BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-225A08
Chromosome7 (Build37)
Map Location 136,662,325 - 136,802,786
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBrwd2
Upstream geneBag3, EG639030, Inpp5f, LOC100043651, 1110007A13Rik, Sec23ip, LOC210714, LOC100043144, Ppapdc1a
Downstream geneLOC100043150, Fgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a, Tacc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-225A08.bB6Ng01-225A08.g
ACCGA039321GA039322
length9601,124
definitionB6Ng01-225A08.b B6Ng01-225A08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,662,325 - 136,663,277)(136,801,651 - 136,802,786)
sequence
gaattcctgaaatttctgagtactcatcagaatggcccattacaacccac
ttccagtatcctggagttgttctagcctgaaatcccaaacttttccaaat
tactccccacaaaccacttctagaaacttctaaaaacaattgtcaggtgc
tcacagcaactaatccacctgagtaccaaggttctagttattttgaattt
taattattcaatttgattgatttaattgctatggaagatacctaagaaaa
acagtttacaggagggtggattcatttggctcaccctcacagtcatggtg
ggggtgtgaagcagaacacctcacatcactgtagccaagaataagacagg
ggagaagaagggggggtgcaacttacattagtacgacttatatcacaaac
catatgctgaatgtctcccatttcacctggacacccagcccatgggaagg
tgccactaatatccagagcatagttaatcatctgtggaaaccatacagac
acagatacaagcacacatacagagagaggtggggagagagagagagagag
aaagagagagagagactcacactcatatacgcttacatgcacacacacac
acaaacacatgtaaacataaactctttattaattatgaagatgcttccca
atcttgtccagttgacaatcaagaggactgtcatattgtcttagttaggg
ttttactgccatgaacagataccatgaccaagacaagtcttttaaaggac
agcattttaattggggctggcttacaggtttagaggttcagtctagtatt
atcaaggcgggagcatggcagcatgcaggcaggcatggcacaggaggagc
tgagagttctacatcttcatctacaggctgctagcagaattactgacttt
acagtctgtagtccagcccccccagtgatcagctgtgaattggaaaagtc
cgaaagatct
gaattcatctcaggatcagcgacaagtgtggccttagctcattccacgct
cactccacacatattcgtgatcctgaagtcaccagtagaccccacaacaa
acagtgattacagatatcaagtacctagtgtgtccacaggaaacatcatt
tgctggccatcgatggtctgttttctctaatgcagaaacaccttccccag
tgaggcagcgtctcacggctgggccacacaaaggatgtcctgcaaagatg
gaacacccagcctgcccccctgtgaaagcactgtcagctccagcccatgg
ctgatgcagaaatcctcaaccatgaggccaggctgggtgagttgcagtaa
ctaatagaccctgaagccttagggcctaagcataacaaaggcttattcta
tgcccattgtgagttggtaggggctgcaggatagcatggggcttatgccc
taatccacacagtcacttgctgatggatggaggctagtggcccattctgc
atcttagaactgaattctctgaaatgtatggcttccacaattaccatgaa
agggaaagagatatcccactcacccccaacctggggctatgcttcaacct
ggaagttaactacaccacttcctcttacagcttgtagtcagacacagtca
aaatggccccacccatcctccaagaggccagaaaagatggggatatcaaa
tatgacattggtaaacaagagccatcacttcaacatcagtgtgtctacag
aggtgggtcccactgaagaacactctcgctcttaggagaggagaactgaa
ttttgataatcgtgttagtaagaaagcacagacgcatacagacagacttc
tgtgtgcatctctgtcctggtacaaaataggctaggatcttcatcaatag
ttgatgggatccagacaatcagccaaggacacacgagtatttagaggatg
accaatggtccaactgaaatgagccgtttgcccactatactttaaaggcc
atagagatcaggagctgttcccatggagctgttccccatgtccctcttac
ccgagcttcatgatttcaccggacagacatgagaagcaggtgcccaggct
aagaagttgccagatcagcacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_136662325_136663277
seq2: B6Ng01-225A08.b_47_1006

seq1  GAATTCCTGAAATTTCTGAGTACTCATCAGAATGGCCCATTACAACCCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAAATTTCTGAGTACTCATCAGAATGGCCCATTACAACCCAC  50

seq1  TTCCAGTATCCTGGAGTTGTTCTAGCCTGAAATCCCAAACTTTTCCAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTATCCTGGAGTTGTTCTAGCCTGAAATCCCAAACTTTTCCAAAT  100

seq1  TACTCCCCACAAACCACTTCTAGAAACTTCTAAAAACAATTGTCAGGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCCCACAAACCACTTCTAGAAACTTCTAAAAACAATTGTCAGGTGC  150

seq1  TCACAGCAACTAATCCACCTGAGTACCAAGGTTCTAGTTATTTTGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGCAACTAATCCACCTGAGTACCAAGGTTCTAGTTATTTTGAATTT  200

seq1  TAATTATTCAATTTGATTGATTTAATTGCTATGGAAGATACCTAAGAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATTCAATTTGATTGATTTAATTGCTATGGAAGATACCTAAGAAAA  250

seq1  ACAGTTTACAGGAGGGTGGATTCATTTGGCTCACCCTCACAGTCATGGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTTACAGGAGGGTGGATTCATTTGGCTCACCCTCACAGTCATGGTG  300

seq1  GGGGTGTGAAGCAGAACACCTCACATCACTGTAGCCAAGAATAAGACAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGTGAAGCAGAACACCTCACATCACTGTAGCCAAGAATAAGACAGG  350

seq1  GGAGAAGAAGGGGGGGTGCAACTTACATTAGTACGACTTATATCACAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGAAGGGGGGGTGCAACTTACATTAGTACGACTTATATCACAAAC  400

seq1  CATATGCTGAATGTCTCCCATTTCACCTGGACACCCAGCCCATGGGAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCTGAATGTCTCCCATTTCACCTGGACACCCAGCCCATGGGAAGG  450

seq1  TGCCACTAATATCCAGAGCATAGTTAATCATCTGTGGAAACCATACAGAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACTAATATCCAGAGCATAGTTAATCATCTGTGGAAACCATACAGAC  500

seq1  ACAGATACAAGCACACATACAGAGAGAGGTGGGGAGAGAGAGAGAGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATACAAGCACACATACAGAGAGAGGTGGGGAGAGAGAGAGAGAGAG  550

seq1  AAAGAGAGAGAGAGACTCACACTCATATACGCTTACATGCACACACACAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAGAGAGAGACTCACACTCATATACGCTTACATGCACACACACAC  600

seq1  ACAAACACATGTAAACATAAACTCTTTATTAATTATGAAGATGCTTCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACATGTAAACATAAACTCTTTATTAATTATGAAGATGCTTCCCA  650

seq1  ATCTTGTCCAGTTGACAATCAAGAGGACTGTCATATTGTCTTAGTTAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTGTCCAGTTGACAATCAAGAGGACTGTCATATTGTCTTAGTTAGGG  700

seq1  TTTTACTGCCATGAACAGATACCATGACCAAGACAAGTCTTTTAAAGGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACTGCCATGAACAGATACCATGACCAAGACAAGTCTTTTAAAGGAC  750

seq1  AGCA-TTTAATTGGGGCTGGCTTACAGGTTTAGAGGTTCAGTCTAGTATT  799
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTTAATTGGGGCTGGCTTACAGGTTTAGAGGTTCAGTCTAGTATT  800

seq1  ATCAAGGCGGGAGCATGGCAGCATGCAGGCAGGCATGGCACAGGAGGAGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGCGGGAGCATGGCAGCATGCAGGCAGGCATGGCACAGGAGGAGC  850

seq1  TGAGAGTTCTACATCTTCATCTACAGGCTGCTAGCAGAA-TACTGAC-TT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
seq2  TGAGAGTTCTACATCTTCATCTACAGGCTGCTAGCAGAATTACTGACTTT  900

seq1  ACAGTCTGTAGTCCAG-CCCCCCAGTGATCAGCTGTGAAT--GGAAAGTC  944
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||
seq2  ACAGTCTGTAGTCCAGCCCCCCCAGTGATCAGCTGTGAATTGGAAAAGTC  950

seq1  CG-AAGATCT  953
      || |||||||
seq2  CGAAAGATCT  960

seq1: chr7_136801651_136802786
seq2: B6Ng01-225A08.g_65_1188 (reverse)

seq1  TTTGTGCTGATCTTGTGCAAACTTCTTAAGCCTGCGCACCTGCTTTCTCA  50
      ||||||||||||   ||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||
seq2  TTTGTGCTGATC---TGGCAACTTCTT-AGCCTGGGCACCTGC-TTCTCA  45

seq1  TGTCCTGTCGGTGGAAATCATGGAGCCTCGGGGTAAGAGGGACATGGGG-  99
      ||| ||||| |  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TGT-CTGTCCGGTGAAATCATGAAG-CTC-GGGTAAGAGGGACATGGGGA  92

seq1  ACAGCTCCATGGGGACAGCTCCCTGGATCTCTATGGCCTTTAAAGTATAG  149
      ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| 
seq2  ACAGCTCCATGGGAACAGCTCC--TGATCTCTATGGCCTTTAAAGTATA-  139

seq1  GTGGGCCAACCGGCTCATTTCAGTTGGACCATTGGTCATCCTCTTAATTC  199
      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
seq2  GTGGG-CAAACGGCTCATTTCAGTTGGACCATTGGTCATCCTCTAAATAC  188

seq1  TCGTGTGTCCCTTGGCTGATTGTCTGGAT-CCATCAACTATTGATGAAGA  248
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGTGT-CCTTGGCTGATTGTCTGGATCCCATCAACTATTGATGAAGA  237

seq1  TCCTAGCCTATTTTGTTACCAGGACAGAGATGCACACAGAAGTCTGTCTG  298
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGCCTATTTTG-TACCAGGACAGAGATGCACACAGAAGTCTGTCTG  286

seq1  TATGCGTCTGTGCTTTCTTACTAACACGATTATCAAAATTCAGTTCTCCT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCGTCTGTGCTTTCTTACTAACACGATTATCAAAATTCAGTTCTCCT  336

seq1  CTCCTAAGAGCGAGAGTGTTCTTCAGTGGGACCCACCTCTGTAGACACAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTAAGAGCGAGAGTGTTCTTCAGTGGGACCCACCTCTGTAGACACAC  386

seq1  TGATGTTGAAGTGATGGCTCTTGTTTACCAATGTCATATTTGATATCCCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTTGAAGTGATGGCTCTTGTTTACCAATGTCATATTTGATATCCCC  436

seq1  ATCTTTTCTGGCCTCTTGGAGGATGGGTGGGGCCATTTTGACTGTGTCTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTTCTGGCCTCTTGGAGGATGGGTGGGGCCATTTTGACTGTGTCTG  486

seq1  ACTACAAGCTGTAAGAGGAAGTGGTGTAGTTAACTTCCAGGTTGAAGCAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACAAGCTGTAAGAGGAAGTGGTGTAGTTAACTTCCAGGTTGAAGCAT  536

seq1  AGCCCCAGGTTGGGGGTGAGTGGGATATCTCTTTCCCTTTCATGGTAATT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCCAGGTTGGGGGTGAGTGGGATATCTCTTTCCCTTTCATGGTAATT  586

seq1  GTGGAAGCCATACATTTCAGAGAATTCAGTTCTAAGATGCAGAATGGGCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGCCATACATTTCAGAGAATTCAGTTCTAAGATGCAGAATGGGCC  636

seq1  ACTAGCCTCCATCCATCAGCAAGTGACTGTGTGGATTAGGGCATAAGCCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAGCCTCCATCCATCAGCAAGTGACTGTGTGGATTAGGGCATAAGCCC  686

seq1  CATGCTATCCTGCAGCCCCTACCAACTCACAATGGGCATAGAATAAGCCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTATCCTGCAGCCCCTACCAACTCACAATGGGCATAGAATAAGCCT  736

seq1  TTGTTATGCTTAGGCCCTAAGGCTTCAGGGTCTATTAGTTACTGCAACTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTATGCTTAGGCCCTAAGGCTTCAGGGTCTATTAGTTACTGCAACTC  786

seq1  ACCCAGCCTGGCCTCATGGTTGAGGATTTCTGCATCAGCCATGGGCTGGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGCCTGGCCTCATGGTTGAGGATTTCTGCATCAGCCATGGGCTGGA  836

seq1  GCTGACAGTGCTTTCACAGGGGGGCAGGCTGGGTGTTCCATCTTTGCAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACAGTGCTTTCACAGGGGGGCAGGCTGGGTGTTCCATCTTTGCAGG  886

seq1  ACATCCTTTGTGTGGCCCAGCCGTGAGACGCTGCCTCACTGGGGAAGGTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCTTTGTGTGGCCCAGCCGTGAGACGCTGCCTCACTGGGGAAGGTG  936

seq1  TTTCTGCATTAGAGAAAACAGACCATCGATGGCCAGCAAATGATGTTTCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGCATTAGAGAAAACAGACCATCGATGGCCAGCAAATGATGTTTCC  986

seq1  TGTGGACACACTAGGTACTTGATATCTGTAATCACTGTTTGTTGTGGGGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGACACACTAGGTACTTGATATCTGTAATCACTGTTTGTTGTGGGGT  1036

seq1  CTACTGGTGACTTCAGGATCACGAATATGTGTGGAGTGAGCGTGGAATGA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGGTGACTTCAGGATCACGAATATGTGTGGAGTGAGCGTGGAATGA  1086

seq1  GCTAAGGCCACACTTGTCGCTGATCCTGAGATGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGGCCACACTTGTCGCTGATCCTGAGATGAATTC  1124