BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-260L14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 148,289,426 - 148,435,177
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrp53i5, Ptdss2, Rnh1, LOC546015, Hras1, Lrrc56, 1600016N20Rik, Rassf7, AA673488
Upstream geneEchs1, Paox, Mtg1, Sprn, Olfr522, Olfr523, Olfr524, E430002D04Rik, 5830411N06Rik, EG622335, Olfr525, Olfr527, GA_x5J8B7W72BC-152913-152037, Olfr60, GA_x5J8B7W72BC-125691-125311, Olfr530, LOC622973, Olfr531, Olfr532, Olfr533, Olfr534-ps1, Olfr535, Olfr536, Olfr537-ps1, Olfr1523-ps1, Olfr538, Olfr1553-ps1, Olfr46, Olfr61, Olfr53, Olfr539, GA_x5J8B7W3EKE-4574231-4574913, Olfr45, Olfr541, GA_x5J8B7W3EKE-4522784-4521912, Cyp2e1, Syce1, LOC100043529, BC066028, 1190003J15Rik, Scgb1c1, Odf3, Bet1l, Ric8, Sirt3, Psmd13, LOC100043546, Cox8b, Nlrp6, Athl1, Ifitm5, Ifitm2, Ifitm1, LOC665143, Ifitm3, Ifitm6, B4galnt4, Pkp3, Sigirr
Downstream geneIrf7, Mucdhl, Sct, Drd4, Deaf1, Tmem80, Eps8l2, B230206H07Rik, Taldo1, LOC100043585, Pddc1, Cend1, Slc25a22, Lrdd, Rplp2, Pnpla2, Efcab4a, Cd151, Polr2l, Tspan4, Chid1, Ap2a2, Muc6, LOC100039649, Muc2, Muc5ac, Muc5b, Tollip, EG623757, Brsk2, 2700078K21Rik, Dusp8, LOC100039728, EG668763, LOC100043616, EG665295, LOC100043617, Krtap5-2, LOC100039757, LOC100039767, EG665305, Krtap5-5, EG640223
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-260L14.bB6Ng01-260L14.g
ACCGA065575GA065576
length1,1341,077
definitionB6Ng01-260L14.b B6Ng01-260L14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(148,434,070 - 148,435,177)(148,289,426 - 148,290,509)
sequence
gaattccactggatcttatgggaatccagactgataatgatgaaaaatca
caccgtgagtgctggatgtcaaacctgtaactatgcactttactgtgcac
agaagacaataaagtcaattaaaattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgcgctccacatatacagcctatcaagaacaactcgtactgct
agttctatctgtggattccggggatcccacttgggttatcaagcttggtg
gcaagcacctttatcttataagccattttgccagcccaataggtataatt
ttaagaggctacagattaattatgacccacctgggcaaagaggaatccct
aaatccacagagttgcatctactaggcacatcaaacactaatctgaagga
gaaggttgggtcactaagataagttcaggatgcagaggtggtctcagggt
tctaggtcccttctataatgtgtcaacagtatttgctacagtttacacta
gccccaggtatttatacacttaggaaatgcagcaggcatatcaacagcac
agggcatgacaacacatctgtaccaaacagtccagatgtgcttctttctc
cctagtagtctctaactaggtttacatgagcttgagtatagaacccacaa
atgtgaaagatgtactattcttctggctgagaaagttgcaggaataatca
gaaatgaccacatatctggactccagaatagagctgatggtgggaggcaa
gcccattatgtcagctttacctgccttccttttccgttttgcagggacac
gaaggtgtcaagggacgctggtatacagcagtgctcagcccagtggcgac
agcctcaatagttttcatccagcagagaagacatgaggtacccttggcac
atgctgcataacaagggacagcaccactcagtgggttgaccatccctttc
ccacgggatggaacactgaagctgggccatgtgagttggaatcccgtcag
tgcaagacttccctattcagatccctggaattatggtgcaaaactggacc
agaagaagccagactagttttaagactgaaactaccttcctaccagacag
tgtgacagcaatgaatcaccaagcagagttgttc
gaattcctgaaccccacctcaggactgaggctctccctgctgcttctccc
catgtctagcaactaagccatctgtttccctgacgtctgtcattctcact
atggaaagtcaggatgactgaggtcttgggctctctgatccgccattctt
ccatgtgatcaaagtcctgctcttccataaggtccccttggaggctgcaa
gctctccagacacatgtcagaggctcatgggagagccttgtcaggtgtgt
gttctagcctgcccttttctaggggttgagcccatgaggcttagttacca
tatctgacaacctaagggatgtctctagagtaatgggaggggctgcagtt
attacattgcttcaacgtggcctggcctgggctggtgaaaagcccaggat
tggaagttgctcttcccagcgccctggctgctctcctccactgtacaata
tgtgtgtgctctgacctatgtccttagccttgcgaggaaccaggcgccgc
tgtagtctgaccatcttgatggcatccagacggatttccacaaggttgct
gaagagcgccaacaggggtgcgagtgggaaagcagccacaaagatggtgg
taaagccgtactggatcactgcagggtgaaaaatctcactgtgtgtccag
tccagccacccactctttaccctgcacacccaccccatctgcccatccca
cagagcgccacacactcatctccatgaactcatcaaacaggctgaaggtg
ttgatgggattcatgtagtagttacgctgccactccttcagttctgggtc
tttggacatgtgaccatgtttggaagcccacattaagcgccatttatggg
ccaacaacctgtgggcacgaagaatatgggaacatacagaaagactgcag
ggcactggggatgggcactgcgggaggctgaagtggatggaaagaggtcc
tcacgggcacaggtactcaacgcagttgctcaggtttgcttcagcccatg
atgatggccatctggataacaggtccatcatgcagccactgaaatggcac
tgtgggccaacatgaggtcatggatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_148434070_148435177
seq2: B6Ng01-260L14.b_46_1179 (reverse)

seq1  GAACAACTCTGCTT-GTGA-TCA-TGCTGTC-CACTGT-TGGTTGGGAGG  45
      |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| || |||
seq2  GAACAACTCTGCTTGGTGATTCATTGCTGTCACACTGTCTGGTAGGAAGG  50

seq1  TAGTTTCAGTCTT-AAACTAGTCTGGCTTC-TCTGGT-CAG-TTTGCACC  91
      ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||
seq2  TAGTTTCAGTCTTAAAACTAGTCTGGCTTCTTCTGGTCCAGTTTTGCACC  100

seq1  ATA--TTCAGGGATCTGAAT--GGGAGTC-TGCACTGACGGGAT--CCAC  134
      |||  | |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||  | ||
seq2  ATAATTCCAGGGATCTGAATAGGGAAGTCTTGCACTGACGGGATTCCAAC  150

seq1  TCACATGGCCCAGC-TCAGTGTTCCAT-CCGTGGGAA--GGGTGGTC-AC  179
      |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || ||||| ||
seq2  TCACATGGCCCAGCTTCAGTGTTCCATCCCGTGGGAAAGGGATGGTCAAC  200

seq1  CCACTGAGTGGTGCTGTCCCTTG-TATGCAGCATGTGCCAA-GGTACCTC  227
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCACTGAGTGGTGCTGTCCCTTGTTATGCAGCATGTGCCAAGGGTACCTC  250

seq1  ATGTCTTCTCTGCTGGATG-AAACTATTGAGGCTGTCGCCACTGGGCTGA  276
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTTCTCTGCTGGATGAAAACTATTGAGGCTGTCGCCACTGGGCTGA  300

seq1  GCACTGCTGTATACCAGCGTCCCTTGACACC-TCGTGTCCCTGCAAAACG  325
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GCACTGCTGTATACCAGCGTCCCTTGACACCTTCGTGTCCCTGCAAAACG  350

seq1  GAAAAGGAAGGCAGGT-AAGCTGACATAATGGGCTTGCCTCCCACCATCA  374
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGAAGGCAGGTAAAGCTGACATAATGGGCTTGCCTCCCACCATCA  400

seq1  GCTCTATTCTGGAGTCCAGATATGTGGTCATTTCTGATTATTCCTGCAAC  424
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTATTCTGGAGTCCAGATATGTGGTCATTTCTGATTATTCCTGCAAC  450

seq1  TTTCTCAGCCAGAAGAATAGTACATCTTTCACATTTGTGGGTTCTATACT  474
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCAGCCAGAAGAATAGTACATCTTTCACATTTGTGGGTTCTATACT  500

seq1  CAAGCTCATGTAAACCTAGTTAGAGACTACTAGGGAGAAAGAAGCACATC  524
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTCATGTAAACCTAGTTAGAGACTACTAGGGAGAAAGAAGCACATC  550

seq1  TGGACTGTTTGGTACAGATGTGTTGTCATGCCCTGTGCTGTTGATATGCC  574
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGTTTGGTACAGATGTGTTGTCATGCCCTGTGCTGTTGATATGCC  600

seq1  TGCTGCATTTCCTAAGTGTATAAATACCTGGGGCTAGTGTAAACTGTAGC  624
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCATTTCCTAAGTGTATAAATACCTGGGGCTAGTGTAAACTGTAGC  650

seq1  AAATACTGTTGACACATTATAGAAGGGACCTAGAACCCTGAGACCACCTC  674
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACTGTTGACACATTATAGAAGGGACCTAGAACCCTGAGACCACCTC  700

seq1  TGCATCCTGAACTTATCTTAGTGACCCAACCTTCTCCTTCAGATTAGTGT  724
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCCTGAACTTATCTTAGTGACCCAACCTTCTCCTTCAGATTAGTGT  750

seq1  TTGATGTGCCTAGTAGATGCAACTCTGTGGATTTAGGGATTCCTCTTTGC  774
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTGCCTAGTAGATGCAACTCTGTGGATTTAGGGATTCCTCTTTGC  800

seq1  CCAGGTGGGTCATAATTAATCTGTAGCCTCTTAAAATTATACCTATTGGG  824
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTGGGTCATAATTAATCTGTAGCCTCTTAAAATTATACCTATTGGG  850

seq1  CTGGCAAAATGGCTTATAAGATAAAGGTGCTTGCCACCAAGCTTGATAAC  874
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAAAATGGCTTATAAGATAAAGGTGCTTGCCACCAAGCTTGATAAC  900

seq1  CCAAGTGGGATCCCCGGAATCCACAGATAGAACTAGCAGTACGAGTTGTT  924
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTGGGATCCCCGGAATCCACAGATAGAACTAGCAGTACGAGTTGTT  950

seq1  CTTGATAGGCTGTATATGTGGAGCGCACACACACACACACACACACACAC  974
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATAGGCTGTATATGTGGAGCGCACACACACACACACACACACACAC  1000

seq1  ACACACACAATTTTAATTGACTTTATTGTCTTCTGTGCACAGTAAAGTGC  1024
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAATTTTAATTGACTTTATTGTCTTCTGTGCACAGTAAAGTGC  1050

seq1  ATAGTTACAGGTTTGACATCCAGCACTCACGGTGTGATTTTTCATCATTA  1074
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTACAGGTTTGACATCCAGCACTCACGGTGTGATTTTTCATCATTA  1100

seq1  TCAGTCTGGATTCCCATAAGATCCAGTGGAATTC  1108
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCTGGATTCCCATAAGATCCAGTGGAATTC  1134

seq1: chr7_148289426_148290509
seq2: B6Ng01-260L14.g_67_1143

seq1  GAATTCCTGAACCCCACCTCAGGACTGAGGCTCTCCCTGCTGCTTCTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGAACCCCACCTCAGGACTGAGGCTCTCCCTGCTGCTTCTCCC  50

seq1  CATGTCTAGCAACTAAGCCATCTGTTTCCCTGACGTCTGTCATTCTCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCTAGCAACTAAGCCATCTGTTTCCCTGACGTCTGTCATTCTCACT  100

seq1  ATGGAAAGTCAGGATGACTGAGGTCTTGGGCTCTCTGATCCGCCATTCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAAGTCAGGATGACTGAGGTCTTGGGCTCTCTGATCCGCCATTCTT  150

seq1  CCATGTGATCAAAGTCCTGCTCTTCCATAAGGTCCCCTTGGAGGCTGCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTGATCAAAGTCCTGCTCTTCCATAAGGTCCCCTTGGAGGCTGCAA  200

seq1  GCTCTCCAGACACATGTCAGAGGCTCATGGGAGAGCCTTGTCAGGTGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCAGACACATGTCAGAGGCTCATGGGAGAGCCTTGTCAGGTGTGT  250

seq1  GTTCTAGCCTGCCCTTTTCTAGGGGTTGAGCCCATGAGGCTTAGTTACCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAGCCTGCCCTTTTCTAGGGGTTGAGCCCATGAGGCTTAGTTACCA  300

seq1  TATCTGACAACCTAAGGGATGTCTCTAGAGTAATGGGAGGGGCTGCAGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGACAACCTAAGGGATGTCTCTAGAGTAATGGGAGGGGCTGCAGTT  350

seq1  ATTACATTGCTTCAACGTGGCCTGGCCTGGGCTGGTGAAAAGCCCAGGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACATTGCTTCAACGTGGCCTGGCCTGGGCTGGTGAAAAGCCCAGGAT  400

seq1  TGGAAGTTGCTCTTCCCAGCGCCCTGGCTGCTCTCCTCCACTGTACAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTTGCTCTTCCCAGCGCCCTGGCTGCTCTCCTCCACTGTACAATA  450

seq1  TGTGTGTGCTCTGACCTATGTCCTTAGCCTTGCGAGGAACCAGGCGCCGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGCTCTGACCTATGTCCTTAGCCTTGCGAGGAACCAGGCGCCGC  500

seq1  TGTAGTCTGACCATCTTGATGGCATCCAGACGGATTTCCACAAGGTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTCTGACCATCTTGATGGCATCCAGACGGATTTCCACAAGGTTGCT  550

seq1  GAAGAGCGCCAACAGGGGTGCGAGTGGGAAAGCAGCCACAAAGATGGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCGCCAACAGGGGTGCGAGTGGGAAAGCAGCCACAAAGATGGTGG  600

seq1  TAAAGCCGTACTGGATCACTGCAGGGTGAAAAATCTCACTGTGTGTCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCCGTACTGGATCACTGCAGGGTGAAAAATCTCACTGTGTGTCCAG  650

seq1  TCCAGCCACCCACTCTTTACCCTGCACACCCACCCCATCTGCCCATCCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCACCCACTCTTTACCCTGCACACCCACCCCATCTGCCCATCCCA  700

seq1  CAGAGCGCCACACACTCATCTCCATGAACTCATCAAACAGGCTGAAGGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCGCCACACACTCATCTCCATGAACTCATCAAACAGGCTGAAGGTG  750

seq1  TTGATGGGATTCATGTAGTAGTTACGCTGCCACTCCTTCAGTTCTGGGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGGATTCATGTAGTAGTTACGCTGCCACTCCTTCAGTTCTGGGTC  800

seq1  TTTGGACATGTGACCATGTTTGGAAGCCCACATTAAGCGCCATTTATGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGACATGTGACCATGTTTGGAAGCCCACATTAAGCGCCATTTATGGG  850

seq1  CCAACAACCTGTGGGCACGAAGAATATGGGGAACATACAGAAAGACTGCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACAACCTGTGGGCACGAAGAATAT-GGGAACATACAGAAAGACTGCA  899

seq1  GGGCACTGGGGATGGGCACTGCGGGAGGCTGAAGTGGGATGGAAAGAGGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GGGCACTGGGGATGGGCACTGCGGGAGGCTGAAGT-GGATGGAAAGAGGT  948

seq1  CCTCACGGGCACAGGTACTCAACGCAGTTGCTCAGGGTTTGCTTCAGGCC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  CCTCACGGGCACAGGTACTCAACGCAGTTGCTCA-GGTTTGCTTCA-GCC  996

seq1  CATGATGATGGCCATCTGGATAAACAGGTCCATCATGCAGCCACTGAGAT  1050
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATGATGATGGCCATCTGGAT-AACAGGTCCATCATGCAGCCACTGAAAT  1045

seq1  GGCACTGTGGGGCCAACATGAAGGTCATGGATGG  1084
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGCACTGT-GGGCCAACATG-AGGTCATGGATGG  1077