BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263N21
Chromosome7 (Build37)
Map Location 83,624,744 - 83,749,316
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG244071
Upstream geneAkap13, Klhl25, LOC100042210, LOC434200
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263N21.bB6Ng01-263N21.g
ACCGA067925GA067926
length4821,067
definitionB6Ng01-263N21.b B6Ng01-263N21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,624,744 - 83,625,231)(83,748,246 - 83,749,316)
sequence
agtgcttggtcaaagttgggaggtaaaggatttatatgtgtgtattgatg
gtttaaaaaaaaacatttaatttttctttctgttgcctttgtctgctttg
ggtataatggttgagcttgctcataaaaatcaggctgagccacttcccca
tcttcccattatctaaacacctctataacttgaggcactatttagtatta
tggttttctgggtctggtggttttatgtgagaaattttaacctgttgact
caattgattcatgattaaaattttctcctagttatttctgagacaagatt
gacaggtggtcttgtatatgcatatgtgtgttaaggtgcacaagcatgtg
tgtatatgtatgggacagaggtaaattcatatggcgttttgcaggtgcta
tctatctatcttgtataatcccctcatcctttttgtctccttccttcctt
ccttcctcttccttccttccttccttccatcc

gaattcaagcacagaatgtgaagttggatgagatgctaatttccttcaga
gttcgcggttatatgatgatgttacagaactctattcatctataattcac
actatctttctctttgggatgatagggatccaatttttgtcagagagaaa
cgtcttttggggaagtataagtacaatggaggagtcaattctcctttgac
ttgatttcatttcatctattctaggaaactaggtaatctttatagatagc
acgaatttctaaacttttccctttctctgtatgatgaaactcttgagttg
agccaagtgttttggactgttgttctggatgtattgtctattcgatgccg
tggaatgccttccatgactggccagaggagagtaagatggtcccttagat
tatacacattattactcagtctcttggtggccagttcctctaaatgagag
cacccaataagtcaatatcaagatggccagattaatagctacatattgga
ttatatttcttaaaatcttcctcccacgtgagatcagatggactttcaga
gctttgattactatagaagagtcttgctgtctgagtttccagagttacca
ccacaaatgatgagcattgatgtatgcagtatatttctggagagaggccc
agccttatcaggacttacaaacattgtaattttttttcttgacattggtc
aaatacagcccaaagccttgggcattttcccttaacactgcacttaaggg
gagagagtgaccccagttctactgacagtgaatcacctgatagcacatta
acctagcccatctctttactctacatcatgtcaaaatcacaatgaacccc
tagggagcttgtcaatatctacgagctctactctgcttacacatttgcct
ggagtagctcgtctttgtttagcacacacatatgagttgtgagcgagagt
atttttctgaatgaagggactgtctcgtcatgatagtctacatcactaag
aaactatataacagaaaataaaccaggaccctctagaactagctaagaaa
aaggaatgagggccttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_83624744_83625231
seq2: B6Ng01-263N21.b_46_533

seq1  GAATTCAGTGCTTGGTCAAAGTTGGGAGGTAAAGGATTTATATGTGTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGCTTGGTCAAAGTTGGGAGGTAAAGGATTTATATGTGTGTA  50

seq1  TTGATGGTTTAAAAAAAAACATTTAATTTTTCTTTCTGTTGCCTTTGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGTTTAAAAAAAAACATTTAATTTTTCTTTCTGTTGCCTTTGTCT  100

seq1  GCTTTGGGTATAATGGTTGAGCTTGCTCATAAAAATCAGGCTGAGCCACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGGGTATAATGGTTGAGCTTGCTCATAAAAATCAGGCTGAGCCACT  150

seq1  TCCCCATCTTCCCATTATCTAAACACCTCTATAACTTGAGGCACTATTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATCTTCCCATTATCTAAACACCTCTATAACTTGAGGCACTATTTA  200

seq1  GTATTATGGTTTTCTGGGTCTGGTGGTTTTATGTGAGAAATTTTAACCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATGGTTTTCTGGGTCTGGTGGTTTTATGTGAGAAATTTTAACCTG  250

seq1  TTGACTCAATTGATTCATGATTAAAATTTTCTCCTAGTTATTTCTGAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTCAATTGATTCATGATTAAAATTTTCTCCTAGTTATTTCTGAGAC  300

seq1  AAGATTGACAGGTGGTCTTGTATATGCATATGTGTGTTAAGGTGCACAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTGACAGGTGGTCTTGTATATGCATATGTGTGTTAAGGTGCACAAG  350

seq1  CATGTGTGTATATGTATGGGACAGAGGTAAATTCATATGGCGTTTTGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGTATATGTATGGGACAGAGGTAAATTCATATGGCGTTTTGCAG  400

seq1  GTGCTATCTATCTATCTTGTATAATCCCCTCATCCTTTTTGTCTCCTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTATCTATCTATCTTGTATAATCCCCTCATCCTTTTTGTCTCCTTCC  450

seq1  TTCCTTCCTTCCTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCC  488
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTCCTTCCTTCCTCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCATCC  488


seq1: chr7_83748246_83749316
seq2: B6Ng01-263N21.g_66_1132 (reverse)

seq1  CAAGGCCCCTCATTTCTTTTTCTTAGGCTTAGTTCTAGAGGGTCCTGGTT  50
      ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||
seq2  CAAGG-CCCTCATTCCTTTTTCTTAG--CTAGTTCTAGAGGGTCCTGGTT  47

seq1  TATTTTCTGTTATATAGTTTCCTTAGTGATGTAGACTATCATGACGAGAA  100
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TATTTTCTGTTATATAGTTT-CTTAGTGATGTAGACTATCATGACGAG-A  95

seq1  CAGTCCCTTCATTCAG-AAAATACTCTCGCTCACAACTCATATGTGTGTG  149
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCTTCATTCAGAAAAATACTCTCGCTCACAACTCATATGTGTGTG  145

seq1  CTAAACAAAGACGAGCTACTCCAGGCAAATGTGTAAGCAGAGTAGAGCTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAAAGACGAGCTACTCCAGGCAAATGTGTAAGCAGAGTAGAGCTC  195

seq1  GTAGATATTGACAAGCTCCCTAGGGGTTCATTGTGATTTTGACATGATGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATATTGACAAGCTCCCTAGGGGTTCATTGTGATTTTGACATGATGT  245

seq1  AGAGTAAAGAGATGGGCTAGGTTAATGTGCTATCAGGTGATTCACTGTCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTAAAGAGATGGGCTAGGTTAATGTGCTATCAGGTGATTCACTGTCA  295

seq1  GTAGAACTGGGGTCACTCTCTCCCCTTAAGTGCAGTGTTAAGGGAAAATG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAACTGGGGTCACTCTCTCCCCTTAAGTGCAGTGTTAAGGGAAAATG  345

seq1  CCCAAGGCTTTGGGCTGTATTTGACCAATGTCAAGAAAAAAAATTACAAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGGCTTTGGGCTGTATTTGACCAATGTCAAGAAAAAAAATTACAAT  395

seq1  GTTTGTAAGTCCTGATAAGGCTGGGCCTCTCTCCAGAAATATACTGCATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTAAGTCCTGATAAGGCTGGGCCTCTCTCCAGAAATATACTGCATA  445

seq1  CATCAATGCTCATCATTTGTGGTGGTAACTCTGGAAACTCAGACAGCAAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAATGCTCATCATTTGTGGTGGTAACTCTGGAAACTCAGACAGCAAG  495

seq1  ACTCTTCTATAGTAATCAAAGCTCTGAAAGTCCATCTGATCTCACGTGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCTATAGTAATCAAAGCTCTGAAAGTCCATCTGATCTCACGTGGG  545

seq1  AGGAAGATTTTAAGAAATATAATCCAATATGTAGCTATTAATCTGGCCAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGATTTTAAGAAATATAATCCAATATGTAGCTATTAATCTGGCCAT  595

seq1  CTTGATATTGACTTATTGGGTGCTCTCATTTAGAGGAACTGGCCACCAAG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATATTGACTTATTGGGTGCTCTCATTTAGAGGAACTGGCCACCAAG  645

seq1  AGACTGAGTAATAATGTGTATAATCTAAGGGACCATCTTACTCTCCTCTG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGAGTAATAATGTGTATAATCTAAGGGACCATCTTACTCTCCTCTG  695

seq1  GCCAGTCATGGAAGGCATTCCACGGCATCGAATAGACAATACATCCAGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTCATGGAAGGCATTCCACGGCATCGAATAGACAATACATCCAGAA  745

seq1  CAACAGTCCAAAACACTTGGCTCAACTCAAGAGTTTCATCATACAGAGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTCCAAAACACTTGGCTCAACTCAAGAGTTTCATCATACAGAGAA  795

seq1  AGGGAAAAGTTTAGAAATTCGTGCTATCTATAAAGATTACCTAGTTTCCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAAAGTTTAGAAATTCGTGCTATCTATAAAGATTACCTAGTTTCCT  845

seq1  AGAATAGATGAAATGAAATCAAGTCAAAGGAGAATTGACTCCTCCATTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGATGAAATGAAATCAAGTCAAAGGAGAATTGACTCCTCCATTGT  895

seq1  ACTTATACTTCCCCAAAAGACGTTTCTCTCTGACAAAAATTGGATCCCTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATACTTCCCCAAAAGACGTTTCTCTCTGACAAAAATTGGATCCCTA  945

seq1  TCATCCCAAAGAGAAAGATAGTGTGAATTATAGATGAATAGAGTTCTGTA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCCAAAGAGAAAGATAGTGTGAATTATAGATGAATAGAGTTCTGTA  995

seq1  ACATCATCATATAACCGCGAACTCTGAAGGAAATTAGCATCTCATCCAAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATCATATAACCGCGAACTCTGAAGGAAATTAGCATCTCATCCAAC  1045

seq1  TTCACATTCTGTGCTTGAATTC  1071
      ||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATTCTGTGCTTGAATTC  1067


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |