BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248M06
Chromosome7 (Build37)
Map Location 75,124,441 - 75,317,087
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIgf1r
Upstream geneAdamts17, Lysmd4, Mef2a, EG665304, Lrrc28, Ttc23, Dmn, LOC665319, LOC100041771
Downstream geneC330024D12Rik, EG434197, LOC100041800, EG384639, Arrdc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248M06.bB6Ng01-248M06.g
ACCGA056760GA056761
length1,0091,028
definitionB6Ng01-248M06.b B6Ng01-248M06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,124,441 - 75,125,440)(75,316,058 - 75,317,087)
sequence
gaattcagtttttcctttttatctacagtttgaagaaggatgtagcttta
tgtttctctttgtgtgcgttcttttccagattttgctgtctggtttaggc
cagctttgtaagatgaattagtggctttcctttttagcttctttgtcatg
gcttgtatagtgtggcaataagctgccctttgttaaaagcttagaagcta
atgctctaaaaactgcccagttttgtcagtttcttaaaatttgtctctgg
gtattggtgtgcagttggcttctgatttactttctgattagtttttggaa
ttgaaaataaatgtcaacagataattaaaaacactcggttgtatgagggt
ctcctccccacccttgaggtggaggtgagggctgaacccagcttaccact
gagctaaatccccaagcccccatgtagcattttcttcatgattttctctt
tcattcctggtcagacctgccagagtgctccttgttcggtgctcctgtcc
aaacagttggttctgtcttattaaagcaattatgccacggcattttgctg
gcgatgggtaacctctatcttttcctggccttgctgggttcatatattat
cagtgacttgatggtagaggctgtagataacaccttttggatgcacacct
ggcttgtttcaggtaaccctgaggatagtcctgtggctgtgcctgctgga
cgttttcattggctctctgtaatgtcccgtgatgggtgccgagagtagat
gccaccttaggacctctatggagagggaaacatttgcatacctgggttca
tcccaaggaatgcattaaagacatgtgtgactctacacatggctctatat
gtgggtcctggggatttgaactcaagtccccatgcttgcactgttaagta
cttcgccttgctgaagtcattcttccccagcccaagattatgttttggat
ggaaaagggtatccaattgtaaattaggaaagtggctccccccccccccg
ccccttttt
gaattcaacctgaaaaaaagagtggctgcggctaagcctgtgttttgttc
cccaagaattgaatctataacccctgtgtgcaagacaagtgctctggccg
ccctgaactcactctgtagaccaggctagtctcgaattcagagatctgcc
tgcctctgcctcagaagcactaggatgaaaggtgtcttcactgtgtagac
caggctagcctcgagttcagagatctgcctgcctctgcctcagaagcact
aggatgaaaggtgtcttcactgtgtagaccaggctagcctcgagttcaga
gatctgcctgcctctgcctcagaagcactaggatgaaaggtgtcttcact
gtgtagaccaggctagcctcaagttcagagatctgcctgcctctgcctca
gaagcactaggatgaaaggtgtcttcactgtggagaccaggctagcctca
aattcagagatctgcctgcctctgcctcagaagcactaggatgaaagttg
tctgtcaccacacccagtaagtaattcttcttcatgggctgaatttccca
atcacattgatctcccatgacaggaagatataaaaacagtaaggtttatg
aattttaaaaggcatgtcttgggatcaataaactcaaagaaaattaatag
atctggtatgagcaaaactacaatttggttattaacataagggtcagcgt
tcttgtgtggggaacagggccctccattgtggaagggtagagaatggggc
aataaaaactaaaggacttgggggctcgagagatggctcagcagttaaga
gcactgactgctcttccaaaggtcctgagtttcaaatcacagcaactaca
tgggtggctcacaactatccataatgagatctgatgccctattctggggt
gtctgaagacagctacagtgcacttacatataataaatcaatcaatcaat
caatcaatcaatcttaagaaaccaacaacaaacagacaatgcctagcctc
aaaaactcactaccacaaaaacccataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_75124441_75125440
seq2: B6Ng01-248M06.b_48_1056

seq1  GAATTCAGTTTTTCCTTTTTATCTACAGTTTGAAGAAGGATGTAGCTTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTTTCCTTTTTATCTACAGTTTGAAGAAGGATGTAGCTTTA  50

seq1  TGTTTCTCTTTGTGTGCGTTCTTTTCCAGATTTTGCTGTCTGGTTTAGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTCTTTGTGTGCGTTCTTTTCCAGATTTTGCTGTCTGGTTTAGGC  100

seq1  CAGCTTTGTAAGATGAATTAGTGGCTTTCCTTTTTAGCTTCTTTGTCATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTGTAAGATGAATTAGTGGCTTTCCTTTTTAGCTTCTTTGTCATG  150

seq1  GCTTGTATAGTGTGGCAATAAGCTGCCCTTTGTTAAAAGCTTAGAAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTATAGTGTGGCAATAAGCTGCCCTTTGTTAAAAGCTTAGAAGCTA  200

seq1  ATGCTCTAAAAACTGCCCAGTTTTGTCAGTTTCTTAAAATTTGTCTCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTAAAAACTGCCCAGTTTTGTCAGTTTCTTAAAATTTGTCTCTGG  250

seq1  GTATTGGTGTGCAGTTGGCTTCTGATTTACTTTCTGATTAGTTTTTGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGGTGTGCAGTTGGCTTCTGATTTACTTTCTGATTAGTTTTTGGAA  300

seq1  TTGAAAATAAATGTCAACAGATAATTAAAAACACTCGGTTGTATGAGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATAAATGTCAACAGATAATTAAAAACACTCGGTTGTATGAGGGT  350

seq1  CTCCTCCCCACCCTTGAGGTGGAGGTGAGGGCTGAACCCAGCTTACCACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCCCACCCTTGAGGTGGAGGTGAGGGCTGAACCCAGCTTACCACT  400

seq1  GAGCTAAATCCCCAAGCCCCCATGTAGCATTTTCTTCATGATTTTCTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAAATCCCCAAGCCCCCATGTAGCATTTTCTTCATGATTTTCTCTT  450

seq1  TCATTCCTGGTCAGACCTGCCAGAGTGCTCCTTGTTCGGTGCTCCTGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCCTGGTCAGACCTGCCAGAGTGCTCCTTGTTCGGTGCTCCTGTCC  500

seq1  AAACAGTTGGTTCTGTCTTATTAAAGCAATTATGCCACGGCATTTTGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTTGGTTCTGTCTTATTAAAGCAATTATGCCACGGCATTTTGCTG  550

seq1  GCGATGGGTAACCTCTATCTTTTCCTGGCCTTGCTGGGTTCATATATTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGATGGGTAACCTCTATCTTTTCCTGGCCTTGCTGGGTTCATATATTAT  600

seq1  CAGTGACTTGATGGTAGAGGCTGTAGATAACACCTTTTGGATGCACACCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACTTGATGGTAGAGGCTGTAGATAACACCTTTTGGATGCACACCT  650

seq1  GGCTTGTTTCAGGTAACCCTGAGGATAGTCCTGTGGCTGTGCCTGCTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTTTCAGGTAACCCTGAGGATAGTCCTGTGGCTGTGCCTGCTGGA  700

seq1  CGTTTTCATTGGCTCTCTGTAATGTCCCGTGATGGGTGCCGAGAGTAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTTCATTGGCTCTCTGTAATGTCCCGTGATGGGTGCCGAGAGTAGAT  750

seq1  GCCACCTTAGGACCTCTATGGAGAGGGAAACATTTGCATACCTGGGTTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTTAGGACCTCTATGGAGAGGGAAACATTTGCATACCTGGGTTCA  800

seq1  TCCCAAGGAATGCATTAAAGACATGTGTGACTCTACACATGGCTCTATAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGGAATGCATTAAAGACATGTGTGACTCTACACATGGCTCTATAT  850

seq1  GTGGGTCCTGGGGATTTGAACTCAGGTCCCCATGCTTGCACTGTTAAGTA  900
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTCCTGGGGATTTGAACTCAAGTCCCCATGCTTGCACTGTTAAGTA  900

seq1  CTTCG-CTTGCTG-AGTCA-TCTT-CCCAGCCC-AGATTATGTTTT-GAT  944
      ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||
seq2  CTTCGCCTTGCTGAAGTCATTCTTCCCCAGCCCAAGATTATGTTTTGGAT  950

seq1  GGAAAAGGGTAT-CAATTGT-AATTA-GAAGGTGGTTCCCCCCCCCCCCG  991
      |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  GGAAAAGGGTATCCAATTGTAAATTAGGAAAGTGGCTCCCCCCCCCCCCG  1000

seq1  CCCCTTTTT  1000
      |||||||||
seq2  CCCCTTTTT  1009

seq1: chr7_75316058_75317087
seq2: B6Ng01-248M06.g_68_1095 (reverse)

seq1  TTATGGGGTTTTTTGTGGTAGTGAGTTTTTGAGGCTTGGGCATTTGTCTG  50
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||
seq2  TTATGGG--TTTTTGTGGTAGTGAGTTTTTGAGGC-TAGGCA-TTGTCTG  46

seq1  TTTGTTTGTTTGTTTCTTTAAGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTT  100
      |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTG-TTGTTGGTTTC-TTAAGATTGATTGATTGATTGATTGATTGATTT  94

seq1  ATTATATGTAAGTGCACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAATAGGGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATGTAAGTGCACTGTAGCTGTCTTCAGACACCCCAGAATAGGGCA  144

seq1  TCAGATCTCATTATGGATAGTTGTGAGCCA-CCATGTAGTTGCTGTGATT  199
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCTCATTATGGATAGTTGTGAGCCACCCATGTAGTTGCTGTGATT  194

seq1  TG-AACTCAGGACCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCC  248
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGCTGAGCC  244

seq1  ATCTCTCGAGCCCCCAAGTCC-TTAGTTTTTATTG-CCCATTCTCTACCC  296
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATCTCTCGAGCCCCCAAGTCCTTTAGTTTTTATTGCCCCATTCTCTACCC  294

seq1  TTCCACAATGGAGGGCCCTGTTCCCCACACAAGAACGCTGACCCTTATGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACAATGGAGGGCCCTGTTCCCCACACAAGAACGCTGACCCTTATGT  344

seq1  TAATAACCAAATTGTAGTTTTGCTCATACCAGATCTATTAATTTTCTTTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAACCAAATTGTAGTTTTGCTCATACCAGATCTATTAATTTTCTTTG  394

seq1  AGTTTATTGATCCCAAGACATGCCTTTTAAAATTCATAAACCTTACTGTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTATTGATCCCAAGACATGCCTTTTAAAATTCATAAACCTTACTGTT  444

seq1  TTTATATCTTCCTGTCATGGGAGATCAATGTGATTGGGAAATTCAGCCCA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATCTTCCTGTCATGGGAGATCAATGTGATTGGGAAATTCAGCCCA  494

seq1  TGAAGAAGAATTACTTACTGGGTGTGGTGACAGACAACTTTCATCCTAGT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAGAATTACTTACTGGGTGTGGTGACAGACAACTTTCATCCTAGT  544

seq1  GCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAATTTGAGGCTAGCCTGGTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAATTTGAGGCTAGCCTGGTC  594

seq1  TCCACAGTGAAGACACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACAGTGAAGACACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGC  644

seq1  AGATCTCTGAACTTGAGGCTAGCCTGGTCTACACAGTGAAGACACCTTTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCTGAACTTGAGGCTAGCCTGGTCTACACAGTGAAGACACCTTTC  694

seq1  ATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAACTCGAGGCTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAACTCGAGGCTA  744

seq1  GCCTGGTCTACACAGTGAAGACACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGTCTACACAGTGAAGACACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAG  794

seq1  AGGCAGGCAGATCTCTGAACTCGAGGCTAGCCTGGTCTACACAGTGAAGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGCAGATCTCTGAACTCGAGGCTAGCCTGGTCTACACAGTGAAGA  844

seq1  CACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAATT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTTCATCCTAGTGCTTCTGAGGCAGAGGCAGGCAGATCTCTGAATT  894

seq1  CGAGACTAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCAGGGCGGCCAGAGCACTTGT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGACTAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCAGGGCGGCCAGAGCACTTGT  944

seq1  CTTGCACACAGGGGTTATAGATTCAATTCTTGGGGAACAAAACACAGGCT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCACACAGGGGTTATAGATTCAATTCTTGGGGAACAAAACACAGGCT  994

seq1  TAGCCGCAGCCACTCTTTTTTTCAGGTTGAATTC  1030
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCGCAGCCACTCTTTTTTTCAGGTTGAATTC  1028