAGGGAATACAAAACAGCAATAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGTAGAGGAATTCTAAAATCCTGGAAGGGAATACAAAACAGCAATAA  593

seq1  TAATGGGAATTCTGATTATCTAGAAAATACTTGAGCTAGTTTCTATTCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGGAATTCTGATTATCTAGAAAATACTTGAGCTAGTTTCTATTCAA  643

seq1  AACATACGACTGGGCCTTAGACCAAGGCAAACAAACATGCTTTTCCATTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATACGACTGGGCCTTAGACCAAGGCAAACAAACATGCTTTTCCATTA  693

seq1  TGAGTTAGGGATAGGTTGACTCTAAGTCTGGCATTCTGCTAAATAACATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTAGGGATAGGTTGACTCTAAGTCTGGCATTCTGCTAAATAACATA  743

seq1  TGGGTTAAATGAATAAAATATTCCCCGGGTTTTCAATTTTTTCTTTTTGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTAAATGAATAAAATATTCCCCGGGTTTTCAATTTTTTCTTTTTGT  793

seq1  TCCTATTTAGAGATGTGTATCAGGGCCTTGTCATCGTTGGACATAGAAAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTTAGAGATGTGTATCAGGGCCTTGTCATCGTTGGACATAGAAAT  843

seq1  GTCTTTCAGGAATAAGAATCCTCCAAGTCAGTGAGTTTTATCTTTCACTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTCAGGAATAAGAATCCTCCAAGTCAGTGAGTTTTATCTTTCACTT  893

seq1  ATGTCTCTGCCAATTTTCTTCACTCTGTCCCTGATGAAATATCTACATCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTCTGCCAATTTTCTTCACTCTGTCCCTGATGAAATATCTACATCA  943

seq1  ATCTGTTGAAAGGAATGGGGATATTATATGGATATGAGACCAGAAAAATA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTTGAAAGGAATGGGGATATTATATGGATATGAGACCAGAAAAATA  993

seq1  GAGAGGAGCAGTAGGAAGTATTGTCTTTCTATATTGGCCTTCCAATTATT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAGCAGTAGGAAGTATTGTCTTTCTATATTGGCCTTCCAATTATT  1043

seq1  GTTAATTCATAGATAATCCTGTATAAGACATTAGAGCTATGACACACTGC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATTCATAGATAATCCTGTATAAGACATTAGAGCTATGACACACTGC  1093

seq1  CTGGTCTAATGAGAATTC  1116
      ||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTAATGAGAATTC  1111

seq1: chr7_68086334_68086786
seq2: B6Ng01-223O14.g_69_522

seq1  GAATTCCAGGGGTTTGTAATGTCATAGGATTAACACTAATATCAACCAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGGGTTTGTAATGTCATAGGATTAACACTAATATCAACCAAC  50

seq1  CAGACCCCACAGAGTTCCAAGGGACTTAACAACCAACCAAGGAGTACACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCCCACAGAGTTCCAAGGGACTTAACAACCAACCAAGGAGTACACA  100

seq1  TGGAAAGACCATGGCTCCAGCTGCAATGTAGCAGAGGATGGCCTTGTCGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAGACCATGGCTCCAGCTGCAATGTAGCAGAGGATGGCCTTGTCGG  150

seq1  GTATCAGTGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCCTATAAAGGCTCAATGTCCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCAGTGGGAGGAGAGGCCCTTGGTCCTATAAAGGCTCAATGTCCAAG  200

seq1  TGTAGGGGAATTTGAGGGCAGAGAGGTTGGAGTGGGTTGGTGGGTGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGGGAATTTGAGGGCAGAGAGGTTGGAGTGGGTTGGTGGGTGACAG  250

seq1  AACACCCTCATAGAAGCAGGGGGAGAGGGGAGGAATAGGTGAATCTGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCCTCATAGAAGCAGGGGGAGAGGGGAGGAATAGGTGAATCTGTGA  300

seq1  TTTTAGTGATGATCA-TTTTTTTGTTAGATAACAAACTGCAATGCTCTTT  349
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGTGATGATCATTTTTTTTGTTAGATAACAAACTGCAATGCTCTTT  350

seq1  CTTTTAGAAGTTTGTCTTATGATCACATATCTCTTTAGGTGTCTGAAATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAGAAGTTTGTCTTATGATCACATATCTCTTTAGGTGTCTGAAATA  400

seq1  CTATACTGATTTTGAGGTCCTGGGCTATTCAAATACTCATTAATATATGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACTGATTTTGAGGTCCTGGGCTATTCAAATACTCATTAATATATGG  450

seq1  ATTG  453
      ||||
seq2  ATTG  454