BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273I18
Chromosome7 (Build37)
Map Location 127,334,121 - 127,487,440
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCrym, Abca14, Abca15
Upstream geneLOC100042871, Gp2, Umod, 1700007B13Rik, C730027J19Rik, Acsm2, Acsm1, BC048390, Thumpd1, EG434233, Acsm3, Exod1, 2610020H08Rik, Dcun1d3, LOC100043399, LOC100043396, Lyrm1, Dnahc3, Tmem159, Zp2, Anks4b
Downstream geneAbca16, LOC668429, LOC546994, LOC100042914, E130201H02Rik, LOC637957, Uqcrc2, 4930408O21Rik, BC030336, E030013G06Rik, EG436008, LOC100043426, Eef2k, Polr3e, Cdr2, 4933427G17Rik, EG668548, Mettl9, LOC668456, Igsf6, Otoa, LOC668556
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273I18.bB6Ng01-273I18.g
ACCGA075092GA075093
length6521,113
definitionB6Ng01-273I18.b B6Ng01-273I18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,334,121 - 127,334,772)(127,486,319 - 127,487,440)
sequence
gaattcccagggcacgttacagaaagagttgagcagggggccaggaggga
tatctagacccaaatgtctctcatcttctagaccacactctttccaatag
taagatagaatactttttaaagataacacctaccattttcccttttaaaa
aacaacaacaacaacaaaaaaccaaaacgtatttgtatgtgtgtgtgcgg
gtgtatgtgtgcacatagatgcgtgtgcgtatatgtgcaggtgcatctgg
atgtcagaggttaagggagacattccccaagatggctgtctattttgttt
tttgagacagaacacctcactggggcacatggctttctgctcaggctcag
ctggttagcaagtgagccctgggaattggtccacttctaccttcccagcc
ttgagattacagatgcacacctccatgtctggggattaaactcaggttct
gatgctcacacggcgagcattttatagacgactaagccatcacctaagct
ggcaagcattttatagactaagccatcacctaagcgcttctgttctactt
caccccctcccaaattcttgtaagttcttacggtcacctagcagcactca
tttttaaaaaccatttaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gt
gaattctgtatgaagcaaagccagccttcaacagtgcgagagagacttcc
tggttccgggaccatacatcaggagtttggtgtcctcaatacatttttgt
tgttgttgttttattatattatttgctactaataactaaaaagctggggg
aaacactccagttatctgtctgagaggagaggctatacctttaatacttg
ctagagctctacagaagtagtttttaaattatcgttggtgctaaagtcat
aaattgctcacaatatggcattaattgtaatttataaaggaaaataatca
gaagcaatatagaagaggaaatgagatgagaatcaaagtggaagatacaa
ggaagcaacagacgaggcacataaaatagatggttgagtgtcaaacggaa
ctccttcctgaccaggaattaccttacttgtttacatggatttaatacaa
cagcgtgagttaaatcctgaagtggcaaaggaggcagaaggtgttggaag
ttcaaagatacatattaattgtgagtctagaaaaaaaattattcatgcca
acacctagagagagtgaaatggctaaactatcagatgaaatgatagattt
caataatcaaaagatactgtgaatagttcttgagctaaaaggccttgcta
tgtagctctggcaggcctggaactcactttgtagaccaggctgcattctt
cctacctcagcctctggagggctgggatcaaaggtgtgagctaccacacc
tgcccaggatggtcaaattttccagaggagaaaacatatctcactcatga
gacacacttaggcttcattagaaactgaggaaatgcaagtttactattca
tttctcttttgtggtgctgacaactggcaaggacatagaaaaacaggaat
tcctcaccttccaccagaactgtagttacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacactcacacatccctacttggcatgtgaattccttaaa
tgctgaagaaagcagctttatttgtctctgttgtagagatgactctagcc
accagtatgtaaccaagtaaagatgtctgatgacaatcagatgaagagtg
aatatctgtccat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_127334121_127334772
seq2: B6Ng01-273I18.b_44_695

seq1  GAATTCCCAGGGCACGTTACAGAAAGAGTTGAGCAGGGGGCCAGGAGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGGGCACGTTACAGAAAGAGTTGAGCAGGGGGCCAGGAGGGA  50

seq1  TATCTAGACCCAAATGTCTCTCATCTTCTAGACCACACTCTTTCCAATAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAGACCCAAATGTCTCTCATCTTCTAGACCACACTCTTTCCAATAG  100

seq1  TAAGATAGAATACTTTTTAAAGATAACACCTACCATTTTCCCTTTTAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATAGAATACTTTTTAAAGATAACACCTACCATTTTCCCTTTTAAAA  150

seq1  AACAACAACAACAACAAAAAACCAAAACGTATTTGTATGTGTGTGTGCGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAACAACAACAAAAAACCAAAACGTATTTGTATGTGTGTGTGCGG  200

seq1  GTGTATGTGTGCACATAGATGCGTGTGCGTATATGTGCAGGTGCATCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTGCACATAGATGCGTGTGCGTATATGTGCAGGTGCATCTGG  250

seq1  ATGTCAGAGGTTAAGGGAGACATTCCCCAAGATGGCTGTCTATTTTGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAGAGGTTAAGGGAGACATTCCCCAAGATGGCTGTCTATTTTGTTT  300

seq1  TTTGAGACAGAACACCTCACTGGGGCACATGGCTTTCTGCTCAGGCTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGACAGAACACCTCACTGGGGCACATGGCTTTCTGCTCAGGCTCAG  350

seq1  CTGGTTAGCAAGTGAGCCCTGGGAATTGGTCCACTTCTACCTTCCCAGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTAGCAAGTGAGCCCTGGGAATTGGTCCACTTCTACCTTCCCAGCC  400

seq1  TTGAGATTACAGATGCACACCTCCATGTCTGGGGATTAAACTCAGGTTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGATTACAGATGCACACCTCCATGTCTGGGGATTAAACTCAGGTTCT  450

seq1  GATGCTCACACGGCGAGCATTTTATAGACGACTAAGCCATCACCTAAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTCACACGGCGAGCATTTTATAGACGACTAAGCCATCACCTAAGCT  500

seq1  GGCAAGCATTTTATAGACTAAGCCATCACCTAAGCGCTTCTGTTCTACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGCATTTTATAGACTAAGCCATCACCTAAGCGCTTCTGTTCTACTT  550

seq1  CACCCCCTCCCAAATTCTTGTAAGTTCTTACGGTCACCTAGCAGCACTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCTCCCAAATTCTTGTAAGTTCTTACGGTCACCTAGCAGCACTCA  600

seq1  TTTTTAAAAACCATTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAACCATTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  650

seq1  GT  652
      ||
seq2  GT  652

seq1: chr7_127486319_127487440
seq2: B6Ng01-273I18.g_68_1180 (reverse)

seq1  ATGGACAGATATTCACTCTTTCATCCTTGATTTGTTCACTCAGACATTCT  50
      |||||||||||||||||| ||||||  |||||   ||| ||||||| |||
seq2  ATGGACAGATATTCACTC-TTCATC--TGATT--GTCA-TCAGACA-TCT  43

seq1  TTACTTGGGTTACATACTTGGTGCCTAGAGTCATCTCTAACAACAGAGAC  100
      |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTACTT-GGTTACATAC-TGGTGGCTAGAGTCATCTCT-ACAACAGAGAC  90

seq1  AAATAAAGCTTGCTTTC-TCAGCATTTAAGG-ATTCACATGCCAAGTTGG  148
      ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |
seq2  AAATAAAGC-TGCTTTCTTCAGCATTTAAGGAATTCACATGCCAAG-TAG  138

seq1  GGTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAA  198
      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAA  188

seq1  CTACAGTTCTGGTGGAAGGTGA-GAATTCCTGTTTTTCTATGTCCTTGCC  247
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGTTCTGGTGGAAGGTGAGGAATTCCTGTTTTTCTATGTCCTTGCC  238

seq1  AGTTGTCAGCACCACAAAAGAGAAATGAATAGTAAACTTGCATTTCCTCA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTCAGCACCACAAAAGAGAAATGAATAGTAAACTTGCATTTCCTCA  288

seq1  GTTTCTAATGAAGCCTAAGTGTGTCTCATGAGTGAGATATGTTTTCTCCT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTAATGAAGCCTAAGTGTGTCTCATGAGTGAGATATGTTTTCTCCT  338

seq1  CTGGAAAATTTGACCATCCTGGGCAGGTGTGGTAGCTCACACCTTTGATC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAAATTTGACCATCCTGGGCAGGTGTGGTAGCTCACACCTTTGATC  388

seq1  CCAGCCCTCCAGAGGCTGAGGTAGGAAGAATGCAGCCTGGTCTACAAAGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCTCCAGAGGCTGAGGTAGGAAGAATGCAGCCTGGTCTACAAAGT  438

seq1  GAGTTCCAGGCCTGCCAGAGCTACATAGCAAGGCCTTTTAGCTCAAGAAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCAGGCCTGCCAGAGCTACATAGCAAGGCCTTTTAGCTCAAGAAC  488

seq1  TATTCACAGTATCTTTTGATTATTGAAATCTATCATTTCATCTGATAGTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCACAGTATCTTTTGATTATTGAAATCTATCATTTCATCTGATAGTT  538

seq1  TAGCCATTTCACTCTCTCTAGGTGTTGGCATGAATAATTTTTTTTCTAGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATTTCACTCTCTCTAGGTGTTGGCATGAATAATTTTTTTTCTAGA  588

seq1  CTCACAATTAATATGTATCTTTGAACTTCCAACACCTTCTGCCTCCTTTG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAATTAATATGTATCTTTGAACTTCCAACACCTTCTGCCTCCTTTG  638

seq1  CCACTTCAGGATTTAACTCACGCTGTTGTATTAAATCCATGTAAACAAGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTCAGGATTTAACTCACGCTGTTGTATTAAATCCATGTAAACAAGT  688

seq1  AAGGTAATTCCTGGTCAGGAAGGAGTTCCGTTTGACACTCAACCATCTAT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAATTCCTGGTCAGGAAGGAGTTCCGTTTGACACTCAACCATCTAT  738

seq1  TTTATGTGCCTCGTCTGTTGCTTCCTTGTATCTTCCACTTTGATTCTCAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGTGCCTCGTCTGTTGCTTCCTTGTATCTTCCACTTTGATTCTCAT  788

seq1  CTCATTTCCTCTTCTATATTGCTTCTGATTATTTTCCTTTATAAATTACA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTTCCTCTTCTATATTGCTTCTGATTATTTTCCTTTATAAATTACA  838

seq1  ATTAATGCCATATTGTGAGCAATTTATGACTTTAGCACCAACGATAATTT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGCCATATTGTGAGCAATTTATGACTTTAGCACCAACGATAATTT  888

seq1  AAAAACTACTTCTGTAGAGCTCTAGCAAGTATTAAAGGTATAGCCTCTCC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACTACTTCTGTAGAGCTCTAGCAAGTATTAAAGGTATAGCCTCTCC  938

seq1  TCTCAGACAGATAACTGGAGTGTTTCCCCCAGCTTTTTAGTTATTAGTAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGACAGATAACTGGAGTGTTTCCCCCAGCTTTTTAGTTATTAGTAG  988

seq1  CAAATAATATAATAAAACAACAACAACAAAAATGTATTGAGGACACCAAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATATAATAAAACAACAACAACAAAAATGTATTGAGGACACCAAA  1038

seq1  CTCCTGATGTATGGTCCCGGAACCAGGAAGTCTCTCTCGCACTGTTGAAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGATGTATGGTCCCGGAACCAGGAAGTCTCTCTCGCACTGTTGAAG  1088

seq1  GCTGGCTTTGCTTCATACAGAATTC  1122
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCTTTGCTTCATACAGAATTC  1113