BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267L24
Chromosome7 (Build37)
Map Location 59,992,278 - 60,136,819
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG620782
Upstream geneLOC654473, LOC100040608, Gas2, 1700015G11Rik, EG668783
Downstream geneLOC100040692, Gm1865, LOC100040718, LOC668789
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267L24.bB6Ng01-267L24.g
ACCGA070790GA070791
length1,106631
definitionB6Ng01-267L24.b B6Ng01-267L24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,992,278 - 59,993,387)(60,136,189 - 60,136,819)
sequence
gaattcattgcagaaagattttcaagaacagaaaataagagatcaagagt
gacagactaaagaatgtataacataaattctcagaaaaatatggatgata
gatgacagataaaatcaatgctgtgaatctgcctgaatgttatcctaatg
aatatgataaaacaagtgtttgcagatcttccctaacattatgtctgaca
taggattaatatataaaatatataaaaaattcaagaagatagacacaaac
aaactaaataaccaatttaaaaatgggttacagaactaaacagagaattc
tcaacagagcctgagaaacccttaaagaagcgttcactgtcctgagtcat
catggaaatgtaaatccaaactaccctgagattccatcttataccagtca
gaatgtctaagagtgaaagctcaagtgatagcacatgctggcaagggcgt
aaagcaaagagaacactcctccatttgctggtgggggttcaaacttacac
aatcactttacacaatcaatttagagagttctcagaaaactggaaatagt
tttacctcaactccccttcccatgccctaaatatactctattctgtacta
tacccattgtatggttggtatctcaggaggaagagatgcctcagcatggg
cccagagaggcacccctcccaactcacaacactgctctctagaaaacatg
tcctgatcatgttataaaacacaacagacagtgctaattgcttctggcaa
atcaaaaatctaagtgatatctgaaacttgaaaggagatcttcagagaga
tctttgctcactctggcttactctctgagataagccaggtgtcatcacac
acaacaatggcacccagaaagaagcaatgctgtgaccacctgtgtcctat
tgacttcactattggaatgaccagcttgatattatatgcaagaccaaatc
aactctttaaatgattgcaaccttgggccaacaccttactggaaatactt
agggaattaagagctagtgtgagccattttataattgataacaaagcttt
cttataaacatgtgtgactttatctttggaagacatgagcaaatatatat
catcag

gaattcaaaaacaacatgagtacatctcacccaagcttcagctactttgc
aaaacagctttcttctttgttgtatgttcatgctcctctccccacttcag
tgttaaatggaattaaaattcttggtagatttgcaaggtcaaccagtgga
tgtgattctttcactgaaatactgaaggaagggcctagatgtcatggact
acctaaaaaagccttgtagctatacaaaaatctgtatttaaattctgcaa
ggaggaaattgaataaacttcctgaagattggtgaaaatagtcagagccc
gtgcagtggatggatatcaaaacctgtgacaaagcagaattctctgggga
tgaaccctgctcacttcattttgatagtgattggcatgagatgctgacca
tcaaccagaagcttcccacaaagtgcaggtaagtgaatgatattcctaca
gtggagaagtaaacagaggtctatagaggcatagctcagtaaagttgggg
tccagtctctctgtagtctctaaaaactatgcttccaaggtaactcagga
acaaaaaccacataaggcttgcaaaatttatctgagaaattttgttgttg
ttgttgttgttgtgtgtgtgttgtttttttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_59992278_59993387
seq2: B6Ng01-267L24.b_46_1151

seq1  GAATTCATTGCAGAAAGATTTTCAAGAACAGAAAATAAGAGATCAAGAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTGCAGAAAGATTTTCAAGAACAGAAAATAAGAGATCAAGAGT  50

seq1  GACAGACTAAAGAATGTATAACATAAATTCTCAGAAAAATATGGATGATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGACTAAAGAATGTATAACATAAATTCTCAGAAAAATATGGATGATA  100

seq1  GATGACAGATAAAATCAATGCTGTGAATCTGCCTGAATGTTATCCTAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACAGATAAAATCAATGCTGTGAATCTGCCTGAATGTTATCCTAATG  150

seq1  AATATGATAAAACAAGTGTTTGCAGATCTTCCCTAACATTATGTCTGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGATAAAACAAGTGTTTGCAGATCTTCCCTAACATTATGTCTGACA  200

seq1  TAGGATTAATATATAAAATATATAAAAAATTCAAGAAGATAGACACAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGATTAATATATAAAATATATAAAAAATTCAAGAAGATAGACACAAAC  250

seq1  AAACTAAATAACCAATTTAAAAATGGGTTACAGAACTAAACAGAGAATTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAATAACCAATTTAAAAATGGGTTACAGAACTAAACAGAGAATTC  300

seq1  TCAACAGAGCCTGAGAAACCCTTAAAGAAGCGTTCACTGTCCTGAGTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGAGCCTGAGAAACCCTTAAAGAAGCGTTCACTGTCCTGAGTCAT  350

seq1  CATGGAAATGTAAATCCAAACTACCCTGAGATTCCATCTTATACCAGTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAAATGTAAATCCAAACTACCCTGAGATTCCATCTTATACCAGTCA  400

seq1  GAATGTCTAAGAGTGAAAGCTCAAGTGATAGCACATGCTGGCAAGGGCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTCTAAGAGTGAAAGCTCAAGTGATAGCACATGCTGGCAAGGGCGT  450

seq1  AAAGCAAAGAGAACACTCCTCCATTTGCTGGTGGGGGTTCAAACTTACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAAAGAGAACACTCCTCCATTTGCTGGTGGGGGTTCAAACTTACAC  500

seq1  AATCACTTTACACAATCAATTTAGAGAGTTCTCAGAAAACTGGAAATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTTTACACAATCAATTTAGAGAGTTCTCAGAAAACTGGAAATAGT  550

seq1  TTTACCTCAACTCCCCTTCCCATGCCCTAAATATACTCTATTCTGTACTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCTCAACTCCCCTTCCCATGCCCTAAATATACTCTATTCTGTACTA  600

seq1  TACCCATTGTATGGTTGGTATCTCAGGAGGAAGAGATGCCTCAGCATGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCATTGTATGGTTGGTATCTCAGGAGGAAGAGATGCCTCAGCATGGG  650

seq1  CCCAGAGAGGCACCCCTCCCAACTCACAACACTGCTCTCTAGAAAACATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGAGGCACCCCTCCCAACTCACAACACTGCTCTCTAGAAAACATG  700

seq1  TCCTGATCATGTTATAAAACACAACAGACAGTGCTAATTGCTTCTGGCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATCATGTTATAAAACACAACAGACAGTGCTAATTGCTTCTGGCAA  750

seq1  ATCAAAAATCTAAGTGATATCTGAAACTTGAAAGGAGATCTTCAGAGAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAATCTAAGTGATATCTGAAACTTGAAAGGAGATCTTCAGAGAGA  800

seq1  TCTTTGCTCACTCTGGCTTACTCTCTGAGATAAGCCAGGTGTCATCACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGCTCACTCTGGCTTACTCTCTGAGATAAGCCAGGTGTCATCACAC  850

seq1  ACAACAATGGCACCCAGAAAGAAGCAATGCTGTGACCACCTGTGTCCTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAATGGCACCCAGAAAGAAGCAATGCTGTGACCACCTGTGTCCTAT  900

seq1  TGACTTCACTATTGGAATGACCAGCTTGATATTATATGCAAGACCAAATC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTCACTATTGGAATGACCAGCTTGATATTATATGCAAGACCAAATC  950

seq1  AACTCTTTAAATGATTGCAACCTT-GGCCAACACCTTTACTGGAAATACT  999
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
seq2  AACTCTTTAAATGATTGCAACCTTGGGCCAACACC-TTACTGGAAATACT  999

seq1  TAGGGAATTAAGAGCTAGTGTTGAAGCCAATTTTAT-ATTGATACAAAAG  1048
      |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| | || 
seq2  TAGGGAATTAAGAGCTAGTGT--GAGCC-ATTTTATAATTGATA-ACAAA  1045

seq1  GCTTTCTATAAAACATTGTGTGACTTTATCTTTGG-AGACATGAGCAAAT  1097
      |||||||   ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GCTTTCTTATAAACA-TGTGTGACTTTATCTTTGGAAGACATGAGCAAAT  1094

seq1  ATATATCCATCAG  1110
      |||||| ||||||
seq2  ATATAT-CATCAG  1106


seq1: chr7_60136189_60136819
seq2: B6Ng01-267L24.g_66_696 (reverse)

seq1  CAAAAAAACAACACACACACAACAACAACAACAACAACAAAATTTCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAACAACACACACACAACAACAACAACAACAACAAAATTTCTCAG  50

seq1  ATAAATTTTGCAAGCCTTATGTGGTTTTTGTTCCTGAGTTACCTTGGAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTTTGCAAGCCTTATGTGGTTTTTGTTCCTGAGTTACCTTGGAAG  100

seq1  CATAGTTTTTAGAGACTACAGAGAGACTGGACCCCAACTTTACTGAGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTTTTAGAGACTACAGAGAGACTGGACCCCAACTTTACTGAGCTA  150

seq1  TGCCTCTATAGACCTCTGTTTACTTCTCCACTGTAGGAATATCATTCACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTATAGACCTCTGTTTACTTCTCCACTGTAGGAATATCATTCACT  200

seq1  TACCTGCACTTTGTGGGAAGCTTCTGGTTGATGGTCAGCATCTCATGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGCACTTTGTGGGAAGCTTCTGGTTGATGGTCAGCATCTCATGCCA  250

seq1  ATCACTATCAAAATGAAGTGAGCAGGGTTCATCCCCAGAGAATTCTGCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTATCAAAATGAAGTGAGCAGGGTTCATCCCCAGAGAATTCTGCTT  300

seq1  TGTCACAGGTTTTGATATCCATCCACTGCACGGGCTCTGACTATTTTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACAGGTTTTGATATCCATCCACTGCACGGGCTCTGACTATTTTCAC  350

seq1  CAATCTTCAGGAAGTTTATTCAATTTCCTCCTTGCAGAATTTAAATACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTCAGGAAGTTTATTCAATTTCCTCCTTGCAGAATTTAAATACAG  400

seq1  ATTTTTGTATAGCTACAAGGCTTTTTTAGGTAGTCCATGACATCTAGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTGTATAGCTACAAGGCTTTTTTAGGTAGTCCATGACATCTAGGCC  450

seq1  CTTCCTTCAGTATTTCAGTGAAAGAATCACATCCACTGGTTGACCTTGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTCAGTATTTCAGTGAAAGAATCACATCCACTGGTTGACCTTGCA  500

seq1  AATCTACCAAGAATTTTAATTCCATTTAACACTGAAGTGGGGAGAGGAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTACCAAGAATTTTAATTCCATTTAACACTGAAGTGGGGAGAGGAGC  550

seq1  ATGAACATACAACAAAGAAGAAAGCTGTTTTGCAAAGTAGCTGAAGCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACATACAACAAAGAAGAAAGCTGTTTTGCAAAGTAGCTGAAGCTTG  600

seq1  GGTGAGATGTACTCATGTTGTTTTTGAATTC  631
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGATGTACTCATGTTGTTTTTGAATTC  631


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |