BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-275O16
Chromosome7 (Build37)
Map Location 104,595,484 - 104,737,224
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKctd14, Ints4, 1810020D17Rik, Rsf1
Upstream geneOdz4, Nars2, Gab2, LOC100040457, Usp35, EG622320, Alg8, Ndufc2, Thrsp
Downstream geneLOC622994, LOC100040211, Clns1a, Aqp11, LOC100040594, Pak1, Gdpd4, Myo7a, Capn5, Omp, B3gnt6, Phca, Tsku, LOC100040269, Gucy2d, LOC100040721, EG434215, A630091E08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-275O16.bB6Ng01-275O16.g
ACCGA076830GA076831
length9921,139
definitionB6Ng01-275O16.b B6Ng01-275O16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,736,323 - 104,737,224)(104,595,484 - 104,596,626)
sequence
gaattcacagctgaatggacgattaggaattggggcatagctgaaagtag
gtcacttggggtatgcctttgaagagtttttcttgttggatctatgctac
agatctcgatccctccctcttttcttcctttccatctccttccccttcct
tgtttctagctgccaggaaatgcgcagctttatttactacaccctctttc
acacctcttccatattgtcctctgatccaccaccaaaaccttacaaacca
cgagccaacatcatctttccacctctcaagttgttgttgttgtttttatt
tatttattttatgtatgtgagcacactgtagctgtacagatggttacgcg
tcttcatgtggttgttgggaattaaatttttaagacctctactcgctctg
gtcaaccccaccactccagtcaaccccactcgctctggtcggccccactc
gctccagcccaaagatttattataatacataagtacactgtagctgtctt
caaacagctaccaaaagagggcatcatatcttattacagatggttgtgag
ccaccatgtggttgctgggatttgaactcaggaccttcagaagagcagtc
agtgctcttacctgctgagccatctcgccagccccctctcaagttgttga
gaccaacaaacagaaaataggtgtcatcctaattttgttatataatccat
aaatgcacaaaagcatctctgcctcctaaatgctgagattataggtgtgc
accaccaccactgcccagcttttgtacttttaaaccctacagctttactg
tttatcttcactattaaagctataagcccgccaaatgcaagggatattat
ttatgtgccttaatataataagacattccagggctgggagatacagctca
gcagttaagagcactggctcctcttccagaggacctgagctggtgggctc
acagccatctgtaatgggatctgatgtcgttttctgggcatg
gaattcttttgtggccaaagcatgaaccaagatgaaaccacaaatccctt
tcagaaaatgccccgacctctgccatatttcaggcagagaaagaggccca
aaggcagacagggactggcccaaggtaatactgagaacaaatggcagagt
cagagctaatagtctggcctcttgcttgttaactgactctgaaagaggct
ctgtcttctggggcccagggatccgtacaatggagctgctcttcccttat
ttgaactgtgatggtcaaatgtgctaatgaatacaaaagtgggggtctgg
ggaccatctaaactcatcttcaaagtttcctcacagaaaagaacaagctg
gagggaaaggcattctaagttccgggaatggcatgaacaaaggcgcggga
gagcaggctgttcagacagctgggctggagcagacagaagatggagctaa
aaacccacaggaaatggagctaaaagctgttcctccgagtgtcaggccct
ccattcattctggggtgaaagtccttgagaactccgcctccctggaggag
tcacctctgtccatggcattaattcctctgggagtcaaactgcagagagc
agaatgtaaggccgggaagctcaccttgtcacctgctacatggcttggac
ccttggcagagagacactgtttgaggcacatgccttgccccggggatgtg
gcttggatatggtgtgagcgtgtgccccaaagttttctatgtaggaaact
ttatactcagtgtggtgatgttaacaggtggcagaggttgttattaaccc
ttccctggtctctctctgggtttggatataagttgtaatttctccctctt
ttgcatgcccttaatgccatgcaccataatgtaacccagcctggggagtc
ctcaccagagactgaatcaatagggactttctgattcttttggccccaaa
ctgtgagctgaataaatctcttttctgataaagtacctaacttcagattt
gggctatagtgacagaaaatgaaaccattgcacctctatacaaagcatta
atctgtgtgaatcaagagaggagagtcattagtctagttacttttctatt
gctttggataaggctctccggccaaagcaagtcagaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_104736323_104737224
seq2: B6Ng01-275O16.b_46_949 (reverse)

seq1  CTGCTGAGCTGTATCT-CCAGCCCTGGAATGTCTTATTATATTAAGGCAC  49
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGCTGTATCTCCCAGCCCTGGAATGTCTTATTATATTAAGGCAC  50

seq1  ATAAATAATAT-CCTTGCATTTGGCGGGCTTATAGCTTTAATAGTGAAGA  98
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATAATATCCCTTGCATTTGGCGGGCTTATAGCTTTAATAGTGAAGA  100

seq1  TAAACAGTAAAGCTGTAGGGTTTAAAAGTACAAAAGCTGGGCAGTGGTGG  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGTAAAGCTGTAGGGTTTAAAAGTACAAAAGCTGGGCAGTGGTGG  150

seq1  TGGTGCACACCTATAATCTCAGCATTTAGGAGGCAGAGATGCTTTTGTGC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCACACCTATAATCTCAGCATTTAGGAGGCAGAGATGCTTTTGTGC  200

seq1  ATTTATGGATTATATAACAAAATTAGGATGACACCTATTTTCTGTTTGTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGGATTATATAACAAAATTAGGATGACACCTATTTTCTGTTTGTT  250

seq1  GGTCTCAACAACTTGAGAGGGGGCTGGCGAGATGGCTCAGCAGGTAAGAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCAACAACTTGAGAGGGGGCTGGCGAGATGGCTCAGCAGGTAAGAG  300

seq1  CACTGACTGCTCTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGACTGCTCTTCTGAAGGTCCTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACATG  350

seq1  GTGGCTCACAACCATCTGTAATAAGATATGATGCCCTCTTTTGGTAGCTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTCACAACCATCTGTAATAAGATATGATGCCCTCTTTTGGTAGCTG  400

seq1  TTTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATGTATTATAATAAATCTTTGGGCTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGACAGCTACAGTGTACTTATGTATTATAATAAATCTTTGGGCTG  450

seq1  GAGCGAGTGGGGCCGACCAGAGCGAGTGGGGTTGACTGGAGTGGTGGGGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGAGTGGGGCCGACCAGAGCGAGTGGGGTTGACTGGAGTGGTGGGGT  500

seq1  TGACCAGAGCGAGTAGAGGTCTTAAAAATTTAATTCCCAACAACCACATG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCAGAGCGAGTAGAGGTCTTAAAAATTTAATTCCCAACAACCACATG  550

seq1  AAGACGCGTAACCATCTGTACAGCTACAGTGTGCTCACATACATAAAATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACGCGTAACCATCTGTACAGCTACAGTGTGCTCACATACATAAAATA  600

seq1  AATAAATAAAAACAACAACAACAACTTGAGAGGTGGAAAGATGATGTTGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAAAACAACAACAACAACTTGAGAGGTGGAAAGATGATGTTGG  650

seq1  CTCGTGGTTTGTAAGGTTTTGGTGGTGGATCAGAGGACAATATGGAAGAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGTGGTTTGTAAGGTTTTGGTGGTGGATCAGAGGACAATATGGAAGAG  700

seq1  GTGTGAAAGAGGGTGTAGTAAATAAAGCTGCGCATTTCCTGGCAGCTAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAAAGAGGGTGTAGTAAATAAAGCTGCGCATTTCCTGGCAGCTAGA  750

seq1  AACAAGGAAGGGGAAGGAGATGGAAAGGAAGAAAAGAGGGAGGGATCGAG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGGAAGGGGAAGGAGATGGAAAGGAAGAAAAGAGGGAGGGATCGAG  800

seq1  ATCTGTAGCATAGATCCAACAAGAAAAACTCTTCAAAGGCATACCCCAAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAGCATAGATCCAACAAGAAAAACTCTTCAAAGGCATACCCCAAG  850

seq1  TGACCTACTTTCAGCTATGCCCCAATTCCTAATCGTCCATTCAGCTGTGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCTACTTTCAGCTATGCCCCAATTCCTAATCGTCCATTCAGCTGTGA  900

seq1  ATTC  902
      ||||
seq2  ATTC  904

seq1: chr7_104595484_104596626
seq2: B6Ng01-275O16.g_65_1203

seq1  GAATTCTTTTGTGGCCAAAGCATGAACCAAGATGAAACCACAAATCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTGGCCAAAGCATGAACCAAGATGAAACCACAAATCCCTT  50

seq1  TCAGAAAATGCCCCGACCTCTGCCATATTTCAGGCAGAGAAAGAGGCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAATGCCCCGACCTCTGCCATATTTCAGGCAGAGAAAGAGGCCCA  100

seq1  AAGGCAGACAGGGACTGGCCCAAGGTAATACTGAGAACAAATGGCAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGACAGGGACTGGCCCAAGGTAATACTGAGAACAAATGGCAGAGT  150

seq1  CAGAGCTAATAGTCTGGCCTCTTGCTTGTTAACTGACTCTGAAAGAGGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTAATAGTCTGGCCTCTTGCTTGTTAACTGACTCTGAAAGAGGCT  200

seq1  CTGTCTTCTGGGGCCCAGGGATCCGTACAATGGAGCTGCTCTTCCCTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTTCTGGGGCCCAGGGATCCGTACAATGGAGCTGCTCTTCCCTTAT  250

seq1  TTGAACTGTGATGGTCAAATGTGCTAATGAATACAAAAGTGGGGGTCTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTGTGATGGTCAAATGTGCTAATGAATACAAAAGTGGGGGTCTGG  300

seq1  GGACCATCTAAACTCATCTTCAAAGTTTCCTCACAGAAAAGAACAAGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCATCTAAACTCATCTTCAAAGTTTCCTCACAGAAAAGAACAAGCTG  350

seq1  GAGGGAAAGGCATTCTAAGTTCCGGGAATGGCATGAACAAAGGCGCGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAAAGGCATTCTAAGTTCCGGGAATGGCATGAACAAAGGCGCGGGA  400

seq1  GAGCAGGCTGTTCAGACAGCTGGGCTGGAGCAGACAGAAGATGGAGCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGCTGTTCAGACAGCTGGGCTGGAGCAGACAGAAGATGGAGCTAA  450

seq1  AAACCCACAGGAAATGGAGCTAAAAGCTGTTCCTCCGAGTGTCAGGCCCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCACAGGAAATGGAGCTAAAAGCTGTTCCTCCGAGTGTCAGGCCCT  500

seq1  CCATTCATTCTGGGGTGAAAGTCCTTGAGAACTCCGCCTCCCTGGAGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCATTCTGGGGTGAAAGTCCTTGAGAACTCCGCCTCCCTGGAGGAG  550

seq1  TCACCTCTGTCCATGGCATTAATTCCTCTGGGAGTCAAACTGCAGAGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTCTGTCCATGGCATTAATTCCTCTGGGAGTCAAACTGCAGAGAGC  600

seq1  AGAATGTAAGGCCGGGAAGCTCACCTTGTCACCTGCTACATGGCTTGGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGTAAGGCCGGGAAGCTCACCTTGTCACCTGCTACATGGCTTGGAC  650

seq1  CCTTGGCAGAGAGACACTGTTTGAGGCACATGCCTTGCCCCGGGGATGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCAGAGAGACACTGTTTGAGGCACATGCCTTGCCCCGGGGATGTG  700

seq1  GCTTGGATATGGTGTGAGCGTGTGCCCCAAAGTTTTCTATGTAGGAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGATATGGTGTGAGCGTGTGCCCCAAAGTTTTCTATGTAGGAAACT  750

seq1  TTATACTCAGTGTGGTGATGTTAACAGGTGGCAGAGGTTGTTATTAACCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACTCAGTGTGGTGATGTTAACAGGTGGCAGAGGTTGTTATTAACCC  800

seq1  TTCCCTGGTCTCTCTCTGGGTTTGGATATAAGTTGTAATTTCTCCCTCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTGGTCTCTCTCTGGGTTTGGATATAAGTTGTAATTTCTCCCTCTT  850

seq1  TTGCATGCCCTTAATGCCATGCACCATAATGTAACCCAGCCTGGGGAGTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATGCCCTTAATGCCATGCACCATAATGTAACCCAGCCTGGGGAGTC  900

seq1  CTCACCAGAGACTGAATCAATAGGGAC-TTCTGA-TCTTTTGGCCCCCAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |
seq2  CTCACCAGAGACTGAATCAATAGGGACTTTCTGATTCTTTTGGCCCC--A  948

seq1  AACTGTGAGCTGAATAAATCTCTTTTCTTGATAAAGTACCTAACTTCAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
seq2  AACTGTGAGCTGAATAAATCTCTTTTC-TGATAAAGTACCTAACTTCA-G  996

seq1  AATTTGGCTATAGTGACAGAAAATG-AACCATTGCA-CTCTATACAAAGC  1046
      | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  ATTTGGGCTATAGTGACAGAAAATGAAACCATTGCACCTCTATACAAAGC  1046

seq1  AATTAATTCTGTGTG-ATCAAGAGAGGAGAGTCA-TAGTCTTAGTTACTT  1094
       ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  -ATTAA-TCTGTGTGAATCAAGAGAGGAGAGTCATTAGTC-TAGTTACTT  1093

seq1  TTCTA-TGCTTT-GATAAAGCTCTCCGGCAAAGGCAAGTTAAGAGAGAAA  1142
      ||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||      |||||
seq2  TTCTATTGCTTTGGATAAGGCTCTCCGGCCAAAGCAAGT-----CAGAAA  1138

seq1  G  1143
      |
seq2  G  1139