BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-270P15
Chromosome7 (Build37)
Map Location 125,597,587 - 125,697,144
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030018N11Rik, Coq7, Tmc7
Upstream geneXylt1, LOC669758, Rps15a, Arl6ip1, 2610207I05Rik, LOC100043339, Syt17, LOC100042845
Downstream geneB230311B06Rik, Tmc5, Mir16, 6330503K22Rik, 9030624J02Rik, 2310008H09Rik, Iqck, Gprc5b, Gpr139, LOC100042871, Gp2, Umod, 1700007B13Rik, C730027J19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-270P15.bB6Ng01-270P15.g
ACCGA073178GA073179
length1,1541,150
definitionB6Ng01-270P15.b B6Ng01-270P15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,695,964 - 125,697,144)(125,597,587 - 125,598,750)
sequence
gaattctaaatactgttcataattgtctcactgcatagtagccagaacac
aatagaagctgtatttgtgaataccacaagagactactgaactaaaactt
tggaccatacatcatacatgctaatagacacctgttagctattcaagagg
ctgaggcaggggatcacaagtttgagaatcaaatgggacacctcaacaaa
tgtttcaaaataaaatgtataagaggagggagctggtagtctagctcaga
tattaacctggcctggtagagactttgggttcaattgtcagcattgtagc
aaaaaataaaatacataaggtaaaataaataaatataaagaaattatttt
tgaaaaaaaaaagaagctaatgagtggggtgctgaagagatggctcagtg
gtaaatgttcactgatgctcttctagaggacagcggttggcttgattctc
agcacccacacggtggctcacaagcatctacaactccgattccaggttaa
ctgatgccctcacttggctttcacaggcaaacatgtaagcaaaacatcca
tacacataaaataagtatattttttaaaaggaagttattaaatggacaaa
aagataatggttttcatcaatgagatagatacctgctcagctgccatatg
gattcagaacaaacttgactgtgtcacagtgagccagcaatggacttatg
ttcaattttgtaaatcttaaatgagaccaactcaccatcctatactttgc
tgctgttctcagagtgatgcttttttgggggccaggtcggtggaagggtt
caagatcaacctgattcggagcgaggaacactttcagagttactgtaata
agatcttcgctggctgggacttctgcatcaccaaccgcagcatggctgag
ctgaagcacagcagcttgcggtacgagctccgagtgagtgctgccgggtt
gccctggggagggacctcagtcctggggagggacctcactggccaggttg
atctggggagctgtttgcagttcatggatgcaggcccagtctgtctcagc
acactcctgtgcagtttagagctctttatagcaacagcttattgactgat
caccttaccaacatgtgctagaacttgggactgtaagagtgtacacacat
gggg
gaattctatccctcctaatgcagggtctctgggaactggtatccagttcc
tctggtggtgcctctgccatctccagctcttaagatgagccagccatttc
cttagagcaccaagccctgtggggcagaagcatccacataataacagtct
tcagaagggaattaggggtgggagtgcagtctctggccgtagactacctg
ttatcattgaaaagtgcccggatggcagaaacagctgttgccacccatcg
ggccacacagcttctggtttagttactatcgattctggccattctcactg
atgaaacctgttgcccaagtcccttttaattctatggcatataaaacatg
tccttcacctgttccctgtatcccttcctgggctgtgtttctacccagaa
tgcctgggcagtaagaaagctcaaagctaattaaacggatagtctgaaac
agggtccccagacctcaagctatgctgcatacccatcagaattctctggt
ccccatctttgccagggacaagagttctgtcttgcctgtctaatgatttg
tgaccagaggcgacaagccatttcacctctgtgaacctcggttttccttg
tctgcaaaatgaatattatacactttggtgccagtgctggagagaactct
agccacttaggacaaatccacaaaacatggctcaccaggagtggttccct
tttttcccctcagagcatgtatttagcctggggcctcctgctttatttta
tgcttggaaggtggagtatgtatgtcaaggaggaaggaggaaccacatgg
aggttgaaattccaactgctctcatcagctagcctgcctgcaagtcacca
ctcacctctcccctcactgtgagacccaggatgcatctctctgtgggcct
cagccttctcctcagtgaatggggtcaaaatcagtgcttcatggcaggaa
gcaccctgccctccctgattgatgcatagagtactgtattttatccataa
gcactgtatcagccctcagagttctcagtaaatgcaacactacatgcttt
tttattctcagaatataattgactgagatacagttcttgttgcagagcca
cattctgagtgtagccatgatgtcacacacacacagtcatgcaacacagc

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_125695964_125697144
seq2: B6Ng01-270P15.b_47_1200 (reverse)

seq1  CCCCATGTGTGTCCCACCTCCCTTCCCAGTCCCAAGTTTCTAGCACCCAT  50
      |||||||||||| |   |||   |  |||||||||| ||||||||  |||
seq2  CCCCATGTGTGTAC--ACTC---TTACAGTCCCAAG-TTCTAGCA--CAT  42

seq1  GTTTGGGTTAAAGGTGATCAGTCCAATAAGCTGTTTGCTATAAAGAGCTC  100
      |||  |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GTT--GGT--AAGGTGATCAGT-CAATAAGCTG-TTGCTATAAAGAGCTC  86

seq1  TTAAAAACTGCAACAGGGAAGTGTGCTGAGACAGACTGGGCCCTGCAATC  150
      |   ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||   
seq2  T---AAACTGC-ACAGG--AGTGTGCTGAGACAGACTGGG-CCTGCA--T  127

seq1  CCATGAAACCTGCAAACAGCCTCCCCAGATCCAACCTGGCCAGTGAGGTC  200
      |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CCATGAA--CTGCAAACAG-CTCCCCAGAT-CAACCTGGCCAGTGAGGTC  173

seq1  CCTCCCCAGGACTGAGGTCCCTCCCCAGGGCAACCCGGCAGCACTCACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCAGGACTGAGGTCCCTCCCCAGGGCAACCCGGCAGCACTCACTC  223

seq1  GGAGCTCGTACCGCAAGCTGCTGTGCTTCAGCTCAGCCATGCTGCGGTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTCGTACCGCAAGCTGCTGTGCTTCAGCTCAGCCATGCTGCGGTTG  273

seq1  GTGATGCAGAAGTCCCAGCCAGCGAAGATCTTATTACAGTAACTCTGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGCAGAAGTCCCAGCCAGCGAAGATCTTATTACAGTAACTCTGAAA  323

seq1  GTGTTCCTCGCTCCGAATCAGGTTGATCTTGAACCCTTCCACCGACCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCCTCGCTCCGAATCAGGTTGATCTTGAACCCTTCCACCGACCTGG  373

seq1  CCCCCAAAAAAGCATCACTCTGAGAACAGCAGCAAAGTATAGGATGGTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCAAAAAAGCATCACTCTGAGAACAGCAGCAAAGTATAGGATGGTGA  423

seq1  GTTGGTCTCATTTAAGATTTACAAAATTGAACATAAGTCCATTGCTGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGTCTCATTTAAGATTTACAAAATTGAACATAAGTCCATTGCTGGCT  473

seq1  CACTGTGACACAGTCAAGTTTGTTCTGAATCCATATGGCAGCTGAGCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTGACACAGTCAAGTTTGTTCTGAATCCATATGGCAGCTGAGCAGG  523

seq1  TATCTATCTCATTGATGAAAACCATTATCTTTTTGTCCATTTAATAACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTCATTGATGAAAACCATTATCTTTTTGTCCATTTAATAACTT  573

seq1  CCTTTTAAAAAATATACTTATTTTATGTGTATGGATGTTTTGCTTACATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTAAAAAATATACTTATTTTATGTGTATGGATGTTTTGCTTACATG  623

seq1  TTTGCCTGTGAAAGCCAAGTGAGGGCATCAGTTAACCTGGAATCGGAGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTGTGAAAGCCAAGTGAGGGCATCAGTTAACCTGGAATCGGAGTT  673

seq1  GTAGATGCTTGTGAGCCACCGTGTGGGTGCTGAGAATCAAGCCAACCGCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATGCTTGTGAGCCACCGTGTGGGTGCTGAGAATCAAGCCAACCGCT  723

seq1  GTCCTCTAGAAGAGCATCAGTGAACATTTACCACTGAGCCATCTCTTCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCTAGAAGAGCATCAGTGAACATTTACCACTGAGCCATCTCTTCAG  773

seq1  CACCCCACTCATTAGCTTCTTTTTTTTTTCAAAAATAATTTCTTTATATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCACTCATTAGCTTCTTTTTTTTTTCAAAAATAATTTCTTTATATT  823

seq1  TATTTATTTTACCTTATGTATTTTATTTTTTGCTACAATGCTGACAATTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTTTACCTTATGTATTTTATTTTTTGCTACAATGCTGACAATTG  873

seq1  AACCCAAAGTCTCTACCAGGCCAGGTTAATATCTGAGCTAGACTACCAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAAAGTCTCTACCAGGCCAGGTTAATATCTGAGCTAGACTACCAGC  923

seq1  TCCCTCCTCTTATACATTTTATTTTGAAACATTTGTTGAGGTGTCCCATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCTCTTATACATTTTATTTTGAAACATTTGTTGAGGTGTCCCATT  973

seq1  TGATTCTCAAACTTGTGATCCCCTGCCTCAGCCTCTTGAATAGCTAACAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCTCAAACTTGTGATCCCCTGCCTCAGCCTCTTGAATAGCTAACAG  1023

seq1  GTGTCTATTAGCATGTATGATGTATGGTCCAAAGTTTTAGTTCAGTAGTC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCTATTAGCATGTATGATGTATGGTCCAAAGTTTTAGTTCAGTAGTC  1073

seq1  TCTTGTGGTATTCACAAATACAGCTTCTATTGTGTTCTGGCTACTATGCA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTGGTATTCACAAATACAGCTTCTATTGTGTTCTGGCTACTATGCA  1123

seq1  GTGAGACAATTATGAACAGTATTTAGAATTC  1181
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGACAATTATGAACAGTATTTAGAATTC  1154

seq1: chr7_125597587_125598750
seq2: B6Ng01-270P15.g_66_1215

seq1  GAATTCTATCCCTCCTAATGCAGGGTCTCTGGGAACTGGTATCCAGTTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATCCCTCCTAATGCAGGGTCTCTGGGAACTGGTATCCAGTTCC  50

seq1  TCTGGTGGTGCCTCTGCCATCTCCAGCTCTTAAGATGAGCCAGCCATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTGGTGCCTCTGCCATCTCCAGCTCTTAAGATGAGCCAGCCATTTC  100

seq1  CTTAGAGCACCAAGCCCTGTGGGGCAGAAGCATCCACATAATAACAGTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAGCACCAAGCCCTGTGGGGCAGAAGCATCCACATAATAACAGTCT  150

seq1  TCAGAAGGGAATTAGGGGTGGGAGTGCAGTCTCTGGCCGTAGACTACCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGGGAATTAGGGGTGGGAGTGCAGTCTCTGGCCGTAGACTACCTG  200

seq1  TTATCATTGAAAAGTGCCCGGATGGCAGAAACAGCTGTTGCCACCCATCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATTGAAAAGTGCCCGGATGGCAGAAACAGCTGTTGCCACCCATCG  250

seq1  GGCCACACAGCTTCTGGTTTAGTTACTATCGATTCTGGCCATTCTCACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACACAGCTTCTGGTTTAGTTACTATCGATTCTGGCCATTCTCACTG  300

seq1  ATGAAACCTGTTGCCCAAGTCCCTTTTAATTCTATGGCATATAAAACATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAACCTGTTGCCCAAGTCCCTTTTAATTCTATGGCATATAAAACATG  350

seq1  TCCTTCACCTGTTCCCTGTATCCCTTCCTGGGCTGTGTTTCTACCCAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCACCTGTTCCCTGTATCCCTTCCTGGGCTGTGTTTCTACCCAGAA  400

seq1  TGCCTGGGCAGTAAGAAAGCTCAAAGCTAATTAAACGGATAGTCTGAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGGGCAGTAAGAAAGCTCAAAGCTAATTAAACGGATAGTCTGAAAC  450

seq1  AGGGTCCCCAGACCTCAAGCTATGCTGCATACCCATCAGAATTCTCTGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCCCCAGACCTCAAGCTATGCTGCATACCCATCAGAATTCTCTGGT  500

seq1  CCCCATCTTTGCCAGGGACAAGAGTTCTGTCTTGCCTGTCTAATGATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATCTTTGCCAGGGACAAGAGTTCTGTCTTGCCTGTCTAATGATTTG  550

seq1  TGACCAGAGGCGACAAGCCATTTCACCTCTGTGAACCTCGGTTTTCCTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAGAGGCGACAAGCCATTTCACCTCTGTGAACCTCGGTTTTCCTTG  600

seq1  TCTGCAAAATGAATATTATACACTTTGGTGCCAGTGCTGGAGAGAACTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAAATGAATATTATACACTTTGGTGCCAGTGCTGGAGAGAACTCT  650

seq1  AGCCACTTAGGACAAATCCACAAAACATGGCTCACCAGGAGTGGTTCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTTAGGACAAATCCACAAAACATGGCTCACCAGGAGTGGTTCCCT  700

seq1  TTTTTCCCCTCAGAGCATGTATTTAGCCTGGGGCCTCCTGCTTTATTTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCCCCTCAGAGCATGTATTTAGCCTGGGGCCTCCTGCTTTATTTTA  750

seq1  TGCTTGGAAGGTGGAGTATGTATGTCAAGGAGGAAGGAGGAACCACATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGGAAGGTGGAGTATGTATGTCAAGGAGGAAGGAGGAACCACATGG  800

seq1  AGGTTGAAATTCCAACTGCTCTCATCAGCTAGCCTGCCTGCAAGTCACCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGAAATTCCAACTGCTCTCATCAGCTAGCCTGCCTGCAAGTCACCA  850

seq1  CTCACCTCTCCCCTCACTGTGAGACCCAGGATGCATCTCTCTGTGGGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTCTCCCCTCACTGTGAGACCCAGGATGCATCTCTCTGTGGGCCT  900

seq1  CAGCCTTCTCCTCAGTGAATGGGGTCAAAATCAGTGCTTCATGGCAGGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTTCTCCTCAGTGAATGGGGTCAAAATCAGTGCTTCATGGCAGGAA  950

seq1  GCACCCTGCCCTCCCTGATTGATGCATAGAGTAACTGTA-TTTATCCCAT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   
seq2  GCACCCTGCCCTCCCTGATTGATGCATAGAGT-ACTGTATTTTATCCATA  999

seq1  AGCACTGTATCAGCCCTCAGGAAGTTCTCAGTAAATGCAACCACTACATG  1049
      ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGCACTGTATCAGCCCTCAG--AGTTCTCAGTAAATGCAA-CACTACATG  1046

seq1  CCTTTTTATTCTCAAGATAT-ATGAACTGGAGATACAGTTC-TGTGGCAG  1097
      | ||||||||||||  |||| ||  ||| |||||||||||| ||| ||||
seq2  CTTTTTTATTCTCAGAATATAATTGACT-GAGATACAGTTCTTGTTGCAG  1095

seq1  AG-CACATCCCTAGAGGTGTGAGGCCATGGGTGGCACACACACACACACA  1146
      || ||||| |      | |||  ||||| | ||       ||||||||||
seq2  AGCCACATTC-----TGAGTGTAGCCAT-GATG------TCACACACACA  1133

seq1  CAGCCATGCACACACAGC  1164
      ||| |||||| |||||||
seq2  CAGTCATGCA-ACACAGC  1150