BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-266K14
Chromosome7 (Build37)
Map Location 117,819,029 - 117,950,376
singlet/doubletdoublet
Overlap geneB430319F04Rik, Ampd3
Upstream geneLOC100042582, D930014E17Rik, BC051019, Ascl3, Tmem9b, 4930431P19Rik, Nrip3, Scube2, Phxr5, Rab6ip1, Tmem41b, Ipo7, AA474408, Zfp143, Wee1, Swap70, EG668368, Sbf2, LOC668246, Adm
Downstream geneRnf141, Xlkd1, Mrvi1, Ctr9, Eif4g2, LOC100043221, LOC100042658, LOC384658, Galntl4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-266K14.bB6Ng01-266K14.g
ACCGA070003GA070004
length1,137810
definitionB6Ng01-266K14.b B6Ng01-266K14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,819,029 - 117,820,162)(117,949,569 - 117,950,376)
sequence
gaattcagataatgagaaggttgtgactggctcactatgtggttatttct
agatcagcagtttattgaattaacagtagtaagatgctcttatgggtcca
ctggtgcagttgggattgcgtagtttcctctttcttcgtgaggctaggcc
tggatgggctgatacccacctatggagagggatggattgctaagaccaga
tctctccagcagaagagtccagggttccctagacagtgtcagacacactg
tggaaaacaagggagcttcctgcaggcctcagtgccctcgtgctcctcag
gaagaacagccagtgcacctctgacctggccctcttggcatcacacatgc
tggaccagtcactgatcagaacagtggacagagttgtggttcactgcagt
gagacagagagaaacgccagtggctgctgtagagcaggcactccaccaat
gtttccaaaagaggaaagctgaatggaatgagtaggggagaaggagagct
gggagacaggacacattagcagtgacgctgggaaacagggcttccctgtg
gcctcctcaccactgacaactgagccgcgacctttaccctgtaataagac
aactaattctcaaaacacattttcagattataaactgctggagtcaggga
gatgctcctacccttggcccagtcatcccacccatgggattctttcataa
ggaaataattcaactaaacaaacagccaagcacacagagatacttatgac
atcatcaaccgaggcagcacatgttcaacaataagaagctacctgatttt
tggtacatttactcagtagaatctcctggaggtgttaaaacagccactgt
gaaggtagtgtgtcaaacatggacatatacagtaagtaatttagtgaaag
tgtgattttgccatatttaatcccttgtttcaatggattaattttaaaaa
tattgattttattatttttaattgtatgtgcacataagcagaggggttca
gtgaaaggtcaaaagttatccagatcccctggaagctgagtttacaggta
agttgtgagcccttgagacatgggtgctgtgaacagaagctaggggtctc
tcagagcatgcatgcctctagctactgagcatctctc
gaattctttgtcccaaaggccttaaaatgagagcataggaatgttgcagc
ccagagcaagggttactagtcaaggaaggattccaaattctgtgcttatt
attatgctaaaattatgctgtaggtgacagagagctgcaggactgcctca
gtgtgtttttctgcagtgcttttatggaggacctgagttcagtttgaggc
agttcacaatgacctgtaactgcagctctaggatccgacagcctctgcag
gcacctgccttgctcatgcacagacctacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacaccagcatgcatgcacaaacacaaaaata
aaaattagcctttcaaaaggaaaggaaaagggaactagaaatactaaacg
gctgctaatgctgtttctgtaaagaaagtaagattattttttagtttttt
ttttcatctaaaatgtaatgtttggttattttatggttaaaagtgagcca
aattgtttttgttggttttcctgctttagtttagttttttgaggggctga
gggttggggggaagatgagaacatgaattgggtagtgggtatggagttga
aagagggaaagaatatgatcaaaatatgtgaaagtattttaaataaaaat
tgaagtgaagccaagaagactacagtggcacatccctcttccaggggcca
tggccctcgaggagcactgaccagagctctgaagaggggatgggggaagg
gaatcctacccccacgcatgggccatttaccttcttaaacagcagcccgt
gggaaatgtt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_117819029_117820162
seq2: B6Ng01-266K14.b_47_1183

seq1  GAATTCAGATAATGAGAAGGTTGTGACTGGCTCACTATGTGGTTATTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATAATGAGAAGGTTGTGACTGGCTCACTATGTGGTTATTTCT  50

seq1  AGATCAGCAGTTTATTGAATTAACAGTAGTAAGATGCTCTTATGGGTCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCAGCAGTTTATTGAATTAACAGTAGTAAGATGCTCTTATGGGTCCA  100

seq1  CTGGTGCAGTTGGGATTGCGTAGTTTCCTCTTTCTTCGTGAGGCTAGGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGCAGTTGGGATTGCGTAGTTTCCTCTTTCTTCGTGAGGCTAGGCC  150

seq1  TGGATGGGCTGATACCCACCTATGGAGAGGGATGGATTGCTAAGACCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGGGCTGATACCCACCTATGGAGAGGGATGGATTGCTAAGACCAGA  200

seq1  TCTCTCCAGCAGAAGAGTCCAGGGTTCCCTAGACAGTGTCAGACACACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCAGCAGAAGAGTCCAGGGTTCCCTAGACAGTGTCAGACACACTG  250

seq1  TGGAAAACAAGGGAGCTTCCTGCAGGCCTCAGTGCCCTCGTGCTCCTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAACAAGGGAGCTTCCTGCAGGCCTCAGTGCCCTCGTGCTCCTCAG  300

seq1  GAAGAACAGCCAGTGCACCTCTGACCTGGCCCTCTTGGCATCACACATGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACAGCCAGTGCACCTCTGACCTGGCCCTCTTGGCATCACACATGC  350

seq1  TGGACCAGTCACTGATCAGAACAGTGGACAGAGTTGTGGTTCACTGCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCAGTCACTGATCAGAACAGTGGACAGAGTTGTGGTTCACTGCAGT  400

seq1  GAGACAGAGAGAAACGCCAGTGGCTGCTGTAGAGCAGGCACTCCACCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACAGAGAGAAACGCCAGTGGCTGCTGTAGAGCAGGCACTCCACCAAT  450

seq1  GTTTCCAAAAGAGGAAAGCTGAATGGAATGAGTAGGGGAGAAGGAGAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCAAAAGAGGAAAGCTGAATGGAATGAGTAGGGGAGAAGGAGAGCT  500

seq1  GGGAGACAGGACACATTAGCAGTGACGCTGGGAAACAGGGCTTCCCTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGACAGGACACATTAGCAGTGACGCTGGGAAACAGGGCTTCCCTGTG  550

seq1  GCCTCCTCACCACTGACAACTGAGCCGCGACCTTTACCCTGTAATAAGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCTCACCACTGACAACTGAGCCGCGACCTTTACCCTGTAATAAGAC  600

seq1  AACTAATTCTCAAAACACATTTTCAGATTATAAACTGCTGGAGTCAGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATTCTCAAAACACATTTTCAGATTATAAACTGCTGGAGTCAGGGA  650

seq1  GATGCTCCTACCCTTGGCCCAGTCATCCCACCCATGGGATTCTTTCATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTCCTACCCTTGGCCCAGTCATCCCACCCATGGGATTCTTTCATAA  700

seq1  GGAAATAATTCAACTAAACAAACAGCCAAGCACACAGAGATACTTATGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATAATTCAACTAAACAAACAGCCAAGCACACAGAGATACTTATGAC  750

seq1  ATCATCAACCGAGGCAGCACATGTTCAACAATAAGAAGCTACCTGATTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAACCGAGGCAGCACATGTTCAACAATAAGAAGCTACCTGATTTT  800

seq1  TGGTACATTTACTCAGTAGAATCTCCTGGAGGTGTTAAAACAGCCACTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTACATTTACTCAGTAGAATCTCCTGGAGGTGTTAAAACAGCCACTGT  850

seq1  GAAGGTAGTGTGTCAAACATGGACATATACAGTAAGTAATTTAGTGAAAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTAGTGTGTCAAACATGGACATATACAGTAAGTAATTTAGTGAAAG  900

seq1  TGTGATTTTGCCAATATTTAATCCCTTGTTTCAATGGATTAATTTTAAAA  950
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTTGCC-ATATTTAATCCCTTGTTTCAATGGATTAATTTTAAAA  949

seq1  ATATTGATTTTATTATTTTTAATTGTATGTGCACATAAGCAGAGGGG-TC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATATTGATTTTATTATTTTTAATTGTATGTGCACATAAGCAGAGGGGTTC  999

seq1  AGTG-AAGGTCAAAAG-TAT-CAGATCCCCTGG-AGCTGGAGTTACAGGT  1045
      |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||
seq2  AGTGAAAGGTCAAAAGTTATCCAGATCCCCTGGAAGCTGAGTTTACAGGT  1049

seq1  -AGTTGTGAGCCC-TGAGACATGGGTGCTGTGAACAG-AGCTAGGGTCCT  1092
       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | 
seq2  AAGTTGTGAGCCCTTGAGACATGGGTGCTGTGAACAGAAGCTAGGGGTC-  1098

seq1  TCTCAGGAGCAATGCATGCTCTTAGCTACTGAGCCATCTCTC  1134
      ||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||
seq2  TCTCA-GAGC-ATGCATGCCTCTAGCTACTGAG-CATCTCTC  1137

seq1: chr7_117949569_117950376
seq2: B6Ng01-266K14.g_66_875 (reverse)

seq1  AACATTTCCCACGGGCTGCTGCTTAAGAAGGTAAGTGGGCCATGCGTGGG  50
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||
seq2  AACATTTCCCACGGGCTGCTGTTTAAGAAGGTAAATGGCCCATGCGTGGG  50

seq1  GGCTAGG-CTCCCATCCCCCATCCCCTCTTCAGAGCTCTGGTCAGTGCTC  99
      || ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GG-TAGGATTCCCTTCCCCCATCCCCTCTTCAGAGCTCTGGTCAGTGCTC  99

seq1  CTCGAGGGCCATGGCCCCTGG-AGAGGGCTGTGCCACTGTAGTCTTCTTG  148
      ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTCGAGGGCCATGGCCCCTGGAAGAGGGATGTGCCACTGTAGTCTTCTTG  149

seq1  GCTTCACTTCAATTTTTATTT-AAATACTTTCACATATTTTGATCATATT  197
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACTTCAATTTTTATTTAAAATACTTTCACATATTTTGATCATATT  199

seq1  CTTTCCCTCTTTCAACTCCATACCCACTACCCAATTCATGTTCTCATCTT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCCTCTTTCAACTCCATACCCACTACCCAATTCATGTTCTCATCTT  249

seq1  CCCCCCAACCCTCAGCCCCTCAAAAAACTAAACTAAAGCAGGAAAACCAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCAACCCTCAGCCCCTCAAAAAACTAAACTAAAGCAGGAAAACCAA  299

seq1  CAAAAACAATTTGGCTCACTTTTAACCATAAAATAACCAAACATTACATT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAACAATTTGGCTCACTTTTAACCATAAAATAACCAAACATTACATT  349

seq1  TTAGATGAAAAAAAAAACTAAAAAATAATCTTACTTTCTTTACAGAAACA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGAAAAAAAAAACTAAAAAATAATCTTACTTTCTTTACAGAAACA  399

seq1  GCATTAGCAGCCGTTTAGTATTTCTAGTTCCCTTTTCCTTTCCTTTTGAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTAGCAGCCGTTTAGTATTTCTAGTTCCCTTTTCCTTTCCTTTTGAA  449

seq1  AGGCTAATTTTTATTTTTGTGTTTGTGCATGCATGCTGGTGTGTGTGTGT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAATTTTTATTTTTGTGTTTGTGCATGCATGCTGGTGTGTGTGTGT  499

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTCTGTGCATGAGC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTCTGTGCATGAGC  549

seq1  AAGGCAGGTGCCTGCAGAGGCTGTCGGATCCTAGAGCTGCAGTTACAGGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGGTGCCTGCAGAGGCTGTCGGATCCTAGAGCTGCAGTTACAGGT  599

seq1  CATTGTGAACTGCCTCAAACTGAACTCAGGTCCTCCATAAAAGCACTGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTGAACTGCCTCAAACTGAACTCAGGTCCTCCATAAAAGCACTGCA  649

seq1  GAAAAACACACTGAGGCAGTCCTGCAGCTCTCTGTCACCTACAGCATAAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACACACTGAGGCAGTCCTGCAGCTCTCTGTCACCTACAGCATAAT  699

seq1  TTTAGCATAATAATAAGCACAGAATTTGGAATCCTTCCTTGACTAGTAAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCATAATAATAAGCACAGAATTTGGAATCCTTCCTTGACTAGTAAC  749

seq1  CCTTGCTCTGGGCTGCAACATTCCTATGCTCTCATTTTAAGGCCTTTGGG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCTCTGGGCTGCAACATTCCTATGCTCTCATTTTAAGGCCTTTGGG  799

seq1  ACAAAGAATTC  808
      |||||||||||
seq2  ACAAAGAATTC  810