BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-250I07
Chromosome7 (Build37)
Map Location 60,310,329 - 60,451,480
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm1865
Upstream geneEG620782, LOC100040692
Downstream geneLOC100040718, LOC668789
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-250I07.bB6Ng01-250I07.g
ACCGA058041GA058042
length1,1061,089
definitionB6Ng01-250I07.b B6Ng01-250I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,450,374 - 60,451,480)(60,310,329 - 60,311,417)
sequence
gaattcttatgtccttagcaggtggaaccagtctcacaatgacctgcttc
tttggagttgtaaaaccagctagttgtgtcctggttatgtttctttgatt
ctcttattgcaagttaaatattgaatcaagatcctcattgtggatgaagg
tagagttgagtccttagagatataaccaggtcatgagagtggagatgtca
tgaaaaggatgagtatccacaaatagggccccatctcttctgtgtgtact
ttctcttgttcctaagaagccacagaagactggctgtccagtaggcctgc
cagcaggttaaacttggatttccagtccttagcagctgtcagaatatccc
tgccacttctcaatagatgggtttgagctgtaaaacattctgttgtacag
aaataaagactactaacatgaaatgtgaaatgtgtgcaattaagtggaag
cttatttctggagaacattagaaattcagtgttaagatggtgataatatt
agagtataccaaaattatgtaattatatttacacagaatttagttataaa
gaattcacattcttccccatgctagggtcctaacacagtattgagattac
ttacagtaagatgtcataatcattaagatattttggcaactaaacacaga
gatttcttctaaccagagaaactgaatagccagtgggtcctccagtcaga
tattgtttttttaataattaattaatttttatattttataccccgctccc
agtccacccttgactgttccatccaccctcgactgctccacatcctgtac
tgctccccaccctctgtctccatgttgatatccccgtacaccccccacct
gacctttaaattccctggggcctccagtctcttgagggttaggtgcatca
tctctgattgaacacagacccagcagtctgtatgtgtgttgggggcctca
tatcagctggtgtatgctggctgtttggtagtccagtgtttgagaggatc
tcaggtccaggttaattgaagactgctggtcttctacagggtcacttttc
cctttagctctttcaggccattcctaattggaccaggaggggtcagtcct
tctgtc

gaattcttatgtcttatttcaaaaatctgtacagaagaaaattggaaaat
ctaaagaaatgaaatgcttttttgattgatattctttaacaatgttaatt
caagatcagacaaagaaattaaatagacttatagctcctaaggaaataaa
agcactcatttaaagtctcctaattataaactaaaagcccagggctagat
ggattcagagcagatttctaccagattttcgaagatgaggacatatctgg
gggcttgtaagaaaactccaggaaaccaagagatgagccttgtggcctca
gcttcttcaaaaacatggacttgttctcccattgtgtttcatacccctct
cgaagtagcaaataggaatgatttgagtttaagtaattcattacaactag
atattgttagtagcttatagacttccagggtaaaaaagaaaacaaatatt
tgtctataaataagctatgcagagcttgtcttccatttgtggattgcctg
tcatgtaacttgctttgtggttgtatgttttactcatgtgactcatctta
actctgatcgtaaattatctgatgctatgaataaaggtggctattgtatg
agactttagtgtgccttatttataagctctactttcccggatcccactga
cagctagagcattaaaaagtggtgcacagatcaggctcctgaacttggct
atgagatatgggagtgagggccctcattggaaggatttggtgatattata
ctttggcataatatctcaataaagatacacaaatatcaaaatcccaacta
ttagattgtcttcaagtcattcaggattataatttctggttttcagaagg
aacttcagaggaaaaagttttgatcagagaccaaaaaaacattgaaagag
ggaaaggatgaccattcagtttgagattatatacaaattaattcaaatta
ttttcaaaattcttaagaaatatcagaagaagcctgctgacaaggagcct
gatatagctgtcttccgaagagctctgcaagtgcctggcaaaatacagaa
gtgatgctcacagtcatcattgaatggagcacaggtccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_60450374_60451480
seq2: B6Ng01-250I07.b_45_1150 (reverse)

seq1  GACAGAAGGAACTGACCCCT-CTTGTTCAATTAGGAATGG-CTGAAAGAA  48
      ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |
seq2  GACAGAAGG-ACTGACCCCTCCTGGTCCAATTAGGAATGGCCTGAAAG-A  48

seq1  GCTAAGGGAAAAAGTGACCCTGTAGAAGGACCAGCAGTC-TCAATTAACC  97
      ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  GCTAAAGGGAAAAGTGACCCTGTAGAA-GACCAGCAGTCTTCAATTAACC  97

seq1  TGGACCCCTGAGAT-CTCTCAAACACTGGACTACCAAACAGCCAGCATAC  146
      ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGA--CCTGAGATCCTCTCAAACACTGGACTACCAAACAGCCAGCATAC  145

seq1  ACCAGCTGATATGAGGCCCCCAACACACATACAGACTGCTGGGTCTGTGT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCTGATATGAGGCCCCCAACACACATACAGACTGCTGGGTCTGTGT  195

seq1  TCAATCAGAGATGATGCACCTAACCCTCAAGAGACTGGAGGCCCCAGGGA  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCAGAGATGATGCACCTAACCCTCAAGAGACTGGAGGCCCCAGGGA  245

seq1  ATTTAAAGGTCAGGTGGGGGGTGTACGGGGATATCAACATGGAGACAGAG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAGGTCAGGTGGGGGGTGTACGGGGATATCAACATGGAGACAGAG  295

seq1  GGTGGGGAGCAGTACAGGATGTGGAGCAGTCGAGGGTGGATGGAACAGTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGGAGCAGTACAGGATGTGGAGCAGTCGAGGGTGGATGGAACAGTC  345

seq1  AAGGGTGGACTGGGAGCGGGGTATAAAATATAAAAATTAATTAATTATTA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGGACTGGGAGCGGGGTATAAAATATAAAAATTAATTAATTATTA  395

seq1  AAAAAACAATATCTGACTGGAGGACCCACTGGCTATTCAGTTTCTCTGGT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAATATCTGACTGGAGGACCCACTGGCTATTCAGTTTCTCTGGT  445

seq1  TAGAAGAAATCTCTGTGTTTAGTTGCCAAAATATCTTAATGATTATGACA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGAAATCTCTGTGTTTAGTTGCCAAAATATCTTAATGATTATGACA  495

seq1  TCTTACTGTAAGTAATCTCAATACTGTGTTAGGACCCTAGCATGGGGAAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACTGTAAGTAATCTCAATACTGTGTTAGGACCCTAGCATGGGGAAG  545

seq1  AATGTGAATTCTTTATAACTAAATTCTGTGTAAATATAATTACATAATTT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAATTCTTTATAACTAAATTCTGTGTAAATATAATTACATAATTT  595

seq1  TGGTATACTCTAATATTATCACCATCTTAACACTGAATTTCTAATGTTCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATACTCTAATATTATCACCATCTTAACACTGAATTTCTAATGTTCT  645

seq1  CCAGAAATAAGCTTCCACTTAATTGCACACATTTCACATTTCATGTTAGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAATAAGCTTCCACTTAATTGCACACATTTCACATTTCATGTTAGT  695

seq1  AGTCTTTATTTCTGTACAACAGAATGTTTTACAGCTCAAACCCATCTATT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTTATTTCTGTACAACAGAATGTTTTACAGCTCAAACCCATCTATT  745

seq1  GAGAAGTGGCAGGGATATTCTGACAGCTGCTAAGGACTGGAAATCCAAGT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTGGCAGGGATATTCTGACAGCTGCTAAGGACTGGAAATCCAAGT  795

seq1  TTAACCTGCTGGCAGGCCTACTGGACAGCCAGTCTTCTGTGGCTTCTTAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCTGCTGGCAGGCCTACTGGACAGCCAGTCTTCTGTGGCTTCTTAG  845

seq1  GAACAAGAGAAAGTACACACAGAAGAGATGGGGCCCTATTTGTGGATACT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGAGAAAGTACACACAGAAGAGATGGGGCCCTATTTGTGGATACT  895

seq1  CATCCTTTTCATGACATCTCCACTCTCATGACCTGGTTATATCTCTAAGG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCTTTTCATGACATCTCCACTCTCATGACCTGGTTATATCTCTAAGG  945

seq1  ACTCAACTCTACCTTCATCCACAATGAGGATCTTGATTCAATATTTAACT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAACTCTACCTTCATCCACAATGAGGATCTTGATTCAATATTTAACT  995

seq1  TGCAATAAGAGAATCAAAGAAACATAACCAGGACACAACTAGCTGGTTTT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAATAAGAGAATCAAAGAAACATAACCAGGACACAACTAGCTGGTTTT  1045

seq1  ACAACTCCAAAGAAGCAGGTCATTGTGAGACTGGTTCCACCTGCTAAGGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTCCAAAGAAGCAGGTCATTGTGAGACTGGTTCCACCTGCTAAGGA  1095

seq1  CATAAGAATTC  1107
      |||||||||||
seq2  CATAAGAATTC  1106


seq1: chr7_60310329_60311417
seq2: B6Ng01-250I07.g_66_1154

seq1  GAATTCTTATGTCTTATTTCAAAAATCTGTACAGAAGAAAATTGGAAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATGTCTTATTTCAAAAATCTGTACAGAAGAAAATTGGAAAAT  50

seq1  CTAAAGAAATGAAATGCTTTTTTGATTGATATTCTTTAACAATGTTAATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGAAATGAAATGCTTTTTTGATTGATATTCTTTAACAATGTTAATT  100

seq1  CAAGATCAGACAAAGAAATTAAATAGACTTATAGCTCCTAAGGAAATAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATCAGACAAAGAAATTAAATAGACTTATAGCTCCTAAGGAAATAAA  150

seq1  AGCACTCATTTAAAGTCTCCTAATTATAAACTAAAAGCCCAGGGCTAGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTCATTTAAAGTCTCCTAATTATAAACTAAAAGCCCAGGGCTAGAT  200

seq1  GGATTCAGAGCAGATTTCTACCAGATTTTCGAAGATGAGGACATATCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCAGAGCAGATTTCTACCAGATTTTCGAAGATGAGGACATATCTGG  250

seq1  GGGCTTGTAAGAAAACTCCAGGAAACCAAGAGATGAGCCTTGTGGCCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTGTAAGAAAACTCCAGGAAACCAAGAGATGAGCCTTGTGGCCTCA  300

seq1  GCTTCTTCAAAAACATGGACTTGTTCTCCCATTGTGTTTCATACCCCTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTTCAAAAACATGGACTTGTTCTCCCATTGTGTTTCATACCCCTCT  350

seq1  CGAAGTAGCAAATAGGAATGATTTGAGTTTAAGTAATTCATTACAACTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGTAGCAAATAGGAATGATTTGAGTTTAAGTAATTCATTACAACTAG  400

seq1  ATATTGTTAGTAGCTTATAGACTTCCAGGGTAAAAAAGAAAACAAATATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTGTTAGTAGCTTATAGACTTCCAGGGTAAAAAAGAAAACAAATATT  450

seq1  TGTCTATAAATAAGCTATGCAGAGCTTGTCTTCCATTTGTGGATTGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTATAAATAAGCTATGCAGAGCTTGTCTTCCATTTGTGGATTGCCTG  500

seq1  TCATGTAACTTGCTTTGTGGTTGTATGTTTTACTCATGTGACTCATCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTAACTTGCTTTGTGGTTGTATGTTTTACTCATGTGACTCATCTTA  550

seq1  ACTCTGATCGTAAATTATCTGATGCTATGAATAAAGGTGGCTATTGTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGATCGTAAATTATCTGATGCTATGAATAAAGGTGGCTATTGTATG  600

seq1  AGACTTTAGTGTGCCTTATTTATAAGCTCTACTTTCCCGGATCCCACTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTTTAGTGTGCCTTATTTATAAGCTCTACTTTCCCGGATCCCACTGA  650

seq1  CAGCTAGAGCATTAAAAAGTGGTGCACAGATCAGGCTCCTGAACTTGGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAGAGCATTAAAAAGTGGTGCACAGATCAGGCTCCTGAACTTGGCT  700

seq1  ATGAGATATGGGAGTGAGGGCCCTCATTGGAAGGATTTGGTGATATTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGATATGGGAGTGAGGGCCCTCATTGGAAGGATTTGGTGATATTATA  750

seq1  CTTTGGCATAATATCTCAATAAAGATACACAAATATCAAAATCCCAACTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGCATAATATCTCAATAAAGATACACAAATATCAAAATCCCAACTA  800

seq1  TTAGATTGTCTTCAAGTCATTCAGGATTATAATTTCTGGTTTTCAGAAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATTGTCTTCAAGTCATTCAGGATTATAATTTCTGGTTTTCAGAAGG  850

seq1  AACTTCAGAGGAAAAAGTTTTGATCAGAGACCAAAAAAACATTGAAAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCAGAGGAAAAAGTTTTGATCAGAGACCAAAAAAACATTGAAAGAG  900

seq1  GGAAAGGATGACCATTCAGTTTGAGATTATATACAAATTAATTCAAATTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGATGACCATTCAGTTTGAGATTATATACAAATTAATTCAAATTA  950

seq1  TTTTCAAAATTCTTAAGAAATATCAGAAG-AGCCTGCTGAC-AGGAGCCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  TTTTCAAAATTCTTAAGAAATATCAGAAGAAGCCTGCTGACAAGGAGCCT  1000

seq1  GATATAGCTGTCTCCCGAGAGGCTCTGCCAGTGCCTGGC-AAATACAGAA  1047
      ||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  GATATAGCTGTCTTCCGAAGAGCTCTGCAAGTGCCTGGCAAAATACAGAA  1050

seq1  GTGGATGCTCACAGTCATCCATTGGATGGAGCACAAGGTCCC  1089
      || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||
seq2  GT-GATGCTCACAGTCAT-CATTGAATGGAGCAC-AGGTCCC  1089


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |