BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-250A14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 77,389,187 - 77,557,726
singlet/doubletdoublet
Overlap geneNr2f2, LOC100042833, B130024G19Rik, LOC100042838
Upstream geneEG665410
Downstream geneLOC665486, LOC100041957
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-250A14.bB6Ng01-250A14.g
ACCGA057695GA057696
length4771,141
definitionB6Ng01-250A14.b B6Ng01-250A14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,389,187 - 77,389,669)(77,556,596 - 77,557,726)
sequence
aaagattcctcagagagttagaagaactttctccaaaggcagtctcacct
ttgtcagattgatccaggccccagagacgtacctctgaccacattgtgaa
atctcttcctccacctacacctacagaaaagccattgatactgccagttc
tgtgaagactgcctaggcccatgggctggaccttactctgaaatgatagc
atttgaatccaaggattcaagtttccaaatacttgattttctaatcatac
ccatatggcgtatatgtattgtacttgaaggtattgcttagtgtagaagt
aacagtaagcaatcttaggaagtattgcgactggcaatattcaaatcttt
aagctctttgcaaggcatccttctcacagatcttgccaatcatcccacca
cttactaagcattgctgagatgaccctatggataagcgaataggtaggtg
aaggagagaggggaagggagggagaga

gaattccatgcaggttggcattcagagactaaaggtccagatgaaaagtg
ctttccgtggtgactggatggaggaaatgcttaccaaagatagaagctca
cctgaaagtcctgcgattggagtaggccctccgcaggaagatgtcgaagc
tgaacctggaggaggcgctgtgcatactgatgtcctgtgattggcaggcc
accagctgctaggttaggacagaccagagcagagaggaaaagcatgagcc
atgtggaaaacaagacaggattctagaagacaagagacaggggccactca
gggggagagcaaaataaaaatagatattgcaagcaacgagcttgaagaac
gagacatgaaagggccaggagatgctaactgttcttcggtaagcagggag
agagactgaaggctggtccttcacacacgtaaaggacagcctctgctcca
gaacactcagagatcgggaagagttttacaaccagagcagagtaatatgc
tcaaaacacagaagagctggcgggagccaggtgagacggggcagcaggag
gccagtaacaaacagcaaagttcctgcaagcaagagcgcaggcttgagca
tggctggcaaaacacccaccctacattttaaagacgctagccactatgtc
ccagcatccttccattggcccttcaagtctctccaatggtagtaaggggt
cacaggcctcccttatggctttggatctatgagctctacatatacaaagt
ttgggagtttttaatgcacttatttatttgtttgttttaagtgagagttt
tgctatatatggcccagtctggcctcagacttaaagactcaccacacaca
caaacacacacacacacatataccacccaccaccaccaccacccacaccc
tgcttggattataggtgtacaccataacacacagctcttccaggaatcct
ctctttgagtgtatttctttgatacactcacctatagttgcataaccctg
gccaggaatattttattgactaaacaataccccttggatacttttgtctt
tgcagagaatgaatactttcttgtatgcaagggcaagtgcctgtaaccta
ttgaactacattccaagtccttattgaaatttttaatagct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_77389187_77389669
seq2: B6Ng01-250A14.b_47_529

seq1  GAATTCAAAGATTCCTCAGAGAGTTAGAAGAACTTTCTCCAAAGGCAGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGATTCCTCAGAGAGTTAGAAGAACTTTCTCCAAAGGCAGTC  50

seq1  TCACCTTTGTCAGATTGATCCAGGCCCCAGAGACGTACCTCTGACCACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTTGTCAGATTGATCCAGGCCCCAGAGACGTACCTCTGACCACAT  100

seq1  TGTGAAATCTCTTCCTCCACCTACACCTACAGAAAAGCCATTGATACTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAATCTCTTCCTCCACCTACACCTACAGAAAAGCCATTGATACTGC  150

seq1  CAGTTCTGTGAAGACTGCCTAGGCCCATGGGCTGGACCTTACTCTGAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCTGTGAAGACTGCCTAGGCCCATGGGCTGGACCTTACTCTGAAAT  200

seq1  GATAGCATTTGAATCCAAGGATTCAAGTTTCCAAATACTTGATTTTCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCATTTGAATCCAAGGATTCAAGTTTCCAAATACTTGATTTTCTAA  250

seq1  TCATACCCATATGGCGTATATGTATTGTACTTGAAGGTATTGCTTAGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACCCATATGGCGTATATGTATTGTACTTGAAGGTATTGCTTAGTGT  300

seq1  AGAAGTAACAGTAAGCAATCTTAGGAAGTATTGCGACTGGCAATATTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTAACAGTAAGCAATCTTAGGAAGTATTGCGACTGGCAATATTCAA  350

seq1  ATCTTTAAGCTCTTTGCAAGGCATCCTTCTCACAGATCTTGCCAATCATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTAAGCTCTTTGCAAGGCATCCTTCTCACAGATCTTGCCAATCATC  400

seq1  CCACCACTTACTAAGCATTGCTGAGATGACCCTATGGATAAGCGAATAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACTTACTAAGCATTGCTGAGATGACCCTATGGATAAGCGAATAGG  450

seq1  TAGGTGAAGGAGAGAGGGGAAGGGAGGGAGAGA  483
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTGAAGGAGAGAGGGGAAGGGAGGGAGAGA  483


seq1: chr7_77556596_77557726
seq2: B6Ng01-250A14.g_67_1207 (reverse)

seq1  AGCTAT--AAAAATTCAATAAGGACTGGGAATGTAGTCCAATAG--TACA  46
      ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||
seq2  AGCTATTAAAAATTTCAATAAGGACTTGGAATGTAGTTCAATAGGTTACA  50

seq1  -GCACTTGCCC-TGCATACAAG-AAGTA-TCA-TCTCTGCAAAGACAAAA  91
       |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||
seq2  GGCACTTGCCCTTGCATACAAGAAAGTATTCATTCTCTGCAAAGAC-AAA  99

seq1  AGTAACCAA-GGGTA-TGTTTAGTCAATAAAATATTCCCTGGCCAGGGTT  139
      |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGTATCCAAGGGGTATTGTTTAGTCAATAAAATATT-CCTGGCCAGGGTT  148

seq1  ATGCAACTATAGGTGAGTGTATCAAAGAAATACACTCAAAGAGAGGATTC  189
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAACTATAGGTGAGTGTATCAAAGAAATACACTCAAAGAGAGGATTC  198

seq1  CTGGAAGAGCTGTGTGTTATGGTGTACACCTATAATCCAAGCAGGGTGTG  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGAGCTGTGTGTTATGGTGTACACCTATAATCCAAGCAGGGTGTG  248

seq1  GGTGGTGGTGGTGGT-GGTGGTATATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGT  288
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGGTGGTGGTGGGTGGTATATGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGT  298

seq1  GGTGAGTCTTTAAGTCTGAGGCCAGACTGGGCCATATATAGCAAAACTCT  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTCTTTAAGTCTGAGGCCAGACTGGGCCATATATAGCAAAACTCT  348

seq1  CACTTAAAACAAACAAATAAATAAGTGCATTAAAAACTCCCAAACTTTGT  388
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAAAACAAACAAATAAATAAGTGCATTAAAAACTCCCAAACTTTGT  398

seq1  ATATGTAGAGCTCATAGATCCAAAGCCATAAGGGAGGCCTGTGACCCCTT  438
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTAGAGCTCATAGATCCAAAGCCATAAGGGAGGCCTGTGACCCCTT  448

seq1  ACTACCATTGGAGAGACTTGAAGGGCCAATGGAAGGATGCTGGGACATAG  488
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACCATTGGAGAGACTTGAAGGGCCAATGGAAGGATGCTGGGACATAG  498

seq1  TGGCTAGCGTCTTTAAAATGTAGGGTGGGTGTTTTGCCAGCCATGCTCAA  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAGCGTCTTTAAAATGTAGGGTGGGTGTTTTGCCAGCCATGCTCAA  548

seq1  GCCTGCGCTCTTGCTTGCAGGAACTTTGCTGTTTGTTACTGGCCTCCTGC  588
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCGCTCTTGCTTGCAGGAACTTTGCTGTTTGTTACTGGCCTCCTGC  598

seq1  TGCCCCGTCTCACCTGGCTCCCGCCAGCTCTTCTGTGTTTTGAGCATATT  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCGTCTCACCTGGCTCCCGCCAGCTCTTCTGTGTTTTGAGCATATT  648

seq1  ACTCTGCTCTGGTTGTAAAACTCTTCCCGATCTCTGAGTGTTCTGGAGCA  688
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGCTCTGGTTGTAAAACTCTTCCCGATCTCTGAGTGTTCTGGAGCA  698

seq1  GAGGCTGTCCTTTACGTGTGTGAAGGACCAGCCTTCAGTCTCTCTCCCTG  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGTCCTTTACGTGTGTGAAGGACCAGCCTTCAGTCTCTCTCCCTG  748

seq1  CTTACCGAAGAACAGTTAGCATCTCCTGGCCCTTTCATGTCTCGTTCTTC  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCGAAGAACAGTTAGCATCTCCTGGCCCTTTCATGTCTCGTTCTTC  798

seq1  AAGCTCGTTGCTTGCAATATCTATTTTTATTTTGCTCTCCCCCTGAGTGG  838
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCGTTGCTTGCAATATCTATTTTTATTTTGCTCTCCCCCTGAGTGG  848

seq1  CCCCTGTCTCTTGTCTTCTAGAATCCTGTCTTGTTTTCCACATGGCTCAT  888
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGTCTCTTGTCTTCTAGAATCCTGTCTTGTTTTCCACATGGCTCAT  898

seq1  GCTTTTCCTCTCTGCTCTGGTCTGTCCTAACCTAGCAGCTGGTGGCCTGC  938
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTCCTCTCTGCTCTGGTCTGTCCTAACCTAGCAGCTGGTGGCCTGC  948

seq1  CAATCACAGGACATCAGTATGCACAGCGCCTCCTCCAGGTTCAGCTTCGA  988
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCACAGGACATCAGTATGCACAGCGCCTCCTCCAGGTTCAGCTTCGA  998

seq1  CATCTTCCTGCGGAGGGCCTACTCCAATCGCAGGACTTTCAGGTGAGCTT  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCCTGCGGAGGGCCTACTCCAATCGCAGGACTTTCAGGTGAGCTT  1048

seq1  CTATCTTTGGTAAGCATTTCCTCCATCCAGTCACCACGGAAAGCACTTTT  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTTTGGTAAGCATTTCCTCCATCCAGTCACCACGGAAAGCACTTTT  1098

seq1  CATCTGGACCTTTAGTCTCTGAATGCCAACCTGCATGGAATTC  1131
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGACCTTTAGTCTCTGAATGCCAACCTGCATGGAATTC  1141


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |