BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-246B14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 103,552,723 - 103,707,133
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOdz4, LOC666858
Upstream geneLOC666823, Frda-ps, EG666836, LOC670727
Downstream geneNars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp, Kctd14, Ints4, 1810020D17Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-246B14.bB6Ng01-246B14.g
ACCGA054810GA054811
length6511,079
definitionB6Ng01-246B14.b B6Ng01-246B14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,552,723 - 103,553,370)(103,706,073 - 103,707,133)
sequence
gaattcttgggtatgtttaggtaacttgagggttttttgattaatccctt
tttggtgggggtagggggattcgcctgagtttgattgagtttgctgggta
gatggatgtataataggtattgttgacaaatagtagaggcttaaaaatat
ttgatgaatcaatcaatacattaaggatttgatggctggcttaagaggag
tcactccttttaaaaatagactaaaattgtggtagaaatttcacaggcca
gctttgggattagaagaacctatattcaaattatactttctactctaggc
ctgtgggaaagtggatccaatctctccatgccttagtttcctaatctgta
aaatggtacactcagaataggctttgtacagagtaaatactagataaacg
gcgtattttgtaataagcactcagatgacagctgtcattattgttacagc
attatgttacagttgtggtaatgaaggctctctaagtgggcaggaagtct
tcatctgttcctgttcttggtgccaccttcctaagtaatgtctcctgtcc
cagagggcttggaggacactgtgtcaggagttgggatggggaagcagagc
cttgtcatcccacaaaaaggaatggaaaacagttggtggtggggggggga
a
gaattcagggcccacggaacagggactttcccagtgatggacgagctagc
aacacctcaaaattggcatgaaatcttatgttttcaattttaattatttt
ttatcttctatgtgtatgtgcatacatatttttatgggttcacatgaatc
tgtgtgtacacacgcatgtggaagccagagggcaactgtgggtatggttc
ctgaggcgctgtctccctaattttttttttctttttgggatagggttggt
cttggatttgccaattaggctatactgggtatccagcaagacccaaggat
ccatgaccccagcactggtatcacaagcttgccactgcccctggctgttc
attttttttcaaatgttggttctaaggatggagtcaagtttttgtgctta
tgtggcaagcacttcactgactgagccatcaccccagacctcagatttta
tagttttgaactatgatgattaacattactgaatgatgagccctattata
gagcattgctcggcagtgttagtatgtttgcaatactgtaatgaccatca
tttctgtttatctccagaacctcctcattctcccaactggagctctgtag
ccagtaacaatcatcccttgttttagttagggttttactgctgtgagcag
acaccatgaccaagacaagtcatataacggataacatttaactggggctg
gctcacaggttcaaaggtacagtccattatcatcaaggtgagagcatggc
agcatctaggcagacatggtgcaggcagagctgagagttctacatcttca
tctgaaggttgctagtggaagactaactttctaggcagctaggatgaggg
tcttaagtccacacccacagtaatacactctaccccaaccaggccatacc
tttctaatagtgccattccctggggccaggcacatacaaaccatcacatg
cccttacgctcccttcacccatctctaataactattaagtgtggtggctt
tttaaagcacagggttctgtggtctctcagaaaggtgaaccaaagttggt
caaagggcttaacagcctggggaacttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_103552723_103553370
seq2: B6Ng01-246B14.b_46_696

seq1  GAATTCTTGGGTATGTTTAGGTAACTTGAGGGTTTTTTGATTAATCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGGGTATGTTTAGGTAACTTGAGGGTTTTTTGATTAATCCCTT  50

seq1  TTTGGTGGGGGTAGGGGGATTCGCCTGAGTTTGATTGAGTTTGCTGGGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTGGGGGTAGGGGGATTCGCCTGAGTTTGATTGAGTTTGCTGGGTA  100

seq1  GATGGATGTATAATAGGTATTGTTGACAAATAGTAGAGGCTTAAAAATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGTATAATAGGTATTGTTGACAAATAGTAGAGGCTTAAAAATAT  150

seq1  TTGATGAATCAATCAATACATTAAGGATTTGATGGCTGGCTTAAGAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGAATCAATCAATACATTAAGGATTTGATGGCTGGCTTAAGAGGAG  200

seq1  TCACTCCTTTTAAAAATAGACTAAAATTGTGGTAGAAATTTCACAGGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTCCTTTTAAAAATAGACTAAAATTGTGGTAGAAATTTCACAGGCCA  250

seq1  GCTTTGGGATTAGAAGAACCTATATTCAAATTATACTTTCTACTCTAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGATTAGAAGAACCTATATTCAAATTATACTTTCTACTCTAGGC  300

seq1  CTGTGGGAAAGTGGATCCAATCTCTCCATGCCTTAGTTTCCTAATCTGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGAAAGTGGATCCAATCTCTCCATGCCTTAGTTTCCTAATCTGTA  350

seq1  AAATGGTACACTCAGAATAGGCTTTGTACAGAGTAAATACTAGATAAACG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTACACTCAGAATAGGCTTTGTACAGAGTAAATACTAGATAAACG  400

seq1  GCGTATTTTGTAATAAGCACTCAGATGACAGCTGTCATTATTGTTACAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTATTTTGTAATAAGCACTCAGATGACAGCTGTCATTATTGTTACAGC  450

seq1  ATTATGTTACAGTTGTGGTAATGAAGGCTCTCTAAGTGGGCAGGAAGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTTACAGTTGTGGTAATGAAGGCTCTCTAAGTGGGCAGGAAGTCT  500

seq1  TCATCTGTTCCTGTTCTTGGTGCCACCTTCCTAAGTAATGTCTCCTGTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTGTTCCTGTTCTTGGTGCCACCTTCCTAAGTAATGTCTCCTGTCC  550

seq1  CAGAGGGCTTGGAGGACACTGTGTCAGGAG-TGGGATGGGGAAGCAGAGC  599
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGCTTGGAGGACACTGTGTCAGGAGTTGGGATGGGGAAGCAGAGC  600

seq1  CTTGTCATCCCAC-AAAAGGAATGG-AAACAGTTGGTGGTGGGGGGGGGG  647
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| 
seq2  CTTGTCATCCCACAAAAAGGAATGGAAAACAGTTGGTGGTGGGGGGGGGA  650

seq1  A  648
      |
seq2  A  651

seq1: chr7_103706073_103707133
seq2: B6Ng01-246B14.g_74_1152 (reverse)

seq1  CCAAGT--CCCA-GCTGTTAAGCC--TTGGACAAC-TTGGTTCACCTTTC  44
      ||||||  |||| |||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||
seq2  CCAAGTTCCCCAGGCTGTTAAGCCCTTTGACCAACTTTGGTTCACCTTTC  50

seq1  TGAGA---CACAGAA-CCTGTGCTTTAAAA--GCAACACAC-TAATAGTT  87
      |||||   ||||||| ||||||||||||||   || ||||| ||||||||
seq2  TGAGAGACCACAGAACCCTGTGCTTTAAAAAGCCACCACACTTAATAGTT  100

seq1  ATTAGAGATGGGTGAGGGGAGCGTAA-GGCATGTGATGGTTTGTATGTGC  136
      ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGAGATGGGTGAAGGGAGCGTAAGGGCATGTGATGGTTTGTATGTGC  150

seq1  TTGG-CCCAGGGAATGGCACTATTAG-AAGGTATGGCCTTGTTGGGGTAG  184
       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  CTGGCCCCAGGGAATGGCACTATTAGAAAGGTATGGCCTGGTTGGGGTAG  200

seq1  -GTGTATTACTGTGGGTGTGGACTTAAGACCCTCATCCTAGCTGCCTAG-  232
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGTGTATTACTGTGGGTGTGGACTTAAGACCCTCATCCTAGCTGCCTAGA  250

seq1  AAGTTAGTCTTCCACTAGCAACCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGC  282
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTAGTCTTCCACTAGCAACCTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGC  300

seq1  TCTGCCTGCACCATGTCTGCCTAGATGCTGCCATGCTCTCACCTTGATGA  332
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTGCACCATGTCTGCCTAGATGCTGCCATGCTCTCACCTTGATGA  350

seq1  TAATGGACTGTACCTTTGAACCTGTGAGCCAGCCCCAGTTAAATGTTATC  382
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGACTGTACCTTTGAACCTGTGAGCCAGCCCCAGTTAAATGTTATC  400

seq1  CGTTATATGACTTGTCTTGGTCATGGTGTCTGCTCACAGCAGTAAAACCC  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTATATGACTTGTCTTGGTCATGGTGTCTGCTCACAGCAGTAAAACCC  450

seq1  TAACTAAAACAAGGGATGATTGTTACTGGCTACAGAGCTCCAGTTGGGAG  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTAAAACAAGGGATGATTGTTACTGGCTACAGAGCTCCAGTTGGGAG  500

seq1  AATGAGGAGGTTCTGGAGATAAACAGAAATGATGGTCATTACAGTATTGC  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGGAGGTTCTGGAGATAAACAGAAATGATGGTCATTACAGTATTGC  550

seq1  AAACATACTAACACTGCCGAGCAATGCTCTATAATAGGGCTCATCATTCA  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATACTAACACTGCCGAGCAATGCTCTATAATAGGGCTCATCATTCA  600

seq1  GTAATGTTAATCATCATAGTTCAAAACTATAAAATCTGAGGTCTGGGGTG  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGTTAATCATCATAGTTCAAAACTATAAAATCTGAGGTCTGGGGTG  650

seq1  ATGGCTCAGTCAGTGAAGTGCTTGCCACATAAGCACAAAAACTTGACTCC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTCAGTCAGTGAAGTGCTTGCCACATAAGCACAAAAACTTGACTCC  700

seq1  ATCCTTAGAACCAACATTTGAAAAAAAATGAACAGCCAGGGGCAGTGGCA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTAGAACCAACATTTGAAAAAAAATGAACAGCCAGGGGCAGTGGCA  750

seq1  AGCTTGTGATACCAGTGCTGGGGTCATGGATCCTTGGGTCTTGCTGGATA  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGTGATACCAGTGCTGGGGTCATGGATCCTTGGGTCTTGCTGGATA  800

seq1  CCCAGTATAGCCTAATTGGCAAATCCAAGACCAACCCTATCCCAAAAAGA  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTATAGCCTAATTGGCAAATCCAAGACCAACCCTATCCCAAAAAGA  850

seq1  AAAAAAAAATTAGGGAGACAGCGCCTCAGGAACCATACCCACAGTTGCCC  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAATTAGGGAGACAGCGCCTCAGGAACCATACCCACAGTTGCCC  900

seq1  TCTGGCTTCCACATGCGTGTGTACACACAGATTCATGTGAACCCATAAAA  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTTCCACATGCGTGTGTACACACAGATTCATGTGAACCCATAAAA  950

seq1  ATATGTATGCACATACACATAGAAGATAAAAAATAATTAAAATTGAAAAC  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTATGCACATACACATAGAAGATAAAAAATAATTAAAATTGAAAAC  1000

seq1  ATAAGATTTCATGCCAATTTTGAGGTGTTGCTAGCTCGTCCATCACTGGG  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATTTCATGCCAATTTTGAGGTGTTGCTAGCTCGTCCATCACTGGG  1050

seq1  AAAGTCCCTGTTCCGTGGGCCCTGAATTC  1061
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCCCTGTTCCGTGGGCCCTGAATTC  1079