BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244H01
Chromosome7 (Build37)
Map Location 33,992,599 - 34,156,688
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG545947, EG434676, EG668431, Abpd
Upstream geneLOC100043842, LOC634929, EG668379, EG668381, LOC668386, LOC626373, EG384589, EG668393, EG330689, LOC100043362, LOC100043365, EG384591, LOC668398, EG384596, LOC100043370, LOC434161, EG270499, LOC100043845, LOC100043373, LOC668410, EG624439, LOC100043376, LOC100043379, LOC100043383, EG668411, LOC100043850, LOC100043386, LOC668416, EG668526, LOC100043388, LOC270234, EG668419, EG668422, EG546954, LOC100043856, LOC100043857
Downstream geneEG545948, LOC435963, LOC435962, EG626970, LOC100043859, LOC627004, LOC100043398, LOC100043401, Scgb2b1, LOC668440, Abpz, LOC100043860, LOC627079, LOC635803, Abpg, LOC100043864, LOC100043865, Abpb, Abpa, LOC100043866, LOC100043867, LOC100043868, Wtip, Sae2, LOC100043410, Pdcd2l, Gpi1, 4931406P16Rik, EG619734, Lsm14a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244H01.bB6Ng01-244H01.g
ACCGA053575GA053576
length773997
definitionB6Ng01-244H01.b B6Ng01-244H01.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,992,599 - 33,993,371)(34,155,711 - 34,156,688)
sequence
gaattcagtccccttcatctccctgggaatttctctggctcctcactgat
aagtggatattagccctgcttctaaaaatctaaaccagagacatacatta
aaatctatgtatgtcatccatgatgggtaagaaggagcaataaacacaga
ttgaagggaggcatgatctcttaaccactctattccctattcaggattat
ggaagaaaagtaaatcttgtgccatgtccagctagtgataactgctcatc
tttaatgaacaaaaaagtgggaattatgctcttcccccatcttgagtagg
ctaaacaacttagctgaattcatctggccttgccacctttgtaatttcct
acaggagctttgaggagttgactgtctactgagcttcctttgcaaatcaa
tccagctgaaacaaaggatggggtctgtaggctttctttatatacacaga
gttgaaaattaagctttccttggtctgaaattttgtcttgactgcatctt
tctctcacaccagttctttttcatttatagcccccctttaaggtaaccca
gctaatctgtggatgcttgacagctacagagaaggaggagctagccctaa
tgccaggaaaagtgtagctaccatagctgagacataaaggacagagagtc
agccaacattaaagagctggggaagagcagccctaggaggctaaccaact
gggtctacagaaacagaactggaataaagattttaatagtaagtttataa
tataggaggagtgtgttagccat
gaattccagatgacccttcaacccactatacctgggccacaggggagcat
ctcccactgcacagggacataaggggactgttgggaagggtgctaagagg
caaggttttggtaggggccctgccccacccaccttggaagcagactgctt
aagcccattcactcagataggggatacactggccaccctggcattgccat
tttaggcttcatgaaagggtacttttgaccgctcatttgtccttctttag
gaagtgtgggctgaacaaacaccaatggaggacgctgaagacagcagagc
aaagcctgaggcatacatataaaggctgaagggtcagcaggatgagctgt
gaaataggccaagagtcttactgctctatggtagctgaagcatttgatgg
gggaaatgcaggagagagtagatagggtcatggaatgaagagagggcaga
ggcaaactctgaggaagaacacaagggattcagaagtcaggataattaga
ccccaaatgctaggaagggtctaggaagctgtacaatctttggagagtgc
attagggcctggagactcatcttggcagagtgccagaaaggctcagcttc
ctatccatgctgtgaaggatctgcagcacaggtaggcctcagggtcccat
gctactaagaggactgctcaggagagtataccagtgctgcctctaccacc
tgctacctgttggagttagtcccttgctgatgtgtattcaaatgctaagt
actggaccccacggaatggaaatctcccaaacttccaactacttgccaat
ctctttaacaaattctcacataccaccagatgttgcttagtaaattagtt
tcacctaaactccttgactatccttaagaaaatgtgattgccagggcaaa
tgatggagagaagaagagaatatttctaggcttttttttttcttggtctg
ggttgtcacaaggtaagggatcagaatgcaagagaataggagagatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_33992599_33993371
seq2: B6Ng01-244H01.b_42_814

seq1  GAATTCAGTCCCCTTCATCTCCCTGGGAATTTCTCTGGCTCCTCACTGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTCCCCTTCATCTCCCTGGGAATTTCTCTGGCTCCTCACTGAT  50

seq1  AAGTGGATATTAGCCCTGCTTCTAAAAATCTAAACCAGAGACATACATTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGATATTAGCCCTGCTTCTAAAAATCTAAACCAGAGACATACATTA  100

seq1  AAATCTATGTATGTCATCCATGATGGGTAAGAAGGAGCAATAAACACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTATGTATGTCATCCATGATGGGTAAGAAGGAGCAATAAACACAGA  150

seq1  TTGAAGGGAGGCATGATCTCTTAACCACTCTATTCCCTATTCAGGATTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGGAGGCATGATCTCTTAACCACTCTATTCCCTATTCAGGATTAT  200

seq1  GGAAGAAAAGTAAATCTTGTGCCATGTCCAGCTAGTGATAACTGCTCATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAAAAGTAAATCTTGTGCCATGTCCAGCTAGTGATAACTGCTCATC  250

seq1  TTTAATGAACAAAAAAGTGGGAATTATGCTCTTCCCCCATCTTGAGTAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATGAACAAAAAAGTGGGAATTATGCTCTTCCCCCATCTTGAGTAGG  300

seq1  CTAAACAACTTAGCTGAATTCATCTGGCCTTGCCACCTTTGTAATTTCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAACTTAGCTGAATTCATCTGGCCTTGCCACCTTTGTAATTTCCT  350

seq1  ACAGGAGCTTTGAGGAGTTGACTGTCTACTGAGCTTCCTTTGCAAATCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAGCTTTGAGGAGTTGACTGTCTACTGAGCTTCCTTTGCAAATCAA  400

seq1  TCCAGCTGAAACAAAGGATGGGGTCTGTAGGCTTTCTTTATATACACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTGAAACAAAGGATGGGGTCTGTAGGCTTTCTTTATATACACAGA  450

seq1  GTTGAAAATTAAGCTTTCCTTGGTCTGAAATTTTGTCTTGACTGCATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAAATTAAGCTTTCCTTGGTCTGAAATTTTGTCTTGACTGCATCTT  500

seq1  TCTCTCACACCAGTTCTTTTTCATTTATAGCCCCCCTTTAAGGTAACCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCACACCAGTTCTTTTTCATTTATAGCCCCCCTTTAAGGTAACCCA  550

seq1  GCTAATCTGTGGATGCTTGACAGCTACAGAGAAGGAGGAGCTAGCCCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATCTGTGGATGCTTGACAGCTACAGAGAAGGAGGAGCTAGCCCTAA  600

seq1  TGCCAGGAAAAGTGTAGCTACCATAGCTGAGACATAAAGGACAGAGAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGGAAAAGTGTAGCTACCATAGCTGAGACATAAAGGACAGAGAGTC  650

seq1  AGCCAACATTAAAGAGCTGGGGAAGAGCAGCCCTAGGAGGCTAACCAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAACATTAAAGAGCTGGGGAAGAGCAGCCCTAGGAGGCTAACCAACT  700

seq1  GGGTCTACAGAAACAGAACTGGAATAAAGATTTTAATAGTAAGTTTATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTACAGAAACAGAACTGGAATAAAGATTTTAATAGTAAGTTTATAA  750

seq1  TATAGGAGGAGTGTGTTAGCCAT  773
      |||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGAGGAGTGTGTTAGCCAT  773

seq1: chr7_34155711_34156688
seq2: B6Ng01-244H01.g_67_1061 (reverse)

seq1  TCTCTCCTCTTCTCTTGCCTTCTGATCCC-TACC-TGTGAC-ACCCAGCC  47
      |||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |
seq2  TCTCTCCTATTCTCTTGCATTCTGATCCCTTACCTTGTGACAACCCAGAC  50

seq1  CA--GAAAAAAAAAGCCTAG-AATA-TCTC-TCTTCTCTCCATCATT--G  90
      ||   ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||   
seq2  CAAGAAAAAAAAAAGCCTAGAAATATTCTCTTCTTCTCTCCATCATTTGC  100

seq1  CCTGGCATTCACATTTTCTTA--GATAGTCA--GAGTTTAGGTG-AACTA  135
      ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||
seq2  CCTGGCAATCACATTTTCTTAAGGATAGTCAAGGAGTTTAGGTGAAACTA  150

seq1  ATTTACTAAGCAACATCTGGT-GTATGTGAGAATTTGTTAAAGAGATTGG  184
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACTAAGCAACATCTGGTGGTATGTGAGAATTTGTTAAAGAGATTGG  200

seq1  CAAGTAGTTGGAAGTTTGGGAGA-TTCCATTCCGTGGGGTCCAGTACTTA  233
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAGTTGGAAGTTTGGGAGATTTCCATTCCGTGGGGTCCAGTACTTA  250

seq1  GCATTTGAATACACATCAGCAAGGGACTAACTCCAACAGGTAGCAGGTGG  283
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTGAATACACATCAGCAAGGGACTAACTCCAACAGGTAGCAGGTGG  300

seq1  TAGAGGCAGCACTGGTATACTCTCCTGAGCAGTCCTCTTAGTAGCATGGG  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGCAGCACTGGTATACTCTCCTGAGCAGTCCTCTTAGTAGCATGGG  350

seq1  ACCCTGAGGCCTACCTGTGCTGCAGATCCTTCACAGCATGGATAGGAAGC  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGAGGCCTACCTGTGCTGCAGATCCTTCACAGCATGGATAGGAAGC  400

seq1  TGAGCCTTTCTGGCACTCTGCCAAGATGAGTCTCCAGGCCCTAATGCACT  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCTTTCTGGCACTCTGCCAAGATGAGTCTCCAGGCCCTAATGCACT  450

seq1  CTCCAAAGATTGTACAGCTTCCTAGACCCTTCCTAGCATTTGGGGTCTAA  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAAGATTGTACAGCTTCCTAGACCCTTCCTAGCATTTGGGGTCTAA  500

seq1  TTATCCTGACTTCTGAATCCCTTGTGTTCTTCCTCAGAGTTTGCCTCTGC  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCTGACTTCTGAATCCCTTGTGTTCTTCCTCAGAGTTTGCCTCTGC  550

seq1  CCTCTCTTCATTCCATGACCCTATCTACTCTCTCCTGCATTTCCCCCATC  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTTCATTCCATGACCCTATCTACTCTCTCCTGCATTTCCCCCATC  600

seq1  AAATGCTTCAGCTACCATAGAGCAGTAAGACTCTTGGCCTATTTCACAGC  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTTCAGCTACCATAGAGCAGTAAGACTCTTGGCCTATTTCACAGC  650

seq1  TCATCCTGCTGACCCTTCAGCCTTTATATGTATGCCTCAGGCTTTGCTCT  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTGCTGACCCTTCAGCCTTTATATGTATGCCTCAGGCTTTGCTCT  700

seq1  GCTGTCTTCAGCGTCCTCCATTGGTGTTTGTTCAGCCCACACTTCCTAAA  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTTCAGCGTCCTCCATTGGTGTTTGTTCAGCCCACACTTCCTAAA  750

seq1  GAAGGACAAATGAGCGGTCAAAAGTACCCTTTCATGAAGCCTAAAATGGC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGACAAATGAGCGGTCAAAAGTACCCTTTCATGAAGCCTAAAATGGC  800

seq1  AATGCCAGGGTGGCCAGTGTATCCCCTATCTGAGTGAATGGGCTTAAGCA  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCAGGGTGGCCAGTGTATCCCCTATCTGAGTGAATGGGCTTAAGCA  850

seq1  GTCTGCTTCCAAGGTGGGTGGGGCAGGGCCCCTACCAAAACCTTGCCTCT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTTCCAAGGTGGGTGGGGCAGGGCCCCTACCAAAACCTTGCCTCT  900

seq1  TAGCACCCTTCCCAACAGTCCCCTTATGTCCCTGTGCAGTGGGAGATGCT  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACCCTTCCCAACAGTCCCCTTATGTCCCTGTGCAGTGGGAGATGCT  950

seq1  CCCCTGTGGCCCAGGTATAGTGGGTTGAAGGGTCATCTGGAATTC  978
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGTGGCCCAGGTATAGTGGGTTGAAGGGTCATCTGGAATTC  995