BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-255F05
Chromosome7 (Build37)
Map Location 150,663,894 - 150,827,657
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSlc22a18, Phlda2, Nap1l4, Cars, Tnfrsf26, Tnfrsf22
Upstream geneLsp1, ENSMUSG00000043795, Tnnt3, Mrpl23, Nctc1, H19, Igf2, Igf2as, Ins2, EG640264, EG624121, Th, Ascl2, Tspan32, R74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1, Cdkn1c
Downstream geneTnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1, Fadd, Tmem16a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-255F05.bB6Ng01-255F05.g
ACCGA061558GA061559
length1,1671,119
definitionB6Ng01-255F05.b B6Ng01-255F05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,663,894 - 150,665,068)(150,826,531 - 150,827,657)
sequence
gaattcagagatgacactaggactttggacccaatcccaggaggacaaag
atgctaccagcggtgaagaaacattcgggagctaagagcactggttgctt
ttacaaaggatgggggtttgattcccagcacccacatgatgccccacaat
cacttggaaccatagtcctggggatatgatgtcctctgtgggcactacat
gtatgtggtacacagactatatgccagccaaacagtcatacacataaaat
aaaatgaaagaaaaaaataaataaaagaaacagtggtcaaggagccaatc
aggactaaggaggacaagtgctcggcgattgctacactcgctttcctgga
gatgatttcaggcatggtacaaagcaaaggaggcatgctggcagtgggaa
gaggcctggggctctctcagtgacagcctaggtaggagacccagggcagt
ctaggcacagggtcacagagaaagaagcaagccacctgagtcaggtgcca
atcagaggggcctgctggagttgccctgagctggacctcgtgaggagaga
ggaatgaggaaagcagccgcttcaggcaaggtgagagagaacacagctgg
agcagacacaggcgctaaggagggctgaacagggaggcactaaggaagag
tctttgtttaatgaccttgttggaaaggaggcctaccaggaaggcctcaa
gagaagagagggggactgaaggagtgttatccttggcatgaggctgaaga
ctcaggtaaaagacggtgggccaagatgttgggcggaggcacaggtttgg
agggagacagtacctcgggcttctgaaatgcagctgaggtggggataaaa
atcctggggttccaggactgcttgggtcctctatagaggctctgtcacct
cacttctcctatcagatagtcacacgcgcatacgcacacacacacacaca
cacacacacacacacacacatgaaggggttgagtcttaaggaattcacag
agcagactgtcttgctgggcagttggccacatctcagaagttatgaaagg
gtttgggcagtcgcttgctgccagggacaaatgctataaagctttgagaa
caaatattagatgacgttgctctgtaccacttgaagttgtgttcttgcac
aaggtagccagaagttt
gaattctttctttctctcagttgtcccacctcctatttcctgcctaagcc
ataggccatcagacttattgacagatgccacatccatacaaacataagac
attctctctatacagcctgatctacgttgtgagttctaggacatcatgac
tacacagagacatattgtcgcaaaaacaaaaacaaaaacaaaaaagacag
aaccattttccacgttcacagatccctgatgctgtaagacatctgcagag
agctgggctgagagtcctccctgcctgtgctccctgctgtattctgagaa
aggacaatgcctagattcagagaattgtgagaggtgacatttatagcttg
agtgtttatggtgtcctgaacacaaggttaaaatcgaacaccccaatggg
aaagccatcttcttttataagccactgagtaagtctcacttaaggaaggt
atacacccagagcccaagggcccactagggctctgggtacaagatcacta
ggtgctcttcagagaacaataaggtgattaaacaaagcatcttcagagat
gtctgatggacatggtggcttctggagagggaactttgtggggcagaggt
gtgtctacagatcaggaccacccatgttggagtccttaggggcagtgtga
tgctattacacaggatgctaaacaatggacctcccaagccatcatctctg
gtctgggtaccaccccagaggcccaaggatgagatactcccagtagtgct
gcttagcactccgtacatctgtgatgggaatgtgaaggtttaccaggaca
cattgtgttcctttcagtgacagtggggtctgtgtgcatatgtgaaggtt
tatactgcaacctgaccctattcttccctggattgcagatcaggaaatgg
tggccgactgctcagccaccagtgaccgggaaatgccagtgccgaacagg
tcttttactactatgacccaaatttccagaatcgtgccgcccatgtacag
taagtaccactgtactggtaggtggtagctttatatgttgctgatagcct
ctatgtccagggagaggacagtcttgtctcataccttgcagatgaccttt
ggtgtggtgaaactttgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_150663894_150665068
seq2: B6Ng01-255F05.b_43_1209

seq1  GAATTCAGAGATGACACTAGGACTTTGGACCCAATCCCAGGAGGACAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGATGACACTAGGACTTTGGACCCAATCCCAGGAGGACAAAG  50

seq1  ATGCTACCAGCGGTGAAGAAACATTCGGGAGCTAAGAGCACTGGTTGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTACCAGCGGTGAAGAAACATTCGGGAGCTAAGAGCACTGGTTGCTT  100

seq1  TTACAAAGGATGGGGGTTTGATTCCCAGCACCCACATGATGCCCCACAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAGGATGGGGGTTTGATTCCCAGCACCCACATGATGCCCCACAAT  150

seq1  CACTTGGAACCATAGTCCTGGGGATATGATGTCCTCTGTGGGCACTACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGAACCATAGTCCTGGGGATATGATGTCCTCTGTGGGCACTACAT  200

seq1  GTATGTGGTACACAGACTATATGCCAGCCAAACAGTCATACACATAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTGGTACACAGACTATATGCCAGCCAAACAGTCATACACATAAAAT  250

seq1  AAAATGAAAGAAAAAAATAAATAAAAGAAACAGTGGTCAAGGAGCCAATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAAAGAAAAAAATAAATAAAAGAAACAGTGGTCAAGGAGCCAATC  300

seq1  AGGACTAAGGAGGACAAGTGCTCGGCGATTGCTACACTCGCTTTCCTGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTAAGGAGGACAAGTGCTCGGCGATTGCTACACTCGCTTTCCTGGA  350

seq1  GATGATTTCAGGCATGGTACAAAGCAAAGGAGGCATGCTGGCAGTGGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGATTTCAGGCATGGTACAAAGCAAAGGAGGCATGCTGGCAGTGGGAA  400

seq1  GAGGCCTGGGGCTCTCTCAGTGACAGCCTAGGTAGGAGACCCAGGGCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCTGGGGCTCTCTCAGTGACAGCCTAGGTAGGAGACCCAGGGCAGT  450

seq1  CTAGGCACAGGGTCACAGAGAAAGAAGCAAGCCACCTGAGTCAGGTGCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCACAGGGTCACAGAGAAAGAAGCAAGCCACCTGAGTCAGGTGCCA  500

seq1  ATCAGAGGGGCCTGTTGGAGTTGCCCTGAGCTGGACCTCGTGAGGAGAGA  550
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAGGGGCCTGCTGGAGTTGCCCTGAGCTGGACCTCGTGAGGAGAGA  550

seq1  GGAATGAGGAAAGCAGCCGCTTCAGGCAAGGTGAGAGAGAACACAGCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGAGGAAAGCAGCCGCTTCAGGCAAGGTGAGAGAGAACACAGCTGG  600

seq1  AGCAGACACAGGCGCTAAGGAGGGCTGAACAGGGAGGCACTAAGGAAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACACAGGCGCTAAGGAGGGCTGAACAGGGAGGCACTAAGGAAGAG  650

seq1  TCTTTGTTTAATGACCTTGTTGGAAAGGAGGCCTACCAGGAAGGCCTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTTAATGACCTTGTTGGAAAGGAGGCCTACCAGGAAGGCCTCAA  700

seq1  GAGAAGAGAGGGGGACTGAAGGAGTGTTATCCTTGGCATGAGGCTGAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAGAGGGGGACTGAAGGAGTGTTATCCTTGGCATGAGGCTGAAGA  750

seq1  CTCAGGTAAAAGACGGTGGGCCAAGATGTTGGGCGGAGGCACAGGTTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGTAAAAGACGGTGGGCCAAGATGTTGGGCGGAGGCACAGGTTTGG  800

seq1  AGGGAGACAGTACCTCGGGCTTCTGAAATGCAGCTGAGGTGGGGAT-AAA  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGGGAGACAGTACCTCGGGCTTCTGAAATGCAGCTGAGGTGGGGATAAAA  850

seq1  ATCCTGGGGTTCCAGGACTGCTTGGGTCCTCTATAGAGGCTCTGTCACCT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGGGTTCCAGGACTGCTTGGGTCCTCTATAGAGGCTCTGTCACCT  900

seq1  CACTTCTCCTATCAGATAGTCACACGCGCATACGCACACACACACACACA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTCCTATCAGATAGTCACACGCGCATACGCACACACACACACACA  950

seq1  CACACACACACACACACACATG-AGGGGTTGAGTCCTAAGGAATTCACAG  998
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACATGAAGGGGTTGAGTCTTAAGGAATTCACAG  1000

seq1  AGCAGACTGTCTTGCTGGGCAGTGGGCCACATCTCAGAAGTTATGAAGGG  1048
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGCAGACTGTCTTGCTGGGCAGTTGGCCACATCTCAGAAGTTATGAAAGG  1050

seq1  GTTTGGGGGCAGTCGCTTGCTGGCCAGGGGACAATGCTATAAAGCTTTGA  1098
      ||||  ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| 
seq2  GTTT--GGGCAGTCGCTTGCT-GCCAGGGACAAATGCTATAAAGCTTTG-  1096

seq1  AGACAAAATATTAAGGATGGACGTTGCTCTGTGGCCCACTTGAAG-TGTG  1147
      |||  ||||||||  ||| |||||||||||||   |||||||||| ||||
seq2  AGAACAAATATTA--GAT-GACGTTGCTCTGT--ACCACTTGAAGTTGTG  1141

seq1  -TCCTGCACAGGGGGTAAGCCAGAAGTTT  1175
       || |||||| ||    ||||||||||||
seq2  TTCTTGCACAAGG---TAGCCAGAAGTTT  1167

seq1: chr7_150826531_150827657
seq2: B6Ng01-255F05.g_66_1184 (reverse)

seq1  CACAAAGTCTCCACCACAC--AATGTCATCTGCCAAAGTATGAGAC-AGA  47
      |||||||| | ||||||||  || |||||||| ||| ||||||||| |||
seq2  CACAAAGT-TTCACCACACCAAAGGTCATCTG-CAAGGTATGAGACAAGA  48

seq1  CTGTCCCTCTCCCTGGACATTAGAGGCTATTCAGGCAACATATAAAGCTA  97
      |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||
seq2  CTGT-CCTCTCCCTGGACA-TAGAGGCTA-TCA-GCAACATATAAAGCTA  94

seq1  CCACCTACCCAGGCCACAGTGGTACTTACTTGGTACATGGGCGGCACGAT  147
      ||||||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||
seq2  CCACCTA-CCAG--TACAGTGGTACTTACT--GTACATGGGCGGCACGAT  139

seq1  TCTGGAAATTTTGGGTCATAGTAGT-AAAGACCTGTTCGGCACTGGCATT  196
      |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAA-TTTGGGTCATAGTAGTAAAAGACCTGTTCGGCACTGGCATT  188

seq1  T-CCGGTCACTGGTGGCTGAGCAGTCGGCCACCATTTCCTGATCTGCAAT  245
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCGGTCACTGGTGGCTGAGCAGTCGGCCACCATTTCCTGATCTGCAAT  238

seq1  CCAGGGAAGAATAGGGTCAGGTTGCAGTATAAACCTTCACATATGCACAC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGAAGAATAGGGTCAGGTTGCAGTATAAACCTTCACATATGCACAC  288

seq1  AGACCCCACTGTCACCTGAAAGGAACACAATGTGTCCTGGTAAACCTTCA  345
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCCACTGTCA-CTGAAAGGAACACAATGTGTCCTGGTAAACCTTCA  337

seq1  CATTCCCATCACAGATGTACGGAGTGCTAAGCAGCACTACTGGGAGTATC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCCATCACAGATGTACGGAGTGCTAAGCAGCACTACTGGGAGTATC  387

seq1  TCATCCTTGGGCCTCTGGGGTGGTACCCAGACCAGAGATGATGGCTTGGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTTGGGCCTCTGGGGTGGTACCCAGACCAGAGATGATGGCTTGGG  437

seq1  AGGTCCATTGTTTAGCATCCTGTGTAATAGCATCACACTGCCCCTAAGGA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCCATTGTTTAGCATCCTGTGTAATAGCATCACACTGCCCCTAAGGA  487

seq1  CTCCAACATGGGTGGTCCTGATCTGTAGACACACCTCTGCCCCACAAAGT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAACATGGGTGGTCCTGATCTGTAGACACACCTCTGCCCCACAAAGT  537

seq1  TCCCTCTCCAGAAGCCACCATGTCCATCAGACATCTCTGAAGATGCTTTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTCCAGAAGCCACCATGTCCATCAGACATCTCTGAAGATGCTTTG  587

seq1  TTTAATCACCTTATTGTTCTCTGAAGAGCACCTAGTGATCTTGTACCCAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCACCTTATTGTTCTCTGAAGAGCACCTAGTGATCTTGTACCCAG  637

seq1  AGCCCTAGTGGGCCCTTGGGCTCTGGGTGTATACCTTCCTTAAGTGAGAC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTAGTGGGCCCTTGGGCTCTGGGTGTATACCTTCCTTAAGTGAGAC  687

seq1  TTACTCAGTGGCTTATAAAAGAAGATGGCTTTCCCATTGGGGTGTTCGAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCAGTGGCTTATAAAAGAAGATGGCTTTCCCATTGGGGTGTTCGAT  737

seq1  TTTAACCTTGTGTTCAGGACACCATAAACACTCAAGCTATAAATGTCACC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAACCTTGTGTTCAGGACACCATAAACACTCAAGCTATAAATGTCACC  787

seq1  TCTCACAATTCTCTGAATCTAGGCATTGTCCTTTCTCAGAATACAGCAGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACAATTCTCTGAATCTAGGCATTGTCCTTTCTCAGAATACAGCAGG  837

seq1  GAGCACAGGCAGGGAGGACTCTCAGCCCAGCTCTCTGCAGATGTCTTACA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACAGGCAGGGAGGACTCTCAGCCCAGCTCTCTGCAGATGTCTTACA  887

seq1  GCATCAGGGATCTGTGAACGTGGAAAATGGTTCTGTCTTTTTTGTTTTTG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAGGGATCTGTGAACGTGGAAAATGGTTCTGTCTTTTTTGTTTTTG  937

seq1  TTTTTGTTTTTGCGACAATATGTCTCTGTGTAGTCATGATGTCCTAGAAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTGTTTTTGCGACAATATGTCTCTGTGTAGTCATGATGTCCTAGAAC  987

seq1  TCACAACGTAGATCAGGCTGTATAGAGAGAATGTCTTATGTTTGTATGGA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACGTAGATCAGGCTGTATAGAGAGAATGTCTTATGTTTGTATGGA  1037

seq1  TGTGGCATCTGTCAATAAGTCTGATGGCCTATGGCTTAGGCAGGAAATAG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCATCTGTCAATAAGTCTGATGGCCTATGGCTTAGGCAGGAAATAG  1087

seq1  GAGGTGGGACAACTGAGAGAAAGAAAGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGGGACAACTGAGAGAAAGAAAGAATTC  1119