BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-234K16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 89,144,276 - 89,267,718
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfp592, Alpk3, Slc28a1, EG623286, LOC100043130, Pde8a, EG636544, Rps17, Cpeb1, LOC623355, Ap3b2, BC048679, Fsd2, Whdc1, Homer2, 2610204K14Rik, 3110040N11Rik, Btbd1, Tm6sf1, LOC100043161, Hdgfrp3, Bnc1
Downstream geneSh3gl3, Adamtsl3, 1700129I04Rik, Eftud1, LOC100038986, LOC619808, Rkhd3, LOC619909
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-234K16.bB6Ng01-234K16.g
ACCGA046367GA046368
length1,0811,140
definitionB6Ng01-234K16.b B6Ng01-234K16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(89,144,276 - 89,145,360)(89,266,579 - 89,267,718)
sequence
gaattcatttaaggaacaccccacttctctgtgatgcttcattcggggtc
agtcagtggaagctcaaaattggccataaatcctgggtatgaacaaagcc
aaactgcaggaatcacacgtgtcggactcatttcacagctgcagctattt
tgcaacagcctttgctgcaaaataccttccataaaagttagtggtttcct
tgggagttcgaaacagggcacataatagccagtgagtaacctacaagtaa
tgcctgtggtgacaattttgctttgttcccttggagtgtaagaagccgag
tcaagacacgattgctccccgtgagtgttgagaaaggagaggacacacac
tccaagcaagttgttctctttatctgagggagcctccaagccttaaatac
gaagggtatacacgtagatggacttacataaagaggagacacagatgttt
tgatgataacttggtagaagccaggaaaagaagaggaactgggtgatctg
acaaagatgtaagcttagccctgcagaggtcccttcttcagagctttgtt
gtccttgaagccaggcagaaagcctggacacaccaggctggcttttctcc
agagcagactctctgcctgaacctctcctctcactttctctcatcaggac
atcactaatggattgcagatgtcccgcttggttagaagcacgtctcagat
acatctgccctccttgcttttatggaaaaaacacctgcaaatctttatct
ttggttagatttaccacacatttgaagctttgaaatttgggtccagtggg
aaagaggaacatgtcaccaccctccttcttaagctgaattccgtagctga
caatagctttcggggaagatgttttcatttttttctttaaggatattagt
cagtaagactttaacagcctcaaacctatgcagtggaaagttaatttatt
aatttctttaatcctagagctcatgaaaaaagtccatagtgactatggca
gacagggttgtggtctctctctctccacccaccctctctctctctctgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtgtgtg
gaattccaggatacagagtcctgtatcttccatttgccttgagcaaaact
ccaaatcattaaaaagctggtcagcctctggcctgatacaagttctggat
ttctgctcttgaccacagtggaaagttgagttccagtattgatgtcttaa
attgaccctgcagtgttaactatgacctctcaatccctagctttgtctct
ttttctcaggagacaccccaggactttgatccaccacaggtcagctgttt
agctaaggcagacctagaagtttctcctcttggaaccaatgtcttcacat
agcttcacataacttcaagctcgctctgagaatatggcgcctttgtgttc
cttgaaccttcatacaccacccgccccctttttacacatctggggaagat
gagtgtccctcagtgaggtaacaggacatgatgaatcccagatgtcagac
atgctaacttgccttgaacttgcaagatcacaactaggaacaaatgcata
gattttcttcacttattgatttatgtgaagctgagagggaaaccagtggt
cagtcagtgaaaagctagaaagagttttcattttaaagggtggagaaaca
cctgaaaagttttagttcacctcagcagttaaggcaaactcactgaccag
tgagtgtagccatttataacacaggatgttgtcccctgaactctataagt
attcagttccaagtctgagtcctatgtagttataattgccctctgtccat
tacagctgctatctctcttttccatattcccccaagcatggtttattttt
catttctaacaaatagatgcctacagtttgtgatggggagtctgtccctg
ctgatggtgcataagatggtgctgccatctggtggtagtcctgggaagtg
acaaaggcaagcaggaaccccaagcatttaagtcgttcatagttcaaagg
tattttggaggtgcattgttgtttgagaagggcctccatgggagccttca
catgctatgtggcagagatgaccttggaactctgatctcagtatgggttg
caagcctgggggtagcttgtgtattagtctttagaacatgccaggcccct
agcttgaaccagctagcctcacttgattggagttgatgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_89144276_89145360
seq2: B6Ng01-234K16.b_48_1128

seq1  GAATTCATTTAAGGAACACCCCACTTCTCTGTGATGCTTCATTCGGGGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTAAGGAACACCCCACTTCTCTGTGATGCTTCATTCGGGGTC  50

seq1  AGTCAGTGGAAGCTCAAAATTGGCCATAAATCCTGGGTATGAACAAAGCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTGGAAGCTCAAAATTGGCCATAAATCCTGGGTATGAACAAAGCC  100

seq1  AAACTGCAGGAATCACACGTGTCGGACTCATTTCACAGCTGCAGCTATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCAGGAATCACACGTGTCGGACTCATTTCACAGCTGCAGCTATTT  150

seq1  TGCAACAGCCTTTGCTGCAAAATACCTTCCATAAAAGTTAGTGGTTTCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACAGCCTTTGCTGCAAAATACCTTCCATAAAAGTTAGTGGTTTCCT  200

seq1  TGGGAGTTCGAAACAGGGCACATAATAGCCAGTGAGTAACCTACAAGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAGTTCGAAACAGGGCACATAATAGCCAGTGAGTAACCTACAAGTAA  250

seq1  TGCCTGTGGTGACAATTTTGCTTTGTTCCCTTGGAGTGTAAGAAGCCGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTGGTGACAATTTTGCTTTGTTCCCTTGGAGTGTAAGAAGCCGAG  300

seq1  TCAAGACACGATTGCTCCCCGTGAGTGTTGAGAAAGGAGAGGACACACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGACACGATTGCTCCCCGTGAGTGTTGAGAAAGGAGAGGACACACAC  350

seq1  TCCAAGCAAGTTGTTCTCTTTATCTGAGGGAGCCTCCAAGCCTTAAATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGCAAGTTGTTCTCTTTATCTGAGGGAGCCTCCAAGCCTTAAATAC  400

seq1  GAAGGGTATACACGTAGATGGACTTACATAAAGAGGAGACACAGATGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGGTATACACGTAGATGGACTTACATAAAGAGGAGACACAGATGTTT  450

seq1  TGATGATAACTTGGTAGAAGCCAGGAAAAGAAGAGGAACTGGGTGATCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATAACTTGGTAGAAGCCAGGAAAAGAAGAGGAACTGGGTGATCTG  500

seq1  ACAAAGATGTAAGCTTAGCCCTGCAGAGGTCCCTTCTTCAGAGCTTTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGATGTAAGCTTAGCCCTGCAGAGGTCCCTTCTTCAGAGCTTTGTT  550

seq1  GTCCTTGAAGCCAGGCAGAAAGCCTGGACACACCAGGCTGGCTTTTCTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTGAAGCCAGGCAGAAAGCCTGGACACACCAGGCTGGCTTTTCTCC  600

seq1  AGAGCAGACTCTCTGCCTGAACCTCTCCTCTCACTTTCTCTCATCAGGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAGACTCTCTGCCTGAACCTCTCCTCTCACTTTCTCTCATCAGGAC  650

seq1  ATCACTAATGGATTGCAGATGTCCCGCTTGGTTAGAAGCACGTCTCAGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTAATGGATTGCAGATGTCCCGCTTGGTTAGAAGCACGTCTCAGAT  700

seq1  ACATCTGCCCTCCTTGCTTTTATGGAAAAAACACCTGCAAATCTTTATCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGCCCTCCTTGCTTTTATGGAAAAAACACCTGCAAATCTTTATCT  750

seq1  TTGGTTAGATTTACCACACATTTGAAGCTTTGAAATTTGGGTCCAGTGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTAGATTTACCACACATTTGAAGCTTTGAAATTTGGGTCCAGTGGG  800

seq1  AAAGAGGAACATGTCACCACCCTCCTTCTTAAGCTGAATTCCGTAGCTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGGAACATGTCACCACCCTCCTTCTTAAGCTGAATTCCGTAGCTGA  850

seq1  CAATAGCTTTCGGGGAAGATGTTTTCATTTTTTTCTTTAAGGATATTAGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCTTTCGGGGAAGATGTTTTCATTTTTTTCTTTAAGGATATTAGT  900

seq1  CAGTAAGACTTTAACAGCCTCAAACCTATGCAGTGGAAAGTTAATTTATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGACTTTAACAGCCTCAAACCTATGCAGTGGAAAGTTAATTTATT  950

seq1  AATTTCTTTAATCCTAGAGCTCATGAAAAAAGTCCATAGTGACTATGGGC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AATTTCTTTAATCCTAGAGCTCATGAAAAAAGTCCATAGTGACTAT-GGC  999

seq1  AGACAGGGTTGTTGTTCTCTTCTCTCTCCCACCCCCCCCTCTCTCTCTCT  1050
      ||||||||||| || |||| |||||||||   ||| ||||||||||||||
seq2  AGACAGGGTTG-TGGTCTC-TCTCTCTCC--ACCCACCCTCTCTCTCTCT  1045

seq1  CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT-GTGTGTG  1085
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTGTG  1081

seq1: chr7_89266579_89267718
seq2: B6Ng01-234K16.g_65_1204 (reverse)

seq1  GACATCAACTCCATTCAAGTGA-GCTA-CTGGGTCAAACTAAGGGGCTTG  48
      ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||| ||| || |
seq2  GACATCAACTCCAATCAAGTGAGGCTAGCTGGTTCAAGCTAGGGGCCTGG  50

seq1  CATGTTCTTAAAGACTTAATTACCACAGCTACCCCCAGCCTTGCA--CCA  96
      ||||||| ||||||||  | |||   |||||||||||| ||||||  |||
seq2  CATGTTC-TAAAGACT--AATACACAAGCTACCCCCAGGCTTGCAACCCA  97

seq1  TACTTGAGATCAGGAGTT-CAAGGTCATCCTCTGCCACATAGCATGTTGA  145
      ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||
seq2  TAC-TGAGATCA-GAGTTCCAAGGTCAT-CTCTGCCACATAGCATG-TGA  143

seq1  AGGCT-CCAT-GAGGCCCTTTCTCAAACAAC-ATGCACCTCC-AAATACC  191
      ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  AGGCTCCCATGGAGGCCC-TTCTCAAACAACAATGCACCTCCAAAATACC  192

seq1  TTTGAACTATGAACGACTTTAAATGCTTGGGGTTCCTGCTTGCCTTTGTC  241
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAACTATGAACGAC-TTAAATGCTTGGGGTTCCTGCTTGCCTTTGTC  241

seq1  ACTTCCCAGGACTACCACCAGATGGCAGCACCATCTTATGCACCATCAGC  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCCAGGACTACCACCAGATGGCAGCACCATCTTATGCACCATCAGC  291

seq1  AGGGACAGACTCCCCATCACAAACTGTAGGCATCTATTTGTTAGAAATGA  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACAGACTCCCCATCACAAACTGTAGGCATCTATTTGTTAGAAATGA  341

seq1  AAAATAAACCATGCTTGGGGGAATATGGAAAAGAGAGATAGCAGCTGTAA  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAACCATGCTTGGGGGAATATGGAAAAGAGAGATAGCAGCTGTAA  391

seq1  TGGACAGAGGGCAATTATAACTACATAGGACTCAGACTTGGAACTGAATA  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACAGAGGGCAATTATAACTACATAGGACTCAGACTTGGAACTGAATA  441

seq1  CTTATAGAGTTCAGGGGACAACATCCTGTGTTATAAATGGCTACACTCAC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAGAGTTCAGGGGACAACATCCTGTGTTATAAATGGCTACACTCAC  491

seq1  TGGTCAGTGAGTTTGCCTTAACTGCTGAGGTGAACTAAAACTTTTCAGGT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAGTGAGTTTGCCTTAACTGCTGAGGTGAACTAAAACTTTTCAGGT  541

seq1  GTTTCTCCACCCTTTAAAATGAAAACTCTTTCTAGCTTTTCACTGACTGA  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTCCACCCTTTAAAATGAAAACTCTTTCTAGCTTTTCACTGACTGA  591

seq1  CCACTGGTTTCCCTCTCAGCTTCACATAAATCAATAAGTGAAGAAAATCT  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGGTTTCCCTCTCAGCTTCACATAAATCAATAAGTGAAGAAAATCT  641

seq1  ATGCATTTGTTCCTAGTTGTGATCTTGCAAGTTCAAGGCAAGTTAGCATG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATTTGTTCCTAGTTGTGATCTTGCAAGTTCAAGGCAAGTTAGCATG  691

seq1  TCTGACATCTGGGATTCATCATGTCCTGTTACCTCACTGAGGGACACTCA  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACATCTGGGATTCATCATGTCCTGTTACCTCACTGAGGGACACTCA  741

seq1  TCTTCCCCAGATGTGTAAAAAGGGGGCGGGTGGTGTATGAAGGTTCAAGG  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCCCAGATGTGTAAAAAGGGGGCGGGTGGTGTATGAAGGTTCAAGG  791

seq1  AACACAAAGGCGCCATATTCTCAGAGCGAGCTTGAAGTTATGTGAAGCTA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAAAGGCGCCATATTCTCAGAGCGAGCTTGAAGTTATGTGAAGCTA  841

seq1  TGTGAAGACATTGGTTCCAAGAGGAGAAACTTCTAGGTCTGCCTTAGCTA  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGACATTGGTTCCAAGAGGAGAAACTTCTAGGTCTGCCTTAGCTA  891

seq1  AACAGCTGACCTGTGGTGGATCAAAGTCCTGGGGTGTCTCCTGAGAAAAA  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCTGACCTGTGGTGGATCAAAGTCCTGGGGTGTCTCCTGAGAAAAA  941

seq1  GAGACAAAGCTAGGGATTGAGAGGTCATAGTTAACACTGCAGGGTCAATT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAAAGCTAGGGATTGAGAGGTCATAGTTAACACTGCAGGGTCAATT  991

seq1  TAAGACATCAATACTGGAACTCAACTTTCCACTGTGGTCAAGAGCAGAAA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACATCAATACTGGAACTCAACTTTCCACTGTGGTCAAGAGCAGAAA  1041

seq1  TCCAGAACTTGTATCAGGCCAGAGGCTGACCAGCTTTTTAATGATTTGGA  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGAACTTGTATCAGGCCAGAGGCTGACCAGCTTTTTAATGATTTGGA  1091

seq1  GTTTTGCTCAAGGCAAATGGAAGATACAGGACTCTGTATCCTGGAATTC  1140
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCTCAAGGCAAATGGAAGATACAGGACTCTGTATCCTGGAATTC  1140