BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-269I11
Chromosome7 (Build37)
Map Location 150,570,507 - 150,711,653
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKcnq1, Cdkn1c, Slc22a18, Phlda2, Nap1l4
Upstream geneCtsd, Syt8, Tnni2, Lsp1, ENSMUSG00000043795, Tnnt3, Mrpl23, Nctc1, H19, Igf2, Igf2as, Ins2, EG640264, EG624121, Th, Ascl2, Tspan32, R74862, Cd81, Tssc4, Trpm5
Downstream geneCars, Tnfrsf26, Tnfrsf22, Tnfrsf23, Osbpl5, Mrgprg, Mrgpre, Nadsyn1, Dhcr7, Gm498, Shank2, Cttn, Ppfia1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-269I11.bB6Ng01-269I11.g
ACCGA072101GA072102
length1,2011,114
definitionB6Ng01-269I11.b B6Ng01-269I11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,570,507 - 150,571,702)(150,710,534 - 150,711,653)
sequence
gaattctactctttggggttggtggccctcacaaccaccctggctctcag
ataccattacaatgccccaggttcttcaagacatggatataacacaaagt
aggctggtgacaaacaccttaaaatgcatattccctggctacccctcagg
ctattgtttggggtcacagagaagtggagtagccaccacctactttcaac
catcaccctagtatcccaggatccacatccatcccacagcatatcataac
aagaggatagatacattatcccctggattcctcaaggctgaccccccccc
gaccccccagccctagcctcaagttctcacataatggaaccttaagcaga
aagtagacccacaagggttcctggtcaaattgtagcatgaggggtagcca
gctgcccatcagtgtgacctcctgtaagaccagagcctgggaaaagtcac
ctgtgtaaagcagctctgccaggcagctatgttcccctatggaacacact
agcagactagccttagccagaatactgtcacataactatccccagtaaag
aagcagagtgctcaaatgaggatttcctgaggggccaaggcaatgtgggc
acaaacagaatatcctgggcagagaaaagaactggaaaccttaaagatag
gcaaggagatatgatgatgtctatggtataaataaataaataaatagata
gatagatagatagatagatagatagataaatagataaatagataaataga
taaataaaatgaggtttcctctgtgctacagagttctgcagacatcagag
aacacatctatgtctctaggttgtggagggggtgttcatatgaagccatg
gtaccccaccttgttcctacaggttctggcaagctgtggggacataggac
ttaagagatgcccgccaggccctcaaggacacagattaaggcctgtaccc
ctctaccaaccccctttcctgctgcctgcccagcctgcccaatcaagcct
tgccccttgcgtgcccggagctactgcttgccagacttgccacaaaattc
cctaagggccctctttctttcccaacattccctgcctccttcctccaggc
ttttttctctgattcatcttctattctcaggtcagaatcttcccactgct
taccggtgagaatctcgatacgctctcgtattccgagcctactgctagcc
a
gaattcacttataagcagatgtgatttttaggggtgatgttttatagtgg
cacaactctaaaattagcttattcagtttccagcctgcattttaaaggga
aatgaatataaaactgtaaacagtgctttcaggaagttgaagaggagaaa
ataagtggctacaatttcagtcaggcaacatgtaacagtgatgagttcta
ggaccaggaaaggaaggaggatggtgctcaggggctgggctacagatttt
aggatggagacactactacattgaccttcagcctatagaattggcctgga
aggcatgtgttgtggtgcttgtcacttgggagacggggtccagccctcag
actgttccttgcctacatggtaacagcctcttgtaggtggtgttcataca
cccaatactgtggttttctaccagtgaatgctgtcaggctgtaacaacaa
ctgacatgagccctgtgagaaatgctgacaccacagttaaacagagagca
ttagatctactccaacctattgctagtcaaggtccaaattatctgtcagg
taatggttgtttggtttcatggaggtgtggcaagaagcccacatcttctt
tttgacctggtgaatatcagcaccactttgatggtcttgcatgtagaccc
ctatggatgcatcatctttgggtgaaaggctgcaaacccatctgcaggat
catcagcagaatgtacattcttctctttgccccatagcagataaacatgt
accattcagcattgaagggcatacaggatcagtctctgtatggtccagta
gggcagctgattcacctacctcctgctcatcctttaaactctcagctttt
ttgacccactgccttatctaaatgaaataattgtaacagatggagcttgt
gaaatgttcacaaggtgtctcggtgccttgttggggtctgagagagctgc
ttgccagctgatttcccttcagtgtgatgttaaaaacattggtgtcggtt
gtaataatagtgtgtttctttcttctctagctctgagatgagaatcttct
ggtagatgtatgtcaaaagccttgaatttcctgtcaggtatttcttgaaa
aagcacttgccttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_150570507_150571702
seq2: B6Ng01-269I11.b_44_1244

seq1  GAATTCTACTCTTTGGGGTTGGTGGCCCTCACAACCACCCTGGCTCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTACTCTTTGGGGTTGGTGGCCCTCACAACCACCCTGGCTCTCAG  50

seq1  ATACCATTACAATGCCCCAGGTTCTTCAAGACATGGATATAACACAAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATTACAATGCCCCAGGTTCTTCAAGACATGGATATAACACAAAGT  100

seq1  AGGCTGGTGACAAACACCTTAAAATGCATATTCCCTGGCTACCCCTCAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGGTGACAAACACCTTAAAATGCATATTCCCTGGCTACCCCTCAGG  150

seq1  CTATTGTTTGGGGTCACAGAGAAGTGGAGTAGCCACCACCTACTTTCAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGTTTGGGGTCACAGAGAAGTGGAGTAGCCACCACCTACTTTCAAC  200

seq1  CATCACCCTAGTATCCCAGGATCCACATCCATCCCACAGCATATCATAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACCCTAGTATCCCAGGATCCACATCCATCCCACAGCATATCATAAC  250

seq1  AAGAGGATAGATACATTATCCCCTGGATTCCTCAAGGCTGACCCCCCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGATAGATACATTATCCCCTGGATTCCTCAAGGCTGACCCCCCCCC  300

seq1  GACCCCCCAGCCCTAGCCTCAAGTTCTCACATAATGGAACCTTAAGCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCCCAGCCCTAGCCTCAAGTTCTCACATAATGGAACCTTAAGCAGA  350

seq1  AAGTAGACCCACAAGGGTTCCTGGTCAAATTGTAGCATGAGGGGTAGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGACCCACAAGGGTTCCTGGTCAAATTGTAGCATGAGGGGTAGCCA  400

seq1  GCTGCCCATCAGTGTGACCTCCTGTAAGACCAGAGCCTGGGAAAAGTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCCCATCAGTGTGACCTCCTGTAAGACCAGAGCCTGGGAAAAGTCAC  450

seq1  CTGTGTAAAGCAGCTCTGCCAGGCAGCTATGTTCCCCTATGGAACACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTAAAGCAGCTCTGCCAGGCAGCTATGTTCCCCTATGGAACACACT  500

seq1  AGCAGACTAGCCTTAGCCAGAATACTGTCACATAACTATCCCCAGTAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGACTAGCCTTAGCCAGAATACTGTCACATAACTATCCCCAGTAAAG  550

seq1  AAGCAGAGTGCTCAAATGAGGATTTCCTGAGGGGCCAAGGCAATGTGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGAGTGCTCAAATGAGGATTTCCTGAGGGGCCAAGGCAATGTGGGC  600

seq1  ACAAACAGAATATCCTGGGCAGAGAAAAGAACTGGAAACCTTAAAGATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAGAATATCCTGGGCAGAGAAAAGAACTGGAAACCTTAAAGATAG  650

seq1  GCAAGGAGATATGATGATGTCTATGGTATAAATAAATAAATAAATAGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGAGATATGATGATGTCTATGGTATAAATAAATAAATAAATAGATA  700

seq1  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAATAGATAAATAGATAAATAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAATAGATAAATAGATAAATAGA  750

seq1  TAAATAAAATGAGGTTTCCTCTGTGCTACAGAGTTCTGCAGACATCAGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAAAATGAGGTTTCCTCTGTGCTACAGAGTTCTGCAGACATCAGAG  800

seq1  AACACATCTATGTCTCTAGGTTGTGGAGGGGGTGTTCATATGAAGCCATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACATCTATGTCTCTAGGTTGTGGAGGGGGTGTTCATATGAAGCCATG  850

seq1  GTACCCCACCTTGTTCCTACAGGTTCTGGCAAGCTGTGGGGACATAGGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCCCACCTTGTTCCTACAGGTTCTGGCAAGCTGTGGGGACATAGGAC  900

seq1  TTAAGAGATGCCCGCCAGG-CCTCAGGGACACAGGATTAGGCCTGTACCC  949
      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||
seq2  TTAAGAGATGCCCGCCAGGCCCTCAAGGACACAGATTAAGGCCTGTACCC  950

seq1  CTCTACCAACCCCC-TTCCTGCTGCCTGCCCCAGCCTGCCCATCCAAGCC  998
      |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||
seq2  CTCTACCAACCCCCTTTCCTGCTGCCTG-CCCAGCCTGCCCAATCAAGCC  999

seq1  -TGCCCCCTGCGTGCCCGGAGCTACTGCTTGCCCAGACTTGCCCACAAAT  1047
       |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||
seq2  TTGCCCCTTGCGTGCCCGGAGCTACTGCTTG-CCAGACTTGCCACAAAAT  1048

seq1  TCC--TAGGGCCCTCTTTC-TTCCCAACATTCCCTG-CTCC-TCTCCCAG  1092
      |||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||
seq2  TCCCTAAGGGCCCTCTTTCTTTCCCAACATTCCCTGCCTCCTTCCTCCAG  1098

seq1  CCTCTCTCCTCCCCACTCATCTCCTAT--TCAGTCCCAGAATCTCCCACC  1140
       || | | || |  | |||||| ||||  ||||   |||||||| ||  |
seq2  GCTTTTTTCT-CTGATTCATCTTCTATTCTCAG-GTCAGAATCTTCCCAC  1146

seq1  TGC-TACCCGTGAGAATCTCAGAATCAGCTCTCGTATTCAGAGCCCTACT  1189
      ||| |||| |||||||||||   ||  |||||||||||| ||| ||||||
seq2  TGCTTACCGGTGAGAATCTC--GATACGCTCTCGTATTCCGAG-CCTACT  1193

seq1  GC-AGCCA  1196
      || |||||
seq2  GCTAGCCA  1201

seq1: chr7_150710534_150711653
seq2: B6Ng01-269I11.g_64_1177 (reverse)

seq1  AAAGAGCAAGTGCTTATTCAAGAAATACTTGACA-GAAAATCAGGGCTTT  49
      |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||
seq2  AAAG-GCAAGTGCTTTTTCAAGAAATACCTGACAGGAAATTCAAGGCTTT  49

seq1  TGACAATACATCTTACCAG-AGATTCTCCATCTCCAGAGGCTAGAAGAAG  98
      |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| ||||| |||||
seq2  TGAC-ATACATC-TACCAGAAGATTCT-CATCT-CAGA-GCTAG-AGAAG  93

seq1  AAAAGAAAACACACTTATATTACAA-CGACACCAATG-TTTTAACATCCA  146
      |||   |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||
seq2  AAA--GAAACACACTATTATTACAACCGACACCAATGTTTTTAACAT-CA  140

seq1  CACTGAAGGGAAATCAGCTGGCAAGCAGCTCTCTCAGACCCCAACAAGGC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAAGGGAAATCAGCTGGCAAGCAGCTCTCTCAGACCCCAACAAGGC  190

seq1  ACCGAGACACCTTGTGAACATTTCACAAGCTCCATCTGTTACAATTATTT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGAGACACCTTGTGAACATTTCACAAGCTCCATCTGTTACAATTATTT  240

seq1  CATTTAGATAAGGCAGTGGGTCAAAAAAGCTGAGAGTTTAAAGGATGAGC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAGATAAGGCAGTGGGTCAAAAAAGCTGAGAGTTTAAAGGATGAGC  290

seq1  AGGAGGTAGGTGAATCAGCTGCCCTACTGGACCATACAGAGACTGATCCT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGTAGGTGAATCAGCTGCCCTACTGGACCATACAGAGACTGATCCT  340

seq1  GTATGCCCTTCAATGCTGAATGGTACATGTTTATCTGCTATGGGGCAAAG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCCCTTCAATGCTGAATGGTACATGTTTATCTGCTATGGGGCAAAG  390

seq1  AGAAGAATGTACATTCTGCTGATGATCCTGCAGATGGGTTTGCAGCCTTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATGTACATTCTGCTGATGATCCTGCAGATGGGTTTGCAGCCTTT  440

seq1  CACCCAAAGATGATGCATCCATAGGGGTCTACATGCAAGACCATCAAAGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCAAAGATGATGCATCCATAGGGGTCTACATGCAAGACCATCAAAGT  490

seq1  GGTGCTGATATTCACCAGGTCAAAAAGAAGATGTGGGCTTCTTGCCACAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTGATATTCACCAGGTCAAAAAGAAGATGTGGGCTTCTTGCCACAC  540

seq1  CTCCATGAAACCAAACAACCATTACCTGACAGATAATTTGGACCTTGACT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGAAACCAAACAACCATTACCTGACAGATAATTTGGACCTTGACT  590

seq1  AGCAATAGGTTGGAGTAGATCTAATGCTCTCTGTTTAACTGTGGTGTCAG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATAGGTTGGAGTAGATCTAATGCTCTCTGTTTAACTGTGGTGTCAG  640

seq1  CATTTCTCACAGGGCTCATGTCAGTTGTTGTTACAGCCTGACAGCATTCA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTCACAGGGCTCATGTCAGTTGTTGTTACAGCCTGACAGCATTCA  690

seq1  CTGGTAGAAAACCACAGTATTGGGTGTATGAACACCACCTACAAGAGGCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTAGAAAACCACAGTATTGGGTGTATGAACACCACCTACAAGAGGCT  740

seq1  GTTACCATGTAGGCAAGGAACAGTCTGAGGGCTGGACCCCGTCTCCCAAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCATGTAGGCAAGGAACAGTCTGAGGGCTGGACCCCGTCTCCCAAG  790

seq1  TGACAAGCACCACAACACATGCCTTCCAGGCCAATTCTATAGGCTGAAGG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAGCACCACAACACATGCCTTCCAGGCCAATTCTATAGGCTGAAGG  840

seq1  TCAATGTAGTAGTGTCTCCATCCTAAAATCTGTAGCCCAGCCCCTGAGCA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGTAGTAGTGTCTCCATCCTAAAATCTGTAGCCCAGCCCCTGAGCA  890

seq1  CCATCCTCCTTCCTTTCCTGGTCCTAGAACTCATCACTGTTACATGTTGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCTCCTTCCTTTCCTGGTCCTAGAACTCATCACTGTTACATGTTGC  940

seq1  CTGACTGAAATTGTAGCCACTTATTTTCTCCTCTTCAACTTCCTGAAAGC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTGAAATTGTAGCCACTTATTTTCTCCTCTTCAACTTCCTGAAAGC  990

seq1  ACTGTTTACAGTTTTATATTCATTTCCCTTTAAAATGCAGGCTGGAAACT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTTACAGTTTTATATTCATTTCCCTTTAAAATGCAGGCTGGAAACT  1040

seq1  GAATAAGCTAATTTTAGAGTTGTGCCACTATAAAACATCACCCCTAAAAA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAGCTAATTTTAGAGTTGTGCCACTATAAAACATCACCCCTAAAAA  1090

seq1  TCACATCTGCTTATAAGTGAATTC  1120
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCTGCTTATAAGTGAATTC  1114