BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-280D23
Chromosome7 (Build37)
Map Location 149,156,731 - 149,325,914
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBrsk2, 2700078K21Rik, Dusp8, LOC100039728, EG668763
Upstream geneLOC665143, Ifitm3, Ifitm6, B4galnt4, Pkp3, Sigirr, Trp53i5, Ptdss2, Rnh1, LOC546015, Hras1, Lrrc56, 1600016N20Rik, Rassf7, AA673488, Irf7, Mucdhl, Sct, Drd4, Deaf1, Tmem80, Eps8l2, B230206H07Rik, Taldo1, LOC100043585, Pddc1, Cend1, Slc25a22, Lrdd, Rplp2, Pnpla2, Efcab4a, Cd151, Polr2l, Tspan4, Chid1, Ap2a2, Muc6, LOC100039649, Muc2, Muc5ac, Muc5b, Tollip, EG623757
Downstream geneLOC100043616, EG665295, LOC100043617, Krtap5-2, LOC100039757, LOC100039767, EG665305, Krtap5-5, EG640223, LOC672428, LOC100039800, LOC100043627, LOC100043629, ENSMUSG00000038442, Krtap5-1, Krtap5-4, LOC270015, 6330512M04Rik, Ctsd, Syt8, Tnni2, Lsp1, ENSMUSG00000043795, Tnnt3, Mrpl23, Nctc1, H19, Igf2, Igf2as, Ins2, EG640264, EG624121, Th, Ascl2, Tspan32, R74862, Cd81, Tssc4, Trpm5, Kcnq1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-280D23.bB6Ng01-280D23.g
ACCGA080021GA080022
length1,0241,073
definitionB6Ng01-280D23.b B6Ng01-280D23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,325,166 - 149,325,914)(149,156,731 - 149,157,791)
sequence
gaattctctccaaattgatctataaatttggtatcatcccaattaaaagc
caagtaaaatttgtttaattgatgcagctactggggtagggggaggaaaa
gcagtccaacaaatggctccccatgcagggtaactaggaaaaataaaaat
atgttgaagtcctaaatattgaggcctgggtaaaatattaaggcctaggt
aactgttacctggataacctgccattataaggaaacttttttaaaatatg
tttttgttgttactaggaaactaaagtcaagattgattacatattttgtt
atgttttgtgcccctgtaaaccaaccatgatggaagtcagtagaactgtt
ttgtatagttagttacaataagctcggacccaaactaaccacccaacagc
acttcctgctcctgtgtatagcatttatggtataagctgcacctaggata
gactccaatataagaaagacagttgcaccaatataagaaactatttgaaa
taagacttccattttgagtagtggtccagtaaagtttaaattcccaagac
ttctctgggaattgacatcctggtcaaaacatgttagaaaatttccatct
tgtttgtaaattaggacatgattattagataaggcaagttgccaaccaat
gggagcaggaaaaatgtacaacaaagatatgttcctaggaaccgcccacc
cccatccctaaatcctgattggtaaaataacttggcacagatgtttgtgg
attttggggcttaaaaaaccctgtatggttttagcctggggtcatggttc
agttcccaaatctagactatggccctagccaaccagtcctagtgtgtatg
ctcaataaactctccctgtctgactgagatcagtgtttgtacagtctgta
agacgattcctggaccccaacactaaacataatgctaaacaatgttttta
gagaaagctttgagagaaaatcccttacaggctttgaggtagccctaagg
tttcttatataggacaataaaaaa
gaattcagtatgaaaggatgtatggtttcacactgcagggtaggtagtct
ttgaggttgtgggaaatttcttctgacttttcagtgttgggcaatgctag
tagtctttggtacccccaaatccagctgacccgacactgggatatttagt
tgattaatcacatgcaaaagcattttaccaagtaagtcatcatctattcc
ctatatgtcccatttgaggcttggcacccaaaatgggtgcaggtatcagc
aataagtacctgccaactctgtctatactaaatctatcaactccataccc
ttgggttgcctcctaccccgagttccccagcaccaggtgagtctcagtgt
agggcaggagttgggaggattaggcagggaggaggtgctcctgggggtag
cctccagctcaccctcagaaccctgccttccaaggaggtaatggaggagc
cgtggagtcctccagtgagatgtggtaggatggggagcccattgactaaa
gtggggatccagtagtgggaactttgccagcaggtaaatggggagagaga
tacagaagccccagacttcttggtatctagcaagggcaagaaacggccaa
gcccccggtgccttgcccttctccagtgtccatgctgacttcctatgtcc
ctcttcctctgcccaccaccttctgtcctgacctaagaggctcaagcttt
ggacctgctaggattagtgagcagtgtggacccttgttacactgggggtg
cttagactatgggactctcatcaggaaggattctggggctgtggttcagg
ggctagggatgtgatctggagctaagcaggctgatggctttgagtcttgc
cttctgttgctcaagacaagctcaatcttgtcctccttggccctgacaag
ggggaggaggggaagccagtttaagagaccaccatgtaagttggaattgt
attctggcaggggtacttgctgcagtgaattggctaccccatatgcctgg
tctgtgctgtcttagcatcattctgaggccctttaagaactgacgtccat
cactgaatttgaatggccctagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr7_149325166_149325914
seq2: B6Ng01-280D23.b_46_794 (reverse)

seq1  CACAAACATCTGTGCCAAGTTATTTTACCAATCAGGATTTAGGGATGGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAACATCTGTGCCAAGTTATTTTACCAATCAGGATTTAGGGATGGGG  50

seq1  GTGGGCGGTTCCTAGGAACATATCTTTGTTGTACATTTTTCCTGCTCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCGGTTCCTAGGAACATATCTTTGTTGTACATTTTTCCTGCTCCCA  100

seq1  TTGGTTGGCAACTTGCCTTATCTAATAATCATGTCCTAATTTACAAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGGCAACTTGCCTTATCTAATAATCATGTCCTAATTTACAAACAA  150

seq1  GATGGAAATTTTCTAACATGTTTTGACCAGGATGTCAATTCCCAGAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAAATTTTCTAACATGTTTTGACCAGGATGTCAATTCCCAGAGAAG  200

seq1  TCTTGGGAATTTAAACTTTACTGGACCACTACTCAAAATGGAAGTCTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGGAATTTAAACTTTACTGGACCACTACTCAAAATGGAAGTCTTAT  250

seq1  TTCAAATAGTTTCTTATATTGGTGCAACTGTCTTTCTTATATTGGAGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATAGTTTCTTATATTGGTGCAACTGTCTTTCTTATATTGGAGTCT  300

seq1  ATCCTAGGTGCAGCTTATACCATAAATGCTATACACAGGAGCAGGAAGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAGGTGCAGCTTATACCATAAATGCTATACACAGGAGCAGGAAGTG  350

seq1  CTGTTGGGTGGTTAGTTTGGGTCCGAGCTTATTGTAACTAACTATACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTGGGTGGTTAGTTTGGGTCCGAGCTTATTGTAACTAACTATACAAA  400

seq1  ACAGTTCTACTGACTTCCATCATGGTTGGTTTACAGGGGCACAAAACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTTCTACTGACTTCCATCATGGTTGGTTTACAGGGGCACAAAACATA  450

seq1  ACAAAATATGTAATCAATCTTGACTTTAGTTTCCTAGTAACAACAAAAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAATATGTAATCAATCTTGACTTTAGTTTCCTAGTAACAACAAAAAC  500

seq1  ATATTTTAAAAAAGTTTCCTTATAATGGCAGGTTATCCAGGTAACAGTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTAAAAAAGTTTCCTTATAATGGCAGGTTATCCAGGTAACAGTTA  550

seq1  CCTAGGCCTTAATATTTTACCCAGGCCTCAATATTTAGGACTTCAACATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGCCTTAATATTTTACCCAGGCCTCAATATTTAGGACTTCAACATA  600

seq1  TTTTTATTTTTCCTAGTTACCCTGCATGGGGAGCCATTTGTTGGACTGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATTTTTCCTAGTTACCCTGCATGGGGAGCCATTTGTTGGACTGCT  650

seq1  TTTCCTCCCCCTACCCCAGTAGCTGCATCAATTAAACAAATTTTACTTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCCCCCTACCCCAGTAGCTGCATCAATTAAACAAATTTTACTTGG  700

seq1  CTTTTAATTGGGATGATACCAAATTTATAGATCAATTTGGAGAGAATTC  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAATTGGGATGATACCAAATTTATAGATCAATTTGGAGAGAATTC  749

seq1: chr7_149156731_149157791
seq2: B6Ng01-280D23.g_67_1139

seq1  GAATTCAGTATGAAAGGATGTATGGTTTCACACTGCAGGGTAGGTAGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTATGAAAGGATGTATGGTTTCACACTGCAGGGTAGGTAGTCT  50

seq1  TTGAGGTTGTGGGAAATTTCTTCTGACTTTTCAGTGTTGGGCAATGCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGTTGTGGGAAATTTCTTCTGACTTTTCAGTGTTGGGCAATGCTAG  100

seq1  TAGTCTTTGGTACCCCCAAATCCAGCTGACCCGACACTGGGATATTTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTTGGTACCCCCAAATCCAGCTGACCCGACACTGGGATATTTAGT  150

seq1  TGATTAATCACATGCAAAAGCATTTTACCAAGTAAGTCATCATCTATTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTAATCACATGCAAAAGCATTTTACCAAGTAAGTCATCATCTATTCC  200

seq1  CTATATGTCCCATTTGAGGCTTGGCACCCAAAATGGGTGCAGGTATCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATATGTCCCATTTGAGGCTTGGCACCCAAAATGGGTGCAGGTATCAGC  250

seq1  AATAAGTACCTGCCAACTCTGTCTATACTAAATCTATCAACTCCATACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGTACCTGCCAACTCTGTCTATACTAAATCTATCAACTCCATACCC  300

seq1  TTGGGTTGCCTCCTACCCCGAGTTCCCCAGCACCAGGTGAGTCTCAGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTTGCCTCCTACCCCGAGTTCCCCAGCACCAGGTGAGTCTCAGTGT  350

seq1  AGGGCAGGAGTTGGGAGGATTAGGCAGGGAGGAGGTGCTCCTGGGGGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGGAGTTGGGAGGATTAGGCAGGGAGGAGGTGCTCCTGGGGGTAG  400

seq1  CCTCCAGCTCACCCTCAGAACCCTGCCTTCCAAGGAGGTAATGGAGGAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGCTCACCCTCAGAACCCTGCCTTCCAAGGAGGTAATGGAGGAGC  450

seq1  CGTGGAGTCCTCCAGTGAGATGTGGTAGGATGGGGAGCCCATTGACTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGAGTCCTCCAGTGAGATGTGGTAGGATGGGGAGCCCATTGACTAAA  500

seq1  GTGGGGATCCAGTAGTGGGAACTTTGCCAGCAGGTAAATGGGGAGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGATCCAGTAGTGGGAACTTTGCCAGCAGGTAAATGGGGAGAGAGA  550

seq1  TACAGAAGCCCCAGACTTCTTGGTATCTAGCAAGGGCAAGAAACGGCCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAGCCCCAGACTTCTTGGTATCTAGCAAGGGCAAGAAACGGCCAA  600

seq1  GCCCCCGGTGCCTTGCCCTTCTCCAGTGTCCATGCTGACTTCCTATGTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCGGTGCCTTGCCCTTCTCCAGTGTCCATGCTGACTTCCTATGTCC  650

seq1  CTCTTCCTCTGCCCACCACCTTCTGTCCTGACCTAAGAGGCTCAAGCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCTCTGCCCACCACCTTCTGTCCTGACCTAAGAGGCTCAAGCTTT  700

seq1  GGACCTGCTAGGATTAGTGAGCAGTGTGGACCCTTGTTACACTGGGGGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTGCTAGGATTAGTGAGCAGTGTGGACCCTTGTTACACTGGGGGTG  750

seq1  CTTAGACTATGGGACTCTCATCAGGAAGGATTCTGGGGCTGTGG-TCA-G  798
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
seq2  CTTAGACTATGGGACTCTCATCAGGAAGGATTCTGGGGCTGTGGTTCAGG  800

seq1  GGCTAGGGATGTGATCTGGAGCTAAGCAGGCTGATGGCTTTGAGTCTTGC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGGGATGTGATCTGGAGCTAAGCAGGCTGATGGCTTTGAGTCTTGC  850

seq1  CTTCTGTTGCTCAAGACAAGCTCAGCCTTGTCCTCCTTGG-CCTGACAAG  897
      ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||
seq2  CTTCTGTTGCTCAAGACAAGCTCAATCTTGTCCTCCTTGGCCCTGACAAG  900

seq1  GGGGAGGAGGGGAAG-CAGTTT-AGAGACCACATGGTAAG-TGGGATTGT  944
      ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||| |||||
seq2  GGGGAGGAGGGGAAGCCAGTTTAAGAGACCACCATGTAAGTTGGAATTGT  950

seq1  A-TCTGGCAGGGGTAC-TGCTGCAGTGAA-TGGCTACCCCATATGCCT-G  990
      | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  ATTCTGGCAGGGGTACTTGCTGCAGTGAATTGGCTACCCCATATGCCTGG  1000

seq1  TCTGT-CTGTCCTAGCATCA-TCTGGAGGCCTTTAAAGACTGAACGTTCA  1038
      ||||| ||||| |||||||| ||||  | |||||||  |||| |||| ||
seq2  TCTGTGCTGTCTTAGCATCATTCTGAGGCCCTTTAAGAACTG-ACGTCCA  1049

seq1  TCACTGATTTTGAATGG-CCTAGG  1061
      ||||||| ||||||||| ||||||
seq2  TCACTGAATTTGAATGGCCCTAGG  1073