BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-260L02
Chromosome7 (Build37)
Map Location 60,363,862 - 60,520,982
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm1865
Upstream geneEG620782, LOC100040692
Downstream geneLOC100040718, LOC668789
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-260L02.bB6Ng01-260L02.g
ACCGA065552GA065553
length1,104791
definitionB6Ng01-260L02.b B6Ng01-260L02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,519,896 - 60,520,982)(60,363,862 - 60,364,570)
sequence
gaattccacacccctaagccccttaccccataaaaacccctagcttctga
gccttgtggtcgaatccactgtctcctgcgtgagataacatttcgaccca
gagctccaccattaaactacctcgtatttttagatcaaggcaatgtgttc
tgttcgtgattcttgggtgcacgctgaatcaggagttgagtgagagtttc
cccactaggttctttcacatccttcaggttctttccaaaaccctgatagg
agatatcaaatgaaggaatgtcctccaaaacaagtggttgtggtaaaaac
caaacaatcaaacaaagcaaaatgaaaaccaaacatcaaagaaacagcaa
aaacgtatatatctagatctctatgatatatatgtatatcatagagatgt
atgtaggtgtgtgcatgtgtatgtatatatatatatatacattatatata
tatatatacattataaatatatatatatatacatatacatgcatacatac
gacatgacagacagaacagacagaaggggcatgcccatttgagccaaagc
agccttttagtatgaggtggttgtagtctttgagttctttgagacaaata
ttttcaacaaagaatagaagcattacttacagagaaaaggctgttccatt
tctagaaatagtatgttatagtaaatgtctttagctttgacaccactcct
gccattcttggatctcatgctcattcctgttcacaggcaatatatcagac
tagccagagagctccatgggcactaatacactgtgttacaatgcttttat
gagatggatttttttagtttcatccaatttgtagagagactgtaaaatga
tgatgggaaactcacttgtacatttttacatagatagtaatgagttttct
caaaatcaactgctatgacacttgacagagtttcaataactttacccttg
attgccttcctgcagtgattatagaatcagatgggaaagttaaatcatta
gatcttcctattctttaatttaagacactggtccctcacccacaaatttg
aattcttccattgaataaatgtggtcattaaaagaacaagaaccttatga
ataa
gaattcaggaaaaaaaggtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgttcataatggtacagtgtgtacacatctttgtgagg
atcaaggtaacctcagatttcctgaatcagaagccattcgctttgttttg
cctggtcctttagattgttaattagtttgattgttggagacgggatcttc
ctgtgtgacctgaggtttgggtattatactagactgaaataagagcaagt
cctccagatttgtacagggtgttctgatgttaaggtcctgttcctcacct
ggttcttgatctgtcactgactatgccaggggctaattatgggacagaag
gaaagaggcgggacttcccattccccagaggaagagatgcaaaggaggaa
gggtgctttctccatgcattggagagagaaaacgtgacctgccatgtgag
acctcaggcagaacgaccataggctgcttctccaggtgggagctcggact
aaaggtaactaagcaactgaagctgagagcagggtgagagatgctgagct
aggagtattaggaagggcactagctgaggaaggcttagaagatcacagca
tttgagccagtaaggcaggtagaaactgagcaatgtgtttgtctgtgttt
tttcatcatcggacccaatattctctgggcaggggctgatattgtggtct
gcccagagcttaaagcagggtagcaaatgctctatggtactcagatcttc
ctgtctgcctttccagcacttggattacatcagatgcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_60519896_60520982
seq2: B6Ng01-260L02.b_44_1147 (reverse)

seq1  TTATTCATAAG--TCTTG-TCTTT--ATGA-CACATTTA-TCAATG--AG  41
      |||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||  ||
seq2  TTATTCATAAGGTTCTTGTTCTTTTAATGACCACATTTATTCAATGGAAG  50

seq1  -ATTCAATTTTGTGGGTGAGGGA-CAGTGTCTTTAAATTAAAGAATA-GA  88
       |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||
seq2  AATTCAAATTTGTGGGTGAGGGACCAGTGTC-TTAAATTAAAGAATAGGA  99

seq1  AGATCTAATGATTTAACTT--CCATCTGATTCTATAATCACTGCAGGAAG  136
      |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTAATGATTTAACTTTCCCATCTGATTCTATAATCACTGCAGGAAG  149

seq1  GCAATCAAGG--TAAGTTATTGAAACTCTGTCAAGTGTCATAGCAGTTGA  184
      ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATCAAGGGTAAAGTTATTGAAACTCTGTCAAGTGTCATAGCAGTTGA  199

seq1  TTTTGAGAAAACTCATTACTATCTATGTAAAAATGTACAAGTGAG-TTCC  233
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTTTGAGAAAACTCATTACTATCTATGTAAAAATGTACAAGTGAGTTTCC  249

seq1  CATCATCATTTTACAGTCTCTCTAC-AATTGGATGAAACTAAAAAAATCC  282
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATCATTTTACAGTCTCTCTACAAATTGGATGAAACTAAAAAAATCC  299

seq1  ATCTCATAAAAGCATTGTAACACAGTGTATTAGTGCCCATGGAGCTCTCT  332
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATAAAAGCATTGTAACACAGTGTATTAGTGCCCATGGAGCTCTCT  349

seq1  GGCTAGTCTGATATATTGCCTGTGAACAGGAATGAGCATGAGATCCAAGA  382
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGTCTGATATATTGCCTGTGAACAGGAATGAGCATGAGATCCAAGA  399

seq1  ATGGCAGGAGTGGTGTCAAAGCTAAAGACATTTACTATAACATACTATTT  432
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGGAGTGGTGTCAAAGCTAAAGACATTTACTATAACATACTATTT  449

seq1  CTAGAAATGGAACAGCCTTTTCTCTGTAAGTAATGCTTCTATTCTTTGTT  482
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAATGGAACAGCCTTTTCTCTGTAAGTAATGCTTCTATTCTTTGTT  499

seq1  GAAAATATTTGTCTCAAAGAACTCAAAGACTACAACCACCTCATACTAAA  532
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATATTTGTCTCAAAGAACTCAAAGACTACAACCACCTCATACTAAA  549

seq1  AGGCTGCTTTGGCTCAAATGGGCATGCCCCTTCTGTCTGTTCTGTCTGTC  582
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGCTTTGGCTCAAATGGGCATGCCCCTTCTGTCTGTTCTGTCTGTC  599

seq1  ATGTCGTATGTATGCATGTATATGTATATATATATATATTTATAATGTAT  632
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCGTATGTATGCATGTATATGTATATATATATATATTTATAATGTAT  649

seq1  ATATATATATATAATGTATATATATATATATACATACACATGCACACACC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATAATGTATATATATATATATACATACACATGCACACACC  699

seq1  TACATACATCTCTATGATATACATATATATCATAGAGATCTAGATATATA  732
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACATCTCTATGATATACATATATATCATAGAGATCTAGATATATA  749

seq1  CGTTTTTGCTGTTTCTTTGATGTTTGGTTTTCATTTTGCTTTGTTTGATT  782
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTTTGCTGTTTCTTTGATGTTTGGTTTTCATTTTGCTTTGTTTGATT  799

seq1  GTTTGGTTTTTACCACAACCACTTGTTTTGGAGGACATTCCTTCATTTGA  832
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGTTTTTACCACAACCACTTGTTTTGGAGGACATTCCTTCATTTGA  849

seq1  TATCTCCTATCAGGGTTTTGGAAAGAACCTGAAGGATGTGAAAGAACCTA  882
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCCTATCAGGGTTTTGGAAAGAACCTGAAGGATGTGAAAGAACCTA  899

seq1  GTGGGGAAACTCTCACTCAACTCCTGATTCAGCGTGCACCCAAGAATCAC  932
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGAAACTCTCACTCAACTCCTGATTCAGCGTGCACCCAAGAATCAC  949

seq1  GAACAGAACACATTGCCTTGATCTAAAAATACGAGGTAGTTTAATGGTGG  982
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGAACACATTGCCTTGATCTAAAAATACGAGGTAGTTTAATGGTGG  999

seq1  AGCTCTGGGTCGAAATGTTATCTCACGCAGGAGACAGTGGATTCGACCAC  1032
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGGGTCGAAATGTTATCTCACGCAGGAGACAGTGGATTCGACCAC  1049

seq1  AAGGCTCAGAAGCTAGGGGTTTTTATGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGG  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTCAGAAGCTAGGGGTTTTTATGGGGTAAGGGGCTTAGGGGTGTGG  1099

seq1  AATTC  1087
      |||||
seq2  AATTC  1104

seq1: chr7_60363862_60364570
seq2: B6Ng01-260L02.g_63_768

seq1  GAATTCAGGAAAAAAAGGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGAAAAAAAGGTGTGTGTGTA----TGTGTGTGTGTGTGTGTG  46

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATAATGGTACAGTGTGTACACATCTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATAATGGTACAGTGTGTACACATCTTTGT  96

seq1  GAGGATCAAGGTAACCTCAGATTTCCTGAATCAGAAGCCATTCGCTTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATCAAGGTAACCTCAGATTTCCTGAATCAGAAGCCATTCGCTTTGT  146

seq1  TTTGCCTGGTCCTTTAGATTGTTAATTAGTTTGATTGTTGGAGACGGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTGGTCCTTTAGATTGTTAATTAGTTTGATTGTTGGAGACGGGAT  196

seq1  CTTCCTGTGTGACCTGAGGTTTGGGTATTATACTAGACTGAAATAAGAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGTGTGACCTGAGGTTTGGGTATTATACTAGACTGAAATAAGAGC  246

seq1  AAGTCCTCCAGATTTGTACAGGGTGTTCTGATGTTAAGGTCCTGTTCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCCTCCAGATTTGTACAGGGTGTTCTGATGTTAAGGTCCTGTTCCTC  296

seq1  ACCTGGTTCTTGATCTGTCACTGACTATGCCAGGGGCTAATTATGGGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGTTCTTGATCTGTCACTGACTATGCCAGGGGCTAATTATGGGACA  346

seq1  GAAGGAAAGAGGCGGGACTTCCCATTCCCCAGAGGAAGAGATGCAAAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAAAGAGGCGGGACTTCCCATTCCCCAGAGGAAGAGATGCAAAGGA  396

seq1  GGAAGGGTGCTTTCTCCATGCATTGGAGAGAGAAAACGTGACCTGCCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGGTGCTTTCTCCATGCATTGGAGAGAGAAAACGTGACCTGCCATG  446

seq1  TGAGACCTCAGGCAGAACGACCATAGGCTGCTTCTCCAGGTGGGAGCTCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACCTCAGGCAGAACGACCATAGGCTGCTTCTCCAGGTGGGAGCTCG  496

seq1  GACTAAAGGTAACTAAGCAACTGAAGCTGAGAGCAGGGTGAGAGATGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAAGGTAACTAAGCAACTGAAGCTGAGAGCAGGGTGAGAGATGCTG  546

seq1  AGCTAGGAGTATTAGGAAGGGCACTAGCTGAGGAAGGCTTAGAAGATCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGGAGTATTAGGAAGGGCACTAGCTGAGGAAGGCTTAGAAGATCAC  596

seq1  AGCATTTGAGCCAGTAAGGCAGGTAGAAACTGAGCAATGTGTTTGTCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTTGAGCCAGTAAGGCAGGTAGAAACTGAGCAATGTGTTTGTCTGT  646

seq1  G-TTTTTCATCATCGGACCCAATATTCTCTGGGCAGGGGCTGATATTGTG  699
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTTCATCATCGGACCCAATATTCTCTGGGCAGGGGCTGATATTGTG  696

seq1  GTCTGCCCAG  709
      ||||||||||
seq2  GTCTGCCCAG  706