BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-273L12
Chromosome7 (Build37)
Map Location 138,318,771 - 138,500,240
singlet/doubletdoublet
Overlap gene5430419D17Rik, LOC546006, LOC100043173, Cuzd1, 1700007K09Rik, 1700063I17Rik, 2310057M21Rik
Upstream geneFgfr2, LOC546005, Ate1, LOC100043163, Nsmce4a, Tacc2, LOC619876, Btbd16, EG434249, Plekha1, Htra1, Dmbt1, 4933402N03Rik
Downstream genePstk, Ikzf5, Acadsb, Hmx3, Hmx2, Bub3, LOC677073, LOC100043679, Gpr26, Cpxm2, 4631426J05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-273L12.bB6Ng01-273L12.g
ACCGA075217GA075218
length1,167658
definitionB6Ng01-273L12.b B6Ng01-273L12.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(138,318,771 - 138,319,940)(138,499,584 - 138,500,240)
sequence
gaattcataaattcaaaacaaataacttgattacagataattgtatgcat
atatttatgcaatattcccagtgtttaaaaaaacagttaagttgtactgg
agcataaggaatgatctcgtgggtgctttatgctttcttttgcatctaca
tatcctatagtacttgagcctgggaatacaggttggagacacagcaatct
cgtggtgattctcaacctgtgggtctcgaccctttggtggtcaaacaacc
ctttctcagggatcacctaaggccagcaaaaccacagatatttacattat
cattcataacagtagcaaaattatagcaacgaaaataatttcatggctgg
ggtcaccacaacatgaggaactgtattaaagggtcacggcattaggaagg
ctaaggaccactgctctagagccttcaggacctaatgcgcactttctagt
cttaggaacttgaaacaagttttgaattctcatgcctctgtgccttctcc
tacaaagggcgtgacatgtgagattaatgaggtgttagcaaaagacttcg
aagggtcactcagacacaggaagtgctcagtcagtctaattactgctata
gatgctgtggactacaagttgtacatcttagatgaagaagtgaaattatt
gaatctcagattcccttagctatgagatctccactttccaagttccccta
agacattgggatagtcccccttccaatatttcagtagctcttttctttcc
ctttttccttttcattgtatgtatgtgtctgtgtgggagcaagcacctga
gcaccaggcccccagaagctggaagagaagtaaggtcccctggaattaga
gttacagaggctgtgagcagcgcagtgtgtgtgtgtgctgggagctgaac
tccagtcttctgcagaagtagcattctcttttttttcataaaactttatt
acatatgtaatttttcttcctatcatgctcaactccaatatcaatccctg
ggttgacaaacaatataaggcacaaatgggctaagcagtttcctgaatcc
taaaggaaaaatcttgctttcatggatatgttttacataaagtctctcca
tgtcatgtaatatgtacagtgagtgaagtgaatttaaatatgatggctaa
actacgagatcttgcat
gaattcaggacagccagggctacacagaactgccaagaaaaaaaccaagg
tcacatttcatttgggtaatggaagaggaaggtgggtgagtcatggccac
ctagaggctggttattttagagagactctagtaatgggtatgatcctctg
tgctggaaggagtcagatccagctcagaacgaaagggaatgagtagacag
gagagatttgaagatttgtgctggatcatagagagctttgatgctatttt
aagtgtgtaaatgcttttggcatgttttaaattttaaaccactattatat
ggaaagtaagtcaaaagaaagcaagactacaaccgagagaccagctgtat
gtgacttcccacccatgagaggtgatgtggtttacagtaggtgccgtaac
gtaacgtgtgtgacgtaacgtgtgtgccgtaacgtgtgtgacgctgggtc
atgcgattgctgggccaggaagcgcagagtcgttgagactagacagttaa
taaactgttgaaggagaaagtaaagccagatgagaaattgaggtttccag
gatggtattacaagaaatataaatggagccgagcagatgaggacacttgg
taaaaggagtctaatttggggaaatataaaatttagctgtgggccaggcg
tggtggca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_138318771_138319940
seq2: B6Ng01-273L12.b_46_1212

seq1  GAATTCATAAATTCAAAACAAATAACTTGATTACAGATAATTGTATGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAAATTCAAAACAAATAACTTGATTACAGATAATTGTATGCAT  50

seq1  ATATTTATGCAATATTCCCAGTGTTTAAAAAAACAGTTAAGTTGTACTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATGCAATATTCCCAGTGTTTAAAAAAACAGTTAAGTTGTACTGG  100

seq1  AGCATAAGGAATGATCTCGTGGGTGCTTTATGCTTTCTTTTGCATCTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAAGGAATGATCTCGTGGGTGCTTTATGCTTTCTTTTGCATCTACA  150

seq1  TATCCTATAGTACTTGAGCCTGGGAATACAGGTTGGAGACACAGCAATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTATAGTACTTGAGCCTGGGAATACAGGTTGGAGACACAGCAATCT  200

seq1  CGTGGTGATTCTCAACCTGTGGGTCTCGACCCTTTGGTGGTCAAACAACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTGATTCTCAACCTGTGGGTCTCGACCCTTTGGTGGTCAAACAACC  250

seq1  CTTTCTCAGGGATCACCTAAGGCCAGCAAAACCACAGATATTTACATTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCAGGGATCACCTAAGGCCAGCAAAACCACAGATATTTACATTAT  300

seq1  CATTCATAACAGTAGCAAAATTATAGCAACGAAAATAATTTCATGGCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCATAACAGTAGCAAAATTATAGCAACGAAAATAATTTCATGGCTGG  350

seq1  GGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCACGGCATTAGGAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACCACAACATGAGGAACTGTATTAAAGGGTCACGGCATTAGGAAGG  400

seq1  CTAAGGACCACTGCTCTAGAGCCTTCAGGACCTAATGCGCACTTTCTAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGACCACTGCTCTAGAGCCTTCAGGACCTAATGCGCACTTTCTAGT  450

seq1  CTTAGGAACTTGAAACAAGTTTTGAATTCTCATGCCTCTGTGCCTTCTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGAACTTGAAACAAGTTTTGAATTCTCATGCCTCTGTGCCTTCTCC  500

seq1  TACAAAGGGCGTGACATGTGAGATTAATGAGGTGTTAGCAAAAGACTTCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAGGGCGTGACATGTGAGATTAATGAGGTGTTAGCAAAAGACTTCG  550

seq1  AAGGGTCACTCAGACACAGGAAGTGCTCAGTCAGTCTAATTACTGCTATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTCACTCAGACACAGGAAGTGCTCAGTCAGTCTAATTACTGCTATA  600

seq1  GATGCTGTGGACTACAAGTTGTACATCTTAGATGAAGAAGTGAAATTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTGGACTACAAGTTGTACATCTTAGATGAAGAAGTGAAATTATT  650

seq1  GAATCTCAGATTCCCTTAGCTATGAGATCTCCACTTTCCAAGTTCCCCTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTCAGATTCCCTTAGCTATGAGATCTCCACTTTCCAAGTTCCCCTA  700

seq1  AGACATTGGGATAGTCCCCCTTCCAATATTTCAGTAGCTCTTTTCTTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATTGGGATAGTCCCCCTTCCAATATTTCAGTAGCTCTTTTCTTTCC  750

seq1  CTTTTTCCTTTTCATTGTATGTATGTGTCTGTGTGGGAGCAAGCACCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCCTTTTCATTGTATGTATGTGTCTGTGTGGGAGCAAGCACCTGA  800

seq1  GCACCAGGCCCCCAGAAGCTGGAAGAGAAGTAAGGTCCCCTGGAATTAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAGGCCCCCAGAAGCTGGAAGAGAAGTAAGGTCCCCTGGAATTAGA  850

seq1  GTTACAGAGGCTGTGAGCAGCGCAGTGTGTGTGTGTGCTGGGAGCTGAAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGAGGCTGTGAGCAGCGCAGTGTGTGTGTGTGCTGGGAGCTGAAC  900

seq1  TCCAGTCTTCTGCAGAAGTAGCATTCTCTTTTTTTTCAATAAAACTTTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCCAGTCTTCTGCAGAAGTAGCATTCTCTTTTTTTTC-ATAAAACTTTAT  949

seq1  TACATATGTAA-TTTTCTTCCTATCATGCTCAACCTCCAATATCAAATCC  999
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||
seq2  TACATATGTAATTTTTCTTCCTATCATGCTCAA-CTCCAATATC-AATCC  997

seq1  CTGGGTTGACAAACAATATAAGCCACAAATGGGCTAAGCAG-TTCCTGAA  1048
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGGGTTGACAAACAATATAAGGCACAAATGGGCTAAGCAGTTTCCTGAA  1047

seq1  TCCTAAA-GAAAAATCTTTGCTTTCCATGGTTATGTATTTACATAAAGTC  1097
      ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||
seq2  TCCTAAAGGAAAAATC-TTGCTTT-CATGGATATGT-TTTACATAAAGTC  1094

seq1  TCTTTCATGTCATGT-ATATGTACAGTGAGTTGAGTG-ATATTAATATGA  1145
      || | |||||||||| |||||||||||||||  |||| || | |||||||
seq2  TC-TCCATGTCATGTAATATGTACAGTGAGTGAAGTGAATTTAAATATGA  1143

seq1  TAGCTAAAACTACGAGATCATGCAT  1170
      | ||| ||||||||||||| |||||
seq2  TGGCT-AAACTACGAGATCTTGCAT  1167

seq1: chr7_138499584_138500240
seq2: B6Ng01-273L12.g_67_724 (reverse)

seq1  TGCCACCACGCCTGGCCCACAGCTAAATTTTATA-TTCCCCAAATTAGAC  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGCCACCACGCCTGGCCCACAGCTAAATTTTATATTTCCCCAAATTAGAC  50

seq1  TCCTTTTACCAAGTGTCCTCATCTGCTCGGCTCCATTTATATTTCTTGTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTACCAAGTGTCCTCATCTGCTCGGCTCCATTTATATTTCTTGTA  100

seq1  ATACCATCCTGGAAACCTCAATTTCTCATCTGGCTTTACTTTCTCCTTCA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCATCCTGGAAACCTCAATTTCTCATCTGGCTTTACTTTCTCCTTCA  150

seq1  ACAGTTTATTAACTGTCTAGTCTCAACGACTCTGCGCTTCCTGGCCCAGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTTATTAACTGTCTAGTCTCAACGACTCTGCGCTTCCTGGCCCAGC  200

seq1  AATCGCATGACCCAGCGTCACACACGTTACGGCACACACGTTACGTCACA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGCATGACCCAGCGTCACACACGTTACGGCACACACGTTACGTCACA  250

seq1  CACGTTACGTTACGGCACCTACTGTAAACCACATCACCTCTCATGGGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTTACGTTACGGCACCTACTGTAAACCACATCACCTCTCATGGGTGG  300

seq1  GAAGTCACATACAGCTGGTCTCTCGGTTGTAGTCTTGCTTTCTTTTGACT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCACATACAGCTGGTCTCTCGGTTGTAGTCTTGCTTTCTTTTGACT  350

seq1  TACTTTCCATATAATAGTGGTTTAAAATTTAAAACATGCCAAAAGCATTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCCATATAATAGTGGTTTAAAATTTAAAACATGCCAAAAGCATTT  400

seq1  ACACACTTAAAATAGCATCAAAGCTCTCTATGATCCAGCACAAATCTTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTTAAAATAGCATCAAAGCTCTCTATGATCCAGCACAAATCTTCA  450

seq1  AATCTCTCCTGTCTACTCATTCCCTTTCGTTCTGAGCTGGATCTGACTCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCTCCTGTCTACTCATTCCCTTTCGTTCTGAGCTGGATCTGACTCC  500

seq1  TTCCAGCACAGAGGATCATACCCATTACTAGAGTCTCTCTAAAATAACCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCACAGAGGATCATACCCATTACTAGAGTCTCTCTAAAATAACCA  550

seq1  GCCTCTAGGTGGCCATGACTCACCCACCTTCCTCTTCCATTACCCAAATG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTAGGTGGCCATGACTCACCCACCTTCCTCTTCCATTACCCAAATG  600

seq1  AAATGTGACCTTGGTTTTTTTCTTGGCAGTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGACCTTGGTTTTTTTCTTGGCAGTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTC  650

seq1  CTGAATTC  657
      ||||||||
seq2  CTGAATTC  658