BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-247F11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 35,566,239 - 35,722,644
singlet/doubletdoublet
Overlap geneChst8, Pepd
Upstream geneLOC627079, LOC635803, Abpg, LOC100043864, LOC100043865, Abpb, Abpa, LOC100043866, LOC100043867, LOC100043868, Wtip, Sae2, LOC100043410, Pdcd2l, Gpi1, 4931406P16Rik, EG619734, Lsm14a, LOC668460, LOC668464, Kctd15
Downstream geneCebpg, Cebpa, Slc7a10, Wdr88, Gpatch1, Rhpn2, C230052I12Rik, Ccdc123, Slc7a9, 2410004F06Rik, Nudt19, Rgs9bp, Ankrd27, Pdcd5, Dpy19l3, zfp507
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-247F11.bB6Ng01-247F11.g
ACCGA055701GA055702
length1,1411,097
definitionB6Ng01-247F11.b B6Ng01-247F11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,566,239 - 35,567,369)(35,721,555 - 35,722,644)
sequence
gaattcacagtcgatctgggctctagagtgaagcaaagacaaaacaaaat
taagtgaaaagtactgagggttaggacctagagagatgagtcagaggtta
aagtgatcattgttcttacacgggacctgagttcagttcccagcatccac
agcaggcagctcactaccacacaactccagttccaggggcctggtgccct
cttgtggtctccataggcacttcacccatgtgcacttacccctcctccac
agagacacatgtgcacacacaattaaaatgttttaaacatttaaaggaat
ataagtaatctgatctataagatctggctctctttcacactcttttgtgt
tcagcaaacagaacacatttttccccaattgctcaaaaattattttgaaa
acttggtttatgttggactacaaaaaaagaaacctcaatagaagtcatta
tctaaccaaaatgcaataagatcgaatattaaaaaatgacagggaaaaat
attggctatgacattgtttttgatggaagaaagtagaaattatacactcg
accttccctggggaaaggagagtcctgttttcaaaggctcgaagatggag
ttaaagagccaggagccagaactgagagttacagcatcacaatcgcaagc
aaaatcaacaacaccgtcatcaggccagatgattcaacaagtttcattga
gacttggaatgatcatgggcttaagagaaatgaagggtatacagaagatt
tgagatgcacagtttatgcattgcctgcatgtacatgtgtagaaatatat
acatgtatatgtaatatattcattggagagactggcttgttgattaaaag
cactgactgtttttccagaccacatgggttcagtcccagcacccacatag
cagctcccaaccactttttaactccagccccaggggatctgcagccctct
tctggcctctctgggaactgcatgcacatggtgtacagacacatgcaggc
aaaacactcaaatacataaaaatatctttttaaaaagtgatgacaaactc
catgccccagttcacagtaacaactacaaaatgaagttagatcacatcct
tcttccccaatgatgccacatgtcagcattttaacattgtt
gaattctcccctccctcctgttacgacaattcttgaggctgcagcccaga
gagggatcttactcagcagtagtgaagcccagccaagtgcaggaatctca
caaccctgaaacagagcctattctagttctctctccaggtttgatgatgg
gaaggcccaaacgagcaatgacattgagatgcactttatagggtgtgagg
gtagtgaagatatacctgccagagaacagaaacaggaccaaagtcagggt
gaagaataaacagatctccctaatgcttggagatacaatgtagcacatgg
tttcattaggagcatgtaaacaaacatttagtttctcttaaaaactggaa
ggcacatggcataaggatccatcaaaagctgcttctcaacgtatgggaaa
aggaaccctatacactacaagtaggactttaaatgagtgcatccaacatg
gaaaccagtctgaaggtcttcacaaaattatgtatgagccactacaccag
tcttaggtatatagccaagagaagcaaaatcagcttactgcagggatcat
tgtatatttactgcagtgcaattcacaccagtgatacacaatcggcctag
tgcccatcaatagacaaacggagatgaaggtgtggtgcatatacacaatg
gggtattaattggccacataagaaatgagagtgtgtcatctccagcagag
atcatctggctaagccagattcagaaagacaaacatggtgtttcctctca
tttacagaatctacagttgaaagaaaacaagagaagaaagtagaagggga
actacgtgaggagacgagggtcagtgttgggcaggacaaacatggacttc
cgatcacagtgcacacacagtgcacatatgtaaacgtaacaagcagctca
tttctgctctacagtctacatacactatgggggctggagagatggttcca
tggttaagtacacttgctgcttctttcacaggaccaaaatttcagttcct
agtacccacactgggcagcttcacaacttccctgtattcataacgccagg
gaaatctgatgccctctttctggtctcataggtactgcatgccacat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_35566239_35567369
seq2: B6Ng01-247F11.b_43_1183

seq1  GAATTCACAGTCGATCTGGGCTCTAGAGTGAAGCAAAGACAAAACAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGTCGATCTGGGCTCTAGAGTGAAGCAAAGACAAAACAAAAT  50

seq1  TAAGTGAAAAGTACTGAGGGTTAGGACCTAGAGAGATGAGTCAGAGGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGAAAAGTACTGAGGGTTAGGACCTAGAGAGATGAGTCAGAGGTTA  100

seq1  AAGTGATCATTGTTCTTACACGGGACCTGAGTTCAGTTCCCAGCATCCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATCATTGTTCTTACACGGGACCTGAGTTCAGTTCCCAGCATCCAC  150

seq1  AGCAGGCAGCTCACTACCACACAACTCCAGTTCCAGGGGCCTGGTGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCAGCTCACTACCACACAACTCCAGTTCCAGGGGCCTGGTGCCCT  200

seq1  CTTGTGGTCTCCATAGGCACTTCACCCATGTGCACTTACCCCTCCTCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTGGTCTCCATAGGCACTTCACCCATGTGCACTTACCCCTCCTCCAC  250

seq1  AGAGACACATGTGCACACACAATTAAAATGTTTTAAACATTTAAAGGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACACATGTGCACACACAATTAAAATGTTTTAAACATTTAAAGGAAT  300

seq1  ATAAGTAATCTGATCTATAAGATCTGGCTCTCTTTCACACTCTTTTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTAATCTGATCTATAAGATCTGGCTCTCTTTCACACTCTTTTGTGT  350

seq1  TCAGCAAACAGAACACATTTTTCCCCAATTGCTCAAAAATTATTTTGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAACAGAACACATTTTTCCCCAATTGCTCAAAAATTATTTTGAAA  400

seq1  ACTTGGTTTATGTTGGACTACAAAAAAAGAAACCTCAATAGAAGTCATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGTTTATGTTGGACTACAAAAAAAGAAACCTCAATAGAAGTCATTA  450

seq1  TCTAACCAAAATGCAATAAGATCGAATATTAAAAAATGACAGGGAAAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACCAAAATGCAATAAGATCGAATATTAAAAAATGACAGGGAAAAAT  500

seq1  ATTGGCTATGACATTGTTTTTGATGGAAGAAAGTAGAAATTATACACTCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTATGACATTGTTTTTGATGGAAGAAAGTAGAAATTATACACTCG  550

seq1  ACCTTCCCTGGGGAAAGGAGAGTCCTGTTTTCAAAGGCTCGAAGATGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCCTGGGGAAAGGAGAGTCCTGTTTTCAAAGGCTCGAAGATGGAG  600

seq1  TTAAAGAGCCAGGAGCCAGAACTGAGAGTTACAGCATCACAATCGCAAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGAGCCAGGAGCCAGAACTGAGAGTTACAGCATCACAATCGCAAGC  650

seq1  AAAATCAACAACACCGTCATCAGGCCAGATGATTCAACAAGTTTCATTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCAACAACACCGTCATCAGGCCAGATGATTCAACAAGTTTCATTGA  700

seq1  GACTTGGAATGATCATGGGCTTAAGAGAAATGAAGGGTATACAGAAGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGGAATGATCATGGGCTTAAGAGAAATGAAGGGTATACAGAAGATT  750

seq1  TGAGATGCACAGTTTATGCATTGCCTGCATGTACATGTGTAGAAATATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGCACAGTTTATGCATTGCCTGCATGTACATGTGTAGAAATATAT  800

seq1  ACATGTATATGTAATATATTCATTGGAGAGACTGGCTTGTTGATTAAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTATATGTAATATATTCATTGGAGAGACTGGCTTGTTGATTAAAAG  850

seq1  CACTGACTGTTTTTCCAGACCACATGGGTTCAGTCCCAGCACCCACATAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGACTGTTTTTCCAGACCACATGGGTTCAGTCCCAGCACCCACATAG  900

seq1  CAGCTCCCAACCAC-TTTTAACTCCAGCCCCAGGGGATCTGCAGCCCTCT  949
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCCCAACCACTTTTTAACTCCAGCCCCAGGGGATCTGCAGCCCTCT  950

seq1  TCTGGCCTCTCTGGGAACTGCATGCACATGGTGTACAGACACATGCAGGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCCTCTCTGGGAACTGCATGCACATGGTGTACAGACACATGCAGGC  1000

seq1  AAAACACTCAAATACAT-AAAATATCTTTTTAAAAAGTGATGACAAACTC  1048
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACTCAAATACATAAAAATATCTTTTTAAAAAGTGATGACAAACTC  1050

seq1  CATG-CCCAG-TCACAGTA--CACTACAAATGAAATTTAGATCACATC--  1092
      |||| ||||| ||||||||   ||||||||   || ||||||||||||  
seq2  CATGCCCCAGTTCACAGTAACAACTACAAAATGAAGTTAGATCACATCCT  1100

seq1  TCT--CCCCATGATG-CACATGTCAGCCATTTAACATGTGTT  1131
      |||  ||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||||
seq2  TCTTCCCCAATGATGCCACATGTCAGCATTTTAACAT-TGTT  1141

seq1: chr7_35721555_35722644
seq2: B6Ng01-247F11.g_67_1163 (reverse)

seq1  ATGT-GCATGCAGTACCTATGGAGACCAG-AAGAGGGCATCAGATTT-CC  47
      |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  ATGTGGCATGCAGTACCTAT-GAGACCAGAAAGAGGGCATCAGATTTCCC  49

seq1  TGGCGTTATGAATTACAGGG-AGTTGTG-AGCTGCCCAGTGTGGGTACTA  95
      |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGCGTTATGAA-TACAGGGAAGTTGTGAAGCTGCCCAGTGTGGGTACTA  98

seq1  GGAACTG-AATTTTGGTCCTGTGAAAG-AGCAGCAAGTGTACTTAACCAT  143
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTGAAATTTTGGTCCTGTGAAAGAAGCAGCAAGTGTACTTAACCAT  148

seq1  GGAACCATCTCTCCAG-CCCCATAGTGTATGTAGACTGTAGAGCAG-AAT  191
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GGAACCATCTCTCCAGCCCCCATAGTGTATGTAGACTGTAGAGCAGAAAT  198

seq1  GAGCTGCTTGTTACGTTTACATATGTGCACTGTGTGTGCACTGTGATCGG  241
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCTTGTTACGTTTACATATGTGCACTGTGTGTGCACTGTGATCGG  248

seq1  AAGTCCATGTTTGTCCTGCCCAACACTGACCCTCGTCTCCTCACGTAGTT  291
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCATGTTTGTCCTGCCCAACACTGACCCTCGTCTCCTCACGTAGTT  298

seq1  CCCCTTCTACTTTCTTCTCTTGTTTTCTTTCAACTGTAGATTCTGTAAAT  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTCTACTTTCTTCTCTTGTTTTCTTTCAACTGTAGATTCTGTAAAT  348

seq1  GAGAGGAAACACCATGTTTGTCTTTCTGAATCTGGCTTAGCCAGATGATC  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAAACACCATGTTTGTCTTTCTGAATCTGGCTTAGCCAGATGATC  398

seq1  TCTGCTGGAGATGACACACTCTCATTTCTTATGTGGCCAATTAATACCCC  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTGGAGATGACACACTCTCATTTCTTATGTGGCCAATTAATACCCC  448

seq1  ATTGTGTATATGCACCACACCTTCATCTCCGTTTGTCTATTGATGGGCAC  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGTATATGCACCACACCTTCATCTCCGTTTGTCTATTGATGGGCAC  498

seq1  TAGGCCGATTGTGTATCACTGGTGTGAATTGCACTGCAGTAAATATACAA  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCCGATTGTGTATCACTGGTGTGAATTGCACTGCAGTAAATATACAA  548

seq1  TGATCCCTGCAGTAAGCTGATTTTGCTTCTCTTGGCTATATACCTAAGAC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCCTGCAGTAAGCTGATTTTGCTTCTCTTGGCTATATACCTAAGAC  598

seq1  TGGTGTAGTGGCTCATACATAATTTTGTGAAGACCTTCAGACTGGTTTCC  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGTAGTGGCTCATACATAATTTTGTGAAGACCTTCAGACTGGTTTCC  648

seq1  ATGTTGGATGCACTCATTTAAAGTCCTACTTGTAGTGTATAGGGTTCCTT  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGGATGCACTCATTTAAAGTCCTACTTGTAGTGTATAGGGTTCCTT  698

seq1  TTCCCATACGTTGAGAAGCAGCTTTTGATGGATCCTTATGCCATGTGCCT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCATACGTTGAGAAGCAGCTTTTGATGGATCCTTATGCCATGTGCCT  748

seq1  TCCAGTTTTTAAGAGAAACTAAATGTTTGTTTACATGCTCCTAATGAAAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTTTTTAAGAGAAACTAAATGTTTGTTTACATGCTCCTAATGAAAC  798

seq1  CATGTGCTACATTGTATCTCCAAGCATTAGGGAGATCTGTTTATTCTTCA  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGCTACATTGTATCTCCAAGCATTAGGGAGATCTGTTTATTCTTCA  848

seq1  CCCTGACTTTGGTCCTGTTTCTGTTCTCTGGCAGGTATATCTTCACTACC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGACTTTGGTCCTGTTTCTGTTCTCTGGCAGGTATATCTTCACTACC  898

seq1  CTCACACCCTATAAAGTGCATCTCAATGTCATTGCTCGTTTGGGCCTTCC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACCCTATAAAGTGCATCTCAATGTCATTGCTCGTTTGGGCCTTCC  948

seq1  CATCATCAAACCTGGAGAGAGAACTAGAATAGGCTCTGTTTCAGGGTTGT  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCAAACCTGGAGAGAGAACTAGAATAGGCTCTGTTTCAGGGTTGT  998

seq1  GAGATTCCTGCACTTGGCTGGGCTTCACTACTGCTGAGTAAGATCCCTCT  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTCCTGCACTTGGCTGGGCTTCACTACTGCTGAGTAAGATCCCTCT  1048

seq1  CTGGGCTGCAGCCTCAAGAATTGTCGTAACAGGAGGGAGGGGAGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTGCAGCCTCAAGAATTGTCGTAACAGGAGGGAGGGGAGAATTC  1097