BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256C14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 124,312,893 - 124,480,449
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePlekha7, Rps13, Pik3c2a, LOC100042798, Nucb2, LOC100043320, EG668484, LOC668485, LOC546993, LOC100043330
Downstream geneXylt1, LOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256C14.bB6Ng01-256C14.g
ACCGA062192GA062193
length1,0761,152
definitionB6Ng01-256C14.b B6Ng01-256C14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,479,381 - 124,480,449)(124,312,893 - 124,314,040)
sequence
gaattctccttcgcctaggacgtgtcactccctgattggctgcagcccat
cggccgagttgacgtcacggggaaggcagagcacatggagtgaagaacca
ccctcggcacatgcgcagattatttgtttaccacttagaacacagctgtc
agcgccatcttgtaacggcgaatgtgggcgcggctcccaacaaggtttag
cacactgagctgtttgattttggtaaatagacgaaaaaccaaactgaccc
ggaggtgcacacagaataggagaacaggtacagaatacttctaggggaca
ctgcagtgtatcccagcctctcactgaactttcactctggtccacagtca
cctttcgctatagaagctgggttccagctctccctgcctcccttgtagtt
agactaaaaatctcatctctagacatcattttggaagctggtactggtca
tagtggaagtaatttttgcacagcttcaagggtagcaagaaaggaacaga
tgtcctaggagagtgttcaggcctgggcatcacaaggttttgaagtccac
cgcagggaaagtcgtcgtctctcctattcacctcctcgtgaatcgtcctt
gatgtcgactcaaaagctgcaccagtttctattgctgttgcaagaaatga
ccacacgctgcatggcttgtggcaatcatggttctctcactgttctgggg
tttggagatgaacatcatggtgtcaggaaggctgctgtccctgtgatgtt
ttaagagagaaacttctttgtttttttgttttgttttgttttgttttgtt
ttgttttactagcttctggtggccactagtaatccttgatttgttgtctc
atttccatctctgcctctgtattcctatggtcttctattatgatatagta
ataattcatctctctcatctctttactttgttgttgacaggatgtcactg
tacagtgtatactaatataggctgtcctcaaaccttggtcctcctgtctc
ataccctttttatattttaatgtttttatatcttatcaatctatcatcta
tccagtggttgttggtgttgtgtgtt
gaattctcaaaaacaaacaaacaaataaacaaacaaatgaaaaagacaaa
aatatagaatcatgcttaacatatgacccaactctacccctcatgaatat
ttgctcagagaatgccaaataaacaggggcagttacataatgcagcataa
atatgaagagcatcacaaccacaccactaacaacaaaggaactcttatcc
aaatgtgccactgcactaaaaacaatgaaactcttatctggctgtgcctt
tcattcacttaacaacatatatcttagccagggggtggtggttcatgcct
ttaatcccagcactcgggaggcagaggcaggtggatctctataagttaac
ctggtttacagagtgagttccaggaaagccaatgctacacagaaaaaccc
tgccttagaaaaaaataaaatgaaacaaaacatacaaaacaatgtgaatc
tcccaacatcatactggaaaagtgtgattcggttttataaatgtaaaact
aagagccagaggagactctaacacaagagatagggctaaccactgaaact
ccataattcccggtagttatttgcaaatgggtcaatcccttgtaggtaag
gatgtaatttggctgcacagaaattgttttgtcatagcagaggtcagatg
tgaaagctactagcctctgtttacgagagagcagacacattaccaattgt
cctacaactcacaggatagcagcagttaccctagacacttcctccatatg
tcagttatgttggagtatagaatcctggactctacctcaaatcccttatg
gggccattctgctcagagccaattagctccttagcatgtgacaggattga
agattcctatgctatgttgagtaaatgttttttttttttttaacacagaa
tgccttgtctcacagcttaaagtgtaaaggaacagcttgaaagtcaaaat
ttcatttttgacttattttttgacataagatgactttttgtgatgaaatt
ctgagaaaataacaggcatgtgggcactgcaaacccacctgtttacatct
gtgattttttggttttggttttggtttttttcagatgggaaatgtacgcc
tagccagttgaactcctagtgaatattcatgaccccaccttaagtttcta
at
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_124479381_124480449
seq2: B6Ng01-256C14.b_45_1119 (reverse)

seq1  ACACACACACACC-ACA--CACTGGATAGATGATAGATTTGAT-AGATAT  46
      ||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||
seq2  ACACACA-ACACCAACAACCACTGGATAGATGATAGA-TTGATAAGATAT  48

seq1  -AAAACATTTAAATAT-AAAAGGGTATGAGACAGGAGGACC-AGGTTTGA  93
       |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  AAAAACATTAAAATATAAAAAGGGTATGAGACAGGAGGACCAAGGTTTGA  98

seq1  GGACAGCCTATATTAGTATACACTGTACAGTGACATCCTGTCAACAACAA  143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGCCTATATTAGTATACACTGTACAGTGACATCCTGTCAACAACAA  148

seq1  AGTAAAGAGATGAGAGAGATGAATTATTACTATATCATAATAGAAGACCA  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAGAGATGAGAGAGATGAATTATTACTATATCATAATAGAAGACCA  198

seq1  TAGGAATACAGAGGCAGAGATGG-AATGAGACAACAAATCAAGGATTACT  242
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATACAGAGGCAGAGATGGAAATGAGACAACAAATCAAGGATTACT  248

seq1  AGTGGCCACCAGAAGCTAGTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCACCAGAAGCTAGTAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC  298

seq1  AAAAAAACAAAGAAGTTTCTCTCTTAAAACATCACAGGGACAGCAGCCTT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAACAAAGAAGTTTCTCTCTTAAAACATCACAGGGACAGCAGCCTT  348

seq1  CCTGACACCATGATGTTCATCTCCAAACCCCAGAACAGTGAGAGAACCAT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGACACCATGATGTTCATCTCCAAACCCCAGAACAGTGAGAGAACCAT  398

seq1  GATTGCCACAAGCCATGCAGCGTGTGGTCATTTCTTGCAACAGCAATAGA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGCCACAAGCCATGCAGCGTGTGGTCATTTCTTGCAACAGCAATAGA  448

seq1  AACTGGTGCAGCTTTTGAGTCGACATCAAGGACGATTCACGAGGAGGTGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGTGCAGCTTTTGAGTCGACATCAAGGACGATTCACGAGGAGGTGA  498

seq1  ATAGGAGAGACGACGACTTTCCCTGCGGTGGACTTCAAAACCTTGTGATG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAGAGACGACGACTTTCCCTGCGGTGGACTTCAAAACCTTGTGATG  548

seq1  CCCAGGCCTGAACACTCTCCTAGGACATCTGTTCCTTTCTTGCTACCCTT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCCTGAACACTCTCCTAGGACATCTGTTCCTTTCTTGCTACCCTT  598

seq1  GAAGCTGTGCAAAAATTACTTCCACTATGACCAGTACCAGCTTCCAAAAT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCTGTGCAAAAATTACTTCCACTATGACCAGTACCAGCTTCCAAAAT  648

seq1  GATGTCTAGAGATGAGATTTTTAGTCTAACTACAAGGGAGGCAGGGAGAG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTAGAGATGAGATTTTTAGTCTAACTACAAGGGAGGCAGGGAGAG  698

seq1  CTGGAACCCAGCTTCTATAGCGAAAGGTGACTGTGGACCAGAGTGAAAGT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAACCCAGCTTCTATAGCGAAAGGTGACTGTGGACCAGAGTGAAAGT  748

seq1  TCAGTGAGAGGCTGGGATACACTGCAGTGTCCCCTAGAAGTATTCTGTAC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGAGAGGCTGGGATACACTGCAGTGTCCCCTAGAAGTATTCTGTAC  798

seq1  CTGTTCTCCTATTCTGTGTGCACCTCCGGGTCAGTTTGGTTTTTCGTCTA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTCCTATTCTGTGTGCACCTCCGGGTCAGTTTGGTTTTTCGTCTA  848

seq1  TTTACCAAAATCAAACAGCTCAGTGTGCTAAACCTTGTTGGGAGCCGCGC  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCAAAATCAAACAGCTCAGTGTGCTAAACCTTGTTGGGAGCCGCGC  898

seq1  CCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTGGTAA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATTCGCCGTTACAAGATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTGGTAA  948

seq1  ACAAATAATCTGCGCATGTGCCGAGGGTGGTTCTTCACTCCATGTGCTCT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATAATCTGCGCATGTGCCGAGGGTGGTTCTTCACTCCATGTGCTCT  998

seq1  GCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCCCCGTGACGTCAACTCGGCCGATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAG  1048

seq1  TGACACGTCCTAGGCGAAGGAGAATTC  1069
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACGTCCTAGGCGAAGGAGAATTC  1075

seq1: chr7_124312893_124314040
seq2: B6Ng01-256C14.g_63_1214

seq1  GAATTCTCAAAAACAAACAAACAAATAAACAAACAAATGAAAAAGACAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAAAAACAAACAAACAAATAAACAAACAAATGAAAAAGACAAA  50

seq1  AATATAGAATCATGCTTAACATATGACCCAACTCTACCCCTCATGAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAGAATCATGCTTAACATATGACCCAACTCTACCCCTCATGAATAT  100

seq1  TTGCTCAGAGAATGCCAAATAAACAGGGGCAGTTACATAATGCAGCATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCAGAGAATGCCAAATAAACAGGGGCAGTTACATAATGCAGCATAA  150

seq1  ATATGAAGAGCATCACAACCACACCACTAACAACAAAGGAACTCTTATCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAGAGCATCACAACCACACCACTAACAACAAAGGAACTCTTATCC  200

seq1  AAATGTGCCACTGCACTAAAAACAATGAAACTCTTATCTGGCTGTGCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGCCACTGCACTAAAAACAATGAAACTCTTATCTGGCTGTGCCTT  250

seq1  TCATTCACTTAACAACATATATCTTAGCCAGGGGGTGGTGGTTCATGCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCACTTAACAACATATATCTTAGCCAGGGGGTGGTGGTTCATGCCT  300

seq1  TTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCTATAAGTTAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCTATAAGTTAAC  350

seq1  CTGGTTTACAGAGTGAGTTCCAGGAAAGCCAATGCTACACAGAAAAACCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTACAGAGTGAGTTCCAGGAAAGCCAATGCTACACAGAAAAACCC  400

seq1  TGCCTTAGAAAAAAATAAAATGAAACAAAACATACAAAACAATGTGAATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTAGAAAAAAATAAAATGAAACAAAACATACAAAACAATGTGAATC  450

seq1  TCCCAACATCATACTGGAAAAGTGTGATTCGGTTTTATAAATGTAAAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAACATCATACTGGAAAAGTGTGATTCGGTTTTATAAATGTAAAACT  500

seq1  AAGAGCCAGAGGAGACTCTAACACAAGAGATAGGGCTAACCACTGAAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCCAGAGGAGACTCTAACACAAGAGATAGGGCTAACCACTGAAACT  550

seq1  CCATAATTCCCGGTAGTTATTTGCAAATGGGTCAATCCCTTGTAGGTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAATTCCCGGTAGTTATTTGCAAATGGGTCAATCCCTTGTAGGTAAG  600

seq1  GATGTAATTTGGCTGCACAGAAATTGTTTTGTCATAGCAGAGGTCAGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAATTTGGCTGCACAGAAATTGTTTTGTCATAGCAGAGGTCAGATG  650

seq1  TGAAAGCTACTAGCCTCTGTTTACGAGAGAGCAGACACATTACCAATTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGCTACTAGCCTCTGTTTACGAGAGAGCAGACACATTACCAATTGT  700

seq1  CCTACAACTCACAGGATAGCAGCAGTTACCCTAGACACTTCCTCCATATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACAACTCACAGGATAGCAGCAGTTACCCTAGACACTTCCTCCATATG  750

seq1  TCAGTTATGTTGGAGTATAGAATCCTGGACTCTACCTCAAATCCCTTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTATGTTGGAGTATAGAATCCTGGACTCTACCTCAAATCCCTTATG  800

seq1  GGGCCATTCTGCTCAGAGCCAATTAGCTCCTTAGCATGTGACAGGATTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATTCTGCTCAGAGCCAATTAGCTCCTTAGCATGTGACAGGATTGA  850

seq1  AGATTCCTATGCTATGTTGAGTAAATGTTTTTTTTTTTTTAAACACAGAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGATTCCTATGCTATGTTGAGTAAATGTTTTTTTTTTTTTTAACACAGAA  900

seq1  TGCCTTGTCTCACAGCTTAAAGTGTAAAGGAACAGCTTGAAAGTCAAAAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTGTCTCACAGCTTAAAGTGTAAAGGAACAGCTTGAAAGTCAAAAT  950

seq1  TTCATTTTTGACTTA-TTTTTGACAATAAGATGAC-TTTTGTGATGAAAT  998
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCATTTTTGACTTATTTTTTGAC-ATAAGATGACTTTTTGTGATGAAAT  999

seq1  TCTGAGAAAAT-ACAGGCATGTGGGCACTGCAAACCCACCTGTTTACATC  1047
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAAAATAACAGGCATGTGGGCACTGCAAACCCACCTGTTTACATC  1049

seq1  TGGTGATTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCAAGATGGAAATTGGAAA  1097
      | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| || | | | 
seq2  T-GTGATTTTTTGGTTTTGGTTTTGGTTTTTTTCAGATGGGAAAT-GTAC  1097

seq1  GGCTAG-CAG-TGAA-TCCTAGTGAAATATTCATGACCCCACCT--AATT  1142
      | |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  | ||
seq2  GCCTAGCCAGTTGAACTCCTAGTG-AATATTCATGACCCCACCTTAAGTT  1146

seq1  TCTAAT  1148
      ||||||
seq2  TCTAAT  1152